VIỆN CÔNG NGHỆ SINH HỌC BÁO CÁO TỔNG KẾT ĐỀ TÀI NGHIÊN CỨU CÁC PHƯƠNG PHÁP CHUẨN ĐOÁN NHẰM HỖ TRỢ ĐIỀU TRỊ PHÒNG NGỪA NHIỄM VI SINH VẬT Ở CÁC BỆNH NHÂN BỊ CÁC BỆNH DẠ DÀY CÓ LIÊN QUAN ĐẾN HELICOBACTER PYLORI CNĐT: NGUYỄN THỊ NGUYỆT 9783 HÀ NỘI- 2012 LỜI CẢM ƠN Tập thể cán khoa học tham gia thực nhiệm vụ Nghị định thư Việt Nam Hoa Kỳ “Nghiên cứu phương pháp chẩn đốn nhằm hỗ trợ điều trị, phịng ngừa nhiễm vi sinh vật bệnh nhân bị bệnh dày liên quan đến Helicobacter pylori” xin bầy tỏ lòng biết ơn chân thành tới Vụ Khoa học tự nhiên Xã hội, Vụ Hợp tác quốc tế, Vụ kế hoạch – Tài Bộ Khoa học Cơng nghệ, Ban lãnh đạo Viện Khoa học Công nghệ Việt Nam, Ban kế hoạch Tài chính, Viện cơng nghệ sinh học, GS Blaser MJ PGS Guillermo IPP, Trường Đại học Tổng hợp New York, GS Fred K, GS David SP, Viện nghiên cứu sức khỏe New Jersey (Mỹ), Viện NCKH Y Dược Lâm sàng 108, Viện Vệ sinh dịch tễ học Trung ương, Bệnh viện Bưu điện, Trường Đại học Y khoa Hà Nội, GS-TS Trương Nam Hải, Viện trưởng Viện Cơng nghệ Sinh học, PGS-TS Trần Đình Mấn, Trưởng khoa Vật liệu sinh học, Viện Công nghệ Sinh học Thành viên Hội đồng nghiệm thu cấp Cơ sở & Nhà nước, đặc biệt GS Tạ Long tận tình giúp đỡ tạo điều kiện cho thực nhiệm vụ Hà Nội tháng năm 2012 Sunday, September 01, 2013 PHẦN I BÁO CÁO TỔNG KẾT THỐNG KÊ VIỆN CƠNG NGHỆ SINH HỌC CỘNG HỒ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập - Tự - Hạnh phúc Hà Nội, ngày tháng năm 200 BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ THỰC HIỆN NHIỆM VỤ HỢP TÁC QUỐC TẾ VỀ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ THEO NGHỊ ĐỊNH THƯ VIỆT-MỸ TỪ THÁNG 1/2010 ĐẾN THÁNG 6/2012 I THÔNG TIN CHUNG Tên đề tài/dự án: “Nghiên cứu phương pháp chẩn đốn nhằm hỗ trợ điều trị, phịng ngừa nhiễm vi sinh vật bệnh nhân bị bệnh dày liên quan đến Helicobacter pylori” Thuộc: Nghị định thư với nước Hoa Kỳ - Chương trình (tên, mã số chương trình): 50 /2010/HĐ-NĐT - Dự án khoa học công nghệ (tên dự án): Nhiệm vụ hợp tác quốc tế khoa học công nghệ theo Nghị định thư - Khoá họp ngày 26 tháng năm 2008 Washington Chủ nhiệm đề tài/dự án - Họ tên : Nguyễn Thị Nguyệt - Ngày, tháng, năm sinh : 06/02/1977 Nam/ Nữ: Nữ - Học hàm, học vị: Tiến sĩ - Chức vụ: Nghiên cứu viên - Điện thoại : Tổ chức: 84-4-8344691 Nhà riêng: 38373578 Mobile: 0942783559 - Fax: 88363144 - E-mail: nguyetnt6897@ yahoo.com -Tên tổ chức công tác:Viện Công nghệ Sinh học, Viện Khoa học Công nghệ Việt Nam - Địa chỉ: Số18, Đường Hoàng Quốc Việt, Cầu Giấy, Hà Nội - Địa nhà riêng: Thôn Phú Mỹ, Xã Mỹ Đình, Từ Liêm, Hà Nội Tổ chức chủ trì đề tài/dự án - Tên tổ chức chủ trì đề tài:Viện Công nghệ sinh học, Viện Khoa học Công nghệ Việt Nam - Điện thoại: 84-4-8344691 Fax: 88363144 - Website: http:/www ibt.ac.vn - Địa chỉ: 18 Đường Hoàng Quốc Việt, Quận Cầu Giấy, Hà Nội - Họ tên thủ trưởng tổ chức: PGS-TS Trương Nam Hải - Số tài khoản: 301 01 039 - Ngân hàng: Tại Kho bạc Nhà nước Ba Đình, Hà Nội - Tên quan chủ quản đề tài: Bộ Khoa học Cơng nghệ II TÌNH HÌNH THỰC HIỆN Thời gian thực đề tài/dự án - Theo Hợp đồng ký kết: Từ tháng năm 2010 đến tháng năm 2012 - Thực tế thực hiện: Từ tháng năm 2009 đến tháng năm 2012 - Được gia hạn (nếu có): Khơng Kinh phí sử dụng kinh phí a) Tổng số kinh phí thực hiện:1800 triệu đồng + Kính phí hỗ trợ từ SNKH: 1800 triệu đồng + Kinh phí từ nguồn khác: Khơng + Tỷ lệ kinh phí thu hồi dự án (nếu có): Khơng b) Tình hình cấp sử dụng kinh phí từ nguồn SNKH Số TT Ghi (Số đề nghị toán) Thực tế đạt Theo kế hoạch Thời gian (Tháng, năm) Kinh phí (Tr.đ) Thời gian (Tháng, năm) Kinh phí (Tr.đ) 1-12/ 2010 1-12/2011 1-6/2012 1000 450 350 1-12/2010 1-12/2011 1-6/2012 1000 450 350 1000 450 350 c) Kết sử dụng kinh phí theo khoản chi Đối với đề tài Số TT Nội dung khoản chi Trả công lao động (khoa học, phổ thông) Nguyên, vật liệu, lượng Thiết bị, máy móc Xây dựng, sửa chữa nhỏ Chi khác Tổng cộng Theo kế hoạch Tổng SNKH Nguồn khác Thực tế đạt Tổng 670 670 510 510 70 70 550 1800 550 1800 Các văn hành trình thực đề tài/dự án SNKH Nguồn khác Số TT Số, thời gian ban hành văn Tên văn 168/QĐ-KHCNVN 09/02/2010 Quyết định giao tiêu kế hoạch năm 2010 2615/QĐ-BKHCN 18/11/2009 Quyết định phê duyệt danh mục kinh phí nhiệm vụ hợp tác Quốc tế Khoa học Công nghệ theo nghị định thư bắt đầu thực năm 2010 340/QĐ-CNSH 28/6/2012 Quyết định thành lập Hội đồng nghiệm thu cấp sở Quy trình sản xuất Kít 341/QĐ-CNSH 28/6/2012 Quyết định thành lập Hội đồng nghiệm thu cấp sở nhiệm vụ nghị định thư Tổ chức phối hợp thực đề tài, dự án Số TT Tên tổ chức Tên tổ đăng ký chức theo Thuyết tham gia minh thực Nội dung tham gia chủ yếu Sản phẩm chủ yếu đạt Bệnh viện Bưu Điện Bệnh 1.Khám lựa chọn 500 viện Bưu bệnh nhân lấy 500 sinh Điện thiết dày lưu trữ để nghiên cứu Xác định tỷ lệ nhiễm H pylori ba nhóm bệnh 1.Lựa chọn 589 bệnh nhân lấy bệnh phẩm dày Xác định tỷ lệ nhiễm H pylori ba nhóm bệnh Đại học Y Hà Nội Đại học 1.Nghiên cứu tổn Y Hà Nội thương dày 2.Xác định diện H pylori, nấm, vi khuẩn non-HP sinh thiết dày Xác định tỷ lệ nhiễm vi sinh vật 1.Xác định tổn thương dày 2.Xác định H pylori, nấm, vi khuẩn non-HP sinh thiết dày Xác định tỷ lệ nhiễm vi sinh vật Viện CNSH Viện CNSH 1.Viết đề cương 2.Viết 10 chuyên đề 3.Tuyển chọn 500 bệnh nhân lấy bệnh phẩm Xác định tỷ lệ nhiễm H pylori ba nhóm bệnh nhân 5.Nghiên cứu kiểu gen CagA/VacA 6.Phân lập H pylori non-HP & định tên xác định tỷ lệ nhiễm 7.Xác định tên 10 loài nấm dày 8.Thiết kế 02 cặp mồi 02 mẫu dò huỳnh quang cho H pylori C krusei 9.Thiết kế chế phẩm sinh học học chẩn đoán nhiễm vi sinh vật dày 10.Thiết kế mẫu mã Bộ sinh phẩm phát bội nhiễm vi sinh vật dày 11.Sản xuất thử 010 Bộ sinh phẩm 12 Nghiên cứu điều kiện sử dụng bảo quản 13.Thử nghiệm Bộ sinh phẩm 200 mẫu sinh phẩm 14 Đề nghị biện pháp đề phòng điều trị vi sinh vật gây nhiễm dày 15.Viết tổng kết kết qủa nghiên cứu nhiệm vụ nghị định thư, 16.Viết 01 báo tiếng Anh 0.3 báo tiếng Việt 17 01 nghiên cứu sinh 1.Hoàn thành 2.10 chuyên đề 3.589 bệnh nhân lấy bệnh phẩm Hoàn thành Các số liệu kiểu gen cagA/vacA 6.Phân lập 27 chủng H pylori, 119 chủng nonHP định tên & tỷ lệ nhiễm Đã xác định tên mười loài nấm từ dày người bệnh, Hai cặp mồi hai mẫu dò MB đặc thù thiết kế Thiết kế Bộ sinh phẩm dẫn sử dụng 10 Chọn mẫu mã 11.Đã sản xuất 10 12 Xác định điều kiện sử dụng bảo quản 13.Đã thử nghiêm 250 mẫu bệnh 14 Đề nghị biện pháp đề phòng điều trị nhiễm vi sinh vật dày 15.Hoàn thành tổng kết tổng hợp 16 Một báo tiếng Anh, bốn tiếng Việt 17 02 Tiến sĩ - Nguyễn Văn Thịnh - Nguyễn Thị Nguyệt Đại học New Yok (Mỹ) Đại học New York (Mỹ) Viện sức khỏe cộng đồng New Jersey (Mỹ) 1.Phân lập H pylori từ 89 mẫu sinh thiết dày nghiên cứu 2.Nghiên cứu kiểu gen CagA, VacA m/s, Vùng IR gen hp0152 hp0153, gen HspA, vùng đột biến gây kháng thuốc Clarythromycin gen 23S rARN, glmM 27 chủng H pylori 3.Phân lập, định tên số chủng non-HP từ 89 mẫu bệnh phẩm dày chẩy máu 4.Xác định loài nấm gây nhiễm dày mẫu dò Beacon 5.Bàn bạc số liệu viết báo tiếng Anh 1.27 chủng H pylori từ 89 mẫu bệnh phẩm nghiên cứu 2.Các số liệu tính trạng di truyền cagA vacA chủng H pylori lưu hành Việt Nam 3.Phân lập định tên 119 chủng non-HP từ 89 mẫu bệnh phẩm dày chẩy máu Phát dịch chuỷển từ nhiễm nấm C albican, sang nhiễm nấm C krusei 5.Một báo tiếng Anh xem xét, 01 làm thêm để lấy số liệu Viện Vệ Viện Vệ Xác định hình dạng sinh Dịch sinh Dịch số loài vi khuẩn nontễ tễ HP kính hiển thường điện tử SEM Ảnh chụp hình dạng chủng vi khuẩn non-HP kính hiển vi thường điện tử SEM Viện Quân Viện Y Trung Quân Y ương 108 Trung ương 108 Phân lập chủng H pylori Giải trình tự gen 23S rARN gây kháng thuốc 29 chủng H pylori Viết 01 báo Phân lập chủng H pylori từ bệnh nhân bị loét tá tràng xác định đột biến gây kháng Clarithromycin Bàn bạc số liệu viết báo Cá nhân tham gia thực đề tài, dự án Số TT Tên nhân cá Tên nhân cá Nội dung tham gia Sản phẩm chủ yếu đạt đăng ký tham gia Thuyết thực minh Nguyễn Thị Nguyệt Nguyễn Nguyễn Viết đề cương 1.Hoàn thành Thị Hồng Thị Hồng 2.Viết muời chuyên đề 2.Hoàn thành Hạnh Hạnh 3.Nghiên cứu tính trạng di 3.Các kết nghiên Nguyễn Thực cơng việc Thị Nguyệt hành dự án 2.Tuyển chọn 500 bệnh nhân lấy 500 bệnh phẩm 3.Xác định tỷ lệ nhiễm H pylori ba nhóm bệnh Nghiên cứu tính trạng di truyền gây bệnh CagA, VacA chủng H pylori lưu hành 5.Phân lập số chủng H pylori non-HP & xác định tỷ lệ nhiễm 6.Xác định tên 10 loài nấm dày Sản xuất thử Bộ sinh phẩm 8.Nghiên cứu điều kiện sử dụng bảo quản Bộ sinh phẩm 9.Thử nghiệm Bộ sinh phẩm 200 mẫu sinh phẩm 10 Tham gia viết tổng kết 11 Tham gia viết báo tiếng Việt Hoàn thành 2.Chọn 589 bệnh nhân lấy 589 bệnh phẩm 3.Tỷ lệ nhiễm H pylori ba nhóm bệnh 4.Các số liệu tính trạng gây bệnh cagA vacA chủng H pylori lưu hành 5.Phân lập 27 chủng HP, 119 chủng non-HP định tên & tỷ lệ nhiễm 6.Xác định tên 11 loại nấm Mười sinh phẩm 8.Các điều kiện sử dụng bảo quản sinh phẩm 9.Kết thử nghiêm 250 mẫu sinh phẩm 10.Hoàn thành tổng kết tổng hợp 11.Một tiếng Anh xem xét, 04 báo tiếng Việt đăng, 01 báo đăng Proceeding hội nghị Quốc tế Tiêu hóa Đơng Nam Á Dương Thu Hương truyền gây bệnh CagA, VacA chủng H pylori lưu hành 4.Phân lập số chủng H pylori non-HP & xác định tỷ lệ nhiễm 5.Xác định tên 10 loài nấm dày 6.Thiết kế cặp mồi mẫu dò huỳnh quang MB cho H pylori C krusei 7.Thiết kế Kit chẩn đoán bội nhiễm vi sinh vật dày 8.Thiết kế mẫu mã Bộ sinh phẩm 9.Sản xuất thử Bộ sinh phẩm 10.Nghiên cứu điều kiện sử dụng bảo quản Bộ sinh phẩm 11.Thử nghiệm Bộ sinh phẩm 200 mẫu sinh phẩm 12 Đưa biện pháp đề phòng điều trị vi sinh vật gây bội nhiễm dày 13.Viết tổng kết tổng hợp 14.Viết 01 báo tiếng Anh 0.3 báo tiếng Việt 15.Hướng dẫn 02 nghiên cứu sinh cứu tính trạng gây bệnh cagA vacA 4.Phân lập 27 chủng H pylori,119 chủng nonHP định tên & tỷ lệ nhiễm 5.Xác định tên 11 loại nấm 6.Thiết kế xong cặp mồi hai mẫu dò MB đặc thù 7.Bộ sinh phẩm với dẫn sử dụng 8.Mẫu mã Bộ sinh phẩm Mười sinh phẩm 10.Các điều kiện sử dụng bảo quản sinh phẩm 11.Thử nghiêm 250 mẫu sinh phẩm 12.Đề nghị biện pháp đề phòng & điều trị nhiễm vi sinh vật dày 13.Bản tổng kết tổng hợp 14 Một báo tiếng Anh, 04 báo tiếng Việt đăng, 15 Hai tiến sĩ bảo vệ năm 2010 2011 Dương Thu 1.Nghiên cứu tính trạng di Hương truyền gây bệnh CagA, VacA chủng H pylori lưu hành 2.Phân lập số chủng H pylori non-HP & xác định tỷ lệ nhiễm 3.Xác định tên 10 loài 1.Số liệu tính trạng cagAvà vacA chủng H pylori lưu hành 2.Phân lập 27 chủng H pylori, 119 chủng nonHP định tên & tỷ lệ nhiễm ... nhiệm vụ Nghị định thư Vi? ??t Nam Hoa Kỳ ? ?Nghiên cứu phương pháp chẩn đoán nhằm hỗ trợ điều trị, phòng ngừa nhiễm vi sinh vật bệnh nhân bị bệnh dày liên quan đến Helicobacter pylori? ?? xin bầy tỏ lòng... PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Sơ đồ nghiên cứu a .Nghiên cứu tình trạng nhiễm H pylori nhiễm vi sinh vật dày bệnh nhân bị vi? ?m, loét ung thư dày b .Nghiên cứu chế tạo Bộ sinh phẩm chẩn đoán nhiễm vi sinh. .. THƯ VI? ??T-MỸ TỪ THÁNG 1/2010 ĐẾN THÁNG 6/2012 I THÔNG TIN CHUNG Tên đề tài/dự án: ? ?Nghiên cứu phương pháp chẩn đốn nhằm hỗ trợ điều trị, phịng ngừa nhiễm vi sinh vật bệnh nhân bị bệnh dày liên quan