Đang tải... (xem toàn văn)
1.1. TÍNH CẤP THIẾT CỦA ĐỀ TÀI Cây ớt (Capsicum sp) thuộc chi Capsicum, họ cà (Solanaceae) có xuất xứ từ Mehico, Goatemala và từ trung tâm khởi nguyên Đông Nam Á. Có hai nhóm ớt phổ biến là ớt cay (Capsicum frutescens L.) và ớt ngọt (Capsicum annuum L.). Trong nhóm cây trồng thuộc họ cà (Solanaceae), cây ớt có tầm quan trọng thứ hai chỉ sau cây cà chua. Ngày nay, ớt được trồng rộng rãi trên toàn thế giới từ 55 o vĩ độ bắc đến 55 o vĩ độ nam đặc biệt là ở các nước châu Mỹ và một số nước châu Á như Trung Quốc, Ấn Độ, Thái Lan, Hàn Quốc, Indonesia, Việt Nam, Malaysia. Đồng bằng sông Hồng (ĐBSH) là một trong những vùng sản xuất ớt hàng hóa tập trung lớn của nước ta. Theo Tổng cục thống kê, đến năm 2017 diện tích trồng ớt của ĐBSH đạt 5.049 ha và sản lượng là 79.640 tấn. Hiện nay, cây ớt được xem là một trong những cây trồng quan trọng, mang lại hiệu hiệu quả kinh tế cao cho người sản xuất. Cũng như nhiều cây trồng khác, cây ớt bị tấn công bởi nhiều dịch hại. Trong số các dịch hại ớt, nấm Colletotrichum spp. (gây bệnh thán thư) được xem là nguy hiểm nhất (Than et al., 2008a). Tại Hàn Quốc, Ấn Độ, Thái Lan bệnh làm giảm từ 10 - 80% năng suất, cá biệt tại bang Ohio, Mỹ bệnh đã làm giảm gần 100% năng suất của cây ớt (Kumar, 2014; Sheu, 2013; Than et al., 2008a). Tại Việt Nam, tất cả các vùng trồng ớt tập trung như Hải Phòng, Hải Dương, Hưng Yên, Thái Bình, Nghệ An, Thanh Hóa, Quảng Bình, Quảng Trị, Thừa Thiên Huế ... đều bị bệnh thán thư phá hại nặng. Cho tới năm 2008, thành phần loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt công bố trên thế giới khá đa dạng, bao gồm ít nhất 7 loài C. gloeosporioides, C. capsici, C. acutatum, C. coccodes, C. dematium, C. nigrum và C. atramentarium. Thành phần loài Colletotrichum gây bệnh thán thư trên cây ớt ở các quốc gia, các vùng khác nhau là khác nhau. Đến nay, đã có nhiều kết quả nghiên cứu về các loài được ghi nhận song vẫn còn nhiều điều cần được nghiên cứu thêm về quá trình lây bệnh và về mối quan hệ phức hợp giữa các loài (Than et al., 2008a). Tại Việt Nam, trước khi thực hiện đề tài này, ít nhất 4 loài là C. acutatum, C. capsici, C. gloeosporioides, C. nigrum đã được công bố gây bênh thán thư ớt (Don et al., 2007; Ngô Bích Hảo, 1991, 1992). Việc định danh nấm Colletotrichum hại ớt (cũng như các loài Colletotrichum khác) dựa vào đặc điểm hình thái (màu sắc, tốc độ phát triển và cấu trúc tản nấm; hình dạng, kích thước bào tử phân sinh, đĩa áp ...) đã có quá nhiều nhầm lẫn. Nguyên nhân là do đặc điểm hình thái của các loài Colletotrichum có sự phụ thuộc cao vào điều kiện môi trường (Hyde et al., 2009a). Theo Weir et al. (2012) và Damm et al. (2012a) C. gloeosporioides và C. acutatum thực chất là các phức hợp loài, trong đó C. gloeosporioides gồm ít nhất 23 loài khác nhau và C. acutatum gồm ít nhất 31 loài khác nhau. Đối với nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư trên ớt, các nghiên cứu phân loại mới gần đây, dựa trên phân tích phân tử, cho thấy đã có thay đổi lớn về thành phần loài so với công bố trước đây. Tại Ấn Độ, định danh lại 52 mẫu nấm C. gloeosporioides sensu lato (s.l) cho thấy chúng thuộc 2 loài là C. fructicola và C. siamense (Sharma & Shenoy, 2013). Tại Thái Lan, 4 loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt đã được xác định là C. gloeosporioides sensu stricto (s.s), C. siamense, C. acutatum và C. truncatum (Suwannarat et al., 2017). Tại Trung Quốc, phân tích trình tự của các mẫu nấm Colletotrichum thu tại 29 tỉnh đã xác định được 15 loài trong đó có 5 loài phổ biến là C. fioriniae, C. fructicola, C. gloeosporioides s.s, C. scovillei và C. truncatum (Diao et al., 2017). Tại Úc, 5 loài C. siamense, C. simmondsii, C. queenslandicum, C. truncatum và C. cairnsense đã được xác định gây bệnh thán thư ớt (De Silva et al., 2017a). Xác định chính xác thành phần cũng như định danh đúng nấm Colltetotrichum có vai trò quan trọng không những về mặt khoa học mà còn trong thực tiễn quản lý bệnh vì quan hệ giữa nấm với cây ký chủ cũng như tính mẫn cảm với thuốc hóa học khác nhau theo loài. Kim et al. (2004) đã cho thấy C. acutatum và C. gloeosporioides có thể nhiễm trên quả ớt ở mọi giai đoạn phát triển quả nhưng thường không gây bệnh trên lá và thân. Trái lại C. coccodes và C. dematium gây hại chủ yếu trên lá và thân cây ớt, đặc biệt cây con. Các loài Colltetotrichum cũng có tính gây bệnh khác nhau theo giai đoạn phát triển của quả ớt. Chẳng hạn, C. capsici gây hại phổ biến trên quả ớt đã chín đỏ, trong khi C. acutatum và C. gloeosporioides gây hại phổ biến trên cả quả ớt xanh và chín (Hong & Hwang, 1998; Kim et al., 1999). Các loài Colletotrichum có thể tồn tại ngoài tự nhiên dưới dạng các kiểu gây bệnh và chúng có tính gây bệnh khác nhau trên ớt. Hiện tại, việc phòng trừ bệnh thán thư hại ớt ngoài sản xuất chủ yếu được thực hiện bằng thuốc hóa học và chưa thu được hiệu quả như mong muốn. Nguyên nhân chủ yếu là: (i) thiếu thông tin đầy đủ, cập nhật và chính xác về thành phần loài Colletotrichum gây bệnh, đặc biệt khi các tiêu chí phân loại chi nấm này đang thay đổi nhanh chóng; (ii) thiếu thông tin về các đặc điểm sinh học của các loài/ kiểu gây bệnh của nấm Colletotrichum phổ biến nhất, trong đó quan trọng là tính gây bệnh trên các giống ớt và phản ứng với các thuốc trừ nấm khác nhau. Việc xác định các thông tin trên có vai trò quan trọng vì nó sẽ là cơ sở khoa học chủ yếu để đề xuất các biện pháp kỹ thuật nhằm phòng chống hiệu quả bệnh thán thư hại ớt tại Việt Nam. 1.2. MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI 1.2.1. Mục tiêu tổng quát Xác định được thành phần loài cũng như đánh giá được một số đặc điểm sinh học chủ yếu của nấm Colletotrichum hại ớt tại ĐBSH. 1.2.2. Mục tiêu cụ thể - Đánh giá được hiện trạng gây hại của bệnh thán thư ớt tại ĐBSH. - Xác định được thành phần, mức độ phổ biến và phương pháp chẩn đoán nhanh các loài nấm Colletotrichum chính hại ớt tại ĐBSH. - Xác định được tính gây bệnh của các loài nấm Colletotrichum chính phát hiện được trên cây ớt tại ĐBSH. - Đánh giá được hiệu lực của một số thuốc hóa học, vi khuẩn đối kháng và dịch chiết địa y đối với các loài Colletotrichum chính phát hiện được trong điều kiện in vitro.
HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM NGUYỄN DUY HƯNG NGHIÊN CỨU THÀNH PHẦN LỒI, TÍNH GÂY BỆNH VÀ KHẢ NĂNG PHÒNG CHỐNG NẤM Colletotrichum spp GÂY BỆNH THÁN THƯ ỚT TẠI ĐỒNG BẰNG SÔNG HỒNG LUẬN ÁN TIẾN SĨ NHÀ XUẤT BẢN HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP - 2020 MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục từ viết tắt vi Danh mục bảng vii Danh mục hình x Trích yếu luận án xii Thesis abstract xiv PHẦN MỞ ĐẦU 1.1 Tính cấp thiết đề tài 1.2 Mục tiêu nghiên cứu đề tài 1.3 Đối tượng phạm vi nghiên cứu 1.4 Những đóng góp đề tài 1.5 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài PHẦN TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Nguồn gốc, tình hình sản xuất ớt giới Việt Nam 2.1.1 Lược sử ớt 2.1.2 Tình hình sản xuất ớt giới 2.1.3 Tình hình sản xuất ớt Việt Nam 2.2 Nghiên cứu bệnh thán thư hại ớt giới 2.2.1 Tầm quan trọng bệnh thán thư 2.2.2 Phân loại nấm Colletotrichum 10 2.2.3 Thành phần nấm Colletotrichum gây hại ớt 13 2.2.4 Một số lồi nấm Colletotrichum gây hại ớt 15 2.2.5 Xâm nhiễm gây bệnh nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt 22 2.2.6 Khả truyền qua hạt ớt nấm Colletotrichum 24 2.2.7 Đặc điểm sinh thái nấm Colletotrichum gây bệnh ớt 25 2.3 Phòng chống nấm Colletotrichum ớt 26 2.3.1 Biện pháp canh tác 26 2.3.2 Biện pháp sử dụng giống chống chịu bệnh 26 2.3.3 Biện pháp hóa học 27 iii 2.3.4 Biện pháp sinh học 28 2.4 Những nghiên cứu bệnh thán thư hại ớt Việt Nam 30 PHẦN VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 33 3.1 Vật liệu, địa điểm thời gian nghiên cứu 33 3.1.1 Vật liệu nghiên cứu 33 3.1.2 Địa điểm thời gian nghiên cứu 34 3.2 Nội dung nghiên cứu 35 3.2.1 Điều tra đánh giá tác hại thu thập mẫu bệnh thán thư ớt 35 3.2.2 Xác định thành phần loài nấm Colletotrichum hại ớt đồng sông Hồng số tỉnh 3.2.3 35 Nghiên cứu số đặc điểm sinh học, tính gây bệnh lồi nấm Colletotrichum phát 3.2.4 35 Đánh giá hiệu lực số thuốc hóa học, vi khuẩn đối kháng Bacillus spp dịch chiết địa y với lồi nấm Colletotrichum phát điều kiện in vitro 36 3.3 Phương pháp nghiên cứu 36 3.3.1 Phương pháp điều tra, thu thập mẫu bệnh thán thư 36 3.3.2 Phương pháp xác định thành phần loài nấm Colletotrichum hại ớt 38 3.3.3 Phương pháp nghiên cứu đặc điểm hình thái, sinh học, tính gây bệnh lồi Colletotrichum 3.3.4 41 Phương pháp đánh giá hiệu lực ức chế nấm Colletotrichum số loại thuốc hóa học, dịch chiết địa y vi khuẩn đối kháng điều kiện 3.5 in vitro 46 Phương pháp tính tốn xử lý số liệu 49 PHẦN KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 4.1 Điều tra đánh giá tác hại thu thập mẫu bệnh thán thư ớt 51 4.1.1 Mức độ phổ biến bệnh thán thư hại ớt đồng sông Hồng 51 4.1.2 Kết điều tra thực trạng bệnh thán thư hại ớt điểm thu thập mẫu 52 4.1.3 Kết thu thập mẫu bệnh thán thư ớt 56 4.1.4 Đặc điểm hình thái mẫu nấm gây bệnh thán thư ớt 57 4.2 Xác định thành phần loài nấm Colletotrichum hại ớt đồng sông Hồng số tỉnh 4.2.1 59 Định danh nấm dựa giải trình tự gen mẫu nấm đại diện thuộc nhóm hình thái xác định 59 iv 4.2.2 Tổng kết thành phần loài Colletotricum phát ớt đồng sông Hồng số tỉnh 4.2.3 70 Phát triển kỹ thuật PCR chẩn đốn nhanh lồi nấm Colletotrichum gây hại ớt 4.2.4 72 Xác định thành phần, mức độ phân bố đa dạng loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt đồng sông Hồng số tỉnh PCR 4.3 Đặc điểm sinh học, tính gây bệnh loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt thu thập 4.3.1 89 Ảnh hưởng môi trường dinh dưỡng đến khả sinh trưởng loài nấm Colletotrichum 4.3.2 89 Ảnh hưởng nhiệt độ đến khả sinh trưởng loài nấm Colletotrichum môi trường PDA 4.3.3 93 Ảnh hưởng pH đến khả sinh trưởng loài nấm Colletotrichum mơi trường PDA 4.3.4 Tính gây bệnh loài Colletotrichum thu thập 4.3.5 Xác định khả tồn bào tử loài nấm C siamense C truncatum ớt 4.4 84 97 101 111 Đánh giá hiệu lực số loại thuốc hóa học, vi khuẩn đối kháng Bacillus spp dịch chiết địa y với loài nấm Colletotrichum phát điều kiện in vitro 4.4.1 114 Ảnh hưởng số thuốc hóa học đến khả sinh trưởng, phát triển loài nấm Colletotrichum phát điều kiện in vitro 4.4.2 Ảnh hưởng số mẫu vi khuẩn đối kháng Bacillus spp đến sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường PDA 4.4.3 115 136 Ảnh hưởng số dịch chiết địa y đến khả sinh trưởng nấm C siamense C truncatum môi trường PDA 140 PHẦN KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 143 5.1 Kết luận 143 5.2 Kiến nghị 145 Danh mục cơng trình công bố 146 Tài liệu tham khảo 147 Phụ lục 162 v DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT Chữ viết tắt Chữ viết đầy đủ bp Base pair (Cặp bazơ) BVTV Bảo vệ thực vật C Colletotrichum CBTB Cấp bệnh trung bình CRD Completely randomized design (Thiết kế hồn tồn ngẫu nhiên) CSB Chỉ số bệnh CT Công thức CTAB cetyltrimethylammonium bromide ĐBSH Đồng sông Hồng DNA Deoxyrobonucleic acid FAO Food and agriculture organization (Tổ chức Nông nghiệp Lương thực Liên hiệp Quốc) Hecta ITS Internal transcribed spacer kb Kilo base PCA Potato Carrot Agar PCR Polymerase chain reaction (Phản ứng chuỗi trùng hợp) PDA Potato Glucose Agar QCVN Quy chuẩn kỹ thuật Quốc gia s.l sensu lato = phức hợp loài s.s sensu stricto = loài TT Số thứ tự TLB Tỷ lệ bệnh WA Water agar µl Microliter vi DANH MỤC BẢNG TT Tên bảng Trang 2.1 Diện tích, suất sản lượng ớt giới (năm 2009 - 2018) 2.2 Diện tích, suất sản lượng ớt Việt Nam (năm 2009 - 2017) 2.3 Thành phần loài Colletotrichum ớt số quốc gia 14 3.1 Các mồi sử dụng định danh phân tử nấm Colletotrichum 38 4.1 Mức độ phổ biến bệnh thán thư hại ớt đồng sông Hồng vụ xuân hè từ năm 2015 - 2017 4.2 52 Mức độ phổ biến bệnh thán thư hại ớt đồng sông Hồng vụ thu đông từ năm 2015 - 2017 52 4.3 Tình hình bệnh thán thư hại ớt số tỉnh năm 2015 54 4.4 Tình hình bệnh thán thư hại ớt số tỉnh năm 2016 55 4.5 Tình hình bệnh thán thư hại ớt số tỉnh năm 2017 55 4.6 Triệu chứng mẫu bệnh thán thư thu thập địa điểm 56 4.7 Đặc điểm hình thái mẫu nấm thán thư hại ớt thu thập 58 4.8 Kết tìm kiếm Ngân hàng gen 10 mẫu nấm Colletotrichum dựa trình tự vùng ITS 4.9 60 Mức đồng trình tự vùng ITS 10 mẫu Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt thu Việt Nam với loài thuộc phức hợp loài C gloeosporioides s.l lồi cơng bố gây bệnh thán thư ớt 61 4.10 Kết tìm kiếm GenBank mẫu nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt dựa trình tự vùng ApMat 65 4.11 Mức đồng trình tự vùng ApMat mẫu Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt thu đồng sông Hồng số tỉnh với loài thuộc phức hợp loài C gloeosporioides s.l 67 4.12 Vùng thiết kế mồi phát loài C truncatum dựa trình tự ITS lồi Colletotrichum công bố gây bệnh thán thư ớt 73 4.13 Vùng thiết kế mồi phát loài C gloeosporioides s.s dựa trình tự ApMat phức hợp loài C gloeosporioides s.l 74 4.14 Vùng thiết kế mồi phát lồi C siamense dựa trình tự ApMat phức hợp loài C gloeosporioides s.l vii 75 4.15 Vùng thiết kế mồi phát loài C fructicola dựa trình tự ApMat phức hợp lồi C gloeosporioides s.l 76 4.16 Đặc điểm cặp mồi thiết kế nhằm phát C truncatum, C fructicola, C siamense C gloeosporioides s.s 78 4.17 Xác định nhiệt độ gắn mồi phù hợp cặp mồi thiết kế 80 4.18 Kết PCR so sánh hai phương pháp chiết DNA mẫu nấm 83 4.19 Phát loài Colletetotrichum gây bệnh thán thư ớt thu thập PCR 85 4.20 Phân bố mẫu nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt thu thập đồng sông Hồng số tỉnh 87 4.21 Khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường dinh dưỡng 92 4.22 Ảnh hưởng nhiệt độ đến khả sinh trưởng loài Colletotrichum 96 4.23 Ảnh hưởng pH mơi trường đến sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum 100 4.24 Kết lây nhiễm nhân tạo loài nấm Colletotrichum số giống ớt 106 4.25 Kết lây nhiễm loài nấm Colletotrichum số ký chủ hay nhiễm bệnh thán thư 109 4.26 Khả tồn nấm C siamense C truncatum ớt sau lây nhiễm nhân tạo phương pháp gây tổn thương 111 4.27 Ảnh hưởng thuốc Azony 25SC đến khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường PDA 118 4.28 Ảnh hưởng thuốc Azony 25SC đến khả nảy mầm bào tử loài nấm Colletotrichum 120 4.29 Ảnh hưởng thuốc Antracol 70WP đến khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường PDA 123 4.30 Ảnh hưởng thuốc Antracol 70WP đến khả nảy mầm bào tử loài nấm Colletotrichum 126 4.31 Ảnh hưởng thuốc Tiptop 250EC đến khả sinh trưởng loài nấm Colletotrichum môi trường PDA 128 4.32 Ảnh hưởng thuốc Tiptop 250EC đến khả nảy mầm bào tử loài nấm Colletotrichum 131 viii 4.33 Ảnh hưởng thuốc Score 250EC đến khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường PDA 133 4.34 Ảnh hưởng thuốc Score 250EC đến khả nảy mầm bào tử loài nấm Colletotrichum 135 4.35 Ảnh hưởng số mẫu vi khuẩn đối kháng đến khả sinh trưởng loài nấm Colletotrichum môi trường PDA 138 4.36 Ảnh hưởng số dịch chiết địa y đến khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường PDA ix 140 DANH MỤC HÌNH TT 2.1 Tên hình Trang Cây phân loại lồi nấm Colletotrichum dựa phân tích trình tự chuỗi gen CHS-1 (251 bp), ACT (305 bp), TUB2 (545 bp) ITS (599 bp) với nhóm (clade) rõ màu khác 12 2.2 Đặc điểm hình thái nấm C truncatum 15 2.3 Phức hợp loài C gloeosporioides s.l gồm 23 loài 16 2.4 Đặc điểm hình thái nấm C siamense 18 2.5 Đặc điểm hình thái nấm C fructicola 19 2.6 Đặc điểm hình thái nấm C aeschynomenes 20 2.7 Đặc điểm hình thái nấm C acutatum s.s: mẫu chuẩn (BRIP 52652) 21 2.8 Đặc điểm hình thái nấm C acutatum s.s: mẫu chuẩn (CBS 112996) 22 2.9 Quá trình xâm nhiễm gây bệnh nấm Colletotrichum 23 2.10 Cách xâm nhiễm gây bệnh nấm Colletotrichum cách hình thành sợi nấm biểu bì 24 2.11 Nấm C capsici hình thành tiền đĩa cành 25 3.1 Kỹ thuật cấy lam để quan sát hình thái đĩa áp nấm Colletotrichum 42 4.1 Số lượng mẫu bệnh thán thư ớt thu thập địa điểm từ 2015 - 2017 56 4.2 Triệu chứng bệnh thán thư điển hình nấm Colletotrichum spp gây hại ớt 4.3 57 Đặc điểm bào tử phân sinh (a, b, c) đĩa áp (d, e, f) nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt đồng sông Hồng Đại diện nhóm hình thái C4 (a,d); C29 (b,e) C25 (c,f) 4.4 59 Phân tích phả hệ dựa trình tự vùng ITS mẫu nấm Colletotrichum thuộc phức hợp loài C gloeosporioides s.l lồi cơng bố gây bệnh thán thư ớt 4.5 Phân tích phả hệ dựa trình tự vùng ApMat mẫu nấm Colletotrichum thuộc phức hợp loài C gloeosporioides s.l 4.6 64 69 Đặc điểm hình thái loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt xác định đồng sông Hồng số tỉnh x 72 4.7 PCR xác định nhiệt độ gắn mồi phù hợp cho cặp mồi đặc hiệu Colletotrichum 4.8 81 Phản ứng PCR so sánh phương pháp chiết DNA (CTAB NaOH) từ nấm Colletotrichum với cặp mồi đặc hiệu 4.9 Phân bố loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt từ tất địa điểm (A) tỉnh đồng sông Hồng (B) 4.10 87 Khả sinh trưởng loài Colletotrichum môi trường dinh dưỡng 4.11 83 93 Khả sinh trưởng loài Colletotrichum điều kiện nhiệt độ khác 97 4.12 Khả sinh trưởng loài Colletotrichum mức pH khác 101 4.13 Lây bệnh nhân tạo loài nấm Colletotrichum số giống ớt 105 4.14 Lây bệnh nhân tạo loài Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt chín số loại ký chủ hay nhiễm bệnh thán thư 4.15 Lây nhiễm nhân tạo bào tử nấm C siamense C truncatum ớt giống Demon phương pháp gây tổn thương 4.16 134 Khả đối kháng mẫu vi khuẩn HT1 N2 loài nấm Colletotrichum 4.22 129 Khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường dinh dưỡng chứa thuốc Score 250EC nồng độ khác 4.21 124 Khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường dinh dưỡng chứa thuốc Tiptop 250EC nồng độ khác 4.20 119 Khả sinh trưởng loài nấm Colletotrichum môi trường dinh dưỡng chứa thuốc Antracol 70WP nồng độ khác 4.19 114 Khả sinh trưởng lồi nấm Colletotrichum mơi trường dinh dưỡng chứa thuốc Azony 25SC nồng độ khác 4.18 112 Đặc điểm bào tử nấm C siamense C truncatum bề mặt ớt giống Demon lây nhiễm phương pháp gây tổn thương 4.17 110 139 Khả ức chế sinh trưởng dịch chiết địa y số loài nấm Colletotrichum 141 xi Hình thái Mẫu nấm Địa điểm thu thập 22 C23 23 C24 24 C25 25 C26 26 C27 27 C28 28 C29 29 C30 30 C31 31 C32 Nhân Hưng, Lý Nhân, Hà Nam Dạ Trạch, Khoái Châu, Hưng Yên Văn Đức, Gia Lâm, Hà Nội Hoàn Long, Yên Mỹ, Hưng Yên Nhân Hưng, Lý Nhân, Hà Nam Thanh Ninh, Phú Bình, Thái Nguyên Thanh Ninh, Phú Bình, Thái Nguyên Vân Nội, Đông Anh, Hà Nội Nhân Hưng, Lý Nhân, Hà Nam Thị trấn Nông trường, Mộc Châu, Sơn La TT Bào tử phân sinh Hình dạng Kích thước (dài x rộng, µm) 167 Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Lưỡi liềm 11,1 ± 1,0 × 4,5 ± 0,6 Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới trịn Lưỡi liềm 11,0 ± 1,1 × 4,3 ± 0,4 Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới trịn 10,7 ± 1,1 × 4,1 ± 0,7 12,6 ± 0,9 × 3,8 ± 0,5 21,5 ± 1,2 ×3,5 ± 0,6 11,6 ± 1,2 × 4,7 ± 0,5 10,7 ± 0,9 × 4,5 ± 0,6 11,9 ± 1,1 × 4,6 ± 0,4 21,9 ± 1,0 × 3,7 ± 0,4 11,8 ± 1,3 × 4,7 ± 0,5 Đĩa áp Màu sắc, hình dạng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số chẻ thùy Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Kớch thc (àm) Nhúm hỡnh thỏi 7,4 0,9 ì 4,8 ± 0,4 I 8,8 ± 1,2 × 4,9 ± 0,4 I 11,7 ± 1,4 × 6,3 ± 1,0 7,3 ± 1,0 × 4,8 ± 0,8 III 8,6 ± 1,1 × 5,1 ± 0,7 I 8,3 ± 1,2 × 4,7 ± 0,5 I 9,7 ± 1,4 × 5,7 ± 0,6 II 8,1 ± 1,3 × 5,3 ± 0,7 III 6,9 ± 0,8 × 5,2 ± 0,5 I 8,0 ± 1,2 × 5,8 ± 0,6 I I Hình thái TT Mẫu nấm Địa điểm thu thập Bào tử phân sinh Hình dạng Kích thước (dài x rộng, µm) Đĩa áp Màu sắc, hình dạng Kích thước (µm) Nhóm hình thái 168 32 C33 Đông Sang, Mộc Châu, Sơn La Trụ, hai đầu tù tới trịn 11,9 ± 1,0 × 4,5 ± 0,7 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng 8,2 ± 1,0 × 5,3 ± 0,6 I 33 C34 I 8,3 ± 1,2 × 5,2 ± 0,6 III 35 C36 11,5 ± 1,1 × 4,8 ± 0,5 8,6 ± 1,2 × 4,9 ± 0,7 I 36 C37 8,8 ± 1,3 × 5,4 ± 0,5 I 37 C38 8,4 ± 1,1 × 5,1 ± 0,6 I 38 C39 8,6 ± 1,1 × 5,3 ± 0,4 I 39 C40 8,8 ± 1,2 × 4,8 ± 0,4 I 40 C41 7,7 ± 0,9 × 4,6 ± 0,5 I 41 C42 7,0 ± 0,6 × 4,7 ± 0,6 I 42 C43 Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng 7,6 ± 0,9 × 6,2 ± 0,5 C35 Trụ, hai đầu tù tới trịn Lưỡi liềm 12,2 ± 1,1 × 4,7 ± 0,5 34 Đông Sang, Mộc Châu, Sơn La Long Thành, Long Định, Tiền Giang Long Thành, Long Định, Tiền Giang Nhân Hưng, Lý Nhân, Hà Nam Mỹ Tiến, Mỹ Lộc, Nam Định Mỹ Tân, Mỹ Lộc, Nam Định Hợp Đức, Tân Yên, Bắc Giang Hợp Đức, Tân Yên, Bắc Giang Song Vân, Tân Yên, Bắc Giang Song Vân, Tân Yên, Bắc Giang 7,7 ± 1,1 × 5,6 ± 0,7 I 22,4 ± 1,4 × 3,9 ± 0,5 10,8 ± 0,9 × 4,6 ± 0,4 10,4 ± 1,1 × 4,8 ± 0,6 11,4 ± 1,2 × 3,8 ± 0,5 10,7 ± 1,1 × 4,9 ± 0,5 11,2 ± 1,1 × 4,7 ± 0,5 12,6 ± 1,2 × 3,6 ± 0,5 11,9 ± 1,1 × 4,1 ± 0,4 Hình thái Mẫu nấm Địa điểm thu thập 43 C44 C45 45 C46 46 C47 47 C48 Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Lưỡi liềm 11,0 ± 1,1 × 3,4 ± 0,2 44 48 C50 C51 50 C52 Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn Trụ, hai đầu tù tới tròn 10,8 ± 0,8 × 4,8 ± 0,4 49 Cổ Bi, Gia Lâm, Hà Nội Cổ Bi, Gia Lâm, Hà Nội Khánh Vân, Yên Khánh, Ninh Bình Khánh Vân, Yên Khánh, Ninh Bình Văn Đức, Gia Lâm, Hà Nội Việt Hồng, Thanh Hà, Hải Dương Thanh Hải, Thanh Hà, Hải Dương Kim Tân, Kim Thành, Hải Dương 51 C53 Lưỡi liềm 21,7 ± 1,2 × 4,1 ± 0,3 52 C54 Kim Tân, Kim Thành, Hải Dương Hoàng Hanh, Ninh Giang, Hải Dương TT Bào tử phân sinh Hình dạng 169 Trụ, hai đầu tù tới trịn Đĩa áp Kích thước (µm) Nhóm hình thái Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng 7,3 ± 1,0 × 4,8 ± 0,8 I 6,6 ± 0,6 × 5,4 ± 1,3 I 7,1 ± 0,9 × 5,1 ± 0,8 I 7,9 ± 1,2 × 5,6 ± 0,5 I 11,7 ± 2,2 × 6,3 ± 1,0 8,3 ± 1,1 × 5,8 ± 0,6 III 7,9 ± 0,8 × 5,5 ± 0,7 I 7,4 ± 0,6 × 5,7 ± 0,5 I Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng 12,1 ± 1,3 × 4,4 ± 0,5 Màu nâu đến nâu đậm; hình trứng, tày, elip tới gần hình thoi, số có hình dạng khơng 9,7 ± 0,8 × 5,6 ± 0,4 III 8,1 ± 1,2 × 5,1 ± 0,7 I Kích thước (di x rng, àm) 12,3 1,3 ì 3,6 0,4 11,9 ± 1,2 × 3,9 ± 0,6 11,2 ± 1,1 × 4,6 ± 0,5 22,4 ± 1,2 × 3,6 ± 0,6 11,3 ± 1,2 × 4,5 ± 0,4 11,9 ± 1,1 × 4,1 ± 0,6 Màu sắc, hình dạng I PHỤ LỤC HÌNH ẢNH CÁC SẢN PHẨM PCR Sản phẩm PCR 10 mẫu nấm Colletotrichum cặp mồi ITS Sản phẩm PCR mẫu nấm Colletotrichum cặp mồi ApMat Sản phẩm PCR tối ưu phương pháp chiết DNA mẫu nấm Colletotrichum 170 Sản phẩm PCR tối ưu nhiệt độ gắn mồi cho cặp mồi tự thiết kế phục vụ chẩn đoán loài nấm Colletotrichum 171 Sản phẩm PCR xác định thành phần loài Colletotrichum cặp mồi đặc hiệu tự thiết kế 172 173 PHỤ LỤC TRÌNH TỰ ĐOẠN ĐỌC ĐƯỢC CỦA CÁC MẪU NẤM Giải trình tự vùng gen ITS 10 mẫu nấm C1-17B4ZAB008 - (548 nts) TTGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCT C4-17B4ZAB009 - (529 nts) AAAAAAAAACAACAAACAACAAGACCAAATGGAAGTAAAAGTCGTAACAA GGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGATCATTACTGAGTTTACGCTATACA ACCCTTTGTGGACATACCTATAACTGTTGCTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGTG ACCCTCCCGGCCTCCCGCCCCCGGGCGGGTCGGCGCCCGCCGGAGGATAAC CAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGAGTGGTACAAGCAAATAATCAAA ACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAA ATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGA ACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCAT TTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACACGCTGATGTAGGCC CTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTAC GTCTCGCACTGGGA C6-17B4ZAB010 - (548 nts) TTGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCT 174 C9-17B4ZAB011 - (547 nts) TTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGTGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCAATTTCCAAAGGTGACCT C14-17B4ZAB012 (549) TTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCTC C25-17B4ZAB013 - (556 nts) TTGGAAGGTAAAAAGTGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTACCGCTCATCAACCCTTTGTGAACATACCTTAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGCGTCCCCTGAAAAGGACGTCTCCCGGCCCTCTCCCGTC CGCGGGTGGGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTT TCTTCTGAGTGACACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTG GTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTG CAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCAT TCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGG TGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCT CGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGA CTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTGACCTC 175 C26-17B4ZAB014 - (560 nts) TTGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGAT CATTACTGAGTTTACGCTCTACAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTA C29-17B4ZAB015 - (563 nts) TTTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTTACGCTCTATAACCCTTTGTGAACATACCTATAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCCTCCGGGCGGG TCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTGA GTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGC ATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTC AGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCGG GCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGG CCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCC TCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGC CGTAAAACCCCCCAATTTCCAAAGGTGACCTCGGATCAGGTAGAT C30-17B4ZAB016 - (556 nts) TTGGAAGTAAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTACCGCTCATCAACCCTTTGTGAACATACCTTAACTGTTG CTTCGGCGGGTAGGCGTCCCCTAAAAAGGACGTCTCCCGGCCCTCTCCCGTC CGCGGGTGGGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTT TCTTCTGAGTGACACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTG GTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTG CAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCAT TCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGG TGTTGGGGCTCTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCT CGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCATTGGGATTCGGAGGGA CTCTAGCCGTAAAACCCCCAATTTTACTAAGGTGACCTC 176 C33-17B4ZAB017 - (551 nts) TTTGGAAGTAAAAATCGTAACAAGGTCTCCGTTGGTGAACCAGCGGAGGGA TCATTACTGAGTTTACGCTCTACAACCCTTTGTGGACATACCTATAACTGTT GCTTCGGCGGGTAGGGTCTCCGTGACCCTCCCGGCCTCCCGCCCCCGGGCGG GTCGGCGCCCGCCGGAGGATAACCAAACTCTGATTTAACGACGTTTCTTCTG AGTGGTACAAGCAAATAATCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGG CATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATT CAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGCATTCTGGCG GGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGG GCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGC CTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTG CCGTAAAACCCCCAATTTCCAAAGGTGACCTCGG Giải trình tự vùng gen ApMat C1-19D5ZAA000/19D5ZAA001 - (915 nts) ACAAGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCTCGCAAG CCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGACCAG CTTAGCAGCGTCGATGAGGTAGAGGCCGCCTCCTACCCGAGAGCGACAAAA CCATCAGCGCGCCCACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTATACC TACCGACTGCGACAAGTCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGAATAGATAT CGGCGCTGCCAAACGACTTTAGGTCGTCCTTGTGTTCTAGACTGGCAGCATC AGCGACCAGAGGAGCCTCAGAACATGGCGCCTTTGGAGGCTGTCTTCGATC TCTATCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACGCATCTGTTCGTCGATTC ACTTCCCGCATGCTGTGGCAAGAGTTACCTGCGCGAGAAACCAACAGACCT TTGTGCGGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGAG GAACCAAGAATCATCCTGGACCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAGCAGAG ATCTTCGATTTGATGAACATATTGGTGCAAAAATGTACTCACAACCCATGTA TTCGCATGTCAAGCGAATACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCC AGTAAATATCATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGAGTGTC TTTTGGCCCCCGCCGTGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTTCGCC ACTGCAGACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACTGCGC ATCACGGGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAA CGTCCCGCACCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGGCTCCC 177 C4-19D5ZAA002/19D5ZAA003 – (919 nts) GCACAAGGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCACGC AAGCCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGGC CAGCTTAGCAGCGTCAATGAGGTAGAGGCCGCCTTCTACCCAAGAGCGACA ACACCATCAGCGCGCCGACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTAT ACCTACCGACTGCGATGAGTCGCTGTAGCATCTGCCACGAAATGGAACTGA TATCGGCGCTGCCAGACGACCTAAGGTTGTCTTTGTGTCCTAGAATGGCAGC ATTAGCGACCAGAGGAGCCTAAGAATGTGGCGCCTTTGGCGGCTGTCTTCG ATCTCCATCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACACATCTGGCCATCG ATTCCCTTCCCGCATGCTGCAGCAAGAGTTACCCTGCGCCAGAAACCAACA GACCTTTGTGCGGCGATACTTAGGCGTACGAATGCAAGGAGATCGCCGGAT CTGAGGAACCAAGAATCATCCTGGCCCATCTGCTTCGCTGGCAACGCGAAC CAGAGATCTTCGATTTAATGAACATATTGGTGGTAAAATGTACTCACAACCC ATGTATTCGCATATTCAGAGCGAACCCGAGTCTTTTTCTGTAATTATAATCT GCAAGCCAGTAAATATTATCTTCATAGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTA AAGTGTCTTTTTCCCCCACCATGGGGACTATTCATTCGCCCATATCATGCTCT TCGCCACTGCGGACTGCCAACACCATCCACGATACACAGCCGCTGTCACGA CTGCGCATCACGGGAGTAACTAGGTCTGATCTTTCTTCCAGTCGCTGCTCCA GATGAACGTCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCC C6-19D5ZAA004/19D5ZAA005 – (910 nts) AGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCTCGCAAGCCGTC TGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGACCAGCTTAG CAGCGTCGATGAGGTAGAGGCCGCCTCCTACCCGAGAGCGACAAAACCATC AGCGCGCCCACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTATACCTACCG ACTGCGACAAGTCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGAATAGATATCGGCG CTGCCAAACGACTTTAGGTCGTCCTTGTGTTCTCGACTGGCAGCATCAGCGA CCAGAGGAGCCTCAGAACATGGCGCCTTTGGAGGCTGTCTTCGATCTCTATC CAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACGCATCTGTTCGTCGATTCACTTCC CGCATGCTGTGGCAAGAGTTACCTGCGCGAGAAACCAACAGACCTTTGTGC GGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGAGGAACCA AGAATCATCCTGGACCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAGCAGAGATCTTC GATTTGATGAACATATTGGTGCAAAAATGTACTCACAACCCATGTATTCGCA TGTCAAGCGAATACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCCAGTAAA TATCATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGAGTGTCTTTTGG CCCCCGCCGTGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTTCGCCACTGCA GACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACTGCGCATCACG GGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAACGTCCC GCACCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGGCTCCC 178 C9-19D5ZAA006/19D5ZAA007 - (894 nts) CACAAGGAGCGCCTCCTGATGATGTACCCCGACTACCGTTACACCCCACGC AAGCCGTCTGAGAAGCGTCATCGAAAGCCCAGTGGCCAAAGCAAGAAGGC CAGCTTAGCAGCGTCGATGAGGTAGAGGTCGTCTCCTACCCGAGAGCGACG ACACCATCAGCGCGCCGACTTGTCAGCTCAAGACGGAGGAGTATGAGTTAC ACCTACCGACTGCGACAAGTCGCTGTAGCATCAGCAACGAATTGGAACCGA TATCGGCGCTGCCAGACCACCTTAGGTTGTCTTTGTGCCCTTGACTGGCAGC ATCAGCGACCAGGGAAGCCTAAGAATATGGCGCCTTTGTGCAGCTGTCTTC GATCTCTATCCAGTCAGCGTGGCCAAGCAGGCACCCATGCATCTGGTCATA GATTCCCTTCTTATATGCTGCGGCAAGAGTTACCCTGCGCCGGAAACCAACA GACCTTTGTGCGGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGAT CTGACGAACCAAGAATCATCCTGGCCCATCTGCTTCGATGGCTACGCGAAC CAGAGATCTTCGATTCGATGAACTTATTGGTAGAAAAATGTACTACTACTGT ACTCACAACCCATATATTCGCATGTTCAAAGCGAACACGTACCTTTTTCTGT AATTATAATCTGCAAGCCAGTAAATATCATCTTCATAGACCATCTATTCCAG ACCGATACCTAGAGTGTCATTTCTTTTCCTAGCATAAGAATAATGATCCGCC CATGTGATGCTCTTCGCCACTGTCACGACCGCGCATCACGGGAATACTAGGT CTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAAGGTCCCGCATCTCCACTCC GTCCCCGATTCTTTGACCCC C14-19D5ZAA008/19D5ZAA009 - (915 nts) ACAAGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCTCGCAAG CCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGACCAG CTTAGCAGCGTCGATGAGGTAGAGGCCGCCTCCTACCCGAGAGCGACAAAA CCATCAGCGCGCCCACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTATACC TACCGACTGCGACAAGTCGCTGTAGTATCAGTCATGGAACGGAATAGATAT CGGCGCTGCCAAACGACTTTAGGTCGTCCTTGTGTTCTAGACTGGCAGCATC AGCGACCAGAGGAGCCTCAGAACATGGCGCCTTTGGAGGCTGTCTTCGATC TCTATCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACGCATCTGTTCGTCGATTC ACTTCCCGCATGCTGTGGCAAGAGTTACCTGCGCGAGAAACCAACAGACCT TTGTGCGGCGATACTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGAG GAACCAAGAATCATCCTGGACCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAGCAGAG ATCTTCGATTTGATGAACATATTGGTGCAAAAATGTACTCACAACCCATGTA TTCGCATGTCAAGCGAATACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCC AGTAAATATCATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGAGTGTC TTTTGGCCCCCGCCGTGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTTCGCC ACTGCAGACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACTGCGC ATCACGGGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAA CGTCCCGCACCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGGCTCCC 179 C26-19D5ZAA010/19D5ZAA011 - (879 nts) CTGATGATGTACCCCGACTACCGTTACACCCCACGCAAGCCGTCTGAGAAG CGTCATCGAAAGCCCAGTGGCCAAAGCAAGAAGGCCAGCTTAGCAGCGTCG ATGAGGTAGAGGTCGTCTCCTACCCGAGAGCGACGACACCATCAGCGCGCC GACTTGTCAGCTCAAGACGGAGGAGTATGAGTTACACCTACCGACTGCGAC AAGTCGCTGTAGCATCAGCAACGAATTGGAACCGATATCGGCGCTGCCAGA CCACCTTAGGTTGTCTTTGTGCCCTTGACTGGCAGCATCAGCGACCAGGGAA GCCTAAGAATATGGCGCCTTTGTGCAGCTGTCTTCGATCTCTATCCAGTCAG CGTGGCCAAGCAGGCACCCATGCATCTGGTCATAGATTCCCTTCTTATATGC TGCGGCAAGAGTTACCCTGCGCCGGAAACCAACAGACCTTTGTGCGGCGATA CTTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGACGAACCAAGAATCAT CCTGGCCCATCTGCTTCGATGGCTACGCGAACCAGAGATCTTCGATTCGATG AACTTATTGGTAGAAAAATGTACTACTACTGTACTCACAACCCATATATTCGC ATGTTCAAAGCGAACACGTACCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCCAGTA AATATCATCTTCATAGACCATCTATTCCAGACCGATACCTAGAGTGTCATTTC TTTTCCTAGCATAAGAATAATGATCCGCCCATGTGATGCTCTTCGCCACTGTC ACGACCGCGCATCACGGGAATACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTC CAGATGAAGGTCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCC C29-19D5ZAA012/19D5ZAA013 (930 nts) TGCAAGATGCACAAGGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTAC ACCCCACGCAAGCCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGC AAGAAGGCCAGCTTAGCAGCGTCAATGAGGTAGAGGCTGCCTCCTACCCGA GAGCGACAACACCCTCAGCGCGCCGACTTGTCGGGTCCAGACGGAGGAGTA TGAGTACCTACCGACTGCGCCGAGTCGCTGTAGCAACAGCCACGAAACGGA ACCGATATCGGCGCTGCCAGACGACCTCAGGTTGTCTTTGTGTCCTAGACTG GCAGCATCAGCGATCAGATGAGCCTAAGAATGTGGCGCCTTTTGCGGCTGTC TTCGATCTCTACCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACACATCTGGTCA TCGATTCTTTGCCGCATGCTGTAGCAAGAGTTGCCCTGCACCAGAAACCAAC AGACCTTTGTGCGGCGAAACTTAGGCGTGCGAACGCAAGGAGATCGCCGGA TCTGAGGAACCAAGAATCATCCTGGCCCATCTGCTTCGATGGCAACGCGAAC CAGGGATCTTCAATTTGATGAACATGTTGGTGGAAAAATGTACTCACAACCC ATGTATTCGCATGTCAAAGCGAACACGAATCTTTTTCTGTAATTATAATCTGC AAGCCAGTAAATATTATCTTCATGGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTAGA GTGTCTTTTGCCCCCCGCCATGAGGACCATTGATTCGCCCACATGTTGCTCTT CGCCACTGCAGACTGCCAACACCATCCATGATGCCCAGCCACTGTCTCGACT GCGCATCACGGGAATAACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGAT GAACGTCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCCGACTCCC 180 C33-19D5ZAA014/19D5ZAA015 (919 nts) GCACAAGGAGCGCCTCTTGATGATGTATCCCGACTACCGTTACACCCCACGC AAGCCGTCTGAGAAGCGCCATCGAAAGCCTAGTGGCCAAAGCAAGAAGGC CAGCTTAGCAGCGTCAATGAGGTAGAGGCCGCCTTCTACCCAAGAGCGACA ACACCATCAGCGCGCCGACTTGTCGGCTCCAGACGGAGGAGTATGAGTTAT ACCTACCGACTGCGATGAGTCGCTGTAGCATCTGCCACGAAATGGAACTGA TATCGGCGCTGCCAGACGACCTAAGGTTGTCTTTGTGTCCTAGAATGGCAGC ATTAGCGACCAGAGGAGCCTAAGAATGTGGCGCCTTTGGCGGCTGTCTTCG ATCTCCATCCAGTCAGCGTGACCCAGGAGGCGACCACACATCTGGCCATCG ATTCCCTTCCCGCATGCTGCAGCAAGAGTTACCCTGCGCCAGAAACCAACA GACCTTTGTGCGGCGATACTTAGGCGTACGAATGCAAGGAGATCGCCGGAT CTGAGGAACCAAGAATCATCCTGGCCCATCTGCTTCGCTGGCAACGCGAAC CAGAGATCTTCGATTTAATGAACATATTGGTGGTAAAATGTACTCACAACCC ATGTATTCGCATATTCAGAGCGAACCCGAGTCTTTTTCTGTAATTATAATCT GCAAGCCAGTAAATATTATCTTCATAGACCATCTATTCCAGCCCGATACCTA AAGTGTCTTTTTCCCCCACCATGGGGACTATTCATTCGCCCATATCATGCTCT TCGCCACTGCGGACTGCCAACACCATCCACGATACACAGCCGCTGTCACGA CTGCGCATCACGGGAGTAACTAGGTCTGATCTTTCTTCCAGTCGCTGCTCCA GATGAACGTCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCC C44-19D5ZAA016/19D5ZAA017 (894 nts) CACAAGGAGCGCCTCCTGATGATGTACCCCGACTACCGTTACACCCCACGCAA GCCGTCTGAGAAGCGTCATCGAAAGCCCAGTGGCCAAAGCAAGAAGGCCAGC TTAGCAGCGTCGATGAGGTAGAGGTCGTCTCCTACCCGAGAGCGACGACACCA TCAGCGCGCCGACTTGTCAGCTCAAGACGGAGGAGTATGAGTTACACCTACCG ACTGCGACAAGTCGCTGTAGCATCAGCAACGAATTGGAACCGATATCGGCGCT GCCAGACCACCTTAGGTTGTCTTTGTGCCCTTGACTGGCAGCATCAGCGACCAG GGAAGCCTAAGAATATGGCGCCTTTGTGCAGCTGTCTTCGATCTCTATCCAGTC AGCGTGGCCAAGCAGGCACCCATGCATCTGGTCATAGATTCCCTTCTTATATGC TGCGGCAAGAGTTACCCTGCGCCGGAAACCAACAGACCTTTGTGCGGCGATAC TTAGACGTACGAACGCTAGGAGATCACCGGATCTGACGAACCAAGAATCATCC TGGCCCATCTGCTTCGATGGCTACGCGAACCAGAGATCTTCGATTCGATGAACT TATTGGTAGAAAAATGTACTACTACTGTACTCACAACCCATATATTCGCATGTT CAAAGCGAACACGTACCTTTTTCTGTAATTATAATCTGCAAGCCAGTAAATATC ATCTTCATAGACCATCTATTCCAGACCGATACCTAGAGTGTCATTTCTTTTCCTA GCATAAGAATAATGATCCGCCCATGTGATGCTCTTCGCCACTGTCACGACCGCG CATCACGGGAATACTAGGTCTGATCTTTTTTCCAGTCGCTGCTCCAGATGAAGG TCCCGCATCTCCACTCCGTCCCCGATTCTTTGACCCC 181 ... bệnh nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt Đến nay, chưa có cơng bố nghiên cứu đặc điểm mơ học bệnh thán thư ớt nấm Colletotrichum gây Quá trình xâm nhiễm gây bệnh loài nấm Colletotrichum gây bệnh. .. loại nấm Colletotrichum 10 2.2.3 Thành phần nấm Colletotrichum gây hại ớt 13 2.2.4 Một số loài nấm Colletotrichum gây hại ớt 15 2.2.5 Xâm nhiễm gây bệnh nấm Colletotrichum gây bệnh thán thư ớt. .. bệnh thán thư ớt nấm C gloeosporioides (Boonratkwang et al., 2007) 2.4 NHỮNG NGHIÊN CỨU VỀ BỆNH THÁN THƯ HẠI ỚT TẠI VIỆT NAM Bệnh thán thư nấm Colletotrichum gây hại nặng hầu hết vùng trồng ớt