... nhận genmãhóa cho protein màng (M) Giảitrìnhtựgen tiến hành phân tích số liệu, so sánh tương đồng nucleotide amino acid để đánh giá đa dạng di truyền chủng PRRS Việt Nam giới dựa trìnhtựgen ... vào trìnhtựgenmãhóa cho protein màng (M)” Trong khuôn khổ luận văn, đặc điểm di truyền phân tử số chủng PRRSV phân lập Việt Nam năm 2010 so sánh với chủng khác Việt Nam giới dựa trìnhtựgen ... [25] Bộ gen PRRSV dài khoảng 15 kb bao gồm tám (ORF) bao gồm ORF1a, 1b, 2,3,4,5,6, -7 , ORF 1a ORF 1b genmãhóa RNA polymerase, GP 2-3-4 genmãhóaprotein chức năng, GP5 (hay E) glycoprotein...
... Hình 18 So sánh trìnhtự DNA với trìnhtựprotein nhóm Nhóm gồm trìnhtự chủng LPH209 với trìnhtựprotein dài gồm 413 axit amin Trìnhtựprotein chủng sai khác với trìnhtựprotein Thite_72629 ... Bùi Ngọc Anh Khóa luận tốt nghiệp vực gen, nhiều genmãhóa cho cellulase nhân dòng giảitrìnhtự DNA Một số genmãhóa cho cellulase có trìnhtự khác biệt chứng tỏ đa dạng cellulase tự nhiên Các ... sai khác trìnhtựprotein DNA, chia 19 chủng thành nhóm sai khác theo mức độ tương đồng với với trìnhtự ThCEL 72629 Nhóm nhóm có trìnhtựproteintrìnhtự DNA tương đồng cao với trìnhtự Thite_72629,...
... cereus Gen gyrB mãhóa tiểu phần protein B ADN gyrase (topoisomerase type II), gen điều khiển siêu xoắn sợi ADN Gen có vai trò quan trọng q trình nhân ADN Do vậy, người ta tách dòng giảitrìnhtựgen ... Trong protein nhiều thành phần này, protein thành phần mãhoágen Tiểu phần B mãhoágen hblA gen hblC hblD mã hố cho tiểu phần L1, L2 Các gen nằm operon Hoạt tính độc tố mạnh có đầy đủ protein ... 3.6 So sánh trìnhtự amino acid protrein BCET vói trìnhtự BAA041341 ngân hàng gen quốc tế 44 Hình 3.7 So sánh trìnhtự amino acid protrein NHE vói trìnhtự DQ153257.1 ngân hàng gen quốc tế...
... sánh trìnhtựgen thu đợc Các bớc tiến hành nh sau: + So sánh trìnhtựgen đợc đọc từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trìnhtự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trìnhtự ... + Giảimãtrìnhtự nucleotit sang trìnhtự axit amin theo khung đọc mở, xác định vị trí mở đầu kết thúc dịch mã + Lập phân loại bảng hệ số đồng dạng so sánh mức độ tơng đồng di truyền trìnhtự ... đoạn gen 16 trìnhtựgen Nib đợc khai thác NCBI Các trìnhtự đợc so sánh với nhờ chơng trình phần mềm DNAstar Với mục đích sử dụng cặp mồi nhân đợc nhiều dòng virus khác nhau, chọn vùng trình tự...
... PCR tinh giảitrìnhtự MACROGEN Phân tích trìnhtựgen chương trình Seqman DNASTAR Kiểm tra trìnhtự chương trình ClustalX (Thompson et al, 1997) Nhận dạng trìnhtự tính tốn chương trình BioEdit ... rút vàng xoăn Trìnhtự đoạn gen CP giảimãtừ sản phẩm PCR TYLCV mẫu cà chua thu huyện Đơn Dương tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trìnhtự phiên mã xi /ngược gen CP vi vi rút ... phân tích protein chương trình ORF-DNA CLUB so sánh với nòi xuất nước lân cận Việt Nam Kết phân tích protein (bảng 4) cho thấy trìnhtựgiảimã vi rút mẫu cà chua thu Đức Trọng tương tự với nòi...
... 40 Hình 16 So sánh trìnhtự vùng mãhóagen giống lúa 41 Hình 17 So sánh trìnhtự vùng khơng mãhóagen giống lúa Trìnhtự nucleotide intron giống so sánh với trìnhtự liệu gen lúa thấy có độ ... kết giảitrìnhtự giống IR28 trình bày hình sau: Hình 15 Hình ảnh cho thấy phần kết giảitrìnhtự mẫu IR28 sử dụng cặp mồi 3.5 Phân tích trìnhtựgen giống lúa Sau thuđược kết giảitrìnhtự giống ... phù hợp thu đoạn gen OsHKT2,1 Các bước thiết kế mồi tiến hành sau: Tìm trìnhtựgentrìnhtự CDS gen OsHKT2,1 từ ngân hàng gen lúa 33 So sánh trìnhtự tương đồng gen với trìnhtự CDS Xác định...
... cứu 3.2 NHÂN GEN PPO Ở CÁC MẪU CHÈ NGHIÊN CỨU Genmãhóa PPO cho có trìnhtựmãhóa có kích thước 1,8 kb Trìnhtựgenmãhóa PPO phân lập từ mRNA genome chè công bố Genbank với mã số DQ513313, ... đoạn genmãhóa PPO 3.4 PHÂN TÍCH TRÌNHTỰGEN PPO CỦA GIỐNG CHÈ NGHIÊN CỨU Từ dòng plasmid tái tổ hợp thu được, chúng tơi tiến hành tinh nhằm mục đích xác định trìnhtựgen PPO Trìnhtựgenmãhóa ... 3.1 với trìnhtự cơng bố dựa trìnhtự nucleotide gen 42 PPO Hệ số tương đồng di truyền giống chè nghiên cứu so với 3.2 trìnhtự cơng bố dựa trìnhtự amino acid suy diễn 42 từgen PPO Số hóa Trung...
... trìnhtự chung hai 39 trìnhtự gene tổng hợp từ hai mồi để nối ghép thành trìnhtự gene hồn chỉnh 3.4.9 So sánh trìnhtự DNA ngân hàng gene NCBI Gene fcs sau giảitrìnhtự so sánh với trìnhtự ... Các gene mãhóa cho cho enzyme sinh tổng hợp vanillin từ acid ferulic xác định gene fcs mãhóa cho enzyme feruloyl-coA synthetase gene ech mãhóa cho enzyme enoyl-CoA hydratase/aldolase Hai gene ... -fcs Giảitrìnhtự So sánh, phân tích trìnhtự gene 33 3.4.1 Khuếch đại đoạn DNA phương pháp PCR - Phản ứng PCR Thực phản ứng PCR nhân gene fcs với cặp mồi thiết kế đặc hiệu với trìnhtự gene...
... sánh gene giảitrìnhtự gene cơng bố Gen bank Query: Trìnhtự gene aprE sau giảitrìnhtự Sbjct: Trìnhtự gene aprE mã số AB 734700 từGen bank 999 1059 780 1119 37 Kết so sánh cho thấy, hai gene ... 3: Xác định trìnhtự gene aprE tách dòng - Giảitrìnhtự gene aprE tách dòng máy giảitrìnhtựtự động Applied Biosystems - So sánh thành phần thiết yếu trìnhtự gene aprE giảitrìnhtự với thiết ... dịch mã đoạn gene giảitrìnhtự - So sánh trìnhtự gene aprE tách dòng với trìnhtự cơng bố ngân hàng gene NCBI (Gene bank) thơng qua chƣơng trình Blast 18 3.4 Phƣơng pháp nghiên cứu 3.4.1 Quy trình...
... định trìnhtựgen FLS gắn với vector pJET 1.2 Sau phân tích trình tự, khẳng định chắn đoạn cDNA 35 phân lập trìnhtự ORF hồn chỉnh mãhóa FLS Gen có kích thước 996 bp, mãhóa 331 amino acid mã ... trìnhtựgen FLS phân lập từ mẫu chè xanh chè tím FLS: Trìnhtựgen FLS từ chè cơng bố Genbank với mã số DQ198089.1; FLS CT: trìnhtựgen FLS phân lập từ mẫu chè Trung du tím; FLS CX: trìnhtự ... dịch mã xảy chè nên thơng tin trìnhtự genome biết đến Đến năm 2010, có 819 trìnhtự nucleotide, 12.664 đoạn trìnhtự biểu (Expressed Sequence Tags - EST), giả thuyết trìnhtự genome 478 protein...
... tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trìnhtự tồn gen HP1125 vừa giảimã so sánh với gen tương ứng chủng nước ngồi chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen ... giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trìnhtự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng (B) 18 acid amine ... Hultman (6a) Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trìnhtựprotein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch...
... tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trìnhtự tồn gen HP1125 vừa giảimã so sánh với gen tương ứng chủng nước ngồi chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen ... giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trìnhtự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng (B) 18 acid amine ... Hultman (6a) Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trìnhtựprotein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch...
... toàn trìnhtựgen đợc xác định trìnhtựprotein với cấu trúc không gian Khi truy cập trang Web có đợc trìnhtựgen so sánh trìnhtựgen nghiên cứu với trìnhtự khác đợc công bố ta đăng ký đa trình ... trình Aligment phần mềm DNAstar để so sánh trìnhtựgen CP đợc nhân lên hai cặp primer khác Kết so sánh cho thấy hai trìnhtự tơng đồng (giống ~98%) Hai trìnhtự đợc so 44 sánh với trìnhtựgen ... bệnh cho đu đủ Gen PRSVN (gen CP) đợc xác định trìnhtự so sánh với trìnhtựgen CP khác ngân hàng gen, mức độ giống từ 86,7% đến 96,8 % Trìnhtự đợc kiểm tra cắt với enzim giới hạn Gen PRSVN đợc...
... toàn trìnhtựgen đợc xác định trìnhtựprotein với cấu trúc không gian Khi truy cập trang Web có đợc trìnhtựgen so sánh trìnhtựgen nghiên cứu với trìnhtự khác đợc công bố ta đăng ký đa trình ... chơng trình Aligment phần mềm DNAstar để so sánh trìnhtựgen CP đợc nhân lên hai cặp primer khác Kết so sánh cho thấy hai trìnhtự tơng đồng (giống ~98%) Hai trìnhtự đợc so sánh với trìnhtựgen ... bệnh cho đu đủ Gen PRSVN (gen CP) đợc xác định trìnhtự so sánh với trìnhtựgen CP khác ngân hàng gen, mức độ giống từ 86,7% đến 96,8 % Trìnhtự đợc kiểm tra cắt với enzim giới hạn Gen PRSVN đợc...
... hóaprotein VP19 Đoạn gen VP19 plasmid pZ -VP19 giảitrình tự, kiểm tra đồng khn với genmã hố protein A có sẵn plasmid pEZZ18 Trìnhtựgen VP19 WSSV mẫu tôm bệnh Việt Nam chúng tơi tạo dòng giải ... Nam Việc giảitrìnhtựgen cho thấy gen vp19 gồm 366bp mãhóa cho 122 axit amin Gen vp19 WSSV gây bệnh tơm sú Việt Nam có độ đồng cao mức ADN mức protein với gen vp19 khác công bố Gen vp19 tái ... Nam chúng tơi tạo dòng giảitrìnhtự công bố ngân hàng gen với mã số AY160771 So sánh trìnhtự VP19 với trìnhtự sẵn có ngân hàng gen. (Hình 6) cho thấy trìnhtựgen VP19 WSSV Việt Nam có sai khác...
... nhân gen CP từ hệ gen SMV 3.3 Tách dòng xác định trìnhtựgen CP mãhóaprotein vỏ SMV 3.4 So sánh trìnhtự nucleotide gen CP; trìnhtự amino acid poty-coat protein đoạn gen CP mãhóa đƣợc với GenBank ... trìnhtự đoạn gen CP SMV dòng SL3 so với trìnhtự có mã số X63771 Vị trí nucleotide X63771 SL3 11 G T 278 A T 708 G C 712 A T Protein có mã số CAA45307 GenBank đƣợc suy diễn từtrìnhtựgenmã ... vực đƣợc bảo tồn genome potyvirrus genmãhóaprotein nhƣ gen CI, gen NIb, gen CP Gen CP SMV giống với gen CP Potato virus Y Tobacco etch virus, nhƣng tổng thể hệ gen SMV tƣơng tự nhƣ Plum pox...
... với trìnhtựgen CP BLAST NCBI để xác định gen đƣợc tách dòng SMV So sánh trìnhtự đoạn gen CP dòng SL với trìnhtự GenBank Giảimãtrìnhtự nucleotide sang trìnhtự amino acid so sánh với trình ... lý trìnhtựgen Sử dụng phần mềm DNAstar, BLAST BioEdit để phân tích, so sánh trìnhtựgen CP, quy trình so sánh xử lý trìnhtựgen CP đƣợc tiến hành theo trìnhtự sau: So sánh trìnhtự đoạn gen ... mang gen CP 39 Hình 3.7 Trìnhtự đoạn gen CP SMV phân lập tỉnh Sơn 41 La trìnhtựgen CP dòng virus SMV đăng ký GenBank có mã số X63771 Hình 3.8 So sánh trìnhtự amino acid suy diễn từgen CP...
... tƣơng GenBank mã số AF516879 dựa trìnhtự đoạn mãhóagen GmEXP1 3.4 Vị trí sai khác trìnhtự nucleotid đoạn mãhóa 43 gen GmEXP1 giống đậu tƣơng 3.5 Hệ số tƣơng đồng hệ số sai khác trìnhtự acid ... định trìnhtự nucleotide đoạn mãhóagen GmEXP1 3.2.4 Kết xác định so sánh trìnhtự nucleotide gen GmEXP1 Xác định trìnhtự nucleotide đoạn mãhóagen GmEXP1 tách dòng.chúng tơi tiến hành đọc trình ... tích trìnhtự nucleotid đoạn mãhóagen GmEXP1 trìnhtự acid amin protein EXP1 Trìnhtự nucleotid đoạn mãhóagen GmEXP1 đậu tƣơng đƣợc xác định có kích thƣớc 768 bp Chúng tơi tiến hành so sánh trình...
... 2.4.2.2 PCR khuếch đại genmãhóaprotein ESAT6-CFP10 Error! Bookmark not defined 2.4.2.3 Tách dòng genmãhóaprotein ESAT6-CFP10.Error! Bookmark not defined 2.4.2.4 Giảitrìnhtự ADN Error! ... Bookmark not defined 3.1.1 Xác định tính ổn định genmãhóaprotein ESAT6/CFP10 Error! Bookmark not defined 3.1.1.1 Kết khuếch đại trìnhtựgenmãhóaprotein ESAT6/CFP10 M.tuberculosis Error! ... đoạn genmãhóaprotein CFP10/ESAT6 Error! Bookmark not defined 2.4.2.6 Thiết kế vector biểu pET21a chứa đoạn genmãhóaprotein CFP10/ESAT6 Error! Bookmark not defined 2.4.2.7 Biểu protein...