Đang tải... (xem toàn văn)
application for the analysis and visualization of SNP-gene associations in eQTL studies. Vaughn DW, Green s , Kalayanarooj s, Innis BL, Nimmannitya s, Suntayakorn s, Endy [r]
(1)VAI TRÒ CỦA GENE MICB VÀ BAK1
TRONG C CHÉ BỆNH SINH SỐT DENGUE THẺ NẶNG
T h s T rà n N gọc Đ ăng - S ộ m ôn Sức khỏe M ô i trư ng, Đ ại họ c Y D ợ c TPHCM
T S Iziim i N aka “
Trường Sau Đại h ọc, Đại h ọ c Tokyo, N hật Bản
A re e t Sa-N gasang; S u p e e A n a n ta p re e c h a ; N uan ju n W ich u kch in d a
Bộ m ôn Khoa h ọ c Y khoa, B ộ Y tế, Thái Lan
P ath om S aw a n p a n y a le rt
Đơn v ị Quản lý Thuốc Thực phẩm , B ộ Y tế, Thái Lan
J in ta n a P atarap o tỉku í - Bộ m ơn Vi sin h M iễn d ịch, Đại h ọ c Mẩhidoí, Thái Lan
G S TS B S N aoyuki T s u c h iy a - Khoa Y, Đ ại họ c Tsukuba, N hật Bản
H n g dẫn: P G S T S Ju n ó h a s h i
Trường Sau Đại h ọ c, Đ ại họ c Tokyo, N hật Bản
T Ó M TẮ T
Đặt vấn đề Mục tiêu nghiên cứu: s ố t dengue thể nặng bao gồm thể chính: thể shock (DSS), thề xuất huyết (DHF), đe dọa mạng sống cùa bệnh nhân nhiễm dengue Tuy nhiên, cốc gene liên quán đến chế bệnh sinh DSS DHF chưa rõ ràng Một nghiên cứu tương quan toàn nhiễm sắc thể (GWAS), đã phàt đa hình đơn nucleotide (SNPs): rs3132468 gen MICB, r$3765524 gen PLCE1 liên quan đến DSS quần thề bệnh nhân trẻ em nhiễm dengue Việt Nam Thêm vào đó, nghiên cứu
GWWS khác, tìm thấy SNPs liên quan đến giảm tiểu cầu quần thể người khỏe mạnh Nhật Bản. Trong nghiên cứu này, chúng tơi tìm hiếu mối liên quan SNPs với sốt dengue thể nặng quần thể bệnh nhân trẻ em nhiễm dengue Thái Lan.
Phương pháp nghiên cứu: SNPs (đó là, rs3132468 cửa MICB, rs3765524 PLCE1), với SNPs liên quan giảm tiểu cầu (bao gồm, rs6065 GP1BA, rs739496 SH2B3, rs385893 RCL1, rs6141 của THPO, rs5745568 BAK1) xác định kiểu di truyền 917 bệnh nhân trẻ em nhiễm dengue Thài: 76 bệnh nhân DSS, 432 bệnh nhân DHF, 409 bệnh nhân DF Đề tìm hiểu mối liến quan cửa SNPs với sốt dengue thể nặng, so sánh tần số alen cùa SNPs hai nhóm: DSS vs khơng DSS SNPs của MICB PLCE1, DHF vs DF SNPs liên quan giảm tiểu cầu.
Kết quả: rs3132468 MICB rs3765524 PLCE1 lẩn khẳng định mối liên quan với DSS
ở bệnh nhân nhiễm dengue (P value = 0,0213, OR - 1,58 cho alen rs3132468-C; p value = 0,0252, OR =
1,49 cho rs3765524-C) Tuy nhiên có alen rs3132468-C thể m ối liên quan có ý nghĩa với hàm lượng mRNA MICB (P value - 0,0267) Trong số SNPs liên quan giảm tiểu cầu, c h ỉ có alen ÍS5745568-G của
BAK1 liên quan với nguy DHF (P value = 0,005, OR = 1,32).
Kết luận: MICB protein thường biểu cốc tế bào nhiễm dengue trình diện đến thụ thể NKG2D trên bề mặt cốc tế bào tiêu diệt tự nhiên, để từ hoạt hóa q trình tiêu diệt tế bào nhiễm Kết nghiên cứu này gợi ý chế bệnh sinh liên quan tới DSS rs3132468 SNPs làm giảm biểu protein MICB và từ giảm quâ trình tiêu diệt tế bào nhiễm dengue Đồng thời rs5745568 BAK1 giổn tiếp làm trầm trọng thêm tình xuất huyết chế bệnh sinh DHF.
Từ khóa: MICB gene, BA K gene, sốt dengue thể nặng, thể shock dengue, thể xuất huyết dengue.
S U M M A R Y
THE ROLE OF MICB AND BAK1 GENE IN PA THOGENESIS OF SEVERE DENGUE
MPH Tran Ngoc Dang Department o f Environmental Health, Faculty o f Public Health, University o f Medicine and Pharmacy, Ho Chi Minh City, Vietnam PhD Izumi Naka - Graduate School o f Science, The University o f Tokyo, Tokyo, Japan Areerat Sa-Ngasang; Surapee Anantapreecha; Nuanjun Wichukchinda Department o f Medical Sciences, Ministry o f Public Health, Nonthaburi, Thailand Pathom Sawanpanyalert Food and drug Administration, Ministry o f Public Heath, Nonthaburi, Thailand Jintana Patarapotikul Department o f Microbiology and Immunology, Faculty o f Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, Thailand
Prof MD PhD Naoyuki Tsuchiya - Faculty o f Medicine, University o f Tsukuba, Tsukuba, Japan
(2)associated with DSS and DHF in patients with dengue A recent genome wide association study (GWAS) identified two SNPs, rs3132468 o f m ajor histocompatibility complex class I polypeptide-related sequence B
(MICB) and rs3765524 o f phospholipase c, epsilon (PLCE1), associated with DSS in Vietnamese children In
addition, another GWAS o f haematological and biochemical traits identified six SNPs associated with low platelet count in healthy subjects in a Japanese population In this study, we aim to examine the association o f above mentioned SNPs with DSS and DHF in patients with dengue in Thai population.
Materials and Methods: Two SNPs in MICB (i.e rs3132468, and rs3765524), and SNPs associated with low platelet count (i.e rs6065 in GP1BA, rs739496 in SH2B3, rs385893 in RCL1, rs6141 in THPO, and ĨS5745568 at BAK1) were genotyped in 917 Thai children with dengue: 76 patients with DSS, 433 DHF, and 409 DF To assess the association o f each SNP with severe dengue, allele frequencies were compared using a Chi-square test between the two groups (i.e DSS vs non DSS in MICB SNPs, and DHF vs DF in platelet SNPs).
Results: The reported DSS-risk alleles were significantly associated with DSS in Thai patients with dengue
(one-sided p - 0.0213 and odds ratio [OR] = 1.58 forrs3132468-C and one-sided p - 0.0252 and OR - 1.49 for
rs3765524C) The ÍS3132468C allele showed a significant association with lower mRNA level o f MICB (P -0.0267), whereas the rs3765524-C allele did not Among the five platelet SNPs, the G allele o f rs5745568 in BAK1 was significantly associated with a risk for DHF [P = 0.005 and crude odd ratio (OR) - 1.32].
Conclusions: These results imply that the escape o f dengue virus-infected cells with lower MICB expression from the natural killer group member D (NKG2D)-mediated killing by NK cells may mediate the pathogenesis of DSS The low-level constitutive production o f platelets caused by the G allele ofrs5745568 seems to increase the risk o f bleeding in dengue infection Our results suggest that BCL-2 homologous antagonisưkiller (BAK) protein, encoded by BAK1, plays a crucial role in the pathogenesis ofDHF.
Keyw ords: MICB, BAK1, severe dengue, dengue shock syndrome, dengue haemorrhagic fever.
Đ Ă T V Á N Đ È V À M Ụ C TIẾ U
Sot dengue bệnh muỗi truyền gây virus dengue Virus dengue có tuýp huyết thanh: DEN1, D EN 2, D E N 3, D EN Khoảng gần ,5 tỉ người trên tồn cầu sổng vùng có nguy cơ lây truyền virus dengue, Đơng Nam A là một khu vực bị ảnh hưởng nghiêm trọng nhất Sốt dengue thể nặng bao gòm the chính: thề shock (D S S), thể xuẩt huyết (D H F), đe dọa mạng sống bệnh nhân nhiễm dengue [1], Tuy nhiên, gene liên quan đến chế bẹnh sinh của D SS D H F chưa rõ ràng Một nghiên cứu tương quan toàn nhiễm sắc thể (G W AS), phát hiện đa hình đơn nucleotide (SNPs): rs3132468 của gen MICB, vả rs3765524 cùa gert PLCE1 iiên quan đến D S S quần thể bệnh nhân trẻ em nhiễm dengue Việt Nam [2] Thêm vào đó, nghiên cứu G W A S khác, tỉm thấy S N P s liên quan đến giảm tiều cầu quần thể người khỏe mạnh Nhật Bản [3] Trong nghiên cứu này, chúng tơi tìm hiểu mối liên quan SN P s với sốt dengue thể nặng ờ quần thể bệnh nhân trè em nhiễm dengue tại Thái Lan.
Đ Ố I TƯỢNG VÀ PHƯƠNG P H Á P N G H IÊ N c ứ u Đ ố i tư ợ n g
Nghiên cứu bao gồm bệnh nhân tuổi S15 nhiễm dengue điều trị hai bệnh viện Ratchaburi Lampang, Thái Lan tư 1999 đến 2004 Bệnh nhân phân thành nhóm: sốt dengue khơng đặc hiệu (D F) gồm người, sốt dengue xuất huyết (D H F) độ độ gồm người, D H F độ 3 (hay gọi shock dengue, D S S ) gồm 76 người, dựa theo tiêu chuẩn phân loại W H O năm 1997 [4].
Nghiên cứu Hội đồng Y đức Bộ Y tế Thái Lan, Hội đồng Y đức Trường Đ ại học Mahidol, và Trường Đ ại học Tsukuba cho phép tiến hành.
P hư n g pháp x c định kiều d i tru y ề n củ a S N P s 2 S N P s (rs31324 M ICB , rs3765524 của PLCE1), với S N P s liên quan giảm tiểu cầu (bao gồm, rs6065 G P1B A, rs739496 SH2B3, rs385893 RCL1, rs6141 T H P O , rs5745568 của BAK1) xác định kiểu di truyền phương pháp J a q M a n ® S N P Genotyping Assay.
SỐ liệu m ứ c đ ộ biểu m R N A
Số liệu mức độ biểu m R N A tương ứng với rs3132468 M ICB rs3765524 PLCE1 được thu thập từ sở liệu G E N E V A R [5, 6].
Phan tíc h th ổ n g kể
Đ ể tìm hiểu mối liên quan cùa S N P s kể với sốt dengue thể nặng, so sánh tần số alen của S N P s giưa hai nhóm: D S S (D H F độ 3,4) vs. không D SS (D F + D H F độ ) S N P s MICB và P LC E 1, D H F (D H F độ 1,2,3 ) vs D F ở SNPs liên quan giảm tiểu cầu sử dụng phép kiểm Chỉ bình phương (Chi2) Sau đó, mơ hình hồi quy logistic đa biển (kiềm soát cho yeu tổ như: tuổi, giới, bệnh viện, tuýp virus) sử dụng để tính tỉ số số chênh (OR) alén nguy M ứ c ý nghĩa thống kê khi p value < 0,05.
K Ế T Q U Ả
Bảng miêu tả đặc điểm dân số quần thể nghiên cứu Theo số bệnh nhân nhiễm dengue là nam nhiều nữ (489 vs 428) s ố bệnh nhân ở bệnh viện Ratchburi nhiều gần gấp đôi số bệnh nhân ở
bệnh viện Lampang (611 vs 306) Tuýp virus DEN1 và D EN chiếm đa so so với íoại khác Khơng có sự khác biệt đáng kể tuổi ở nhóm bệnh nhân sốt dengue.
Bảng Đ ặ c đ ề m quằn thề nghiên cừu _ Đặc điểm
Bệnh nhân nhiếm dengue DF
(n = 409)
DHF (n =432)
(3)Giới:
Nam 213 235 41
Nữ 196 197 35
Bệnh viện:
Ratchaburi 237 322 52 Lampang 172 110 24 Tuýp virus:
DEN-1 153 136 15 DEN-2 109 158 39
DEN-3 92 73
DEN-4 54 64 16
DEN-3 + DEN-4
a Trung vị (min,max)
Bảng sò sánh tan số alien rs3132468-C của MICB and alien rs3765524-C PLCE1 hai nhóm D SS (D HF độ 3,4) không D S S (D F + D H F độ và 2) SNPs cho thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê với D SS bệnh nhân nhiễm dengue (P value = 0,0213, O R = 1,58 cho alen rs3132468-C; P
thuộc đặc điểm dân số quần thể nghiên cứu (như íà: tuổi, giới, bệnh viện, virus) mơ hình hồi quy logistic đa biến (P value = 0,01547 OR =1,57 cho rs3132468-C; p value = 0,0226, O R = 1,48 cho rs3765524-C).
Bảng Mối liên quan M IC B rs3132468 và PLCE1 rs3765524 với D SS
Alien (gene) Bệnh nhân dengue One-sided P-value OR 95% Cl DSS non-DSS rs3132468-C
iỊyilCB) 0,217 0,149 0,0213 1,58 1,02-2,40 rs3765524-C
(PLCE1) 0,763 0,684 0,0252 1,49 1,00-2,26
Hỉnh bên thể mối liên quan alen nguy D SS M IC B PLCE1 với mức độ biểu hiện mRNA Có thể thấy số alien rs3132468-C càng cao mức độ biểu m R NA M ICB càng thấp, mối lỉên quan có ý nghĩa thống kê với p value = 0,0 hệ số tương quan = -0 ,1 Trong khí mổi liên quan rs3765524-C với m RNA của PLCE1 khơng có ý nghĩa thống kê, với p value = 0,0863 and partial h ệ số tương quan = 0,0209.
MÍCB (6) PLCE1
I ) < j
I 6.0 i
1 Ị
1 5.9
2
-2
5.8-(a)
Ị « f
I 9.2-1
Z 9.0'I £ M ị
« 8.6 í
N ị
I 8.4 -1 o 8.2 Ị
Z
8.0 L í
TT (68) CT (15} CC (5) TT{4) CT(35) CC(50)
rs3132468 «3765524
Hỉnh Mức độ biểu mRNA kiểu di truyền SNP (a) Mức độ biểu mRNA cùa MỈCB SNP
rs3132468
(b) Mức độ biểu mRNA PLCE1 với SNP rs3765524 Bảng so sánh tần số alien nguy S N P s liên quan giảm tiểu cầu hai nhóm D H F (D H F độ 1,2,3 ) vs DF Trong số SN P s liên quan giảm tiểu cầu có rs5745568 BAK1 liên quan có ý nghĩa thống kê với D H F (P value = 0,005, O R thô = 1,32) Mối liên quan không thay đỗi hiệu Chĩnh cho yếu tố thuộc v ề đặc tính dân sổ (P vaiue =
0,008, O R hiệu chỉnh = 1,31).
xác.
SNP id (gene) Kiễu di truyèn (Alien)
Bệnh nhân nhiém denque Phép kiếm Chi2 Hồi quy logistic DHF DF OR thô P-vaỉue OR hiệu chỉnh P-va!ue
rs5745568 (BAK1) TT GT GG 48 191 265 47 187 173
G-ailele 721 (71,5%) 533 (65,5%) 1,32 0,005’ 1,31 0,008* rs6141 (THPO) TT CT cc 82 260 164 70 189 148
C-alỉele 588 (58,1%) 485 (59,6%) 0,94 0,523 0,96 0,739
rs6065 (GP1BA) TT CT c c 2 37 467 42 366
c-allele 971 (96,0%) 774 (94,9%) 1,28 0,263 1,5 0,084
rs739496 (SH2B3) AA AG GG 18 137 350 12 114 281
A-allele 173(17,1%) 138(17,0%) 1,01 0,921 0,95 0,743
rs385893 (RCL1) TT CT cc 49 200 258 39 165 205
(4)BÀN LUẬ N
V a i trò c u a M IC B tro n g c c h ế b ệnh s in h s ố t de n g u e th ề nặng (H ìn h 2)
K/IICB protein thường biểu tế bào nhiễm dengue trình diện đến thụ thể N K G 2D bề mặt tể bào tiêu diệt tự nhiên, tế bào T C D 8+, để từ hoạt hóa q trình tiêu diệt tế bào nhiễm Kết quả nghiên cửu với kểt nghiên cứu trước [2,7] gợi ý chế bệnh sinh Hên quan tới sốt dengue thể nặng ià rs3132 SN P s gene MICB làm giảm biểu protein M IC B từ giảm n t i ả t r ì n h t i ê > < H ị p t c ỏ Q t ả h n n h ị ậ r p H n g n o M r v n n f p g n n h ị ố n { J l 'p t i t n p r V r * r f i n g r h | r a r ằ r ^ n t i Ị m r v n n n ’l o w i r t t c dengue máu nhiều mức độ bệnh nặng [8].
Làm suy giảm trìn h tiê u d iệ t t ế bào n h iễm của t ế bào tiê u d iệ t tự n h iên , v t ế bào T CD8+
D o đ ó làm gia tă n g g ánh nặng virus tro n g th ể
Hình Vai trò gene MICB CO’ che bệnh sinh sơt dengue ỉhể nặng
V trị c ủ a BAK1 tro n g c c h ế bệnh sin h s ố t d e n g u e th ề nặng
S N P rs5745568 nằm ở vùng gắn kết cùa các yếu tố phiên mã gene BAK1 [9] Do SNP TS5745568 ảnh hưởng đến mức độ biểu hiện của BAK1 BAK protein thuộc họ gia đình protein có chức quy định trình tự chết tế bào BAK protein chứng minh ià có liên quan đến việc !y giải tiểu cầu chuột [10] Do đó, kết nghiên cứu này gợi ý rs5745568-G cùa BAK1 đâ gián
tiếp làm trầm trọng thêm tình xuất huyết cơ che bệnh sinh DHF C ác phương pháp điều trị trong tương lai tỉm cách làm giảm mức độ biểu hiện của BAK protein để điều trị cho bệnh nhân DHF.
K Ế T LUẬN
(5)vọng đ ề u trị cho bệnh nhân sốt dengue thể nặng.
T À I LIỆU T H A M K H Ả O
1 Anders KL, Nguyet NM, Chau NV, Hung NT, Thuy TT, Lien le B, Farrar J, Wills B, Hien TT, Simmons CP: Epidemiological factors associated with dengue shock syndrome and mortality in hospitalized dengue patients in Ho Chi Minh City, Vietnam Am J Trop Med Hyg 2011, 84: 127-134.
2 Khor cc, Chau TN, Pang J, Davila s, Long HT, Ong RT, Dunstan SJ, Wilis B, Farrar J, Van Tram T, Gan TT, Binh NT, Tri le T, Lien le B, Tuan NM, Tham NT, Lanh MN, Nguyet NM, Hieu NT, Van NVinh Chau N, Thuy TT, Tan DE, Sakuntabhai A, Teo YY, Hibberd ML, Simmons CP: Genome-wide association study identifies susceptibility loci for dengue shock syndrome at M!CB and PLCE1 Nat Genet 2011, :1 -1
3 Kamatani, Y., et al., Genome-wide association sỉudy of hematoiogical and biochemical traits in a Japanese population Nat Genet, 2010 42(3): p 210-5.
4 Chow VT: Molecular diagnosis and epidemiology of dengue virus infection Ann Acad Med Singapore 1997, 26: 820-826.
5 Yang TP, Beazley c, Montgomery SB, Dimas AS, Gutierrez-Arcelus M, stranger BE, Deioukas p, Dermitzakis ET: Genevan a database and Java
application for the analysis and visualization of SNP-gene associations in eQTL studies Bioinformatics 2010, 26: 2474-2476.
6 Stranger BE, Nica AC, Forrest MS, Dimas A, Bird CP, Beazley c , ingle CE, Dunning M, Fiicek p, Koiler D, Montgomery s, Tavare s, Deloukas p, Dermitzakis ET: Population genomics of human gene expression Nat Genet 2007, :1 -1 2 4
7 Whitehorn J, Chau TN, Nguyet NM, Kien DT, Quyen NT, Trung DT, Pang J, Wilis B, Van Vinh Chau N, Farrar J, Hibberd ML, Khor cc, Simmons CP: Genetic variants of MICB and PLCE1 and associations with non-severe dengue PloS One 2013, 8: e59067.
8 Vaughn DW, Green s , Kalayanarooj s, Innis BL, Nimmannitya s, Suntayakorn s, Endy TP, Raengsakulrach B, Rothman AL, Ennis FA, Nisaiak A: Dengue viremia titer, antibody response pattern, and virus seroiype correlate with disease severity J infect Dis 2000, 1 :2 -9
9 Xu, z and J.A Taylor: SNPinfo: integrating GWAS and candidate gene information into functional SNP selection for genetic association studies Nucleic Acids Res, 2009 37(W eb Server issue): p W600-5.
10 Mason, K.D., et al., Programmed anuciear cell death delimits platelet life span Ceil, 2007 128(6): p. 1173-86.
CHĂM SÓC PHỤ NỮ MANG THAI, SINH ĐẺ
CỦA NGƯỜIDÂN TỘCTHIẺU SỐ VÀ MỌT SỐ RÀO CẢN VÈ TIẾP CẬN DỊCH VỤ Y TÉ TẠI GIA LAI
T h s T rần Thị Đ iệ p 1, P G S T S Đ in h T h ị P hư ng H ò a 2. T h s T rần K hánh L o n g 1, P G S T S Trần Hữu Bích*
1 Giảng viên, T rường Đại h ọ c Y tế công cộng 2 Nguyên g iảng viên, T rường Đại h ọ c Y tế công cọng
TĨ M T Ắ T
Mặc tíừ nước ta đẫ có nhiều thành cơng cải thiện sức khỏe phụ nữ thời gian mang thai sinh đẻ nhưng nhiều phụ nữ dân tộc vùng sâu, xa khó tiếp cận với cốc dịch vụ Các tập tục ảnh hưởng nặng nề đến sức khỏe bà mẹ tuồi sinh đè Vi vậy, nghiên cứu tiến hành với mục tiêu: Mô tả thực trạng và rào cản chăm sóc sức khỏe bà mẹ mang thai sinh đẻ người Bana J ’rai tỉnh Gia Lai: Sử dụng phương pháp nghiên cứu định tính, thu thập số liệu từ 12 vấn sâu 12 thảo luận nhóm bà mẹ có tuổi Kểt bàn luận: Phụ nữ người dân tộc hiểu biết lợi ích khám thai sử dụng dịch vụ chăm sóc thời gian mang thai hạn chế Đẻ nhà phổ biến Câc bà mẹ sau sinh thường ăn kiêng kéo dài; đí làm nương/rẫy sớm thường mệt mỏi không đù sữa cho bú Ba rào cản cho việc tiếp cận chăm sóc sức khỏe 1) phụ nữ dàn tộc thiều số không hiểu hết thông điệp truyền thông hình
thức truyền thơng chưa phù hợp 2) Tại gia đình, việc chăm sóc thai nghén, sinh đẻ phần lớn chồng bố, mẹ
quyết đmh 3) Kinh tế gia đình khó khăn càn trở lớn đến việc tiếp cận dịch vụ chăm sóc y tế Kết luận: Các can thiệp đồng cần tiếp tục tiên hành nhằm cải thiện sức khỏe bà mẹ mang thai, sinh đẻ cho cộng đồng Bana và J ’rai Cần ưu tiên cho can thiệp truyền thông, đặc biệt với nhóm đối tượng chồng, bà mẹ; tư vấn nhóm nhỏ cần được sử dụng nhiều hơn.
Từ khóa: Phụ nữ, mang thai sinh đẻ, dân tộc.
S U M M A R Y _
CARE OF ETHNIC MINORITY WOMEN DURING PREGNANCY AND A T BIRTH AND SOME BARRIERS ON ACCESS TO HEALTH CARE SERVICES IN GIA u \ i
MS Tran Thi Diep1, Asso Prof Dinh Thi Phuong Hoa2, MS Tran Khanh Long1, Asso Prof Tran Huu Bich1