... CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
PHÂN TÍCH ĐADẠNGDITRUYỀN MỘT SỐ MẪU NẤM
Corynespora cassiicola (Berk. & Curt.) Wei GÂY BỆNH TRÊN
CÂY CAO ... thống R-M được chuyên tính bởi virus hay plasmid
11
hiện mầm bệnh trên người, động vật, thực vật, thực phẩm…(Hồ Huỳnh Thuỳ
Dương, 2000)
Tất cả các DNA polymerase đều cần những primer chuyên ... LÂM TP. HỒ CHÍ MINH
BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC
PHÂN TÍCH ĐADẠNGDITRUYỀN MỘT SỐ MẪU NẤM
Corynespora cassiicola (Berk & Curt) Wei GÂY BỆNH TRÊN
CÂY CAO...
... định tính độc và sự đadạngditruyền bằng các phƣơng pháp phân tử hiện đại.
Xuất phát từ vấn đề trên chúng tôi thực hiện đề tài:”Xác định gen gây độc Pr1 và
tính đadạngditruyền đoạn gen Pr1 ... định đadạngditruyền và xác định gen gây
độc nhằm tạo ra đƣợc thuốc trừ sâu sinh học có hoạt tính ổn định và hiệu quả đối với
từng loại cây trồng, đáp ứng nhu cầu trong công tác bảo vệ thựcvật ... giới nhƣ kỹ thuật PCR phát
hiện sự hiện di n của gen Pr1 (protease) của nấm Metarrhizium anisopliae; kỹ thuật
RFLP, RAPD dùng để xác định sự đadạngditruyền của gen gây độc Pr1 giữa những
dòng...
... có 6 dạng (rDNA-ITS): Dạng 1 (A
1
,
H
1
, T
1
), dạng 2 (A
2
, H
2
, T
2
), dạng 3 (A
3
, H
1
, T
3
), dạng 4 (A
3
, H
1
, T
1
), dạng 5 (A
3
, H
3
,
T
1
), và dạng 6 (A
2
, H
4
, T
4
). Dạng ... III, và Taq I
Enzyme
Dạng 1
(RM-61 và
BV-61-02)
Dạng 2
(CX-8-
02)
Dạng 3
(CTĐ-
77)
Dạng 4
(BV-
62-03)
Dạng 5
(KT-
63-01)
Dạng 6
(XL-4)
Dạng ?
L-73
Dạng ?
ĐHL-
63
Alu I ... thực hiện đề tài “Sử
dụng kỹ thuật RFLP khảo sát sự đadạngditruyền của nấm Rhizoctonia solani
phân lập từ nhiều cây ký chủ khác nhau”.
1.2. Mục tiêu
Cung cấp các thông tin về sự đa dạng...
... đadạngdi
truyền bởi nó cho chúng ta biết về thành phần gen giữa các cá thể trong cùng
1 loài và giữa các loài khác nhau. Đến nay các nghiên cứu về tính đa hình
cũng như tính đadạngditruyền ...
có sự đadạng về mặt di truyền.
1
ĐẶT VẤN ĐỀ
Việt Nam nằm trong vùng khí hậu nhiệt đới nên tài nguyên thựcvật rất
dồi dào, với di n tích rừng của Việt Nam chúng ta thấy được sự đadạng ... hai, phân tích này cho thấy tính đadạngditruyền đối với xuất xứ
của chúng hay sự đadạng về thành phần kiểu gen giữa các mẫu trong cùng
xuất xứ.
11
kết ditruyền (bản đồ có mật độ cao trong...
... động vật không có vách vững chắc nên khi tách chiết DNA
từ tế bào động vật không cần giai đoạn phá vỡ vách tế bào. Cũng do không có vách
tế bào, tế bào động vật phát triển rất đadạng về hình dạng. ... tích đadạngdi truyền.
- Ứng dụng trong chẩn đoán bệnh.
2.4.6 Nguyên tắc multiplex PCR
Multiplex PCR là phản ứng PCR cho phép phát hiện cùng lúc nhiều gen của
một sinh vật hay nhiều sinh vật ... động vật, sản phẩm động vật qua biên giới di n biến hết sức
phức tạp, chính quyền địa phƣơng chƣa thực sự quan tâm chỉ đạo công tác ngăn
chặn và xử lý nhập lậu động vật, sản phẩm động vật qua...
... đổi cấu trúc gen dẫn đến
phân tích tính đadạngditruyền của một số dòng nấm Magnaporthe grisea.
Mục đích nghiên cứu: Nghiên cứu tính đadạngditruyền của một số dòng nấm
Magnaporthe grisea, ... Các băng điện di không thẳng do điện cực ở máy
điện di không ổn định trong quá trình điện di hoặc do bồn điện di bị rung trong quá
trình điện di. Trong điều kiện này, kết quả điện di tạo mẫu lai ...
55
0
C. Thực hiện rửa màng theo các bước sau:
2
sự đadạngditruyền của nấm Magnaporthe grisea. Ở nước ta, những nghiên cứu như
vậy còn rất ít.
Xuất phát từ tình hình trên, tôi đãthực hiện...
... vùng ITS-rDNA trong nghiên cứu sự đadạngdi
truyền của nấm R. solani 13
2.6.1. Giới thiệu về vùng rDNA 13
2.6.2. Sử dụng vùng rDNA để nghiên cứu sự đadạngditruyền 15
2.7. Một số nghiên cứu ... Phòng thực tập Bệnh cây Bộ môn Bảo Vệ Thực Vật, khoa Nông Học,
và Trung tâm Phân Tích Thí Nghiệm, Trường Đại học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh.
3.2. Nội dung đề tài
Phân tích sự đadạngditruyền ... phân tách bằng điện di trên gel agarose 2%, sau
đó nhuộm ethidium bromide. Ghi nhận kết quả thông qua máy Gel doc.
2
1. 2. Mục tiêu
Nghiên cứu sự đadạng về ditruyền của các dòng...
... (Jaysinghe, 2000).
2.4. Giới thiệu về thông tin di truyền, tính đadạngditruyền và chỉ thị
2.4.1. Thông tin ditruyền
Nucleic acid, vật liệu mang thông tin ditruyền của các hệ thống sống. Như
tên ... sự đadạng của nguồn bệnh.
Mặc dù những phương pháp truyền thống như: quan sát hình thái đặc điểm phát
triển, hình thái bào tử, cây chỉ thị.v.v. đã được sử dụng để phát hiện sự đadạngdi
truyền ... for a better under standing of disease
outbreaks, predicting future disease development and developing effective strategy in
breeding for disease resistant clones. It is indicated that RAPD will...
... với nhau là: đadạngditruyền
(tính đadạng về mặt ditruyền trong một loài) và đadạng sinh thái (số lƣợng các loài
trong một quần xã sinh vật) . Đadạng sinh học (Biological Diversity) có ... phú, đadạng của các dạng sống hiện đang tồn tại trên Trái Đất. Đadạng sinh
học bao gồm sự đadạng của các dạng sống, vai trò sinh thái mà chúng thể hiện và đa
dạng ditruyền mà chúng có. Sự đa ... truyền mà chúng có. Sự đadạng sinh học đƣợc biết ở ba mức, đó là:
- Sự đadạng của các hệ sinh thái.
- Sự đadạng của các loài.
- Sự đadạngditruyền hay sự đadạng của các nguồn gene bên...
... Điện di sản phẩm PCR và đánh giá kết quả điện di
Sản phẩm PCR sẽ được kiểm tra bằng cách điện di trên gel agarose 1%.
Hóa chất cho kỹ thuật điện di
DNA ladder loại 1000bp (Biorad).
Ethidium ... gian 15 phút.
Sau đó, sản phẩm cắt sẽ được kiểm tra bằng cách điện di trên gel agarose 1% -
1,5%, phân tích sự đadạngditruyền giữa các dòng nấm.
PHẦN 4
KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.1. Phân ... lược tạo giếng di n di.
- Chờ gel đông lại. Cho vào bể điện di và đổ dung dịch TAE vào.
- Lấy 4 l sản phẩm PCR trộn với 2 l loading dye cho vào
giếng và tiến hành chạy điện di.
- Phân tích...
... :phòng thực tập bệnh cây Bộ Môn Bảo Vệ Thực Vật, khoa Nơng
Học và trung tâm Phân Tích Thí Nghiệm Hóa Sinh trường Đại Học Nơng Lâm
Thành Phố Hồ Chí Minh .
3.2. Vật liệu và hoá chất
3.2.1. Vật ... nấm Beauveria bassiana vuille
Khi thực hiện phản ứng enzyme cắt giới hạn cho 6 dòng nấm Beauveria
Bassiana. kết quả cho thấy chƣa thấy rõ sự đadạng về ditruyền giữa các dòng nấm,
nguyên nhân ... trƣờng dinh
dƣỡng, có thể đƣợc chế tạo ở dạng chế phẩm sinh học, và tiêu di t một lƣợng không
nhiều các côn trùng có ích (Nguyễn Ngọc Tú và Nguyễn Cửu Thị Hƣơng Giang,
1997).
Chất di t côn...
... lấy dọc đƣờng sông.
Quần thể Cóc trắng tại rừng Cần Giờ có mức đadạngditruyền thấp. Do đó
cần làm tăng độ đadạngditruyền của quần thể bằng cách trồng xen các cây
có nguồn gốc giống ... nghiên cứu đadạngditruyền 19
2.3.4.1. Microsatellite/ SSR 19
2.3.4.2. AFLP 21
2.3.4.3. RAPD 25
3.1. Thời gian và địa điểm thực hiện 28
3.1.1. Thời gian thực hiện 28
3.1.2. Địa điểm thực hiện ... đadạngditruyền 12
2.3.1. Phƣơng pháp tách chiết DNA ở thựcvật 12
2.3.2. Định lƣợng và xác định độ tinh sạch của DNA 13
2.3.2.1. Phƣơng pháp đo quang phổ 13
2.3.2.2. Phƣơng pháp điện di...