Nghiên cứu ứng dụng mPCR để xác định phân týp của HIV 1 ở hà nội viêng chăn

166 807 0
Nghiên cứu ứng dụng mPCR để xác định phân týp của HIV 1 ở hà nội viêng chăn

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y SA NGOUAN KA VANH NGHIÊN CỨU ỨNG DỤNG MULTIPLEX PCR ĐỂ XÁC ĐỊNH PHÂN TÝP CỦA HIV-1 Ở HÀ NỘI VÀ VIÊNG CHĂN (2007-2011) LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC HÀ NỘI - 2016 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y SA NGOUAN KA VANH NGHIÊN CỨU ỨNG DỤNG MULTIPLEX PCR ĐỂ XÁC ĐỊNH PHÂN TÝP CỦA HIV-1 Ở HÀ NỘI VÀ VIÊNG CHĂN (2007-2011) Chuyên ngành: VI SINH Y HỌC Mã số: 62.72.01.15 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS Nguyễn Thái Sơn GS TS Lê Bách Quang HÀ NỘI - 2016 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan luận án sử dụng phần số liệu đề tài nghiên cứu cấp Bộ Quốc phòng có tên: “NGHIÊN CỨU XÂY DỰNG CƠ SỞ NGUỒN GEN VÀ NGUỒN CHỦNG CÁC MẦM BỆNH PHỤC VỤ KIỂM SOÁT CÁC TÁC NHÂN SINH HỌC” Kết đề tài thành nghiên cứu tập thể mà thành viên tham gia Tôi chủ nhiệm đề tài cho phép sử dụng phần số liệu để bảo vệ luận án tiến sĩ Các kết luận án trung thực chưa công bố công trình khác nhóm nghiên cứu Tác giả SA NGOUAN KA VANH LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cảm ơn Đảng Nhà nước, Bộ quốc phòng, các ngành có liên quan hai nước iệt - trực tiếp phòng T y viên Quốc phòng Đại sứ quán nước CHDCND Lào nước CHXHCN Việt Nam tin tưởng cử sang Việt Nam học tập nghiên cứu Tôi xin chân thành cảm ơn Đảng ủy - Ban giám đốc Học viện Quân y, Bệnh viện quân y 103, Phòng Sau đại học, Bộ môn - Khoa Vi sinh y học, Trung tâm Y - Dược học Quân sự, Phòng xét nghiệm sinh học phân tử - Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương tận tình tạo điều kiện thuận lợi để hoàn thành luận án Tôi xin trân trọng bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Nguyễn Thái Sơn GS.TS ê Bách Quang nh ng người thầy có nhiều kiến thức dày dặn kinh nghiệm tận tình giảng dạy hướng dẫn bảo giúp đỡ suốt trình học tập, nghiên cứu thực đề tài hoàn thiện luận án Tôi xin trân trọng biết ơn thầy cô Học viện truyền đạt kiến thức, kinh nghiệm đóng góp nh ng ý kiến quý báu cho hoàn thiện luận án chân thành cảm ơn bạn bè đồng nghiệp động viên giúp đỡ vật chất, tình thần trình học tập nghiên cứu Tôi xin chân thành cảm ơn bệnh viện trung tâm phòng chống điều trị HI IDS nh ng người đối tượng nghiên cứu khu vực Hà ội - iệt am iêng Ch n - tạo điều kiện thuận lợi cho lấy mẫu bệnh ph m để hoàn thành luận án Tôi xin chân thành cảm ơn Đại tá Thiều Minh Hùng Hệ trưởng Hệ Quốc tế tập thể cán nhân viên Hệ Quốc tế tạo điều kiện giúp đỡ nơi n chỗ động viên trình học tập, nghiên cứu Tôi vô biết ơn đại gia đình bên nội ngoại đặc biệt vợ hết lòng ủng hộ động viên suốt trình học tập nghiên cứu động lực giúp vượt qua nh ng khó kh n để hoàn thiện luận án Tác giả luận án SA NGOUAN KA VANH MỤC LỤC Trang phụ bìa Trang ời cam đoan Lời cảm ơn Mục lục Danh mục từ viết tắt Danh mục bảng Danh mục biểu đồ Danh mục hình ĐẶT VẤN ĐỀ 01 CHƢƠNG TỔNG QUAN…… …04 1.1 Tình hình nhiễm HIV/AIDS toàn cầu… 04 Tình hình HI IDS châu Á … 05 1.1.2 Tình hình nhiễm HI iệt am 05 Tình hình nhiễm HI 06 1.2 Nguồn gốc, xuất xứ HIV .07 1.3 Cấu trúc HIV 11 Đặc điểm cấu trúc virus HI .11 Sự xâm nhập trình nhân lên HI tế bào chủ thể 14 1.4 Vài nét lịch sử phân loài HIV 16 1.4.1 Các phân týp HIV 17 hân bố phân t p HI - khu vực toàn cầu .18 Đồng nhiễm bội nhiễm dạng tái tổ hợp HI -1 .19 1.5 Đ c i m phân t p HIV-1 số khu vực 20 Đặc điểm phân t p HI - châu Phi 20 Đặc điểm phân t p HI - châu Âu 21 .3 Đặc điểm phân t p HI - châu Mỹ .21 Đặc điểm phân t p HI - Trung Đông 22 Đặc điểm phân t p HI - Liên Bang Nga 22 Đặc điểm phân t p HI - châu Úc .22 Đặc điểm phân t p HI - châu Á 23 Đặc điểm phân t p HI - iệt am 24 Đặc điểm phân t p HI - Lào 24 1.6 Một số kỹ thuật xác ịnh phân t p HIV-1 .25 hát kháng thể peptide đặc hiệu HI -1 25 Kỹ thuật Heteroduplex Mobility ssay (HM ) .25 Kỹ thuật giải trình tự gen (Sequencing) 26 Kỹ thuật multiplex CR hay m CR ( CR đa mồi) 27 CHƢƠNG ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 30 2.1 Đối tƣợng 30 Địa điểm lấy mẫu máu khu vực Hà ội (K H ) - Viêt Nam 30 Địa điểm lấy mẫu máu khu vực iêng Ch n (K C) - Lào 30 2.2 Vật liệu thiết bị nghiên cứu 32 Các sinh ph m hoá chất 32 Các máy thiết bị .33 Các mồi d ng nghiên cứu 33 2.3 Phƣơng pháp nghiên cứu 36 Thiết kế nghiên cứu 36 Tách chiết acid nucleic (R D ) .38 3.3 Tham khảo quy trình tác giả Fumihiro ( 00 ) 40 Quy trình thực m CR .50 2.4 Các bƣớc tối ƣu chu trình nhiệt thành phần phản ứng PCR mPCR 53 Tối ưu hoá nhiệt độ gắn mồi thích hợp Tối ưu hóa thời gian trì nhiệt độ gắn mồi 59 Tối ưu hóa nồng độ MgCl2 60 2.5 Xác ịnh kích thƣớc sản phẩm PCR 62 2.6 Ch y ki m tra quy trình sau tối ƣu áp dụng .62 2.7 Giải trình tự gen ối chiếu kết với kỹ thuật mPCR 63 Tinh sản ph m CR 63 Bước chạy phản ứng CR gắn BigDye .65 Bước tinh sản ph m CR gắn BigDye 66 Bước biến tính HiDi Formamid 66 2.8 Địa i m thời gian nghiên cứu 66 Địa điểm nghiên cứu .Thời gian nghiên cứu 66 CHƢƠNG KẾT QUẢ .67 3.1 Tối ƣu hóa qui trình mPCR xác ịnh phân t p HIV-1 phù hợp khu vực Hà Nội Viêng Chăn .67 Kết tách D 67 Kết lựa chọn quy trình phản ứng CR 68 .3 Kết tối ưu hoá quy trình m CR xác định phân t p HI -1 70 Kết kiểm tra quy trình tối ưu .77 Quy trình xác định phân t p HI - đối tượng nhiễm Khu vực Hà ội khu vực iêng Ch n 3.2 Kết xác ịnh phân t p HIV-1 khu vực Hà Nội Viêng Chăn 84 Kết xác định phân t p HI - khu vực H C m CR Kết giải trình tự gen đối chiếu với kết kỹ thuật m CR 87 CHƢƠNG BÀN LUẬN 100 4.1 Tối ƣu hóa quy trình mPCR xác ịnh phân t p HIV-1 ối tƣợng nhiễm khu vực Hà Nội Viêng Chăn 100 ựa chọn phương pháp tách D R 100 ựa chọn kỹ thuật xác định phân t p HI -1 101 ựa chọn quy trình phản ứng multiplex CR 102 Kết tìm nhiệt độ gắn mồi thích hợp 103 Kết tìm thời gian trì nhiệt độ gắn mồi 04 Kết tối ưu hoá nồng độ MgCl2 105 Kiểm tra qui trình tối ưu .106 4.2 Ứng dụng quy trình mPCR xác ịnh phân t p HIV-1 ối tƣợng khu vực Hà Nội Viêng Chăn .110 KẾT LUẬN .117 DANH MỤC CÁC C NG TR NH C NG BỐ KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI LUẬN ÁN TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT TRONG LUẬN ÁN Từ viết tắt Từ gốc tiếng Anh viết ầy ủ/nghĩa tiếng Việt AIDS Aquired Immune Deficiency Syndrome/ Hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải bp Base pair/cặp bazơ BLAST Basic Local Alignment Search Tool Công cụ tìm kiếm trình tự tương đồng CD4 Cluster of Differentiation CDC Centers for Disease Control and Prevention/Trung tâm kiểm soát phòng ngừa dịch bệnh cDNA Complementary DNA chuỗi D bổ sung CHAS Centre for HIV/AIDS/STI Trung tâm phòng chống HI IDS bệnh lây truyền qua đường tình dục quốc gia CRF- cpx Circulating recombinant form – Complex Tái tổ hợp phức tạp CRFs Circulating recombinant forms Tái tổ hợp lưu hành DNA Deoxyribonucleic acid dNTP Deoxynucleotit triphosphate/ Edit Editorial EDTA Ethylen Diamin Tetra Acetic ELISA Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay/Thử nghiệm miễn dịch xít deoxyribonucleic gắn enzym Env Envelop vỏ GMD Gái mại dâm GC Guanine - Cytosine gag group specific antigen/ Kháng nguyên đặc hiệu nhóm gp Glycoprotein irus gây suy giảm miễn dịch người HIV Human Immunodeficiency Virus Invi Invitrogen Kda Kilodalton KVHN Khu vực Hà ội KVVC Khu vực iêng Ch n MOH Ministry of Health Bộ Y tế mPCR Multiplex olymerase Chain Reaction hản ứng CR đa mồi NC ghiên cứu NCMT Nghiện chích ma túy OD Optical Density Mật độ quang học PBMCs Peripheral Blood Mononuclear Cell Tế bào bạch cầu máu ngoại vi đơn nhân RNA Acid ribonucleic/ xít ribonucleic RT Reverse Transcriptase/ Enzyme phiên mã ngược TBE Tris Borat EDTA Tm Melting Temperature/ Nhiệt độ nóng chảy tMRCA Time of most recent common ancestor Ước tính thời gian xuất nguồn gốc gần irus gây suy giảm miễn dịch khỉ SIV Simian Immunodeficiency Virus URF Unique recombinant form Tái tổ hợp UNAIDS United Nation Program on HIV and AIDS Prevention Chương trình hỗ trợ phòng ngừa HI IDS iên hợp quốc V Volt / Vôn WHO World Health Organization Tổ chức Y tế giới 133 Sousa J.D; Muller V; Lemey P, et al (2010), “High GUD Inci dence in the Early 20th Century Created a Particularly Permissive time Window for the Origin and Initial Spread of Epidemic HIV Strains” PLoS ONE 5(4) pp 1-16 134 Sauter D; Petit S J; Plantier J.C, et al (2011) “ HIV-1 Group P is unable to antagonize human tetherin by Vpu Env or Nef ” licensee BioMed Central Ltd, Retrovirology, 8(103), pp 1- 135 Takebe Y; Motomura K; Tatsumi M, et al (2003), “ High prevalence of diverse forms of HIV-1 inter subtype recombinants in Central Myanmar: geographical hot spot of exten sive recombination” AIDS, (17), pp 2077–87 136 Thomson M M; Vinogradova A;Delgado E, et al, (2009),“Molecular Epidemiology of HIV-1 in St Petersburg, Russia: Predominance of Subtype A, Former Soviet Union Variant and Identification of Intrasubtype Subclusters” J Acquir Immune Defic Syndr 51,(3), pp.1- 137 Tommy W C; Wong K H; Wang Y, et al (2008) “Molecular Epidemiology Demon strated Three Emerging Clusters of Human Immuno deficien cy Virus Type Subtype B Infection in Hong Kong” Aids Research and Human Retroviruses, 24 (7), pp.1- 138 Triques K; Bourgeois A; Vidal N, et al (2000) “Near-Full-Length Genome Sequencing of Diver Gent African HIV Type Subtype F” Aids Research and Human Retroviruses, 16(2), pp.139-151 139 Triques K ; Bourgeois A ; Saragosti S, et al (1999), “High Diversity of HIV1 Subtype F Strains in Central Africa” Virology, (259), pp 99-109 140 UNAIDS (2012), Factsheet Global statistics 141 UNAIDS (2012), The gap report 142 UNAIDS (2012), Together we will end AIDS 143 USAIDS (2011), HIV/AIDS health profile, Asia 144 Vallari A N; Holzmayer V R; Harris B R, et al (2011), “Confirmation of Putative HIV-1 Group P in Cameroon” Journal of virology, 85(3), p p.1403–1407 145 Vidal N; Mulanga C; Bazepeo E S, et al (2006) “Identification and Molecular Characterization of Sub subtype A4 in Cen tral African” Aids research and Human Retroviruses, 22 (2), pp 182–187 146 Vladimir A N; Monty A Montano M F, et al (1999) “Molecular cloning and Phylogenetic Analysis of Human Immuno deficiency Virus Type Subtype C: a Set of 23 Full-Length Clones from otswana” Journal of virology, 73(5), pp 4427– 4432 147 Wainberg M A; and Brenner B G (2010), “Role of HIV Subtype Diversity in the Development of Resistance to Antiviral Drugs” Viruses, 2, pp.2493-2508 148 Weniger B G; Takebe Y; Yamazaki S, et al (1994) “The molecular epidemiology of HIV in Asia” AID, (2), p 513-528 149 Wertheim J O; Worobey M, (2009), “Dating the Age of the SIV Lineages That Gave Rise to HIV-1 and HIV-2” PLoS Comput Biol, (5), pp.1- 150 World (2012), Population data sheet 151 Worobey M; Gemmel M; Teuwen, et al (2008) “Direct Evidence of Extensive Diversityof HIV-1in Kinshasaby1960” Nature,455, pp.661-664 152 Yang S J, Lopez L A, Colin M E, et al ( 2011) “Lack of a daptation to human tetherin in HIV-1 Group O and P” Retrovirology, (8), pp.1-18 153 Yerly S, Wy V l; Ledergerber B, et al (2007) “Transmission of HIV1drug resistance in Switzerland a 10-year molecular epidemiology survey” AIDS, 21, pp 2223-2229 154 Yiming S; and Williamson C, (2012), “The HIV-1 Epidemic Low to Middle-Income Countries” Cold Spring Har Perspect Med (2), pp.1-14 155 156 157 158 Yong Z; Lin L; Liu L; Yang L, et al (2006) “ Domi nance of HIV-1 subtype CRF01_AE in sexually acquired cases leads to a new epidemic in Yunnan province of China” PLoS Med, 3(11), pp 2065- 2077 Yu X ; Yuan L; Huang Y; Fang Z, et al (2011), “Susceptibility of HIV-1 Subtypes ’ CRF07_ C and CRF01_AE that Are Predominantly Circulating in China to HIV-1 Entry Inhibitors” PLoS ONE (3), pp.1-8 Zhang M; Foley B; Kathrin S A, et al (2010), “The role of recombination in the emergence of a complex and dynamic HIV epidemic” Retrovirology,7:25, pp.1-15 Zhang M; Wilbe K; Wolfe N D, et al (2005) “HIV Type CRF13_cpx Revisited Identification of a New Sequence from Cameroon and Signal for Subsubtype J2”, Aids Research and Human Retroviruses, 21(11), pp.955–960 159 Zhong P; Pan Q; Ning Z; Gong J, et al (2007) “Genetic diversity and drug resistance of human immunodeficiency virus type1(HIV-1) strains circulating in Shanghai” AIDS Res Hum Retroviruses 23 (7), pp 847-56 160 http://en.wikipedia.org/wiki/File:HIV_Mature_and_Immature.PNG Phụ lục PHIẾU THU THẬP THÔNG TIN ĐỐI TƯỢNG NGHIÊN CỨU Tiến hành đề tài: “Nghiên cứu ứng dụng Multiplex PCR xác định phân týp HIV-1 khu vực Hà Nội - Viêng Chăn (2007-2011” Họ tên: Giới tính: Mã số nghiên cứu: - Nam □ - Nữ □ Ngày, tháng, năm sinh: Hoặc Tuổi: Nghề nghiệp: Địa chỉ:  Với Khu vực Viêng Chăn: - Bản : - Huyện:  Với Khu vực Hà Nội: - Huyện: - Quận:  Thời gian sống khu vực (năm): Điều trị ARV theo phác đồ: Điều trị từ ngày tháng năm: Bệnh kèm theo: - BK □ - HBV □ - HCV □ Phỏng vấn thu thập thông tin đối tượng tự nguyện hợp tác nghiên cứu xác minh lại thông tin thông qua hồ sơ lưu trữ Ngày Tháng Năm (Họ tên, chữ ký người vấn) Phụ lục Phụ lục GIẤY XÁC NHẬN VỀ SỰ ĐỒNG Ý VÀ TỰ NGUYỆN THAM GIA NGHIÊN CỨU Tôi tên là: Tuổi: Giới: Nghề nghiệp: Địa tại: Sau đọc phiếu vấn, trực tiếp nghe vấn lời giải thích nhóm nghiên cứu, thân hiểu phần ý nghĩa tầm quan trọng đề tài: “Nghiên cứu ứng dụng Multiplex PCR xác định phân týp HIV-1 khu vực Hà Nội - Viêng Chăn (2007-2011”, với hai mục tiêu: (1) Tối ưu hóa qui trình multiplex PCR để xác định phân týp HIV-1 khu vực Hà Nội Viêng Chăn (2) Xác định phân týp HIV-1 đối tượng khu vực Hà Nội Viêng Chăn kỹ thuật multiplex PCR Hơn thời điểm thuận lợi để thể tính tự nguyện, góp sức vào chương trình phòng chống HIV/AIDS quốc gia tầm khu vực Vì tự nguyện, đồng ý cung cấp thông tin theo phiếu vấn cho phép nhóm nghiên cứu tiếp tục phân tích mẫu máu tìm phân týp HIV sau xét nghiệm kiểm tra định kỳ Ngày tháng năm Xác nhận Trưởng khoa điều trị Chứ ký Người đồng ý tham gia Phụ lục NỒNG ĐỘ DNA CỦA 15 MẪU SAU TINH SẠCH GEL C C MẪU Đ BIẾT PH N T P ĐỂ TIẾN H NH GIẢI TR NH TỰ ĐỐI CHIẾU KẾT QUẢ Ký hiệu Mẫu OD260/OD280 Nồng độ DNA (ng/ul) G1 HNA04 1,48 29,10 G2 HNA31 1,68 30,30 G3 HNA46 1,88 114,50 G4 HNB34 1,82 36,30 G5 HNB39 1,75 20,20 G6 HNB50 1,82 41,20 G7 HNC31 1,86 124,30 G8 HNC33 1,91 215,40 G9 HNC35 1,87 286,30 G10 HNC40 1,85 166,20 G11 VCA02 1,85 24,30 G12 VCA33 1,82 121,0 G13 VCB07 1,95 49,20 G14 VCB25 1,79 30,90 G15 VCB27 1,88 44,0 Phụ lục N TỔNG HỢ STT Mã số XN Mã số BN 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 HNA01 HNA02 HNA03 HNA04 HNA05 HNA06 HNA07 HNA08 HNA09 HNA10 HNA11 HNA12 HNA13 HNA14 HNA15 HNA16 HNA17 HNA18 HNA19 HNA20 HNA21 HNA22 HNA23 HNA24 HNA25 HNA26 HNA27 HNA28 HNA29 HNA30 HNA31 HNA32 HNA33 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 OD 260/ 280 ổ 31 36 32 26 38 26 30 26 35 50 33 33 31 34 29 52 43 32 40 23 29 29 29 30 37 24 25 37 40 30 29 26 25 Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nữ Nam Nữ Nam Nam Nam Nam Nam 2.02 1.49 1.88 1.48 1.86 1.57 1.83 1.52 1.78 1.82 1.87 1.95 1.53 2.05 1.61 2.67 1.89 1.74 1.83 1.86 1.72 1.59 1.88 1.95 1.52 1.93 1.9 1.42 1.62 1.56 1.68 1.59 1.83 N Nồn độ DNA (ng/ul) 36.20 27.76 70.60 29.43 28.91 31.86 28.49 27.57 46.10 28.71 70.40 23.28 22.94 34.82 25.70 27.23 170.90 17.50 89.20 179.50 10.20 22.70 198.40 31.92 24.30 37.10 15.40 13.80 29.30 42.60 30.30 25.90 36.80 N n E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E -1 Ngày, tháng, Nă 09/03/2009 09/03/2009 17/08/2009 28/07/2009 03/03/2009 09/03/2009 09/03/2009 08/05/2009 03/07/2009 09/03/2009 03/07/2009 09/03/2009 09/03/2009 09/03/2009 08/05/2009 08/05/2009 17/08/2009 23/03/2009 17/08/2009 17/08/2009 13/05/2009 09/07/2009 17/08/2009 23/03/2009 13/05/2009 23/03/2009 13/05/2009 01/04/2009 01/04/2009 01/04/2009 28/07/2009 13/05/2009 01/04/2009 n N CRF01-AE CRF01-AE 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 HNA34 HNA35 HNA36 HNA37 HNA38 HNA39 HNA40 HNA41 HNA42 HNA43 HNA44 HNA45 HNA46 HNA47 HNA48 HNA49 HNA50 HNB01 HNB02 HNB03 HNB04 HNB05 HNB06 HNB07 HNB08 HNB09 HNB10 HNB11 HNB12 HNB13 HNB14 HNB15 HNB16 HNB17 HNB18 HNB19 HNB20 HNB21 HNB22 HNB23 1034 1035 1036 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 45 33 31 29 33 29 25 31 33 31 40 31 32 32 49 31 26 27 32 24 36 35 20 33 27 32 25 25 21 31 22 25 24 35 29 24 26 24 26 22 Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ 1.81 1.87 1.98 1.87 1.77 1.89 1.88 1.84 1.79 1.77 1.88 1.89 1.88 1.84 1.82 1.87 2.13 1.89 1.86 1.83 1.86 1.78 2.05 1.76 1.77 1.84 1.80 1.76 1.79 1.86 1.77 1.92 1.93 1.74 1.81 1.84 1.82 1.93 1.83 1.92 33.80 37.20 26.10 160.30 62.90 35.40 259.3 65.40 34.10 44.10 88.40 219.6 144.5 221.6 99.90 161.3 44.90 49.10 97.60 37.20 100.9 29.70 37.00 68.90 32.80 78.50 268.40 22.30 32.70 45.70 40.20 68.90 28.10 20.90 43.40 144.80 112.50 42.00 98.10 35.30 E E E KXĐ E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E KXĐ E E E E E E E E E E 07/07/2009 03/07/2009 01/04/2009 1/04/2009 14/05/2009 02/04/2009 17/08/2009 02/04/2009 02/04/2009 02/04/2009 04/05/2009 04/05/2009 28/07/2009 04/05/2009 04/05/2009 04/05/2009 04/05/2009 10/03/2009 18/08/2009 10/03/2009 18/08/2009 10/03/2009 10/03/2009 10/03/2009 07/03/2009 18/08/2009 07/03/2009 10/03/2009 10/03/2009 10/03/2009 11/03/2009 18/08/2009 07/03/2009 11/05/2009 11/03/2009 06/07/2009 05/05/2009 07/03/2009 05/05/2009 18/08/2009 CRF01-AE 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 HNB24 HNB25 HNB26 HNB27 HNB28 HNB29 HNB30 HNB31 HNB32 HNB33 HNB34 HNB35 HNB36 HNB37 HNB38 HNB39 HNB40 HNB41 HNB42 HNB43 HNB44 HNB45 HNB46 HNB47 HNB48 HNB49 HNB50 HNC01 HNC02 HNC03 HNC04 HNC05 HNC06 HNC07 HNC08 HNC09 HNC10 HNC11 HNC12 HNC13 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 31 35 27 27 26 26 23 24 44 31 35 31 22 24 27 20 28 36 35 25 34 21 26 32 49 32 33 35 30 53 31 33 28 29 27 28 33 28 36 24 Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nam Nam Nam Nữ Nam Nữ Nữ Nam Nam Nữ Nam Nam Nữ 1.9 2.06 2.75 1.76 1.83 1.22 1.87 1.88 1.83 1.87 1.82 1.79 1.91 1.83 1.78 1.75 1.83 1.83 1.84 1.93 1.79 1.85 1.75 1.91 1.83 1.81 1.82 1.25 2.48 1.85 1.86 1.91 1.77 1.83 2.31 1.82 2.09 2.29 1.87 1.83 113.9 42.70 39.70 48.29 38.44 21.30 21.50 107.20 73.80 63.70 36.30 37.40 28.40 207.00 39.30 50.20 23.50 40.40 31.60 35.70 42.70 30.90 14.10 44.00 171.50 53.20 41.2 29.60 38.80 148.00 100.20 34.90 129.00 28.30 50.30 24.90 35.40 23.30 44.00 51.60 E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E 05/05/2009 05/05/2009 07/03/2009 11/05/2009 11/05/2009 11/03/2009 05/05/2009 18/08/2009 07/03/2009 11/03/2009 28/07/2009 11/03/2009 12/03/2009 18/08/2009 07/03/2009 28/07/2009 12/03/2009 12/03/2009 12/03/2009 12/03/2009 12/03/2009 12/03/2009 05/05/2009 02/04/2009 05/05/2009 05/05/2009 28/07/2009 18/02/2009 25/02/2009 02/03/2009 17/08/2009 02/03/2009 28/07/2009 02/03/2009 25/02/2009 25/02/2009 25/02/2009 25/02/2009 17/08/2009 16/02/2009 CRF01-AE CRF01-AE CRF01-AE 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 HNC14 HNC15 HNC16 HNC17 HNC18 HNC19 HNC20 HNC21 HNC22 HNC23 HNC24 HNC25 HNC26 HNC27 HNC28 HNC29 HNC30 HNC31 HNC32 HNC33 HNC34 HNC35 HNC36 HNC37 HNC38 HNC39 HNC40 VCA01 VCA02 VCA03 VCA04 VCA05 VCA06 VCA07 VCA08 VCA90 VCA10 VCA11 VCA12 VCA13 1114 1115 1116 1117 1118 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 793 624 779 774 798 769 80 800 797 246 791 384 560 29 21 28 27 26 31 29 45 51 19 28 31 27 29 23 27 33 32 42 26 28 28 34 29 23 28 37 55 55 55 25 32 50 32 35 48 34 46 27 43 Nữ Nam Nam Nữ Nam Nữ Nam Nam Nam Nam Nữ Nam Nữ Nữ Nữ Nữ Nam Nam Nam Nam Nam Nữ Nữ Nam Nữ Nữ Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam 1.82 1.93 1.84 1.79 1.88 1.87 1.87 1.86 1.85 1.90 1.85 1.87 1.92 1.86 1.91 1.87 1.85 1.86 1.87 1.91 1.85 1.87 1.92 1.86 1.91 1.87 1.85 2.06 1.85 1.76 1.77 1.92 1.87 1.88 1.82 1.77 1.82 1.79 1.79 1.83 29.20 57.20 173.40 91.50 121.00 303.70 20.20 244.70 284.50 235.40 191.70 286.30 100.90 81.00 78.20 276.60 166.20 124.30 122.50 215.40 191.70 286.30 100.80 81.00 78.20 276.60 166.20 21.90 24.30 37.10 29.10 33.80 29.30 42.60 34.10 25.90 36.80 33.80 27.20 26.10 E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E A E E E E E E E E E E KXĐ 16/02/2009 18/02/2009 07/05/2009 07/05/2009 18/08/2009 07/05/2009 28/07/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 15/01/2009 27/04/2009 18/08/2009 27/04/2009 27/04/2009 27/04/2009 07/05/2009 27/04/2009 27/04/2009 03/07/2009 27/04/2009 14/12/2010 23/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 CRF01-AE CRF01-AE CRF01-AE CRF01-AE 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 VCA14 VCA15 VCA16 VCA17 VCA18 VCA19 VCA20 VCA21 VCA22 VCA23 VCA24 VCA25 VCA26 VCA27 VCA28 VCA29 VCA30 VCA31 VCA32 VCA33 VCA34 VCA35 VCA36 VCA37 VCA38 VCA39 VCA40 VCA41 VCA42 VCA43 VCA44 VCA45 VCA46 VCA47 VCA48 VCA49 VCA50 VCB01 VCB02 VCB03 20 420 558 298 145 66 56 705 581 198 704 191 271 771 196 758 720 16 448 786 700 22 691 764 466 30 365 745 323 433 407 673 626 808 182 470 60 782 463 798 28 23 37 37 54 46 25 35 33 30 36 27 50 38 28 35 31 59 50 38 41 47 28 41 28 36 45 26 46 24 35 34 40 38 47 58 45 32 57 47 Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nữ Nữ Nữ 1.78 2.12 1.83 1.93 1.84 1.77 1.79 1.85 1.75 1.91 1.83 1.81 1.79 1.89 1.86 1.83 1.82 1.79 2.05 1.82 1.77 1.84 1.82 1.74 1.77 1.86 1.78 1.93 1.93 1.77 1.91 1.84 1.81 1.79 1.83 1.92 1.94 1.76 1.83 1.86 160.30 72.90 15.40 259.30 35.40 34.10 44.10 88.40 219.60 144.50 221.60 99.90 161.30 24.92 36.20 27.70 70.60 30.30 18.90 121.00 18.42 27.50 46.10 18.70 70.40 43.21 22.40 34.20 35.70 27.35 170.90 29.50 28.70 179.5 20.23 22.70 198.40 59.15 98.10 35.30 KXĐ KXĐ E KXĐ E E KXĐ E KXĐ E E E E E E E E E E B E E E E E E E E KXĐ E E KXĐ E E E KXĐ E E E E 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 14/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 16/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 23/12/2010 15/12/2010 31/12/2010 16/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 15/12/2010 16/12/2010 16/12/2010 16/12/2010 16/12/2010 16/12/2010 16/12/2010 22/12/2010 16/12/2010 17/12/2010 16/12/2010 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 VCB04 VCB05 VCB06 VCB07 VCB08 VCB09 VCB10 VCB11 VCB12 VCB13 VCB14 VCB15 VCB16 VCB17 VCB18 VCB19 VCB20 VCB21 VCB22 VCB23 VCB24 VCB25 VCB26 VCB27 VCB28 VCB29 VCB30 VCB31 VCB32 VCB33 VCB34 VCB35 VCB36 VCB37 VCB38 VCB39 VCB40 VCB41 VCB42 VCB43 331 37 43 802 787 795 752 476 712 589 572 321 161 166 790 373 757 774 585 471 81 161 257 749 46 596 508 386 208 455 397 423 32 315 75 629 503 189 535 554 29 34 31 28 56 30 22 24 20 48 41 36 36 46 21 38 28 33 28 27 33 27 29 24 36 27 32 30 28 43 30 29 29 33 35 34 32 44 41 46 Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ 1.72 1.59 1.88 1.95 1.82 1.93 1.94 1.92 1.82 1.76 1.68 1.79 1.83 1.81 1.77 1.98 1.87 1.76 1.89 1.88 1.94 1.79 1.77 1.88 1.89 1.88 1.84 1.82 1.87 2.03 177 1.89 1.88 1.88 1.86 1.77 1.83 1.82 1.78 1.82 113.9 42.70 22.70 49.20 32.17 28.30 21.50 107.2 73.80 33.70 36.00 58.40 28.40 207.0 29.30 29.30 23.51 30.43 31.60 35.70 42.72 30.90 24.12 44.00 171.50 53.20 39.80 107.20 73.80 29.72 37.40 17.40 28.40 207.00 19.30 19.01 23.50 27.42 31.60 35.70 E E E C E E E E E KXĐ E E E E E E E E E E E C E C E E E E E E E KXĐ E E KXĐ E KXĐ E E E 20/12/2010 17/12/2010 20/12/2010 28/12/2010 20/12/2010 20/12/2010 16/12/2010 20/12/2010 16/12/2010 17/12/2010 16/12/2010 21/12/2010 16/12/2010 21/12/2010 16/12/2010 16/12/2010 16/12/2010 20/12/2010 17/12/2010 17/12/2010 17/12/2010 23/12/2010 17/12/2010 24/12/2010 31/12/2010 16/12/2010 17/12/2010 17/12/2010 17/12/2010 17/12/2010 17/12/201 3/11/2010 17/12/2010 31/12/2010 3/11/2010 17/12/2010 3/11/2010 17/12/2010 17/12/2010 21/12/2010 Phân 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 VCB44 VCB45 VCB46 VCB47 VCB48 VCB49 VCB50 VCC01 VCC02 VCC03 VCC04 VCC05 VCC06 VCC07 VCC08 VCC09 VCC10 VCC11 VCC12 VCC13 VCC14 VCC15 VCC16 VCC17 VCC18 VCC19 VCC20 VCC21 VCC22 VCC23 VCC24 VCC25 VCC26 VCC27 VCC28 VCC29 VCC30 VCC31 VCC32 VCC33 255 54 231 633 392 493 457 193 192 56 57 184 190 682 168 89 88 171 172 166 167 195 79 370 203 175 202 76 160 322 129 762 137 115 82 112 111 197 71 39 28 27 35 35 45 29 30 19 35 26 36 27 35 20 42 55 42 46 42 60 37 56 50 40 36 45 29 14 35 34 44 34 32 23 29 Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nữ Nam Nữ Nam Nữ Nữ Nữ Nam Nữ Nữ Nam Nam Nữ Nữ Nam Nam Nam Nam Nữ Nữ Nam Nam Nam Nữ Nữ Nam Nữ Nam Nam Nữ Nam Nữ Nữ Nữ 1.87 1.95 1.83 2.05 1.81 2.07 1.89 1.85 1.75 1.85 1.82 1.76 1.85 1.82 1.85 1.77 1.83 1.85 1.84 1.82 1.85 1.81 1.85 1.87 1.85 1.85 1.75 1.88 1.85 1.86 1.91 1.77 1.84 2.11 1.82 2.09 2.15 1.87 1.83 1.92 42.70 30.90 24.13 44.00 171.50 53.20 21.81 44.00 27.60 19.20 17.20 173.40 91.30 121.00 303.70 20.20 64.42 166 215 169 261 131 120 142 140 122 244 122 235 191 286 100.8 81.31 78.2 206.6 166.2 29.6 28.8 148 100.2 E KXĐ E E KXĐ E KXĐ E E E E E E B E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E E 17/12/2010 20/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 20/12/2010 20/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 28/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 21/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 16/11/2010 22/12/2010 22/12/2010 274 275 VCC34 VCC35 150 151 35 42 Nam Nữ 1.03 1.8 34.9 129 E E 22/12/2010 22/12/2010 276 277 278 VCC36 VCC37 VCC38 200 201 41 24 36 34 Nữ Nam Nam 1.69 1.88 1.87 28.3 10.3 24.9 E E E 22/12/2010 22/12/2010 22/12/2010 279 280 VCC39 VCC40 20 199 21 29 Nữ Nam 1.87 1.47 15.4 23.3 E E 22/12/2010 22/12/2010 C KXĐ A01, 02, 03… N , 02, 03… K 554bp Vê N HNA01, N 02, N 03… ă VCA01, HNB02, HC03… : , 644 , 67 C, 350 ă Phụ trách phòng xét nghiệm TT-YDHQS ( Phòng Vi sinh vật mầm b nh sinh học mPCR2.2 Lãn đạo khao MD-SHPT Vi n V sinh d ch t r N S ện [...]... [65], [13 3], [13 4], [14 9], theo W yM ự (2009), [14 9], phân tích ì ự G , P ủ S V z/ V -1 và SIVsm /HIV- 2, y ằ ự E ữ ớ ủ ủ ừ SV z , ữ ữ P , vùng gen phân : 12 65 658 -16 79) HIV- 1/ M P 17 95 16 27 -19 00 HIV- 1/ O P 18 27 (16 80 -19 17) HIV- 1/ P là vùng gen Env phân hóa 18 45 (17 66 -19 12), [13 4] HIV- 1/ N P m 19 32 (18 76 -19 68) SV P ớ 16 86 15 25- HIV- 2/ P 19 05 18 57 -19 49) HIV- 2/B P 19 14 18 68 -19 55) 18 11) 10 N ySV z ớ í 969 a thành... Vì v y : Nghiên cứu ứng dụng multiplex PCR để xác định phân týp của HIV- 1 ở Hà Nội - Viêng Chăn (2007- 2 011 ) ” ớ ụ : 1 Tối ưu hóa qui trình multiplex PCR để xác định các phân týp chủ yếu của HIV- 1 ở khu vực Hà Nội và Viêng Chăn 2 Xác định các phân týp chủ yếu của HIV- 1 trên các đối tượng ở khu vực Hà Nội và Viêng Chăn bằng kỹ thuật multiplex PCR 4 CHƢƠNG 1 TỔNG QUAN 1. 1 Tình hình nhiễm HIV/ AIDS trên... HIV- 1 của 05 mẫu mPCR có kết quả khác phân t p E 97 3 .19 Kết quả xác định phân týp HIV- 1 bằng mPCR theo khu vực nghiên nghiên cứu ………………………… 97 3.20 Tỷ lệ phân bố phân týp HIV- 1 trên các nhóm nghiên cứu 98 3. 21 Tỷ lệ phân bố phân týp HIV- 1 trên các nhóm nghiên cứu ở khu vực Hà Nội và Viêng Ch n 99 4 .1 Một số kết quả nghiên cứu phân týp HIV- 1 bằng mPCR .11 1 DANH MỤC CÁC... .78 3 .12 Thành phần của phản ứng PCR1 80 3 .13 Thành phần của phản ứng PCR2.0 đã tối ưu 81 3 .14 Thành phần phản ứng của PCR 2 .1 đã tối ưu 82 3 .15 Thành phần phản ứng của PCR 2.2 đã tối ưu .83 3 .16 Kết quả xác định phân týp HIV- 1 bằng mPCR 87 3 .17 Kết quả đối chiếu phân týp HIV- 1 của 10 mẫu mPCR có kết quả phân t p E 96 3 .18 Kết quả đối chiếu phân týp HIV- 1 của. .. 19 95, Salminen, ặc bi t là kỹ thu t t phá mới làm rõ v chi u dài 19 99 danh pháp phân lo i HIV phân týp y ủ của b c thống nh t [12 2] 17 1. 4 .1 Các phân týp HIV y, HIV 1 c chia thành 2 týp: HIV- 1 và HIV- 2, HIV- chia thành 4 nhóm: M, N, O, P [16 ], [65], [11 4], [11 5], [13 2], nhóm M chia thành 10 phân týp: A, B, C, D, E, F, G, H, J và K [28], [12 2]; ừ p ố phân týp M G; ,B , J, K ớ [12 8], A4 [14 5], A5 [12 0],... 1. 1 Tóm tắt đại dịch HIV/ AIDS toàn cầu n m 0 1. 2 Nguồn gốc, xuất xứ, phân loài của HIV …………………………….04 ………………….…………… 09 2 .1 Nh ng ký hiệu cho các đối tương nghiên cứu theo khu vực . 31 2.2 Thành phần phản ứng PCR1 của tác giả Fumihiro………………………… 0 2.3 Thành phần phản ứng PCR 2 .1 của tác giả Fumihiro . 51 2.4 Thành phần phản ứng PCR 2.2 của tác giả Fumihiro 52 2.5 Thành phần của phản ứng PCR1... cầu V y y S ỷ, ì ặ í 19 59 19 81 mã ớ ặ y y, V/ S y S y Mỹ x ố ắ S ữ Theo UNAIDS/WHO, ố 34,2 V Z re, châu Phi [15 1], ữ 19 83 , [95] ẻ M ớ V, V [38] Cho ố q ố 2 012 , ớ 16 ,7 í ụ ữ, 3,4 [14 0], [14 1], [14 3] ản 1. 1 Tóm tắt đại dịch HIV/ AIDS toàn cầu năm 2 012 34,2 [ 31, 8 – 35,9 ] T n s Số ố ớ N V ớ P ụ ữ Tẻ 16 ,7 [ 15 ,7 – 17 ,9 ] < 15 T n s N V ớ N 2 011 T ẻ T S 2 011 30,7 [ 28,6 – 32,2 ] 3,4 [ 3 ,1 – 3,9 ] 2,5 [ 2,2... 000 [14 0], [14 1], ỷ Thái Lan, [13 7] Á, S ốq ố 5 / Đ ng Nam Á V Trung Q ố ố yể ố cao [14 2] Ấ Đ q ố ,x ố ứ ớ ự V 2 ,1 ứ [14 3] 1. 1.2 T nh h nh nhi m HIV ở Việt Nam T T B y ố ớ p ớ , , xé ỉ ự 19 90 y, V V í 19 98, 77% ố x , ì V trên ỉ V/ 2 011 , q ố S x ố [1] 10 0% 98% ố q , y , Tì 2 011 ố 14 12 5, ố S , , thành V V 6 432 ố ố ỉ ớ giáp ớ L y ố ừ ắ T y Bắ ố , x N hí Minh Đ ố Q ỉ ồ V xé S 2 413 [1] 6 i u đ 1. 1 Tình... thành HIV- 1/ M x ồ ố ủ V -1/ M tính trung bình 17 95 SIVs x q x q ì q yể , ố ì ự 1 1: B , [ 21] , [62], ồ ủ 98% [4], ớ , y yể , ủ ồ 19 81 ữ SV ữ [62], x y x ớc ủ , ắ , [11 5], ớ y 4 ớ ể ớ ự ể ữ ỉ ì ủ , ố [35], S B A Hình 1. 1 Con người sinh hoạt có thể tiếp xúc với Retrovirus , B ừ , ố *Nguồn theo: Hahn B H et al (2000), [62]; Peeters M et al.(2 012 ), [11 5] 11 1. 3 Cấu trúc HIV 1. 3 .1 Đặc điểm cấu trúc của virus HIV. .. ể , V í ỉ 80 -10 0 ồ 3 ớ ì ừ (Hình 1. 2), [2], [49], [83], [11 2], [11 6] 1. 3 .1. 1 Lớp bao ngoài (envelope - env) Lớ é , ắ y y 16 0 y còn V ắ 16 0 ồ y y ủ ể + Glycoprotein xuyên màng có tr q 41, í ì ủ 41 ắ x ớ 12 0, 41 ỗ x ò 1. 3 .1. 2 Lớp vỏ trong (vỏ capsid ) ồ 2 ớ : Lớp ngoài hình c u, c u t o b i protein có tr V -1 18 18 Lớp trong hình trụ 24 Đ y vacxin phòng y ể ớ y ng phân t 41 kDa (gp 41) , ủ y 17 [2]: ắ xí

Ngày đăng: 21/10/2016, 17:14

Từ khóa liên quan

Mục lục

  • Lời cam đoan

  • Lời cảm ơn

  • Mục lục

  • Danh mục từ viết tắt

  • Danh mục các bảng

  • Danh mục các biểu đồ

  • Danh mục các hình

  • 1.1.2. Tình hình nhiễm HIV ở Việt Nam

  • Theo Bộ y tế Việt Nam, trường hợp phát hiện đầu tiên vào năm 1990 ở Thành phố Hồ Chí Minh. Đến nay, dịch HIV đã lan ra khắp các tỉnh thành, phần lớn số người xét nghiệm HIV dương tính cao là ở các tỉnh, thành phố lớn, các tỉnh khu vực miền núi Tâ...

  • Qua các số liệu giám sát cho thấy dịch HIV/AIDS đã xuất hiện ở 100% tỉnh, thành phố từ năm 1998, đến cuối năm 2011 đã có 98% số quận, huyện, thị xã và 77% số xã, phường, thị trấn có người nhiễm HIV được báo cáo. Tình hình nhiễm HIV trên toàn quốc tron...

  • 1.1.3. Tình hình nhiễm HIV ở Lào

  • 1.3.1. Đặc điểm cấu trúc của virus HIV

  • 1.3.2. Sự xâm nhập và quá trình nhân lên của HIV trong tế bào vật chủ

  • Để hiểu được cơ chế gây bệnh của HIV, cần tìm hiểu chu trình nhân lên và phát triển của nó trong tế bào vật chủ, quá trình này gồm các bước sau:

  • 1.4.1. Các phân týp HIV

  • Hiện nay, HIV được chia thành 2 týp: HIV-1 và HIV-2, trong đó HIV-1 được chia thành 4 nhóm: M, N, O, P [16], [65], [114], [115], [132], trong đó nhóm M lại chia thành 10 phân týp: A, B, C, D, E, F, G, H, J và K [28], [122]; phổ biến nhất là các phân ...

  • Sự đa dạng của HIV-1 là do tính di truyền đột biến cao và tích lũy qua các chu kỳ nhân lên liên tiếp qua nhiều vật chủ dẫn đến vô số các biến thể virus ở cá thể đồng nhiễm trong cộng đồng mà HIV đồng lưu hành. Quá trình này có mối liên hệ chặt chẽ gi...

  • + Yếu tố đầu tiên là sự sai sót tự nhiên trong quá trình phiên mã ngược từ RNA sao chép thành cDNA làm thay đổi nucleotid, dẫn đến sự thay đổi amino acid ở vị trí tương ứng với tần suất của sự thay đổi khoảng 9x10-5 nucleotid trên một vị trí trong mộ...

  • + Yếu tố thứ hai là khả năng nhân lên của HIV cao, khoảng 1010 virion được sản xuất trong một ngày. Yếu tố thứ ba là dưới tác dụng và áp lực của các thuốc kháng virus, dẫn đến HIV thích nghi bằng cách đột biến [29], [34], [40], [96], [97], tạo ra các...

  • + Một yếu tố quan trọng đó là ở những vùng lưu hành đồng thời nhiều phân týp HIV dẫn đến hiện tượng đồng nhiễm hai hay nhiều phân týp hoặc bội nhiễm ở cá nhân hoặc cộng đồng là điều kiện thuận lợi rất dễ tạo ra các dạng tái tổ hợp và các biến thể mớ...

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan