Đang tải... (xem toàn văn)
Lúa gạo là một trong những loại cây lương thực chủ yếu trên thế giới, có vai trò rất quan trọng ở cả lĩnh vực kinh tế và vấn đề an ninh lương thực. Lúa được trồng rộng khắp từ 10o Nam vĩ tuyến đến 53o Bắc vĩ tuyến. Diện tích trồng lúa chiếm khoảng 110 diện tích các giống cây trồng trên thế giới, khoảng 91% diện trích trồng lúa là ở Châu Á, 9% còn lại được phân bố ở Châu Âu, Châu Mỹ, Châu Phi. Với tính thích ứng rộng, cây lúa có mặt ở khoảng 125 nước trên thế giới, cung cấp lương thực cho khoảng 23 dân số trên thế giới và là nguồn cung cấp lương thực chủ yếu của châu Á. Trên thế giới có 15 nước trồng lúa với diện tích hơn hơn 1 triệu ha, trong đó có tới 13 nước ở Châu Á. Riêng Trung Quốc và Ấn Độ chiếm khoảng 50% diện tích trồng lúa và 56% sản lượng lúa toàn cầu. Bangladesh, Indonexia, Thái Lan mỗi nước đều có diện tích trồng lúa lớn hơn tổng diện tích trồng lúa của tất cả các nước Mĩ La tinh.
Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh LỜI CẢM ƠN Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS Khuất Hữu Trung tận tình giúp đỡ suốt thời gian thực đề tài, suốt thời gian hoàn chỉnh luận văn tốt nghiệp Tôi xin chân thành cảm ơn cán bộ, nhân viên Viện Di truyền Nông nghiệp tạo điều kiện điều kiện tốt nhất, giúp đỡ hoàn thành luận văn Tôi xin gửi lời cảm ơn đến TS Nguyễn Như Toản quý thầy cô giáo, gia đình, bạn bè khích lệ tinh thần giúp đỡ để có điều kiện tốt suốt trình thực khóa luận tốt nghiệp Do thời gian kiến thức có hạn nên khóa luận không tránh khỏi hạn chế thiếu sót định Tôi xin cảm ơn tiếp thu ý kiến đóng góp thầy giáo, cô giáo bạn sinh viên Hà Nội, tháng 05 năm 2012 Sinh viên Bùi Thị Linh Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan khóa luận tốt nghiệp đại học: “Nghiên cứu đa dạng di truyền tập đoàn lúa thơm miền Bắc thị SSR’’ hoàn thành hướng dẫn TS Khuất Hữu Trung không trùng với khóa luận khác Các số liệu, kết nêu luận văn hoàn toàn trung thực, khách quan, theo nhận thức vấn đề riêng tác giả Nếu có sai sót xin chịu hoàn toàn trách nhiệm Trong trình nghiên cứu thực khóa luận, kế thừa thành tựu nhà khoa học với trân trọng biết ơn! Hà Nội, tháng 05 năm 2012 Sinh viên Bùi Thị Linh Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT ADN : Acid Deoxyribonucleic AFLP : Amplified Fragment Length Polymorphism ARN : Acid Ribonucleic CTAB : Cetyl Trimetyl Amonium Bromit dNTP : Dideoxy Ribonucleozit Triphotphat EDTA : Etylen Diamine Tetra Acetic acid FAO : Food and Agriculture Orgnization - Tổ Chức nông lương giới IRRI : International rice resarch Institute - Viện Nghiên cứu lúa Quốc tế NTSYS : Numerial Taxonomy System PCR : Polymerase Chain Reaction RAPD : Random Amplified Phlymorphic DNA RE : Restriction Enzyme SSR : Simple Sequence Repeats SNPs : Single Nucleotide Polymorphism TAE : Tris Acetat Acid TCTK : Tổng cục thống kê TE : Tris EDTA UPGMA : Unweighted Pair - Group Method with Arithmetical averages Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh DANH MỤC CÁC BẢNG VÀ HÌNH VẼ Danh mục bảng Trang Bảng 1.1: Các loài Oryza theo Takeoka (1963) với số nhiễm sắc thể, kiểu gen phân bố địa lý Bảng 1.2: Đặc trưng hình thái sinh lý tổng quát nhóm giống lúa Bảng 1.3: Năng suất sản lượng lúa châu lục qua năm 13 Bảng 1.4: Diễn biến sản xuất lúa gạo giới năm gần Bảng 1.5: Diện tích, suất sản lượng lúa Việt Namqua số 13 năm Bảng 2.6: Danh sách 17 giống lúa thu thập dùng nghiên cứu 15 28 Bảng 2.7: Thông tin cặp mồi nghiên cứu Bảng 3.8: Bảng tần số ellele cặp mồi 29 35 Bảng 3.9: Số allele thể hệ số PIC 31 cặp mồi SSR Bảng 3.10: Tỷ lệ khuyết số liệu (M) tỷ lệ dị hợp tử (H) 40 giống lúa chất lượng nghiên cứu 42 Bảng 3.11: Mối quan hệ di truyền 50 giống lúa chất lượng 46 Danh mục hình vẽ Hình 1.1: Vi trí gen thơm nhiễm sắc thể số 24 Hình 3.2: DNA tổng số 17 giống lúa nghiên cứu Hình 3.3: Ảnh điện di sản phẩm PCR mồi RM245 34 41 Hình 3.4: Ảnh điện di sản phẩm PCR giống lúa nghiên cứu với cặp mồi RM515 (205 - 231 bp) Hình 3.5: Ảnh điện di sản phẩm PCR cặp mồi RM270 (104- 117 bp) Hình 3.6: Sơ đồ hình mối quan hệ di truyền giống lúa 43 44 Chất lượng nghiên cứu 45 MỤC LỤC MỞ ĐẦU 1.Lý chọn đề tài Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Mục đích đề tài: 3 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài: 3.1 Ý nghĩa khoa học .3 3.2 Ý nghĩa thực tiễn .3 Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU .4 1.1 Nguồn gốc, phân loại lúa .4 1.1.1 Nguồn gốc 1.1.2 Phân loại 1.2 Tình hình sản xuất lúa giới Việt Nam 11 1.2.1 Trên giới 11 1.2.2 Tình hình sản xuất lúa gạo Việt Nam 13 1.4 Các phương pháp nghiên cứu đa dạng di truyền dựa thị phân tử 18 1.4.1 Nghiên cứu đa dạng di truyền thông qua thị ADN 18 1.4.2 Một số thị phân tử dựa phản ứng PCR 18 1.4.3 Ứng dụng thị SSR nghiên cứu đa đạng di truyền, chọn tạo giống lúa thơm 22 Chương II VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .26 2.1 Vật liệu 26 2.2 Phương pháp nghiên cứu 29 2.2.1 Tách chiết ADN tổng số 29 Chương 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 32 3.1 Kết tách chiết ADN tổng số .32 3.2 Hệ số PIC, số allele tổng số băng ADN thể cặp mồi 33 Bảng 3.8 Tần số allele cặp mồi .34 ( TM: Tên mồi; x: Tổng số ellele dị hợp; y, z: Tổng số ellele khuyết) 37 3.3 Tỷ lệ khuyết số liệu (M) tỷ lệ dị hợp tử (H) giống lúa chất lượng nghiên cứu 40 Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Tỷ lệ dị hợp tử (H) tỷ lệ số liệu khuyết (M) tập đoàn Tám thơm nghiên cứu dựa kết phân tích với 15 cặp mồi SSR trình bày bảng 3.10 .40 3.4 Kết phân tích đa hình mối quan hệ di truyền giống lúa chất lượng nghiên cứu 43 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 48 TÀI LIỆU THAM KHẢO 49 Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh MỞ ĐẦU Lý chọn đề tài Lúa gạo loại lương thực chủ yếu giới, có vai trò quan trọng lĩnh vực kinh tế vấn đề an ninh lương thực Lúa trồng rộng khắp từ 10 o Nam vĩ tuyến đến 53o Bắc vĩ tuyến Diện tích trồng lúa chiếm khoảng 1/10 diện tích giống trồng giới, khoảng 91% diện trích trồng lúa Châu Á, 9% lại phân bố Châu Âu, Châu Mỹ, Châu Phi Với tính thích ứng rộng, lúa có mặt khoảng 125 nước giới, cung cấp lương thực cho khoảng 2/3 dân số giới nguồn cung cấp lương thực chủ yếu châu Á Trên giới có 15 nước trồng lúa với diện tích hơn triệu ha, có tới 13 nước Châu Á Riêng Trung Quốc Ấn Độ chiếm khoảng 50% diện tích trồng lúa 56% sản lượng lúa toàn cầu Bangladesh, Indonexia, Thái Lan nước có diện tích trồng lúa lớn tổng diện tích trồng lúa tất nước Mĩ La tinh Ở Việt Nam, lúa loại trồng quan trọng nhất, vừa nguồn lương thực chủ yếu vừa nông sản có kim nghạch xuất lớn Từ năm 1989 trở lại đây, Việt Nam trở thành quốc gia xuất gạo hàng đầu giới Năm 2001 nước xuất (tính theo triệu tấn) bao gồm: Thái Lan (6,4); Việt Nam (4,0); Trung Quốc (3,0); Mỹ( 2,8); (Nguồn USDA, 2001) Tuy sản xuất với số lượng nhiều chất lượng giá gạo xuất Việt Nam thường thấp so với số nước như: Thái Lan; Mỹ… đặc biệt có chênh lệch lớn loại gạo đặc sản gạo cao cấp Trong số chủng loại chính, gạo thơm ý nhiều người tiêu dùng đặc biệt nước vùng vịnh Pecsic số nước Đông Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Nam Á Tại loại gạo có giá trị cao 2-3 lần so với loại gạo thường Các giống lúa thơm Basmatic 370 Ấn Độ; Khao Dawk Mali105 Thái Lan; Jasmine 85 Mỹ giống lúa gạo quen thuộc thị trường giới Việt Nam có giống lúa Tám thơm, Dự thơm Bắc Bộ; Nàng Hương, Nàng Thơm Chợ Đào Nam Bộ sản xuất lâu đời nhiều người ưa chuộng Tuy nhiên thương hiệu gạo đặc sản nước ta thị trường quốc tế chưa có, việc tiêu thụ gạo phải đương đầu với nhiều khó khăn thách thức cạnh tranh thị trường, nhu cầu chất lương gạo ngày cao Chất lượng gạo đặc tính quan trọng nhất, tác động mạnh mẽ đến giá thị trường thị hiếu người tiêu dùng Chất lượng hạt gạo xác định nhiều yếu tố hình dạng hạt, giá trị dinh dưỡng, chất lượng sau chế biến đặc biệt mùi thơm Mùi thơm đặc tính quan trọng gạo đóng vai trò đáng kể giá thị hiếu sử dụng Trên thực tế, giá gạo thấp nước khác Lượng gạo xuất trọng xuất cao, mặt chất lượng so với nhiều nước khác Điều ngược với xu hướng thị trường giới nước, người tiêu dùng sử dụng nhiều sẵn sàng trả giá cao với loại gạo thơm, ngon Trong năm 2006 giá gạo không thơm từ 250 - 300 USD/tấn giá gạo thơm Basmati bán 850USD/tấn Sự phát triển giống lúa chất lượng cao đặc biệt giống lúa Thơm mục tiêu quan trọng chương trình phát triển giống lúa ngày Chính vậy, tiến hành đề tài: “ Nghiên cứu đa dạng di truyền tập đoàn lúa tám thơm miền Bắc thị SSR’’ nhằm đánh giá, tuyển chọn nguồn gen lúa có đặc tính quý suất, Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh chất lượng, hương thơm phục vụ công tác chọn tạo giống lúa có suất, chất lượng cao Mục đích đề tài: Đánh giá mức độ đa dạng di truyền tập đoàn giống lúa tám thơm địa Việt Nam mức phân tử xác định mối quan hệ di truyền nguồn gen, tuyển chọn nguồn gen lúa có đặc tính quý suất, chất lượng tính chống chịu phục vụ công tác chọn tạo giống lúa thơm phù hợp với điều kiện khí hậu miền Bắc Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài: 3.1 Ý nghĩa khoa học Đánh giá đa dạng di truyền nguồn gen lúa tám thơm tạo sở lý luận cho việc chọn lọc nguồn gen lúa chất lượng ưu tú phục vụ nghiên cứu lai tạo giống định hướng cho công tác thu thập bảo tồn đa dạng nguồn gen lúa chất lượng mức phân tử 3.2 Ý nghĩa thực tiễn Kết nghiên cứu đề tài có ý nghĩa quan trọng việc xác định allele hiếm, allele đặc trưng để nhận dạng xác nguồn gen ưu tú góp phần vào công tác chọn tạo giống lúa thơm có suất cao, phẩm chất gạo tốt phục vụ cho sản xuất miền Bắc Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Nguồn gốc, phân loại lúa 1.1.1 Nguồn gốc Tổ tiên lúa tồn từ đầu kỷ Phấn trắng Vào kỷ này, xuất loại nguyên thuỷ thuộc họ Oryzae, loại Streptochasta Schrad Đến cuối kỷ Phấn trắng xuất loại tre (Bambusa) lúa (Oryza) Một số loại khác xuất muộn vào kỷ thứ ba, thời kỳ phát triển mạnh họ Hoà thảo (Gramineae) Các loài lúa Oryza spp có tổ tiên chung xuất vào thời địa cầu Gondwanaland, sau trái đất tách rời thành năm lục địa [1] Theo Chang (1985): lúa trồng Oryza sativa tiến hoá từ lúa dại hàng năm Oryza nivara Do điều kiện khí hậu, đặc biệt nhiệt độ, lúa Oryza sativa tiếp tục tiến hoá theo ba nhóm: Indica thích hợp với khí hậu nhiệt đới, Japonica thích ứng với khí hậu lạnh Javanica có đặc tính trung gian [18] Tác giả Oka (1988) lại cho Oryza sativa có nguồn gốc từ lúa dại lâu năm Oryza rufipogon [16] Đến năm 2003, nghiên cứu di truyền tiến hoá 101 giống lúa, bao gồm lúa trồng lúa dại, Cheng chia loài lúa trồng Oryza sativa thành hai nhóm tương ứng với hai loài phụ Indica Japonica Trong Oryza rufipogon chia thành bốn nhóm là: nhóm Oryza rufipogon hàng niên ba nhóm Oryza rufipogon đa niên Tác giả giống lúa Japonica có quan hệ gần gũi với nhóm Oryza rufipogon đa niên, giống lúa Indica có quan hệ gần với nhóm lúa Oryza rufipogon hàng niên [21] Ở Châu Phi thấy xuất hai loài lúa dại Oryza longistaminata (đa niên) Oryza brevigulata (hàng niên), nhiều tác giả cho Oryza glaberrima có nguồn gốc từ Oryza breviligulata [1] Cho đến nay, nhiều nhà khoa học đồng ý lúa Khoa Sinh- KTNN Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Bảng 3.10: Tỷ lệ khuyết số liệu (M) tỷ lệ dị hợp tử (H) giống lúa chất lượng nghiên cứu TT 10 11 12 13 14 Tên giống Tám tức Tây Bắc Tám trắng Vĩnh Phúc Tám đen Hà Đông Tám thơm Hải Dương Tám thơm Thái Bình Tám tròn Hải Dương Tám đứng Hải Dương Tám xoan có râu Hải Dương Tám xoan Bắc Ninh Tám nghệ hạt đỏ Tám xoan Vĩnh Phúc Tám xoan Hải Hậu Tám thơm ấp bẹ Tám Xuân Đài 15 Tám tiêu 16 17 Tám Xuân Hồng Tám Nghĩa Hồng Tổng Trung bình M% 0 6,67 0 0 0 6,67 6,67 H% 6,67 0 0 0 0 7,14 6,67 0 0 20,01 1,17 6,67 27,15 1,60 Kết bảng 3.10 cho thấy: có giống khuyết số liệu mồi tỉ lệ 6,67% T4 (Tám thơm Hải Dương), T11 (Tám xoan Vĩnh Phúc), T12 (Tám xoan Hải Hậu) 14 giống lại không bị khuyết số liệu Tỉ lệ khuyết số liệu trung bình 17 giống 1,17%; giống có tỷ lệ khuyết số liệu lớn 15% Như vậy, 17 giống nghiên cứu có ý nghĩa phân tích thống kê Tỷ lệ dị hợp tử (H) cao giống lúa T12 (Tám xoan Hải Hậu) 7,14% Có giống (Tám trắng Vĩnh Phúc), T13 (Tám thơm ấp bẹ), T16 (Tám Xuân Hồng) có tỷ lệ dị hợp 6,67% Còn lại 13 giống có tỷ lệ dị hợp tử 0% có nghĩa giống đồng hợp phạm vi 15 mồi nghiên cứu (chỉ Khoa Sinh- KTNN 41 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh có băng ADN nhất/mồi) Tỷ lệ dị hợp tử trung bình tập đoàn thấp 1,60% Hình 3.4: Ảnh điện di sản phẩm PCR giống lúa nghiên cứu với cặp mồi RM515 Hình 3.5: Ảnh điện di sản phẩm PCR giống lúa nghiên cứu Khoa Sinh- KTNN 42 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh với cặp mồi RM270 3.4 Kết phân tích đa hình mối quan hệ di truyền giống lúa chất lượng nghiên cứu Số liệu thu từ tiêu điện di sản phẩm PCR 15 cặp mồi SSR với tập đoàn 17 giống lúa chất lượng nghiên cứu thống kê phân tích phần mềm NTSYSpc 2.1, từ thiết lập bảng hệ số tương đồng di truyền (Bảng 3.4) sơ đồ hình mối quan hệ di truyền giống lúa chất lượng (hình 3.5) Khoa Sinh- KTNN 43 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Hình 3.6: Sơ đồ hình mối quan hệ di truyền giống lúa chất lượng nghiên cứu Khoa Sinh- KTNN 44 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Bảng 3.11: Mối quan hệ di truyền 17 giống lúa chất lượng Giống T1 T2 T3 T4 T5 T6 T7 T8 T9 T10 T11 T12 T13 T14 T15 T16 T17 T1 1.00 0.22 0.47 0.18 0.56 0.40 0.40 0.65 0.56 0.27 0.73 0.63 0.56 0.33 0.40 0.56 0.40 T2 T3 T4 T5 T6 T7 T8 T9 T10 T11 T12 T13 T14 T15 T16 T17 1.00 0.40 0.53 0.40 0.12 0.27 0.27 0.17 0.12 0.18 0.18 0.17 0.17 0.12 0.08 0.12 1.00 0.37 0.47 0.27 0.33 0.47 0.33 0.12 0.37 0.44 0.27 0.17 0.17 0.27 0.22 1.00 0.37 0.24 0.30 0.30 0.18 0.24 0.20 0.14 0.18 0.18 0.18 0.08 0.18 1.00 0.40 0.65 0.75 0.56 0.33 0.63 0.37 0.47 0.33 0.33 0.33 0.33 1.00 0.40 0.47 0.47 0.47 0.44 0.30 0.40 0.33 0.27 0.33 0.33 1.00 0.65 0.47 0.22 0.44 0.24 0.33 0.27 0.33 0.22 0.22 1.00 0.75 0.33 0.73 0.44 0.56 0.40 0.40 0.40 0.40 1.00 0.47 0.86 0.53 0.47 0.47 0.47 0.47 0.33 1.00 0.44 0.24 0.33 0.40 0.33 0.27 0.27 1.00 0.60 0.53 0.53 0.53 0.53 0.37 1.00 0.44 0.37 0.44 0.63 0.30 1.00 0.47 0.75 0.56 0.75 1.00 0.56 0.47 0.47 1.00 0.56 0.56 1.00 0.56 1.00 Khoa Sinh- KTNN 45 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Qua kết thu bảng 3.11 hình 3.6 cho thấy: Hệ số tương đồng di truyền 17 giống lúa Tám nghiên cứu dao động khoảng từ 0,08 (T4 - Tám thơm Hải Dương T16 - Tám Xuân Hồng) đến 0,86 (T9 Tám xoan Bắc Ninh T11 - Tám xoan Vĩnh Phúc) Dựa vào sơ đồ mối quan hệ di truyền 17 giống lúa, mức tương đồng di truyền 36%, 17 mẫu giống lúa nghiên cứu chia thành nhóm: * Nhóm I: Có 12 giống lúa bao gồm giống T1 (Tám tức Tây Bắc), T12 (Tám xoan Hải Hậu), T5 (Tám thơm Thái Bình), T8 (Tám xoan có râu Hải Dương), T7 (Tám đứng Hải Dương), T9 (Tám xoan Bắc Ninh), T11 (Tám xoan Vĩnh Phúc), T16 (Tám Xuân Hồng), T14 (Tám Xuân Đài), T15 (Tám tiêu), T13 (Tám thơm ấp bẹ), T17 (Tám Nghĩa Hồng) Xét mức tương đồng di truyền 48%: 12 giống nhóm I chia làm nhóm phụ: - Nhóm I.1 gồm có giống lúa: T1 (Tám tức Tây Bắc), T12 (Tám xoan Hải Hậu), T116 (Tám Xuân Hồng) Hệ số tương đồng di truyền cao 0,63 (T1 T12), (T12 T16) Hệ số di truyền tương đồng thấp (giữa giống T1 giống T16) 0,56 - Nhóm I.2 gồm có giống lúa: T5 (Tám thơm Thái Bình), T7 (Tám đứng Hải Dương), T8 (Tám xoăn có râu Hải Dương), T9 (Tám xoan Bắc Ninh) T11 (Tám xoan Vĩnh Phúc) Trong hệ số tương đồng di truyền dao động khoảng từ 0,44 đến 0,86 T9 T11 có hệ số tương đồng di truyền cao 0,86 - Nhóm I.3 gồm giống lúa: T13 (Tám thơm ấp bẹ), T17(Tám Nghĩa Hồng), T14 (Tám Xuân Đài) T15 (Tám tiêu) Trong có hệ số tương đồng cao 0,75 (giữa T13 T15) Hệ số tương đồng di truyền giống lại dao động từ 0,47 đến 0,74 * Nhóm II: Gồm giống lúa T6 (Tám tròn Hải Dương) T10 (Tám nghệ hạt đỏ) Hệ số tương đồng di truyền giống nhóm 0,47 Khoa Sinh- KTNN 46 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh * Nhóm III: Gồm giống lúa T2 (Tám trắng Vĩnh Phúc), T3 (Tám đen Hà Đông), T4 (Tám thơm Hải Dương) Nhóm có hệ số tương đồng di truyền dao động từ 0,37- 0,53 T2 T4 có hệ số tương đồng di truyền cao Khoa Sinh- KTNN 47 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ Kết luận Tập đoàn lúa Tám thơm địa miền Bắc nghiên cứu đa dạng thành phẩn allele Kết phân tích với 15 cặp mồi SSR thu tổng số 42 loại allele, trung bình 2,8 allele/cặp mồi Hệ số PIC trung bình 15 cặp mồi nghiên cứu 0,48 Hệ số PIC đạt giá trị cao (0,74) cặp mồi RM153 với allele thể Các giống lúa nghiên cứu có độ di truyền cao (tỉ lệ dị hợp tử trung bình tập đoàn 1,60%) Tập đoàn 17 giống lúa chất lượng nghiên cứu đa dạng, có hệ số tương đồng di truyền giống dao động từ 0,08 đến 0,82 Xét mức tương đồng di truyền 36%: 17 mẫu giống lúa nghiên cứu chia thành nhóm: + Nhóm I: Gồm có 12 giống hệ số tương đồng di truyền dao động khoảng từ 0,22 - 0,86 chia làm nhóm phụ + Nhóm II: Gồm có giống hệ số tương đồng di truyền 0,47 + Nhóm III: Gồm có giống có hệ số tương đông từ 0,37- 0,53 Các kết thu hữu ích việc xác định nguồn gen phục vụ cho công tác bảo tồn, khai thác sử dụng có hiệu nguồn gen lúa chất lượng Việt Nam Kiến nghị Tiếp tục nghiên cứu xác định allele đặc trưng, allele để nhận dạng xác nguồn gen lúa Tám thơm ưu tú phục vụ nghiên cứu lai tạo giống định hướng cho công tác thu thập bảo tồn đa dạng nguồn gen lúa chất lượng mức phân tử Khoa Sinh- KTNN 48 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh TÀI LIỆU THAM KHẢO * Tài liệu Tiếng Việt Bùi Chí Bửu, Nguyễn Thị Lang (1995), ‘‘Ứng dụng công nghệ sinh học cải tiến giống lúa”, NXB Nông nghiệp, Hà Nội Bùi Chí Bửu, Nguyễn Thị Lang (1999), “Di truyền phân tử - nguyên tắc chọn giống trồng”, NXB nông nghiệp, TP Hồ Chí Minh Phạm Văn Chương (2001), “ Hiện trạng xu phát triển sản xuất lúa gạo Việt Nam ”, Tạp chí Nông nghiệp phát triển Nông thôn, số Lê Doãn Diên, “Nâng cao chất lượng lúa gạo phục vụ tiêu dùng xuất khẩu”, Nhà xuất Nông nghiệp, Hà Nội 2003, trang 37 - 150 Bùi Huy Đáp (1999), “Một số vấn đề lúa”, NXB Nông nghiệp, Hà Nội Trần Văn Đạt, “Sản xuất lúa gạo giới - trạng khuynh hướng phát triển kỷ 21’’, NXB Nông nghiệp, 2005 Trần Văn Đạt (2002), “Tiến trình phát triển sản xuất lúa gạo Việt Nam tù thời nguyên thủy đến đại”, NXB Nông nghiệp TP Hồ Chí Minh Nguyễn Thị Lang (2002), “Ứng dụng công nghệ sinh học chọn tạo giống lúa chất lượng cao” Báo cáo khoa học, An Giang Nguyễn Thị Lang, Trương Bá Thảo, Bùi Chí Bửu (2004), “Nghiên cứu di truyền gen thơm lúa” Tạp chí nông nghiệp phát triển nông thôn 10 Tạ Minh Sơn, Nguyễn Tấn Hinh, Lê Vĩnh Thảo, Vũ Tuyên Hoàng, Nguyễn Hữu Nghĩa, Trương Văn Kính, Nghiễn Trọng Khanh (2006), “Kết nghiên cứu chọn tạo giống lúa giai đoạn 2001-2005” Kỷ yếu Hội nghị tổng kết khoa học công nghệ nông nghiệp 2001 - 2005, Viện Khoa học nông nghiệp Việt Nam, NXB Nông nghiệp, Hà Nội Khoa Sinh- KTNN 49 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh 11 Nguyễn Đức Thành, Phan Thị Bảy, Lê Hồng Điệp (1999), "Phát triển ứng dụng thị phân tử nghiên cứu đa dạng lúa" Báo cáo khoa học, Hội nghị công nghệ sinh học toàn quốc 1999, tr 1205-1215 12 Lê Vĩnh Thảo, Bùi Chí Bửu, Lưu Ngọc Trình, Nguyễn Văn Vương (2004), “Các giống lúa đặc sản, giống lúa chất lượng cao kỹ thuật canh tác”, NXB Nông nghiệp, Hà Nội 13 Đỗ Khắc Thịnh, Nguyễn Ngọc Quỳnh, Dương Ký, Nguyễn Văn Huấn (1997), “Kết tuyển chọn giống lúa mùa FRG67 cho vùng đất phèn, nhiễm mặn, ảnh hưởng thuỷ triều ven thành phố Hồ Chí Minh”, Tạp chí Nông nghiệp Công Nghiệp Thực Phẩm (11/1997) 14 Nguyễn Thanh Tuyền, Trần Văn Chiến (2005), “Kỷ yếu Hội nghị khoa học Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp Việt Nam’’, NXB Nông nghiệp, Hà Nội 15 Tổng cục Thống kê (2008), “Niên giám thống kê năm 2008”, NXB Thống kê, Hà Nội * Tài liệu nước 16 Akagi H, Yokozeki Y, Inagaki A, Fujimura T (1996) Microsatellite DNA markers for rice chromosomes Theor Appl Genet 93:1071 17 Berner DK, Hoff BJ (1986) Inheritance of scent in American long grain rice Crop Science 26: 876-878 18 Chang T.T (1985) Crop history and genetic conservation Rice, A case study In: Iwova state Journal of research, 59, pp 425-455 19 Chen X, Cho Y, McCouch S (2002) Sequence divergence of rice microsatellites in Oryza and other plant species Mol Gen Genomics 268: 331-343 Khoa Sinh- KTNN 50 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh 20 Chen X, Temnykh S, Xu Y, Cho YG, McCouch SR (1997) Development of a microsatellite framework map providing genome-wide coverage in rice (Oryza sativa L.) Theor Appl Genet, 95:553 21 Cheng C Y Motohashi R., Tsuchimoto S., Fukuta Y., Ohtsubo H (2003) Polyphyletic of cultivated rice: based on the interspersion pattern of SINEs Mol.Biol.Evol , pp.67-75 22 Cho YG., Ishii T, Temnykh S, Chen X, Lipovich L, McCouch SR, Park WD, Ayres N, Cartinhour S (2000) Diversity of microsatellites derived from genomic libraries and GenBank sequences in rice (Oryza sativa L.) Theor Appl Genet 100-713 23 Coburn JR, Temnykh SV, Paul EM and McCouch SR (2002) Design and application of microsatellite marker panels for semiautomated genotyping of rice (Oryza sativa L.) Crop Science 42-2092 24 Hokanson SC, Szewc-McFadden AK., Lamboy WF and McFerson JR (1998) Microsatellite (SSR) markers reveal genetic identities, genetic diversity and relationships in Malus × domestica borkh Core subset collection Theor Appl Genet 671-683 25 Kibria K, Nur F, Begum SN, Islam MM, Paul SK, Rahman KS, and Azam SMM (2009) Molecular Marker based Genetic Diversity Analysis in Aromatic Rice Genotypes Using SSR and RAPD Markers Int J Sustain Crop Prod 4(1):23-34 26 Litt M, Luty JA (1989) A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene Am J Hum Genet 44: 397 - 401 27 Mahmoud M Saker, Sawsan S Youssef, Naglaa A Abdallah, Hany S Ashandy and AhmedM El Sharkawy (2005), Genetic analysis of some Khoa Sinh- KTNN 51 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh Egyptian rice genotypes using RAPD, SSR and AFLP, African Journal of Biotechnology Vol (9), pp 882-890 28 Malik AR, Muhammad SM, Zabta KS and Kazuko YS (2010) Genetic analysis of Basmati and non-Basmati Pakistani rice (Oryza sativa L.) cultivars using microsatellite markers Pak J Bot 42(4): 2551-2564 29 McCouch SR, Leonid T, Xu Y, Lobos KB, Clare K, Walton M, Fu B, Maghirang R, Li Z, Xing Y, Zhang Q, Kono I, Yano M, Fjellstrom R, DeClerck G, Schneider D, Cartinhour S, Ware D, Stein L (2002) Development and Mapping of 2240 new SSR Markers for Rice (Oryza sativa L.) DNA Res 9:199-207 30 Natalya V Alpatyeva (2000), Genetic diversity of Vietnamese landraces of rice by RFLP markers,Research study in NIAR, Japan 31 Oka H I (1988), Origin of cultivatied rice J Sci Societies press, Tokyo 32 Olufowote JO, Xu Y, Chen X, Park WD, Beachell HM, Dilday RH, Goto M and McCouch SR (1997) Comparative evaluation of within-cultivar variation of rice (Oryza sativa L.) using microsatellite and RFLP markers Genome 38: 1170-1176 33 Panaud O, Chen X, McCouch SR (1996) Development of microsatellite markers and characterization of simple sequence length polymorphism (SSLP) in rice (Oryza sativa L.) Mol Gen Genet 252-597 34 Sujatha K, Upadhyay R, Kaladhar K, Rani NS and Sarla N (2004) Genetic relationship among aromatic short grain and Basmati rice based on ISSR and SSR markers Rice Genetic Newsletter vol 21 35 Singh Balwant, Singh S.P, Kumar J, 2011 Assessment of genetic diversity of aromatic rices (Oryza sativa L.) using morphological, physiochemical and SSR markers 35 Shu Xia Sun, Fang Yuan Gao, Xian Jun Lu, Xian Jun Wu, Xu Dong Wang,Guang Jun Ren and Hong Luo.2008 Genetic analysis and gene Khoa Sinh- KTNN 52 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Bùi Thị Linh fine mapping of aroma in rice (Oryza sativa L) Genetics and Molecular Biology, 31, 2, 532-538 36 Tateoka, T., 1963 Taxononic Studies of Oryza III Key to the species and their enumeration Bot Mag Tokyo 76: 165-173 37 Tateoka, T., 1964 Notes on some grasses XVI Embryo structure of the genus Oryza in relation to the systematics Amer J Bot 51: 539-543 38 Temnykh S, Park WD, Ayres N, Cartinhour S, Hauck N (2000) Mapping and genome organization of microsatellite sequences in rice (Oryza sativa L.) Theor Appl Genet 100-697 39 Vos P, Hogers R, Bleeker M, Reijans M, Lee TVD, Hornes M, Frijters A, Pot J, Peleman J, Kuiper M, Zabeau M (1995) AFLP: a new technique for DNA fingerprinting Nucl Acids Res 23(21): 4407 - 4414 40 Welsh J and McClelland M (1990) Genomic fingerprinting produced by PCR with arbitrary primers Nucl Acids Res 18: 7213-7218 41 Williams JGK, Kubelik AR, Livak KJ, Rafalski JA and Tingey SV (1990) DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers Nucl Acids Res 18: 6531-6535 * Wedside 42.http://www.vietecon.org/hoithao/faea2008/papers/12%20Chu%20Tien %20Quang-Viet.pdf 43 http://www.longdinh.com 44 www.gramene.org, 2006 Khoa Sinh- KTNN 53 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Khoa Sinh- KTNN Bùi Thị Linh 54 Lớp K34A- Sinh Khóa luận tốt nghiệp Khoa Sinh- KTNN Bùi Thị Linh 55 Lớp K34A- Sinh ... nghiên cứu đa dạng di truyền dựa thị phân tử 18 1.4.1 Nghiên cứu đa dạng di truyền thông qua thị ADN 18 1.4.2 Một số thị phân tử dựa phản ứng PCR 18 1.4.3 Ứng dụng thị SSR nghiên cứu đa. .. lúa thơm cổ truyền Việt Nam ảnh hưởng đất đai nơi canh tác 1.4 Các phương pháp nghiên cứu đa dạng di truyền dựa thị phân tử 1.4.1 Nghiên cứu đa dạng di truyền thông qua thị ADN Chỉ thị phân tử... kỹ thuật nêu áp dụng tốt cho nghiên cứu đa dạng di truyền lúa (Mahmoud M Saker ctv., 2005) [27] Kết nghiên cứu đa dạng di truyền 38 giống lúa thơm địa Basmati thị SSR tác giả Raj (Raj ctv., 2006)