Đang tải... (xem toàn văn)
Mục tiêu của luận văn nhằm xác định đặc điểm sinh học và cơ cấu nhóm huyết thanh của Neisseria meningitidis phân lập tại một số đơn vị tân binh trong quân đội; xác định tính nhạy cảm kháng sinh của các chủng Neisseria meningitidis phân lập từ người mang mầm bệnh không triệu chứng.
LỜI CẢM ƠN Tơi xin chân thành cảm ơn Ban giám hiệu, Khoa Sinh HọcTrường Đại Học Khoa Học Tự NhiênĐại Học Quốc Gia Hà Nội, đã hết lòng tạo điều kiện để chúng tơi có thể học tập tốt và đạt được những thành quả như ngày hơm nay Đặc biệt, với lòng biết ơn sâu sắc, tơi xin gửi lơi cam ̀ ̉ ơn tơi th ́ ầy hướng dẫn TS. Đoàn Trọng Tuyên và GS.TS. Phạm Văn Ty đa tân tâm ̃ ̣ hương dân, giup đ ́ ̃ ́ ỡ, tao điêu kiên thuân l ̣ ̀ ̣ ̣ ợi đê tôi hoan thanh luân văn tôt ̉ ̀ ̀ ̣ ́ nghiêp ̣ Tôi cung xin g ̃ ửi lơi cam ̀ ̉ ơn chân thanh nhât đên can bô nhân viên cua ̀ ́ ́ ́ ̣ ̉ khoa Vi sinh Vật viên Y h ̣ ọc Dự phòng Quân đội va Lanh đao ch ̀ ̃ ̣ ỉ huy viện đa giup đ ̃ ́ ỡ va tao điêu kiên đê tôi thu th ̀ ̣ ̀ ̣ ̉ ập số liệu, thực hiện nghiên cứu và hoan thanh lu ̀ ̀ ận văn tôt nghiêp ́ ̣ Xin gửi tới Ban lãnh đạo Bệnh viện Phổi Hà Nội lời cảm ơn sâu sắc đã tạo điều kiện về thời gian để tơi có thể hồn thành khóa học này Một lần nữa, tơi xin gửi lời cảm ơn tới các thầy cơ, bạn bè và tồn bộ những người thân trong gia đình đã ln giúp đỡ nhiệt tình và động viên tơi trong suốt q trình học tập Học Viên Vũ Thị Xn Thu MỤC LỤC MỤC LỤC DANH MỤC HÌNH DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT .1 NMC: Não mô cầu VMN: Viêm màng não PS: Polysaccharide LOS: Lipo – oligosaccharide LPS: Lipopolysaccharide .1 MỞ ĐẦU Chương 1 TỔNG QUAN .3 1.1. Một số đặc điểm dịch tễ học bệnh viêm màng não do Neisseria meningitidis .3 1.1.1.Dịch tễ học của bệnh viêm màng não 1.1.2.Dịch tễ học người mang mầm bệnh không triệu chứng 1.2. Đặc điểm sinh học của N. meningitidis 1.2.1.Danh pháp và phân loại Não mô cầu [32] Hình 1.1: Hình ảnh nhuộm Gram N. meningitidis từ dịch não tủy[63] 1.2.2. Tính chất ni cấy .7 Hình 1.2:Khuẩn lạc N. meningitidis trên thạch chocolate. [63] .8 Hình 1.3: Khuẩn lạc N. meningitidis trên thạch máu. [63] 1.2.3. Sức đề kháng .9 Hình 1.4: Hình ảnh màng tế bào N. meningitidis cắt ngang.[18] 1.3. Các kỹ thuật chẩn đốn phòng thí nghiệm 11 Hình 1.5: Hình ảnh ni cấy N. meningitidis trên mơi trường thạch chocolate có kháng sinh 12 Hình1.6: Hình ảnh định danh N. meningitidis trên thanh định danh API NH .12 Hình 1.7 : Hình ảnh bộ sinh phẩm Pastorex phát hiện N. meningitidis .14 1.3.5. Kỹ thuật sinh học phân tử phát hiện vi khuẩn gây viêm màng não 14 1.4. Đặc điểm gene đích phát hiện N. meningitidis 15 Hình 1.8: Đặc điểm gene mã hóa kháng ngun của N. meningitidis 16 1.5. Đặc điểm gene đích (gen đặc hiệu) xác định nhóm huyết thanh của N. meningitidis 17 Hình 1.9 : Bản đồ gene capsule (CPS) của Nmen (14), ctrABCD operon mã hóa ATPprotein (khung kẻ ơ). SynABC(màu ghi), D/E/F/G (chấm), sacABCD (sọc ngang), xcbABC (gạch chéo), mã hóa nhóm huyết thanhspecific enzymes cho tổng hợp capsule . oatC (nhóm huyết thanh C) và oatWY (nhóm huyết thanh W135 và Y), kết hợp sao chép cùng với syn operons và mã hóa Oacetyltransferases. lipA và lipB mã hóa protein. ctrE and ctrF được biết như LipA và LipB 20 1.6. Đáp ứng miễn dịch 20 Bảng 1.3 . Protein màng ngoài của N. meningitidis .21 1.7. Điều trị và dự phòng .22 Bảng 1.4. Đặc điểm lâm sàng, chẩn đoán, điều trị nhiễm N. meningitidis 22 Chương 2 25 ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 25 2.1. Đối tượng 25 2.2. Vật liệu nghiên cứu 25 2.2.1.Thiết bị 25 2.2.2. Sinh phẩm 25 2.3. Phương pháp nghiên cứu .26 2.3.1. Phương pháp dịch tễ học mô tả cắt ngang .26 2.3.2. Phương pháp thực nghiệm trong phòng thí nghiệm: .26 Hình 2.1 : Thiết kế nghiên cứu đặc điểm sinh học của N. meningitidis 27 Bảng 2. 1. Các hóa chất gắn trong các giếng của thẻ định danh NH 27 Bảng 2.2: Trình tự mồi khảo sát phát hiện gene đích của N. meningitidis và các nhóm huyết thanh (A; B; C) 32 Hình 2.2. Thanh E test 35 Hình 2.3. Kết quả thử nghiệm MIC bằng E test 35 Bảng 2.3:Tiêu chuẩn đánh giá MIC theo hướng dẫn của Viện lâm sàng và chuẩn thức phòng thí nghiệm (CLSI) năm 2013[] 35 Chương 3 37 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN 37 3.1. Đặc điểm sinh học và cơ cấu nhóm huyết thanh của Neisseria meningitidis phân lập tại một số đơn vị tân binh trong quân đội 37 3.1.1. Đặc điểm sinh học của chủng Neisseria meningitidis phân lập tại các đơn vị tân binh trong quân đội .37 Bảng 3.1. Đặc điểm chuyển hóa axit amin của N.meningitidis 37 theo nguồn gốc chủng trên thẻ định danh NH 37 Bảng 3.2. Đặc điểm chuyển hóa đường của N.meningitidis .38 theo nguồn gốc chủng trên thẻ định danh NH 38 theo nhóm huyết thanh B và C trên thẻ định danh NH 39 Bảng 3.4. Đặc điểm chuyển hóa đường của N.meningitidis .39 theo nhóm huyết thanh B và C trên thẻ định danh NH .39 3.1.2. Cơ cấu nhiễm Neisseria meningitidis và các nhóm huyết thanh của các chủng Neisseria meningitidis phân lập tại các đơn vị tân binh trong quân đội bằng phương pháp PCR 40 Bảng 3.5: Tỷ lệ nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh 40 lưu hành tại 03 đơn vị giám sát 40 Bảng 3.6: Tần suất nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh .41 theo trung đoàn 41 Bảng 3.7: Tỷ lệ nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh theo địa phương nhập ngũ 43 Bảng 3.8. Kết quả kiểm tra chủng N. meningitidis trên thanh NH và 45 cơ cấu nhóm huyết thanh bằng kỹ thuật MultiplexPCR 45 3.1.3. Khảo sát đặc điểm sinh học phân tử của các chủng N.meningitidis phân lập được bằng các cặp mồi đặc hiệu lồi và nhóm N.meningitidis thơng qua phản ứng PCR 47 Lựa chọn 32 trong tổng số 61 chủng đã phân lập được ở trên tiến hành khảo sát đặc điểm sinh học phân tử bằng các cặp mồi đặc hiệu cho lồi và nhóm N.meningitidis 47 Hình 3.1: Khảo sát gene CtrA trên 32 chủng N. Meningitidis 48 Hình 3.2: Khảo sát gene ctrA trên 32 chủng N. Meningitidis 49 Hình 3.3: Tiếp tục khảo sát sự xuất hiện của gen ctrA trên 32 chủng 50 N. meningitidis 50 Hình 3.4: Kết quả khảo sát sự có mặt của gene Por A trên 32 chủng 51 N. meningitidis phân lập được 51 Hình 3.5: Khảo sát gene CrgA mã hóa LysR của N. meningitidis trên 32 52 Hình 3.6: Khảo sát gene SodC trên 32 chủng N. meningitidis 53 Khảo sát bằng các cặp mồi phát hiện nhóm N. Meningitidis .54 Khảo sát cự có mặt của gene siaDc phát hiện nhóm A của N. meningitidis [31] 54 Hình 3.7 : Khảo sát gene siaDc phát hiện N. meningitidis nhóm huyết thanh A, 55 Hình 3.8: Khảo sát gene siaDb phát hiện N. meningitidis nhóm B 56 Khảo sát cự có mặt của gene siaDc phát hiện nhóm huyết thanh C của N. meningitidis [31] 56 Hình 3.9: Khảo sát gene siaDc phát hiện N. meningitidis nhóm C 57 3.2. Đánh giá sự nhậy cảm với kháng sinh của các chủng N. meningitidis nhóm huyết thanh B và C 57 Bảng 3.9: Xác định MIC của chủng Neisseria meningitidis, 57 nhóm huyết thanh B (n=23) 57 Bảng 3.10: Kết quả thử nghiệm in vivo trên người nhiễm 59 N. meningitidis, nhóm huyết thanh B 59 Bảng 3.11 : Xác định MIC (in vitro) của chủng Neisseria meningitidis, .59 nhóm huyết thanh C (n=4) 59 Bảng 3.12: Kết quả thử nghiệm in vivo trên người nhiễm 60 N. meningitidis, nhóm huyết thanh C 60 KẾT LUẬN 62 PHỤ LỤC 76 DANH MỤC BẢNG MỤC LỤC DANH MỤC HÌNH DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT .1 NMC: Não mô cầu VMN: Viêm màng não PS: Polysaccharide LOS: Lipo – oligosaccharide LPS: Lipopolysaccharide .1 MỞ ĐẦU Chương 1 TỔNG QUAN .3 Hình 1.1: Hình ảnh nhuộm Gram N. meningitidis từ dịch não tủy[63] Hình 1.2:Khuẩn lạc N. meningitidis trên thạch chocolate. [63] .8 Hình 1.3: Khuẩn lạc N. meningitidis trên thạch máu. [63] Hình 1.4: Hình ảnh màng tế bào N. meningitidis cắt ngang.[18] Hình 1.5: Hình ảnh ni cấy N. meningitidis trên mơi trường thạch chocolate có kháng sinh 12 Hình1.6: Hình ảnh định danh N. meningitidis trên thanh định danh API NH .12 Hình 1.7 : Hình ảnh bộ sinh phẩm Pastorex phát hiện N. meningitidis .14 Hình 1.8: Đặc điểm gene mã hóa kháng ngun của N. meningitidis 16 Hình 1.9 : Bản đồ gene capsule (CPS) của Nmen (14), ctrABCD operon mã hóa ATPprotein (khung kẻ ơ). SynABC(màu ghi), D/E/F/G (chấm), sacABCD (sọc ngang), xcbABC (gạch chéo), mã hóa nhóm huyết thanhspecific enzymes cho tổng hợp capsule . oatC (nhóm huyết thanh C) và oatWY (nhóm huyết thanh W135 và Y), kết hợp sao chép cùng với syn operons và mã hóa Oacetyltransferases. lipA và lipB mã hóa protein. ctrE and ctrF được biết như LipA và LipB 20 Bảng 1.3 . Protein màng ngoài của N. meningitidis .21 Bảng 1.4. Đặc điểm lâm sàng, chẩn đoán, điều trị nhiễm N. meningitidis 22 Chương 2 25 ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 25 Hình 2.1 : Thiết kế nghiên cứu đặc điểm sinh học của N. meningitidis 27 Bảng 2. 1. Các hóa chất gắn trong các giếng của thẻ định danh NH 27 Bảng 2.2: Trình tự mồi khảo sát phát hiện gene đích của N. meningitidis và các nhóm huyết thanh (A; B; C) 32 Hình 2.2. Thanh E test 35 Hình 2.3. Kết quả thử nghiệm MIC bằng E test 35 Bảng 2.3:Tiêu chuẩn đánh giá MIC theo hướng dẫn của Viện lâm sàng và chuẩn thức phòng thí nghiệm (CLSI) năm 2013[] 35 Chương 3 37 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN 37 Bảng 3.1. Đặc điểm chuyển hóa axit amin của N.meningitidis 37 theo nguồn gốc chủng trên thẻ định danh NH 37 Bảng 3.2. Đặc điểm chuyển hóa đường của N.meningitidis .38 theo nguồn gốc chủng trên thẻ định danh NH 38 theo nhóm huyết thanh B và C trên thẻ định danh NH 39 Bảng 3.4. Đặc điểm chuyển hóa đường của N.meningitidis .39 theo nhóm huyết thanh B và C trên thẻ định danh NH .39 Bảng 3.5: Tỷ lệ nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh 40 lưu hành tại 03 đơn vị giám sát 40 Bảng 3.6: Tần suất nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh .41 theo trung đồn 41 Bảng 3.7: Tỷ lệ nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh theo địa phương nhập ngũ 43 Bảng 3.8. Kết quả kiểm tra chủng N. meningitidis trên thanh NH và 45 cơ cấu nhóm huyết thanh bằng kỹ thuật MultiplexPCR 45 Hình 3.1: Khảo sát gene CtrA trên 32 chủng N. Meningitidis 48 Hình 3.2: Khảo sát gene ctrA trên 32 chủng N. Meningitidis 49 Hình 3.3: Tiếp tục khảo sát sự xuất hiện của gen ctrA trên 32 chủng 50 N. meningitidis 50 Hình 3.4: Kết quả khảo sát sự có mặt của gene Por A trên 32 chủng 51 N. meningitidis phân lập được 51 Hình 3.5: Khảo sát gene CrgA mã hóa LysR của N. meningitidis trên 32 52 Hình 3.6: Khảo sát gene SodC trên 32 chủng N. meningitidis 53 Khảo sát bằng các cặp mồi phát hiện nhóm N. Meningitidis .54 Khảo sát cự có mặt của gene siaDc phát hiện nhóm A của N. meningitidis [31] 54 Hình 3.7 : Khảo sát gene siaDc phát hiện N. meningitidis nhóm huyết thanh A, 55 Hình 3.8: Khảo sát gene siaDb phát hiện N. meningitidis nhóm B 56 Khảo sát cự có mặt của gene siaDc phát hiện nhóm huyết thanh C của N. meningitidis [31] 56 Hình 3.9: Khảo sát gene siaDc phát hiện N. meningitidis nhóm C 57 Bảng 3.9: Xác định MIC của chủng Neisseria meningitidis, 57 nhóm huyết thanh B (n=23) 57 Bảng 3.10: Kết quả thử nghiệm in vivo trên người nhiễm 59 N. meningitidis, nhóm huyết thanh B 59 Bảng 3.11 : Xác định MIC (in vitro) của chủng Neisseria meningitidis, .59 nhóm huyết thanh C (n=4) 59 Bảng 3.12: Kết quả thử nghiệm in vivo trên người nhiễm 60 N. meningitidis, nhóm huyết thanh C 60 KẾT LUẬN 62 PHỤ LỤC 76 DANH MỤC HÌNH MỤC LỤC DANH MỤC HÌNH DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT .1 NMC: Não mô cầu VMN: Viêm màng não PS: Polysaccharide LOS: Lipo – oligosaccharide LPS: Lipopolysaccharide .1 MỞ ĐẦU Chương 1 TỔNG QUAN .3 Hình 1.1: Hình ảnh nhuộm Gram N. meningitidis từ dịch não tủy[63] Hình 1.2:Khuẩn lạc N. meningitidis trên thạch chocolate. [63] .8 Hình 1.3: Khuẩn lạc N. meningitidis trên thạch máu. [63] Hình 1.4: Hình ảnh màng tế bào N. meningitidis cắt ngang.[18] Hình 1.5: Hình ảnh ni cấy N. meningitidis trên mơi trường thạch chocolate có kháng sinh 12 Hình1.6: Hình ảnh định danh N. meningitidis trên thanh định danh API NH .12 Hình 1.7 : Hình ảnh bộ sinh phẩm Pastorex phát hiện N. meningitidis .14 Hình 1.8: Đặc điểm gene mã hóa kháng ngun của N. meningitidis 16 Hình 1.9 : Bản đồ gene capsule (CPS) của Nmen (14), ctrABCD operon mã hóa ATPprotein (khung kẻ ơ). SynABC(màu ghi), D/E/F/G (chấm), sacABCD (sọc ngang), xcbABC (gạch chéo), mã hóa nhóm huyết thanhspecific enzymes cho tổng hợp capsule . oatC (nhóm huyết thanh C) và oatWY (nhóm huyết thanh W135 và Y), kết hợp sao chép cùng với syn operons và mã hóa Oacetyltransferases. lipA và lipB mã hóa protein. ctrE and ctrF được biết như LipA và LipB 20 Bảng 1.3 . Protein màng ngoài của N. meningitidis .21 Bảng 1.4. Đặc điểm lâm sàng, chẩn đoán, điều trị nhiễm N. meningitidis 22 Chương 2 25 ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 25 Hình 2.1 : Thiết kế nghiên cứu đặc điểm sinh học của N. meningitidis 27 Bảng 2. 1. Các hóa chất gắn trong các giếng của thẻ định danh NH 27 Bảng 2.2: Trình tự mồi khảo sát phát hiện gene đích của N. meningitidis và các nhóm huyết thanh (A; B; C) 32 Hình 2.2. Thanh E test 35 Hình 2.3. Kết quả thử nghiệm MIC bằng E test 35 Bảng 2.3:Tiêu chuẩn đánh giá MIC theo hướng dẫn của Viện lâm sàng và chuẩn thức phòng thí nghiệm (CLSI) năm 2013[] 35 Chương 3 37 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN 37 Bảng 3.1. Đặc điểm chuyển hóa axit amin của N.meningitidis 37 theo nguồn gốc chủng trên thẻ định danh NH 37 Bảng 3.2. Đặc điểm chuyển hóa đường của N.meningitidis .38 theo nguồn gốc chủng trên thẻ định danh NH 38 theo nhóm huyết thanh B và C trên thẻ định danh NH 39 Bảng 3.4. Đặc điểm chuyển hóa đường của N.meningitidis .39 theo nhóm huyết thanh B và C trên thẻ định danh NH .39 Bảng 3.5: Tỷ lệ nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh 40 lưu hành tại 03 đơn vị giám sát 40 Bảng 3.6: Tần suất nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh .41 theo trung đoàn 41 Bảng 3.7: Tỷ lệ nhiễm N. meningitidis và nhóm huyết thanh theo địa phương nhập ngũ 43 Bảng 3.8. Kết quả kiểm tra chủng N. meningitidis trên thanh NH và 45 cơ cấu nhóm huyết thanh bằng kỹ thuật MultiplexPCR 45 Hình 3.1: Khảo sát gene CtrA trên 32 chủng N. Meningitidis 48 Hình 3.2: Khảo sát gene ctrA trên 32 chủng N. Meningitidis 49 Hình 3.3: Tiếp tục khảo sát sự xuất hiện của gen ctrA trên 32 chủng 50 N. meningitidis 50 Hình 3.4: Kết quả khảo sát sự có mặt của gene Por A trên 32 chủng 51 N. meningitidis phân lập được 51 Hình 3.5: Khảo sát gene CrgA mã hóa LysR của N. meningitidis trên 32 52 Hình 3.6: Khảo sát gene SodC trên 32 chủng N. meningitidis 53 Khảo sát bằng các cặp mồi phát hiện nhóm N. Meningitidis .54 Khảo sát cự có mặt của gene siaDc phát hiện nhóm A của N. meningitidis [31] 54 Hình 3.7 : Khảo sát gene siaDc phát hiện N. meningitidis nhóm huyết thanh A, 55 Hình 3.8: Khảo sát gene siaDb phát hiện N. meningitidis nhóm B 56 Khảo sát cự có mặt của gene siaDc phát hiện nhóm huyết thanh C của N. meningitidis [31] 56 Hình 3.9: Khảo sát gene siaDc phát hiện N. meningitidis nhóm C 57 Bảng 3.9: Xác định MIC của chủng Neisseria meningitidis, 57 nhóm huyết thanh B (n=23) 57 Bảng 3.10: Kết quả thử nghiệm in vivo trên người nhiễm 59 N. meningitidis, nhóm huyết thanh B 59 Bảng 3.11 : Xác định MIC (in vitro) của chủng Neisseria meningitidis, .59 nhóm huyết thanh C (n=4) 59 Bảng 3.12: Kết quả thử nghiệm in vivo trên người nhiễm 60 N. meningitidis, nhóm huyết thanh C 60 KẾT LUẬN 62 PHỤ LỤC 76 DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT NMC: Não mô cầu VMN: Viêm màng não PS: Polysaccharide LOS: Lipo – oligosaccharide LPS: Lipopolysaccharide OMP: OuRer membrase protein PCR: Polymerase chain reaction MIC Minimum inhibition concentration VSV: Vi sinh vật MỞ ĐẦU Viêm màng não là một bệnh lý nhiễm trùng nghiêm trọng, tỷ lệ tử vong cao nếu khơng được nghĩ đến, khơng chẩn đốn và điều trị kịp thời Sự hiểu biết về các tác nhân gây bệnh thường gặp, sẽ hỗ trợ cho cơng tác điều trị và xây dựng các chương trình phòng chống bệnh tật tại từng Quốc gia. Hầu hết những dữ liệu về dịch tễ của viêm màng não mủ ở người lớn đều xuất phát từ những quốc gia đã phát triển, trong đó 4 tác nhân gây bệnh thường gặp là: Streptococcus pneumoniae (30%60%), Neisseria meningitidis (1337%), Listeria monocytogenes Haemophilus influenzae. Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae type b (Hib) và Streptococcus pneumoniae loại vi khuẩn có vỏ (polysaccharide encapsuleated) là nguyên nhân quan trọng gây bệnh và tử vong trên thế giới [23] Hàng năm có từ 400.000 – 500.000 người chết do viêm màng não (WHO, 2006). Trong thời gian cuối thế kỷ 20 và đầu thế kỷ 21, đã có sự chuyển đổi trong việc chẩn đốn các tác nhân sinh học, kết hợp kiểu hình và huyết thanh học với việc xác định kiểu gene bằng các kỹ thuật sinh học phân tử [39]. Phân tích tính đa dạng về tổ hợp trình tự nhiều vùng gene (MLST) là tiêu chuẩn vàng cho việc xác định đặc điểm vi khuẩn N meningitidis phục vụ công tác giám sát dịch tễ học. Sự phát triển của các kỹ thuật phân tử cho phép phân tích vi khuẩn gây viêm màng não từ mẫu ni cấy phân lập và khơng phân lập để chẩn đốn xác định được ca bệnh và nó trở thành cơng cụ hữu ích cho nâng cao chất lượng giám sát, phát hiện và tiên lượng dịch, đây là chiến lược phòng ngừa chính ở các nước Châu âu 64 TÀI LIỆU THAM KHẢO [1].Achtman M. (1995), "Epidemic spread and antigenic variability of Neisseria meningitidis", Trends in Microbiology. 3 (5), pp. 186192 [2]. Bentley, S. D., G. S. Vernikos, L. A. Snyder, C. Churcher, C. Arrowsmith, T. Chillingworth, A. Cronin, P. H. Davis, N. E. Holroyd, K. Jagels, M. Maddison, S. Moule, E Rabbinowitsch, S Sharp, L Unwin, S Whitehead, M A Quail, M. Achtman, B Barrell, N J Saunders, and J Parkhill (2007), “Meningococcal genetic variation mechanisms viewed through comparative analysis of serogroup C strain FAM18”, PLoS Genetics 3, pp. 23 [3]. Boisier, P., P. Nicolas, S. Djibo, M. K. Taha, I. Jeanne, H. B. Mainassara, B. Tenebray, K. K. Kairo, D. Giorgini, and S. Chanteau (2007), “Meningococcal meningitis: unprecedented incidence of serogroup Xrelated cases in 2006 in Niger”, Clinical Infectious Diseases 44, pp. 657663 [4]. Borel, T., A. M. Rose, M. Guillerm, F. Sidikou, S. Gerstl, A. Djibo, N. Nathan, S Chanteau, and P J Guerin (2006), “High sensitivity and specificity of the Pastorex latex agglutination test for Neisseria meningitidis serogroup A during a clinical trial in Niger”, Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene 100, pp. 964969 [5]. Borrow, R., H. Claus, U. Chaudhry, M. Guiver, E. B. Kaczmarski, M. Frosch, and A. J. Fox (1998), “siaD PCR ELISA for confirmation and identification of serogroup Y and W135 meningococcal infections”, FEMS Microbiology Letters 159, pp. 209214 [6]. Borrow, R., H. Claus, M. Guiver, L. Smart, D. M. Jones, E. B. Kaczmarski, M. Frosch, and A. J. Fox (1997), “Nonculture diagnosis and serogroup determination of meningococcal B and C infection by a sialyltransferase (siaD) PCR ELISA”, Epidemiology and Infection 118, pp.111117 65 [7] Broome CV (1986),“The carrier state: Neisseria meningitidis” , J Antimicrob Chemother 18 (Suppl. A), pp. 25–34. [8]. Bundle, D. R., H. J. Jennings, and C. P. Kenney (1974), “Studies on the group specific polysaccharide of Neisseria meningitidis serogroup X and an improved procedure for its isolation”, Journal of Biological Chemistry 249, pp. 47974801 [9] Bustin, S A (2004), “The PCR Revolution Basic technologies and Applications”, Cambridge University Press [10]. Caugant DA, Høiby EA, Magnus P, Scheel O, Hoel T, Bjune G, Wedege E, Eng J & Frøholm LO (1994), “Asymptomatic carriage of Neisseria meningitidis in a randomly sampled population”. J Clin Microbiol 32, pp. 323–330. [11]. Cartwright K (1995), “Meningococcal carriage and disease Meningococcal Disease” (CartwrightK, ed), pp. 115–146 [12]. Carvalho, M. G., M. L. Tondella, K. McCaustland, L. Weidlich, L. McGee, L. W. Mayer, A. Steigerwalt, M. Whaley, R. R. Facklam, B. Fields, G. Carlone, E. W. Ades, R. Dagan, and J. S. Sampson (2007), “Evaluation and improvement of real time PCR assays targeting lytA, ply, and psaA genes for detection of pneumococcal DNA”. Journal of Clinical Microbiology 45, pp. 24602466. [13]. Cedric Mims (1996), “The Pathogenesis of the Acute Exanthemst”. Review in Medical Virology. Vol 6, pp. 18 [14] Clare L Bennett, Erwin van Rijn, Steffen Jung, Kayo Inaba, Ralph M. Steinman, Martien L. Kapsenberg, and Björn E. Clausen (2005), “Inducible ablation of mouse langerhans cells diminishes but fails to abrogate contact hypersensitivity”, The Journal of Cell Biology, Vol 169, No 4,pp. 569576 [15]. Claus, H., R. Borrow, M. Achtman, G. Morelli, C. Kantelberg, E. Longworth, M. Frosch, and U. Vogel (2004), “Genetics of capsule Oacetylation in serogroup C, W135, and Y meningococci”, Molecular Microbiology 51, pp. 227239 66 [16]. Claus, H., M. C. Maiden, R. Maag, M. Frosch, and U. Vogel (2002), “Many carried meningococci lack the genes required for capsule synthesis and transport”, Microbiology 148, pp. 18131819 [17]. Claus, H., U. Vogel, M. Muhlenhoff, R. GerardySchahn, and M. Frosch (1997), “Molecular divergence of the sia locus in different serogroups of Neisseria meningitidisexpressing polysialic acid capsules”, Molecular and General Genetics 257, pp. 2834 [18]. Corless, C. E., M. Guiver, R. Borrow, V. EdwardsJones, A. J. Fox, and E. B. Kaczmarski (2001), “Simultaneous detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and Streptococcus pneumoniae in suspected cases of meningitis and septicemia using realtime PCR”, Journal of Clinical Microbiology 39, pp. 15531558 [19]. Csako, G. (2006) “Present and future of rapid and/or highthroughput methods for nucleic acid testing”, Clinica Chimica Acta 363, pp. 631 [20]. DolanLivengood, J. M., Y. K. Miller, L. E. Martin, R. Urwin, and D. S. Stephens (2003), “Genetic basis for nongroupable Neisseria meningitidis”. Journal of Infectious Diseases 187, pp. 16161628 [21]. Dolan Thomas, J., C.P. Hatcher, D.A. Satterfield, M.J. Theodore, M.C. Bach, K.B. Linscott, X. Zhao, X. Wang, R. Mair, S. Schmink, K.E. Arnold, D.S. Stephens, L.H. Harrison, R.A. Hollick, A.L. Andrade, J. LamaroCardoso, A.P.S. de Lemos, J. Gritzfeld, S. Gordon, A. Soysal, M. Bakir, D. Sharma, S. Jain, S.W. Satola, N.E. Messonnier, and L.W. Mayer (2011), “sodCBased RealTime PCR for Detection of Neisseria meningitidis”, PLoS One 6, e19361 [22] Edwards, U., A Muller, S Hammerschmidt, R GerardySchahn, and M. Frosch (1994), “Molecular analysis of the biosynthesis pathway of the alpha2,8 polysialic acid capsule by Neisseria meningitidis serogroup B”, Molecular Microbiology 14, pp.141149 67 [23]. Falla, T. J., D. W. Crook, L. N. Brophy, D. Maskell, J. S. Kroll, and E. R. Moxon (1994), “PCR for capsular typing of Haemophilus influenzae” Journal of Clinical Microbiology 32, pp. 23822386 [24]. Frosch, M., U. Edwards, K. Bousset, B. Krausse, and C. Weisgerber (1991), “Evidence for a common molecular origin of the capsule gene loci in gramnegative bacteria expressing group II capsular polysaccharides”, Molecular Microbiology 5, pp. 12511263 [25] Frosch, M., and A Muller (1993), “Phospholipid substitution of capsular polysaccharides and mechanisms of capsule formation in Neisseria meningitidis”. Molecular Microbiology 8, pp. 483493 [26]. Gagneux, S. P., A. Hodgson, T. A. Smith, T. Wirth, I. Ehrhard, G. Morelli, B. Genton, F. N. Binka, M. Achtman, and G. Pluschke (2002), “Prospective study of a serogroup X Neisseria meningitidis outbreak in northern Ghana”, Journal of Infectious Diseases 185, pp. 618626 [27]. Ganguli, S., G. Zapata, T. Wallis, C. Reid, G. Boulnois, W. F. Vann, and I. S Roberts (1994), “Molecular cloning and analysis of genes for sialic acid synthesis in Neisseria meningitidis group B and purification of the meningococcal CMP NeuNAc synthetase enzyme”, Journal of Bacteriology 176, pp. 45834589 [28]. Goldacre M J, Trevor Lambert, Julie Evans, Gill Turner. “Preregistrantion house officers’ views on whether their experience at medical school prepared them well for their jobs: national questionnaise survey” BMJ Volume 326, pp. 1011 1012 [29] Hammerschmidt, S., C Birkholz, U Zahringer, B D Robertson, J van Putten, O. Ebeling, and M. Frosch (1994), “Contribution of genes from the capsule gene complex 53(cps) to lipooligosaccharide biosynthesis and serum resistance in Neisseria meningitidis”. Molecular Microbiology 11, pp. 885896 68 [30]. Hammerschmidt, S., A. Muller, H. Sillmann, M. Muhlenhoff, R. Borrow, A. Fox, J. van Putten, W. D. Zollinger, R. GerardySchahn, and M. Frosch ( 1996), “Capsule phase variation in Neisseria meningitidis serogroup B by slippedstrand mispairing in the polysialyltransferase gene (siaD): correlation with bacterial invasion and the outbreak of meningococcal disease”, Molecular Microbiology 20, pp. 12111220 [31]. Hongfei Zhu, Quan Wang, Liuqing Wen ,Jianguo Xu,Zhujun Shao, Min Chen, Mingliang Chen, Peter R Reeves ,Boyang Cao,và Lei Wang “Development of a Multiplex PCR Assay for Detection and Genogrouping of Neisseria meningitidis” J Clin Microbiol 2012 January; 50(1): 46–51.: 10.1128/JCM.0091811PMCID: PMC3256684” [31]. Janson, H., M. Ruan, and A. Forsgren (1993), “Limited diversity of the protein D gene (hpd) among encapsulated and nonencapsulated Haemophilus influenzae strains”, Infection and Immunity 61, pp. 45464552 [32] Kroll, J S (1992), “The genetics of encapsulation in Haemophilus influenzae”. Journal of Infectious Diseases 165 Suppl 1, pp. 9396 [33] Kroll, J S., B M Loynds, and E R Moxon (1991), “The Haemophilus influenzae capsulation gene cluster: a compound transposon”, Molecular Microbiology 5, pp. 15491560 [34]. Kroll, J. S., and E. R. Moxon (1988), “Capsulation and gene copy number at the cap locus of Haemophilus influenzae type b”, Journal of Bacteriology 170, pp. 859864 [35] Kroll, J S., S Zamze, B Loynds, and E R Moxon (1989), “Common organization of chromosomal loci for production of different capsular polysaccharides in Haemophilus influenzae”, Journal of Bacteriology 171, pp. 33433347 [36]. LaClaire, L. L., M. L. Tondella, D. S. Beall, C. A. Noble, P. L. Raghunathan, N. E. Rosenstein, and T. Popovic (2003), “Identification of Haemophilus influenzae serotypesby standard slide agglutination serotyping and PCRbased capsule typing”, Journal of Clinical Microbiology 41, pp.393396 69 [37]. Lee, L. G., C. R. Connell, and W. Bloch (1993), “Allelic discrimination by nicktranslation PCR with fluorogenic probes”, Nucleic Acids Research 21, pp. 37613766 [38] Liu, T Y., E C Gotschlich, E K Jonssen, and J R Wysocki (1971), “Studies on the meningococcal polysaccharides I Composition and chemical properties of the group A polysaccharide”, Journal of Biological Chemistry 246, pp. 28492858 [39]. Martin C.J. Maiden and Mathias Frosch (2001), “Molecular Techniques for the Investigation of Meningococcal Disease Epidemiology”, Molecular Biotechnology, Volume 18, pp. 119134 [40]. Masson, L., and B. E. Holbein (1983), “Physiology of sialic acid capsular polysaccharide synthesis in serogroup B Neisseria meningitidis”, Journal of Bacteriology 154, pp. 728736 [41N]. Marcelo Reyes, Juan Pablo Torres, Valeria Prado, Roberto Vidal. “Multiplex PCR assay in spinal fluid to identify simultaneously bacterial pathogens associated to acute bacterial meningitis in Chilean children”, Rev Méd Chile 2008; 136, pp. 338 346 [41]. Messmer, T. O., J. S. Sampson, A. Stinson, B. Wong, G. M. Carlone, and R. R Facklam (2004), “Comparison of four polymerase chain reaction assays for specificity in the identification of Streptococcus pneumoniae”, Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 49, pp. 249254 [42]. Moore, C. E., A. Sengduangphachanh, T. Thaojaikong, J. Sirisouk, D. Foster, R. Phetsouvanh, L. McGee, D. W. Crook, P. N. Newton, and S. J. Peacock (2010), “Enhanced determination of Streptococcus pneumoniae serotypes associated with invasive disease in Laos by using a realtime polymerase chain reaction serotyping assay with cerebrospinal fluid”, American Journal of Tropical Medicine and Hygiene 83, pp. 451457 70 [43]. Mothershed, E. A., C. T. Sacchi, A. M. Whitney, G. A. Barnett, G. W. Ajello, S Schmink, L W Mayer, M Phelan, T H Taylor, Jr., S A Bernhardt, N. E. Rosenstein, and T Popovic (2004), “Use of realtime PCR to resolve slide agglutination discrepancies in serogroup identification of Neisseria meningitidis”. Journal of Clinical Microbiology 42, pp. 320328 [43] Muhamedkheir TaHa “Simultaneous approach for nonculture PCR base indentification and serogroup prediction of N”. meningitidis journal of clinical microbiology.Feb, 2000, pp. 855857 [44]. Mullis, K. B., and F. A. Faloona (1987), “Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerasecatalyzed chain reaction”, Methods In Enzymology 155, pp. 335350 [45]. Murdoch, D. R., T. P. Anderson, K. A. Beynon, A. Chua, A. M. Fleming, R. T. Laing, G. I. Town, G. D. Mills, S. T. Chambers, and L. C. Jennings (2003), “Evaluation of a PCR assay for detection of Streptococcus pneumoniae in respiratory and nonrespiratory samples from adults with communityacquired pneumonia”. Journal of Clinical Microbiology 41, pp. 6366 [46]. Pai, R., R. E. Gertz, and B. Beall (2006), “Sequential multiplex PCR approach for determining capsular serotypes of Streptococcus pneumoniae isolates”, Journal of Clinical Microbiology 44, pp. 124131 [47]. Parkhill, J., M. Achtman, K. D. James, S. D. Bentley, C. Churcher, S. R. Klee, G. Morelli, D. Basham, D. Brown, T. Chillingworth, R. M. Davies, P. Davis, K. Devlin, T. Feltwell, N. Hamlin, S. Holroyd, K. Jagels, S. Leather, S. Moule, K. Mungall, M. A. Quail, M. A. Rajandream, K. M. Rutherford, M. Simmonds, J. Skelton, S. Whitehead, B. G. Spratt, and B. G. Barrell (2000), “Complete DNA sequence of a serogroup A strain of Neisseria meningitidis Z2491”, Nature 404, pp. 502506 [48]. Robert K Selander, Dominique A. Caugant, Howard Ochaman, James M. Musser, Marion N. Gilmour, and Thomas Whittam (1986), “Methods of Multilocus 71 Enzyme Electrophoresis for Bacterial Population Genetics and Systematics”, Applied and Enviromental Microbiology, pp. 873884 [49]. Resti, M., M. Moriondo, M. Cortimiglia, G. Indolfi, C. Canessa, L. Becciolini, E Bartolini, F M de Benedictis, M de Martino, and C Azzari (2010), “Communityacquired bacteremic pneumococcal pneumonia in children: diagnosis and serotyping by realtime polymerase chain reaction using blood samples”, Clinical Infectious Diseases 51, pp. 10421049 [50] Sadler, F., A Fox, K Neal, M Dawson, K Cartwright, and R Borrow ( 2003), “Genetic analysis of capsular status of meningococcal carrier isolates”, Epidemiology and Infection 130, pp. 5970 [51]. Saiki, R. K., S. Scharf, F. Faloona, K. B. Mullis, G. T. Horn, H. A. Erlich, and N. Arnheim (1985), “Enzymatic amplification of betaglobin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia”, Science 230, pp. 13501354 [52]. Satola, S. W., P. L. Schirmer, and M. M. Farley (2003), “Complete sequence of the cap locus of Haemophilus influenzae serotype b and nonencapsulated b capsule negative variants”, Infection and Immunity 71, pp. 36393644 [53]. Satola, S. W., P. L. Schirmer, and M. M. Farley (2003), “Genetic analysis of the capsule locus of Haemophilus influenzae serotype f”, Infection and Immunity 71, pp. 72027207 [54]. Song, X. M., A. Forsgren, and H. Janson (1995), “The gene encoding protein D (hpd) is highly conserved among Haemophilus influenzae type b and nontypeable strains”. 63, pp. 696699 [55]. Steven M. Pollard, Koichi Yoshikawa, Ian D. Clarke, Davide Danovi, Stefan Strieker, Roslin Russell, Jane Bayani, Renee Head, Marco Lee, Mark Bernstein, Jeremy A. Squire, Austin Smith, and Peter Dirks (2009), “Glioma Stem Cell Lines Expanded in Adherent Culture Have Tumor Specific Phenotypes and Are Suiable for Chemical and Genetic Screens”, Cell stem cell 4, pp. 568580 72 [56] Stratagene (2006), “Introduction to Quantitative PCR: Methods and Application Guide” [57]. Suzuki, N., M. Yuyama, S. Maeda, H. Ogawa, K. Mashiko, and Y. Kiyoura (2006), “Genotypic identification of presumptive Streptococcus pneumoniae by PCR using four genes highly specific for S Pneumoniae”, Journal of Medical Microbiology 55, pp. 709714 [58]. Swartley, J. S., J. H. Ahn, L. J. Liu, C. M. Kahler, and D. S. Stephens (1996), “Expression of sialic acid and polysialic acid in serogroup B Neisseria meningitidis: divergent transcription of biosynthesis and transport operons through a common promoter region”, Journal of Bacteriology 178, pp. 40524059 [59]. Swartley, J. S., L. J. Liu, Y. K. Miller, L. E. Martin, S. Edupuganti, and D. S. Stephens (1998), “Characterization of the gene cassette required for biosynthesis of the (alpha1>6)linked NacetylDmannosamine1phosphate capsule of serogroup A Neisseria meningitidis”, Journal of Bacteriology 180, pp. 15331539. 55 [60]. Swartley, J. S., A A. Marfin, S Edupuganti, L J. Liu, P. Cieslak, B. A. Perkins, J. D. Wenger, and D. S. Stephens (1997), “Capsule switching of Neisseria meningitidis”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 94, pp. 271276 [61]. Swartley, J. S., and D. S. Stephens (1994), “Identification of a genetic locus involved in the biosynthesis of NacetylDmannosamine, a precursor of the (alpha 2>8)linked polysialic acid capsule of serogroup B Neisseria meningitidis”, Journal of Bacteriology 176, pp. 15301534 [62].Taha, M.K (2000), “Simultaneous approach for nonculture PCRbased identification and serogroup prediction of Neisseria meningitidis”, Journal of Clinical Microbiology 38, pp. 855857 [63]. Taha, M. K., J. M. Alonso, M. Cafferkey, D. A. Caugant, S. C. Clarke, M. A. Diggle, A. Fox, M. Frosch, S. J. Gray, M. Guiver, S. Heuberger, J. Kalmusova, K. 73 Kesanopoulos, A. M. Klem, P. Kriz, J. Marsh, P. Mölling, K. Murphy, P. Olcén, O. Sanou, G. Tzanakaki, and U. Vogel (2005), “Interlaboratory comparison of PCR based identification and genogrouping of Neisseria meningitidis”, Journal of Clinical Microbiology 43, pp. 144149 [64]. Tarrago, D., A. Fenoll, D. SanchezTatay, L. A. Arroyo, C. MunozAlmagro, C Esteva, W P Hausdorff, J Casal, and I Obando (2008), “Identification of pneumococcal serotypes from culturenegative clinical specimens by novel real time PCR”, Clinical Microbiology and Infection 14, pp. 828834 [65]. Tettelin, H., N. J. Saunders, J. Heidelberg, A. C. Jeffries, K. E. Nelson, J. A. Eisen, K. A. Ketchum, D. W. Hood, J. F. Peden, R. J. Dodson, W. C. Nelson, M. L. Gwinn, R. DeBoy, J. D. Peterson, E. K. Hickey, D. H. Haft, S. L. Salzberg, O. White, R. D. Fleischmann, B. A. Dougherty, T. Mason, A. Ciecko, D. S. Parksey, E. Blair, H. Cittone, E. B. Clark, M. D. Cotton, T. R. Utterback, H. Khouri, H. Qin, J. Vamathevan, J. Gill, V. Scarlato, V. Masignani, M. Pizza, G. Grandi, L. Sun, H. O Smith, C M Fraser, E R Moxon, R Rappuoli, and J C Venter (2000), “Complete genome sequence of Neisseria meningitidis serogroup B strain MC58”, Science 287, pp. 18091815 [66] Tzeng, Y.L., C Noble, and D S Stephens (2003), “Genetic basis for biosynthesis of the (alpha 1>4)linked NacetylDglucosamine 1phosphate capsule of Neisseria meningitidis serogroup X”, Infection and Immunity 71, pp. 67126720 [67]. Tzeng, Y. L., A. K. Datta, C. A. Strole, M. A. Lobritz, R. W. Carlson, and D. S. Stephens (2005), “Translocation and surface expression of lipidated serogroup B capsular Polysaccharide in Neisseria meningitidis”, Infection and Immunity 73, pp. 14911505 [68]. Vogel, U., H. Claus, and M. Frosch (2000), “Rapid serogroup switching in Neisseria meningitidis”, New England Journal of Medicine 342, pp. 219220 74 [69]. WaggonerFountain, L. A., J. O. Hendley, E. J. Cody, V. A. Perriello, and L. G. Donowitz (1995), “The emergence of Haemophilus influenzae types e and f as significant pathogens”. 21, pp. 13221324.56 [70]. Wang, X., R. Mair, C. Hatcher, M. J. Theodore, K. Edmond, H. M. Wu, B. H. Harcourt, G. Carvalho Mda, F. Pimenta, P. Nymadawa, D. Altantsetseg, M. Kirsch, S. W. Satola, A. Cohn, N. E. Messonnier, and L. W. Mayer (2011), “Detection of bacterial pathogens in Mongolia meningitis surveillance with a new realtime PCR assay to detect Haemophilus influenzae”, International Journal of Medical Microbiology 301, pp. 303309 [71]. Weber, M. V., H. Claus, M. C. Maiden, M. Frosch, and U. Vogel (2006), “Genetic mechanisms for loss of encapsulation in polysialyltransferasegene positive meningococci isolated from healthy carriers”, International Journal of Medical Microbiology 296, pp. 475484 [72]. Whatmore, A. M., A. Efstratiou, A. P. Pickerill, K. Broughton, G. Woodard, D. Sturgeon, R. George, and C. G. Dowson (2000), “Genetic relationships between clinical isolates of Streptococcus pneumoniae, Streptococcus oralis, and Streptococcus mitis: Characterization of “atypical” pneumococci and organisms allied to S mitis harboring S pneumoniae virulence factorencoding genes”, Infection and Immu [73]Claus, H., M. C. Maiden, R. Maag, M. Frosch, and U. Vogel (2002), “Many carried meningococci lack the genes required for capsule synthesis and transport”, Microbiology 148, pp. 18131819 75 PHỤ LỤC (Trình tự Nucleotide các vùng gene và kết quả so sánh trên ngân hàng gene ) [1]Query 541 TTGGAAGATTTAGTTGCAAATCCGCGACAAAATATTTTGCTGCGTCGCGGTGATGTGGTT 600 Sbjct 583 TTGGAAGATTTGGTGGCCAATCCGCGGCAAAATATTTTGTTGCGCCGTGGTGATGTGGTG 642 Query 601 ACCATGATTACCAATCCCTATACCTTTACGTCTATGGGTGCGGTGGGGAGAACACAAGAA 660 Sbjct 643 ACGATGATTACCAATCCCTACACTTTTACGTCTATGGGTGCGGTGGGGAGAACACAAGAA 702 Query 661 ATCGGTTTTTCAGCCAGAGGCTTATCGCTTTCTGAAGCCATTGGCCGTATGGGCGGTTTG 720 Sbjct 703 ATCGGTTTTTCAGCCAGAGGCTTATCGCTTTCTGAAGCCATTGGCCGTATGGGCGGTTTG 762 Query 721 CAAGATCGCCGTTCTGATGCGCGTGGTGTGTTTGTGTTCCGCTATACGCCATTGGTGGAA 780 Sbjct 763 CAAGATCGCCGTTCTGATGCGCGTGGTGTGTTTGTGTTCCGTTACACGCCTTTGGTGGAA 822 Query 781 TTGCCGGCAGAACGTCAGGATAAATGGATTGCTCAAGGTTATGGCAGTGAGGCAGAGATT 840 Sbjct 823 TTGCCGGCAGAACGTCAGGATAAATGGATTGCGCAAGGCTATGGCAGTGAGGCGGAGATT 882 [2]Query 421 CCGCTGACGGCAGCCGGTGAGCGTGTGTTGGATGCGGTGGCTGCGGTAGGTGGTTCAACG 480 Sbjct 463 CCGCTGACGGCAGCCGGTGAGCGTGTGTTGGATGCGGTGGCTGCGGTAGGTGGTTCAACG 522 Query 481 GCAAATGTGCAGGATACGAATGTGCAGCTGACACGTGGCAATGTAGTACGAACTGTTGCC 540 Sbjct 523 GCAAATGTGCAGGATACCAATGTGCAGCTAACACGTGGCAATGTGGTGCGCACGGTGGCT 582 Query 541 TTGGAAGATTTAGTTGCAAATCCGCGACAAAATATTTTGCTGCGTCGCGGTGATGTGGTT 600 Sbjct 583 TTGGAAGATTTGGTGGCCAATCCGCGGCAAAATATTTTGTTGCGCCGTGGTGATGTGGTG 642 76 [3]Query 766 GATGCGGTGGCTGCGGTAGGTGGTTCAACGGCAAATGTGCAGGATACGAATGTGCAGCTG 825 Sbjct 601 GATGCGGTGGCTGCGGTAGGTGGTTCAACGGCAAATGTGCAGGATACGAATGTGCAGCTG 660 Query 826 ACACGTGGCAATGTAGTACGAACTGTTGCCTTGGAAGATTTAGTTGCAAATCCGCGACAA 885 Sbjct 661 ACACGTGGCAATGTAGTACGAACTGTTGCCTTGGAAGATTTAGTTGCAAATCCGCGACAA 720 Query 886 AATATTTTGCTGCGTCGCGGTGATGTGGTTACCATGATTACCAATCCCTATACCTTTACG 945 Sbjct 721 AATATTTTGCTGCGTCGCGGTGATGTGGTTACCATGATTACCAATCCCTATACCTTTACG 780 Query 946 TCTATGGGTGCGGTGGGGAGAACACAAGAAATCGGTTTTTCAGCCAGAGGCTTATCGCTT 1005 Sbjct 781 TCTATGGGTGCGGTGGGGAGAACACAAGAAATCGGTTTTTCAGCCAGAGGCTTATCGCTT 840 Query 1006 TCTGAAGCCATTGGCCGTATGGGCGGTTTGCAAGATCGCCGTTCTGATGCGCGTGGTGTG 1065 Sbjct 841 TCTGAAGCCATTGGCCGTATGGGCGGTTTGCAAGATCGCCGTTCTGATGCGCGTGGTGTG 900 Query 1066 TTTGTGTTCCGCTATACGCCATTGGTGGAATTGCCGGCAGAACGTCAGGATAAATGGATT 1125 Sbjct 901 TTTGTGTTCCGCTATACGCCATTGGTGGAATTGCCGGCAGAACGTCAGGATAAATGGATT 960 Query 1126 GCTCAAGGTTATGGCAGTGAGGCAGAGATTCCAACGGTATATCGTGTGAATATGGCTGAT 1185 Sbjct 961 GCTCAAGGTTATGGCAGTGAGGCAGAGATTCCAACGGTATATCGTGTGAATATGGCTGAT 1020 [4]Query 661 AAAAATGGCGGTTTTGCCGGGAACTATGCCTTTAAATACGCGAAACACGCCAATGTGGGC 720 Sbjct 661 AAAAATGGCGGTTTTGCCGGGAACTATGCCTTTAAATACGCGAAACACGCCAATGTGGGC 720 Query 721 CGTGATGCTTTTGAGTTGTTCTTGCTCGGCAGCGGGAGTGATGAAGCCAAAGGTACCGAT 780 Sbjct 721 CGTGATGCTTTTGAGTTGTTCTTGCTCGGCAGCGGGAGTGATGAAGCCAAAGGTACCGAT 780 Query 781 CCCTTGAAAAACCATCAGGTACACCGCCTGACGGGCGGCTATGAGGAAGGCGGCTTGAAT 840 Sbjct 781 CCCTTGAAAAACCATCAGGTACACCGCCTGACGGGCGGCTATGAGGAAGGCGGCTTGAAT 840 Query 841 CTCGCCTTGGCGGCTCAGTTGGATTTGTCTGAAAATGGCGACAAAACCAAAAACAGTACG 900 [5]Query 497 CTGCTGGCGCCGCTGGCAACAAAATTCAACGAACGCTATCCGCATATCCGACTTTCGCTC 556 Sbjct 1930503CTGCTGGCGCCGCTGGCAACAAAATTCAACGAACGCTATCCGCATATCCGACTTTCGCTC 1930444 Query 557 616 GTTTCTTCCGAAGGCTATATCAATCTGATTGAACGCAAAGTCGATATTGCCTTACGGGCC Sbjct 1930443GTTTCTTCCGAAGGCTATATCAATCTGATTGAACGCAAAGTCGATATTGCCTTACGGGCC 1930384 Query 617 676 GGAGAATTGGACGATTCCGGGCTGCGTGCACGCCATCTGTTTGACAGCCGCTTCCGCGTA Sbjct 1930383 GGAGAATTGGACGATTCCGGGCTGCGTGCACGCCATCTGTTTGACAGCCGCTTCCGCGTA 1930324 Sbjct 1930323 ATCGCCAGTCCTGAATACCTGGCAAAACACGGCACGCCGCAATCTACAGAAGAGCTTGCC 1930264 [6]Query 1427411 TGCAAAACAACATGGTTACCCATGGCAAGATGATGCACACTTAGGTGATTTACCTGCATT 1427470 Sbjct 904201 TGCAAAACAACATGGTTACCCATGGCAAGATGATGCACACTTAGGTGATTTACCTGCATT 904142 Query 1427471 AACTGTATTGCATGATGGCACAGCAACAAATCCTGTTTTAGCACCACGTCTTAAACATTT 1427530 Sbjct 904141 AACTGTATTGCATGATGGCACAGCAACAAATCCTGTTTTAGCACCACGTCTTAAACATTT 904082 Query 1427531 AGATGATGTTCGCGGTCACTCTATTATGATCCACACGGGTGGTGATAATCACTCCGATCA 1427590 Sbjct 904081 AGATGATGTTCGCGGTCACTCTATTATGATCCACACGGGTGGTGATAATCACTCCGATCA 904022 [7]Query 76681 tttttttAGCATATTCAGGAAAGGGGACATGCAATATGTCAAAATGATCTATATATCCTT 76740 Sbjct 76681 TTTTTTTAGCATATTCAGGAAAGGGGACATGCAATATGTCAAAATGATCTATATATCCTT 76740 Query 76741 TAATATTAAGATTATTTCCAATCAAATAACGTTCTAATTTTGTTGGATGATATGAAAATG 76800 Sbjct 76741 TAATATTAAGATTATTTCCAATCAAATAACGTTCTAATTTTGTTGGATGATATGAAAATG 76800 77 Query 76801 ATTCTAATAAAGGAGCATATGTTCCAGTCCCTTCATCAATTAAATGAGTCGTAATATTCt 76860 Sbjct 76801 ATTCTAATAAAGGAGCATATGTTCCAGTCCCTTCATCAATTAAATGAGTCGTAATATTCT 76860 Query 76861 ttttttttGCAATACTAATCAGATAGGAGTAGTGGCCTGTAAAAGACAGCATATAGAGAT 76920 Sbjct 76861 TTTTTTTTGCAATACTAATCAGATAGGAGTAGTGGCCTGTAAAAGACAGCATATAGAGAT 76920 Query 76921 GAGCAGGCTGTATAATATTAAGGAtttttttGTAACTTCTATAAATATAAAGTAATTTTT 76980 Sbjct 76921 GAGCAGGCTGTATAATATTAAGGATTTTTTTGTAACTTCTATAAATATAAAGTAATTTTT 76980 Query 76981 TAGGAGTTATATTATTAGGGCTTCTAGGAAGCTCAAATAGATAAATAGATTCAAATAGAT 77040 Sbjct TAGGAGTTATATTATTAGGGCTTCTAGGAAGCTCAAATAGATAAATAGATTCAAATAGAT 77040 Query 77041 TCTTGTTAGCTGATTGATGAACTAACTTAGGCATTTTTAAGTTTTTAGAAGTATATAAAA 77100 Sbjct 76981 TCTTGTTAGCTGATTGATGAACTAACTTAGGCATTTTTAAGTTTTTAGAAGTATATAAAA 77100 Query 77101 77041 TTACTAGTAAATTATTGGTTAATTTTTGTATTTTAATTAGGCTTTGGACTTGGTTAAGCT 77160 Sbjct 77101 TTACTAGTAAATTATTGGTTAATTTTTGTATTTTAATTAGGCTTTGGACTTGGTTAAGCT 77160 Sbjct 77161 GACCTAAATTAGATATGACAAATAAATTGTTACGTGGGGGGGTAAGATAAAATGGAGATG 77220 Query 7221 TTGTCAACCACATTGAATCTTGAAAAAACTTTTTAGGCTGAAAAAGAGCtttttttATTT 77280 Sbjct 77221 TTGTCAACCACATTGAATCTTGAAAAAACTTTTTAGGCTGAAAAAGAGCTTTTTTTATTT 77280 78 ... N meningitidis, mắc bệnh trong cộng đồng. Với đề tài nghiên cứu: “ Nghiên cứu đặc điểm sinh học và tính kháng kháng sinh của Neisseria meningitidis tại các ổ dịch lưu hành trong quân đội. Với mục tiêu:... 3.1. Đặc điểm sinh học và cơ cấu nhóm huyết thanh của Neisseria meningitidis phân lập tại một số đơn vị tân binh trong quân đội 37 3.1.1. Đặc điểm sinh học của chủng Neisseria meningitidis phân lập tại các đơn vị tân binh trong quân đội ... 1. Xác định đặc điểm sinh học và cấu nhóm huyết thanh của Neisseria meningitidis phân lập tại một số đơn vị tân binh trong quân đội. Xác định tính nhạy cảm kháng sinh chủng Neisseria