Nghiên cứu đa dạng di truyền nguồn gen mướp thu thập ở các tỉnh miền Bắc Việt Nam bằng chỉ thị SSR

6 18 0
Nghiên cứu đa dạng di truyền nguồn gen mướp thu thập ở các tỉnh miền Bắc Việt Nam bằng chỉ thị SSR

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

102 chỉ thị SSR đã được sử dụng để nghiên cứu đa dạng di truyền của 108 mẫu giống mướp thu thập ở các tỉnh miền Bắc Việt Nam; trong đó có 50 chỉ thị cho các băng ADN đa hình. Kết quả cho thấy tổng số alen phát hiện tại 50 locut là 196 alen khác nhau với trung bình là 3,92 alen/locut, 7 alen đặc trưng ở 5 locut. Hệ số đa hình di truyền (PIC) dao động từ 0,49 (ZJULM70) đến 0,85 (ZJULM13) với giá trị trung bình là 0,69. Hệ số tương đồng di truyền giữa các mẫu giống dao động trong khoảng từ 0,47 đến 0,87.

Tạp chí Khoa học Cơng nghệ Nơng nghiệp Việt Nam - Số 4(113)/2020 variety he yield and yield components of L27 groundnut variety also were improved when applied eggshell powder Comparison among the treatments the results showed that the higher values of growth and physiological characteristics were observed in 400 kg/ha of eggshell powder treatment In addition the highest values of yield and yield components were also observed in 400 kg/ha of eggshell powder treatment he values of growth, physiology and yield of treatment with 400 kg/ha of eggshell powder were signiicantly higher than that in the control treatment (500 kg/ha of lime) with theoretical yield and actual yield of 5.25 tons/ha and 3.63 tons/ha, respectively Keywords: Eggshell powder, growth, yield, groundnut Ngày nhận bài: 11/3/2020 Ngày ph̉n biện: 19/3/2020 Ngừi ph̉n biện: PGS TS Ninh hị Phíp Ngày duyệt đăng: 23/03/2020 NGHIÊN CỨU ĐA DẠNG DI TRUYỀN NGUỒN GEN MƯỚP THU THẬP Ở CÁC TỈNH MIỀN BẮC VIỆT NAM BẰNG CHỈ THỊ SSR Lê hị hu Trang1, Lã Tuấn Nghĩa1, Trần hị Minh Hằng2, Hoàng hị Huệ1, Đàm hị hu Hà1 TÓM TẮT 102 thị SSR sử dụng để nghiên ću đa dạng di truyền 108 mẫu giống mướp thu thập tỉnh miền Bắc Việt Nam; có 50 thị cho băng ADN đa hình Kết qủ cho thấy t̉ng số alen phát 50 locut 196 alen khác với trung bình 3,92 alen/locut, alen đặc trưng locut Hệ số đa hình di truyền (PIC) dao động từ 0,49 (ZJULM70) đến 0,85 (ZJULM13) với giá trị trung bình 0,69 Hệ số tương đồng di truyền mẫu giống dao động khỏng từ 0,47 đến 0,87 ̉ hệ số tương đồng di truyền 0,60 108 mẫu giống mướp chia thành nhóm Nhóm I gồm 30 mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền dao động từ 0,65 đến 0,87 Nhóm II gồm 38 mẫu giống chia thành nhóm phụ: nhóm phụ II-a gồm 30 mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền từ 0,67 đến 0,86 nhóm phụ II-b gồm mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền từ 0,66 đến 0,78 Nhóm III gồm 23 mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền từ 0,62 đến 0,75 Nhóm IV gồm 17 mẫu giống cịn lại có hệ số tương đồng di truyền cao 0,82 Các kết qủ thu nghiên ću có ý nghĩa công tác b̉o tồn chọn tạo giống mướp Việt Nam Từ khóa: Cây mướp, đa dạng di truyền, thị SSR I ĐẶT VẤN ĐỀ Mướp (Lufa aegyptiaca (L.) Roem.) 26 loài trồng làm rau thuộc họ bầu bí (Cucurbitaceae) nhiều nước giới Ngồi giá trị dinh dưỡng, mướp cịn trồng làm thuốc Malaysia, Hàn Quốc, Nhật B̉n, Đài Loan Trung Quốc (Demir H et al., 2008) Mướp có đặc điểm cho qủ vào mùa hè, vào th̀i điểm mà chủng loại rau đơn điệu, có suất cao, dễ trồng, sâu bệnh Tuy nhiên, giống mướp trồng chủ yếu giống địa phương, ngừi dân tự để giống với quy mô gia đình nên s̉n phẩm hàng hóa thương mại chưa cao Hiện nay, công tác nghiên ću tạo giống mướp nước ta chưa nhiều Hơn nữa, mướp thuộc nhóm giao phấn, đặc điểm hoa đơn tính gốc nên có tính dị hợp tử cao quần thể Vì vậy, việc đánh giá đa dạng di truyền nguồn gen thực cần thiết để chọn vật liệu khởi đầu chọn tạo giống, giống mướp lai F1 Với phát triển thị phân tử (RAPD, SSR, ISSR,…) hữu ích việc phân loại đánh giá đa dạng di truyền Trình tự lặp lại đơn gỉn (SSR- simple sequence repeat marker) cơng cụ hữu ích để xác định đa dạng di truyền nguồn gen Phương pháp có ưu điểm đánh giá nhanh, xác, cho đa hình ̉n định; thị SSR sử dụng rộng rãi có hiệu qủ nhiều đối tượng trồng Trong nghiên ću này, thị SSR sử dụng để nghiên ću đa dạng di truyền nguồn gen 108 mẫu giống mướp miền Bắc Việt Nam Qua phân tích SSR phân nhóm nguồn vật liệu, từ làm dẫn liệu cho trình lai tạo giống mướp II VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Vật lịu nghiên cứu 108 mẫu giống mướp có nguồn gốc thu thập miền Bắc Việt Nam, lưu giữ Trung tâm Tài nguyên thực vật (B̉ng 1) Trung tâm Tài nguyên thực vật; Học viện Nông nghiệp Việt Nam 115 Tạp chí Khoa học Cơng nghệ Nơng nghiệp Việt Nam - Số 4(113)/2020 Bảng Danh sách mẫu giống mướp nghiên ću STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 SĐK 3684 3835 3836 5328 5350 6565 6566 6567 6569 6571 6577 6720 6734 6735 6777 7761 7762 7763 7764 7772 7773 7774 8407 8410 8862 8863 9757 9759 9765 9766 9767 9770 9772 9774 9777 12238 12240 12242 12244 12245 12246 12498 12503 13609 13615 13617 15380 15385 15386 15387 15389 15390 15391 15392 Tên giống Mướp Mướp Mướp to Mướp Mướp Lai th̀i Mướp tròn Mướp hương Mướp Buốp hom Súi qua vật Mướp trạch Mướp hương Mướp hương Mướp mừi Mướp trâu Mướp nương qủ ngắn Mướp qủ dài Mướp trâu Mướp qủ to Mướp hương Mướp trâu qủ dài Qủ Lài thới Mác ve Mắc ve t̉ Mướp hương qủ nhỏ Mướp trâu qủ ngắn Lai sới Qủ Mướp hương Mướp nương Puộp Buộp thay Mướp hương Mạc buộp tến Mặc buộp Mướp nếp Mướp hương Mướp trâu Mướp hương Mặc puộp tến Mắc mướn Rừm nan liết Plái buộp Puộc Má noi Má bốp Mướp trâu Si cua Má pốp Mướp Mắc buốp Má puốp Ghi chú: SĐK: số đăng ký 116 Nơi thu thập Cao Bằng Sơn La Sơn La Lai Châu H̉i Dương Tuyên Quang Tuyên Quang Bắc Giang Lạng Sơn Bắc Kạn Bắc Giang Hà Giang Lạng Sơn Bắc Giang Hồ Bình Lạng Sơn Hồ Bình Lạng Sơn Bắc Ninh Bắc Giang Bắc Giang Bắc Giang Qủng Ninh Sơn La Bắc Giang Bắc Giang Bắc Giang Bắc Giang Sơn La Qủng Ninh Qủng Ninh H̉i Phòng Sơn La Sơn La Qủng Ninh Sơn La Sơn La Bắc Giang Hà Tây Hà Tây Hà Tây Sơn La Điện Biên Sơn La Sơn La Sơn La Sơn La Sơn La Điện Biên Điện Biên Điện Biên Điện Biên Sơn La Sơn La STT 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 SĐK 15393 15394 15395 15396 15399 16610 16613 16624 16626 16627 16629 16635 16644 16648 19973 19987 19988 19994 19995 20373 20376 20380 20381 20388 20389 20395 20397 20399 20401 20403 20404 20406 20407 20408 21861 21870 21878 21880 21883 21884 21885 21886 21887 21890 21891 21899 21900 21901 21905 21906 21908 21909 21910 21916 Tên giống Má pốp Má buốp Má pốp Má pốp Má puốp Má pốp Tâu dúa già Tâu dúa dà Má buốp Má buốp Sơ cua Má buốp Ve Lày dẩy Hoe Cà lây Má buốp Lày giấy Mác buôp Pìu t̉n Má buốp Má puốp Sư cua Mướp hương Mướp thừng Puộc Ve Que rì hom Quê Buốc Mạc que hom mướp c̉ Quê mướp vàng Tâu rua già Má pốp Tâu dua dà Cà rẩy cà đẩy bulặt Mặc que Tông zua già Má buốp Má buốp Má bốp Dò dới Kế Xúi qua Lạ sẩy Sư cua Mác Buôp Bốp Lài giấy Buốp hom Quê khêu Nơi thu thập Lai Châu Lai Châu Lai Châu Lai Châu Lai Châu Sơn La Sơn La Yên Bái Lai Châu Lai Châu Yên Bái Sơn La Lạng Sơn Lạng Sơn Cao Bằng Hà Giang Điện Biên Lào Cai Lào Cai Lào Cai Điện Biên Điện Biên Điện Biên Bắc Kạn Bắc Kạn Phú họ Cao Bằng Cao Bằng Cao Bằng Tuyên Quang Tuyên Quang Tuyên Quang Tuyên Quang Tuyên Quang Sơn La Lai Châu Yên Bái Lai Châu Lào Cai Lào Cai Lào Cai Sơn La Sơn La Lào Cai Lào Cai Lạng Sơn Qủng Ninh Qủng Ninh Hà Giang Lào Cai Bắc Kạn Bắc Kạn Bắc Kạn Tuyên Quang Tạp chí Khoa học Cơng nghệ Nơng nghiệp Việt Nam - Số 4(113)/2020 102 mồi SSR chọn lọc từ sở liệu hệ genome mướp với thông tin trình tự, kích thước, nhiệt độ gắn mồi công bố NCBI sử dụng để đánh giá đa dạng di truyền 108 mẫu giống mướp nghiên ću 2.2 Phương pháp nghiên cứu - Tách chiết ADN: ADN t̉ng số mướp tách chiết tinh theo phương pháp CTAB Djè cộng tác viên (2006) - Kỹ thuật PCR: Ph̉n ́ng PCR với mồi SSR thực với hỗn hợp ph̉n ́ng gồm 2µl PCR bufer 10X có 15 mM MgCl2; 1,6µl dNTP mix 2,5mM; 1,4µl mồi (F&R) nồng độ 25ng/µl, 0,1µl Green Taq DNA polymerase (5 đơn vị/µl) 2,5µl ADN (5ng/µl); 12,4 µl nước cất hai lần khử ion Điều kiện ph̉n ́ng PCR sau: 95ºC phút; 35 chu trình: 94ºC phút, 55ºC - 60ºC 30 giây (tùy thuộc Tm mồi), 72ºC phút; 72ºC phút - Điện di s̉n phẩm PCR gel polyacrylamide 8% phát tia UV phương pháp nhuộm Ethidium bromide - Phương pháp phân tích số liệu: Số liệu phân tích SSR sơ đồ hình thiết lập phần mềm NTSYSpc 2.11X theo phương pháp Rohlf, 2000 Hệ số PIC (Polymorphism Information Content) thị SSR ́ng locut tính tốn theo phương pháp Mohammadi, 2003 2.3 hời gian địa điểm nghiên cứu - h̀i gian nghiên ću: Năm 2017 - 2018 - Địa điểm nghiên ću: Phịng thí nghiệm cơng nghệ sinh học, Bộ môn Đa dạng sinh học Nông nghiệp, Trung tâm Tài nguyên thực vật - An Khánh, Hoài Đ́c, Hà Nội III KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 Sự đa hình ch̉ thị SSR với mẫu giống mướp nghiên cứu Trong số 102 thị SSR sử dụng nghiên ću đa dạng di truyền 108 mẫu giống mướp có 50 thị cho băng ADN đa hình 50 locut với kích thước nằm khỏng từ 110 - 590 bp Tại locut, kích thước alen thu tập đồn mướp biến thiên từ 10bp (ZJULM70) đến 80bp (ZJULM38) T̉ng số alen thu 196 alen Số alen đa hình locut biến động từ alen (ZJULM46) đến alen (ZJULM70), trung bình đạt 3,92 alen/locut Có cặp mồi cho alen (ZJULM4, ZJULM16, ZJULM30, ZJULM36, ZJULM50, ZJULM56, ZJULM69, ZJULM64, ZJULM80), có cặp mồi cho alen (ZJULM18, ZJULM38, ZJULM51), riêng cặp mồi ZJULM60 cho alen Tần số alen ph̉ biến dao động dao động từ 22,73% đến 61,11% Hình Ảnh điện di s̉n phẩm PCR số mẫu giống mướp thị ZJULM64 Trong t̉ng số 50 locut nghiên ću có thị xuất alen đặc trưng ZJULM64, ZJULM28, ZJULM51, ZJULM56, ZJULM69 mẫu giống mướp Qủ (SĐK9766) Xúi qua (SĐK 21900) thu thập Qủng Ninh, Pìu t̉n (SĐK 20373) thu thập Lào Cai, Má puốp (SĐK 15399), Sơ cua (SĐK 16629) thu thập Lai Châu, Plái buộp (SĐK13615) thu thập Sơn La, Quê khêu (SĐK21916) thu thập Tuyên Quang Các alen đặc trưng phát giúp nhận dạng mẫu giống nh̀ xuất băng ADN có kích thước khác mẫu giống Má puốp (SĐK15399) nhận dạng thị ZJULM51 (260bp), Qủ (SĐK9766) nhận dạng thị ZJULM64 (470bp), Xúi qua (GBVN021900) sử dụng thị ZJULM28 (225bp) để nhận dạng (B̉ng 2) Hệ số thơng tin đa hình mồi (PIC) thu 50 locut SSR nghiên ću dao động từ 0,49 (ZJULM70) đến 0,85 (ZJULM70) Hệ số PIC nghiên ću trung bình đạt 0,69, cho thấy ḿc độ đa dạng gen tồn 108 mẫu giống mướp ḿc đa dạng Kết qủ cao so với nghiên ću đa dạng di truyền 32 giống mướp (L.cylindrica L.acutangula) Trung Quốc An cộng tác viên (2017) với hệ số PIC dao động từ 0,1730 đến 0,7896, trung bình đạt 0,5281 117 Tạp chí Khoa học Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam - Số 4(113)/2020 Bảng Đa hình locut SSR mẫu giống mướp nghiên ću 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 ZJULM1 ZJULM3 ZJULM4 ZJULM5 ZJULM6 ZJULM7 ZJULM8 ZLULM10 ZJULM11 ZJULM12 ZJULM13 ZJULM14 ZJULM16 ZJULM18 ZJULM19 ZJULM25 ZJULM28 ZJULM30 ZJULM32 ZJULM34 ZJULM36 ZJULM38 ZJULM39 ZJULM41 ZJULM45 ZJULM46 ZJULM48 ZJULM50 3 3 4 3 5 4 Kích thước alen (bp) 140 - 160 190 - 224 240 - 280 210 - 239 220 - 251 200 - 227 260 - 285 225 - 257 170 - 196 240 - 280 280 - 315 240 - 280 230 - 279 280 -354 220 - 245 195 - 237 225 - 270 530 - 590 235 - 260 250 - 320 120 - 192 250 - 330 275 - 305 340 - 370 250 - 300 350 - 367 420 - 445 240 -310 29 ZJULM51 225 -290 43,40 30 31 32 ZJULM53 ZJULM54 ZJULM55 4 490- 540 315 - 353 360 - 395 29,63 40,74 47,22 33 ZJULM56 240 - 285 25,93 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 ZJULM57 ZJULM58 ZJULM59 ZJULM60 ZJULM63 ZJULM64 ZJULM66 ZJULM67 ZJULM68 ZJULM69 ZJULM70 ZJULM71 ZJULM73 4 450 - 485 250 - 290 240 - 270 330 - 410 355 - 392 410 - 470 140 -175 190 - 220 390 - 445 490 - 553 350 - 360 320 - 370 350 - 390 43,52 37,04 43,52 23,15 38,89 33,05 38,89 37,04 51,59 37,04 31,48 26,85 33,33 47 48 49 50 ZJULM77 ZJULM78 ZJULM79 ZJULM80 Trung bình Tổng số 4 3,92 196 250 - 300 410 - 470 250 - 300 110 - 180 29,63 39,13 39,81 46,31 STT Locut SSR Số allen Ghi chú: SĐK: số đăng ký, PIC: Hệ số đa hình 118 Tần số alen phổ biến 36,11 36,23 44,64 38,89 33,33 40,48 61,11 44,44 47,71 45,37 22,73 33,33 30,56 24,07 57,41 40,74 52,78 46,53 49,07 30,56 40,74 58,33 34,86 53,70 31,63 28,69 38,89 31,40 Alen đặc trưng Mẫu giống xuất hịn alen đặc trưng SĐK 21900 (225bp) SĐK 15399 (260bp), SĐK 16629 (290bp) PIC 0,66 0,70 0,69 0,65 0,74 0,64 0,55 0,65 0,62 0,63 0,85 0,74 0,78 0,82 0,57 0,64 0,67 0,78 0,74 0,63 0,76 0,82 0,66 0,72 0,75 0,50 0,65 0,75 0,65 0,74 0,73 0,66 SĐK 13615 (285bp), SĐK 21900 (250bp) SĐK 9766 (470bp) SĐK 21916(490bp) 0,66 0,65 0,73 0,66 0,77 0,66 0,75 0,74 0,58 0,72 0,72 0,49 0,60 0,62 0,63 0,67 0,74 0,78 0,69 Tạp chí Khoa học Cơng nghệ Nơng nghiệp Việt Nam - Số 4(113)/2020 3.2 Quan ḥ di truỳn gĩa mẫu giống mướp tập đồn Kết qủ phân tích đa dạng di truyền 108 mẫu giống mướp với 50 locut tương ́ng với mồi SSR thống kê xử lý số liệu theo NTSYS-UPGMA để lập ma trận tương đồng di truyền mẫu giống mướp sử dụng chương trình NTSYS Tree-Display để vẽ phân nhóm di truyền Kết qủ phân tích cho thấy hệ số tương đồng di truyền mẫu giống mướp nghiên ću dao động từ 0,47 đến 0,87 (trung bình 0,67), điều ch́ng tỏ tập đồn mẫu giống nghiên ću đa dạng (khác biệt di truyền mẫu giống nghiên ću lớn từ 13 - 53%) ̉ ḿc tương đồng di truyền 0,60 108 mẫu giống mướp phân thành nhóm (Hình 2) Nhóm I gồm 30 mẫu giống, với hệ số tương đồng di truyền mẫu giống dao động khỏng 0,65 đến 0,87 Trong nhóm có cặp mẫu giống SĐK 21884 SĐK 21906 có nguồn gốc thu thập Lào Cai có hệ số tương đồng di truyền cao 0,87, điều ch́ng tỏ cặp mẫu giống có quan hệ di truyền gần Nhóm II gồm 38 mẫu giống, ḿc tương đồng di truyền 0,63 phân tách thành phân nhóm II-a (30 mẫu giống) II-b (8 mẫu giống) Nhóm phụ II-a gồm 30 mẫu giống có hệ tương đồng di truyền từ 0,67 đến 0,86 Trong có 16 mẫu giống có nguồn gốc thu thập Sơn La, mẫu giống có nguồn gốc thu thập Điện Biên, 10 mẫu giống có nguồn gốc thu thập Lai Châu mẫu giống (SĐK7763) có nguồn gốc Lạng Sơn Nhóm phụ II-b gồm mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền từ 0,66 đến 0,78 Nhóm có mẫu giống (SĐK15390, SĐK19988, SĐK20376, SĐK20381) có nguồn gốc Điện Biên cặp mẫu giống Má buốp (SĐK16627) Má pốp (SĐK21870) có hệ số tương đồng di truyền cao 0,78 có nguồn gốc thu thập Lai Châu Nhóm III gồm 23 mẫu giống với hệ số tương đồng di truyền nhóm dao động từ 0,62 đến 0,75 ̉ nhóm này, có 11 mẫu giống nằm phân tách với giống lại ḿc độ tương đồng di truyền 0,65 Cặp mẫu giống SĐK8407 SĐK9767 có hệ số tương đồng di truyền cao 0,75 có nguồn gốc Qủng Ninh Nhóm IV gồm 17 mẫu giống cịn lại mẫu giống có nguồn gốc thu thập Lạng Sơn Bắc Giang Nhóm có hệ số tương đồng di truyền 0,64 đến 0,82 Hình Sơ đồ hình mối quan hệ di truyền 108 mẫu giống mướp dựa thị SSR Kết qủ phân nhóm dựa vào ḿc độ tương đồng di truyền cho thấy mẫu giống mướp nghiên ću đa dạng, có khác biệt rõ ràng khơng có trùng lặp giống Đây sở để phân loại, xác định nhóm có ưu lai, nhận dạng nguồn gen phục vụ công tác b̉o tồn, chọn tạo giống mướp miền Bắc Việt Nam IV KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 4.1 Kết luận Với 50 thị SSR sử dụng nghiên ću đa dạng di truyền108 mẫu giống mướp thu 196 alen khác với trung bình 3,92 alen/locut, alen đặc trưng locut Hệ số đa hình di truyền (PIC) dao động từ 0,49 đến 0,85, trung bình đạt 0,69 Tập đồn mẫu giống nghiên ću đa dạng, hệ số tương đồng di truyền mẫu giống đao động từ 0,47 đến 0,87 ̉ ḿc tương đồng di truyền 0,6 108 mẫu giống chia thành nhóm: Nhóm I gồm 30 mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền dao động từ 0,65 đến 0,87 Nhóm II gồm 38 mẫu giống chia thành nhóm phụ: nhóm phụ II-a gồm 30 mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền dao động từ 0,67 đến 0,86 nhóm phụ II-b gồm mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền dao động từ 0,66 đến 0,78 Nhóm III gồm 23 mẫu giống có hệ số tương đồng di truyền từ 0,62 đến 0,75 Nhóm IV gồm 17 mẫu giống cịn lại có hệ số tương đồng di truyền cao 0,82 Kết qủ thu nghiên ću có ý nghĩa cơng tác b̉o tồn chọn, tạo giống mướp miền Bắc Việt Nam 119 Tạp chí Khoa học Cơng nghệ Nơng nghiệp Việt Nam - Số 4(113)/2020 4.2 Đ̀ nghị Sử dụng kết qủ phân tích đa đạng di truyền giống mướp địa phương nghiên ću làm sở để lựa chọn t̉ hợp lai có hiệu qủ cơng tác chọn tạo giống mướp TÀI LIỆU THAM KHẢO An J., Yin M., Zhang Q., Gong D., Jia X., Guan Y and Hu J., 2017 Genome Survey Sequencing of Lufa Cylindrica L and Microsatellite High Resolution Melting (SSR-HRM) Analysis for Genetic Relationship of Luffa Genotypes International Journal of Molecular Sciences, 18, 1942 Demir H., Top A., Balkose D., Ulku S., 2008 Dye adsorption behavior of Lufa cylindrica ibers Journal of Hazardous Materials, 153 (1, 2): 389-394 Djè Y., Tahi G C., Zoro Bi I A., Malice M., Baudoin J P and Bertin P., 2006 Optimization of ISSR markers for African edible-seeded Cucurbitaceae species’ genetic diversity analysis African Journal of Biotechnology Vol , pp 083-087 Mohammadi S.A and Prasanna B.M., 2003 Analysis of genetic diversity in crop plant- Salient statistical tool and considerations Crop Sci, 43(4): 1235-1248 Rohlf F J., 2000 NTSYS-pc: numerical taxonomy and multivariate analysis system Exeter Publishing Ltd, 1, version 2.1, New York, USA Genetic diversity evaluation of lufa collected from some provinces of Northern Vietnam using SSR markers Le hi hu Trang, La Tuan Nghia, Tran hi Minh Hang, Hoang hi Hue, Dam hi hu Ha Abstract 102 SSR markers were used to study genetic diversity of 108 lufa accessions collected from some provinces of Northern Vietnam he results revealed that the total number of alleles detected at 50 loci was 196 with an average of 3.92 alleles per locus; unique alleles at loci were revealed Polymorphic information content (PIC) values varied from 0.49 (ZJULM70) to 0.85(ZJULM13) with an average of 0.69 In addition, genetic similarity coeicients of 108 lufa accession ranged from 0.47 to 0.87 At a genetic similarity coeicient of 0.60; 108 lufa accessions were divided into four groups based on analysis of genetic relationships Group I comprised 30 lufa accessions with genetic similarity coeicient ranging from 0.65 to 0.87 Group II consisted of 38 lufa accessions divided into sub-groups: Sub-group IIa comprised 30 lufa accessions with genetic similarity coeicient ranging from 0.67 to 0.86 and sub-group IIb comprised lufa accessions with genetic similarity coeicient ranging from 0.66 to 0.78 Group III consisted of 23 lufa accessions with genetic similarity coeicient ranging from 0.62 to 0.75 Group IV consisted of 17 lufa accessions with the highest genetic similarity coeicient of 0.82 hus, the results are valuable information for lufa conservation and breeding program in Vietnam Keywords: Lufa aegyptiaca, genetic diversity,SSR marker Ngày nhận bài: 12/4/2020 Ngày ph̉n biện: 25/4/2020 Ngừi ph̉n biện: PGS.TS Khuất Hữu Trung Ngày duyệt đăng: 29/4/2020 NGHIÊN CỨU XỬ LÝ BÙN TH̉I CỦA NHÀ MÁY S̉N XUẤT BIA LÀM PHÂN BÓN HỮU CƠ Vũ huý Nga1, Lương Hữu hành1, Nguyễn hị hu1, Đàm hị Huyền1, Đàm Trọng Anh1, Nguyễn Ngọc Quỳnh1, H́a hị Sơn1, Nguyễn Kiều Băng Tâm2, Đỗ Văn Mạnh3 TÓM TẮT Mục tiêu nghiên ću đánh giá đặc tính sinh hóa tiềm xử lý bùn th̉i nhà máy bia làm phân bón hữu cho trồng Kết qủ nghiên ću cho thấy bùn th̉i nhà máy bia Sài Gòn ch́a hàm lượng chất hữu cao (33,74 - 33,87%), hàm lượng Nitơ t̉ng số cao (1,378 - 3,85%), kali đạt ḿc trung bình (0,133 - 0,411%) lân t̉ng số ḿc nghèo (0,039 - 0,12%) Sau 30 ngày xử lý bùn chế phẩm vi sinh vật, trình ủ làm thay đ̉i hàm lượng chất bùn loại bỏ vi sinh vật gây bệnh Hàm lượng hữu đạt 21,42%, Nts đạt 1,84%, Viện Môi trừng Nông nghiệp; Trừng Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội Viện Công nghệ Môi trừng, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam 120 ... giống Mướp Mướp Mướp to Mướp Mướp Lai th̀i Mướp tròn Mướp hương Mướp Buốp hom Súi qua vật Mướp trạch Mướp hương Mướp hương Mướp mừi Mướp trâu Mướp nương qủ ngắn Mướp qủ dài Mướp trâu Mướp qủ... đồng di truyền 0,64 đến 0,82 Hình Sơ đồ hình mối quan hệ di truyền 108 mẫu giống mướp dựa thị SSR Kết qủ phân nhóm dựa vào ḿc độ tương đồng di truyền cho thấy mẫu giống mướp nghiên ću đa dạng, ... nghiên ću trung bình đạt 0,69, cho thấy ḿc độ đa dạng gen tồn 108 mẫu giống mướp ḿc đa dạng Kết qủ cao so với nghiên ću đa dạng di truyền 32 giống mướp (L.cylindrica L.acutangula) Trung Quốc

Ngày đăng: 26/11/2020, 00:48

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan