BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP & PTNT HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM KHOA THÚ Y KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP “GIÁM SÁT CÚM GIA CẦM TYPE A /H5N1 VÀ A /H7N9 TRÊN GIA CẦM, THỦY CẦM SỐNG ĐƯỢC BÁN TẠI CÁC CHỢ TẠI ĐỊA BÀN THÀNH PHỐ HÀ NỘI VÀ TỈNH NINH BÌNH” Giảng viên hưỡng dẫn : PGS. TS. Nguyễn Bá Hiên : TS. Nguyễn Thị Thanh Thủy Sinh viên thực hiện : Đinh Công Trưởng Mã sinh viên : 554889 HÀ NỘI - 2014 NỘI DUNG BÁO CÁO Phần IV. Kết luận và kiến nghị Phân III: Kết quả và thảo luận Phần II: Nội dung và phương pháp nghiên cứu Phân I: Mở đầu Phần I Mở đầu TÍNH CẤP THIẾT CỦA ĐỀ TÀI “Giám sát cúm gia cầm type A/H5N1 và A/H7N9 trên gia cầm, thủy cầm sống được bán tại các chợ tại địa bàn thành phố Hà Nội và tỉnh Ninh Bình”. “Giám sát cúm gia cầm type A/H5N1 và A/H7N9 trên gia cầm, thủy cầm sống được bán tại các chợ tại địa bàn thành phố Hà Nội và tỉnh Ninh Bình”. Ngành chăn nuôi gia cầm giữ vai trò quan trọng, nhưng lại gặp không ít khó khăn bởi dịch bệnh nhất là những bệnh xảy ra trên vật nuôi gây thiệt hại lớn về kinh tế và lây sang người gây tử vong Ngành chăn nuôi gia cầm giữ vai trò quan trọng, nhưng lại gặp không ít khó khăn bởi dịch bệnh nhất là những bệnh xảy ra trên vật nuôi gây thiệt hại lớn về kinh tế và lây sang người gây tử vong Bệnh cúm gia cầm chủng độc lực cao (HPAI) với nhiều subtype khác nhau và khả năng tổng hợp biến chủng làm căn bệnh càng nguy hiểm. Bệnh cúm gia cầm chủng độc lực cao (HPAI) với nhiều subtype khác nhau và khả năng tổng hợp biến chủng làm căn bệnh càng nguy hiểm. Gia cầm sống được xác định là đối tượng lưu trữ nguồn bệnh. Vật mang bệnh thầm lặng đóng vai trò quan trọng trong những ổ dịch. Gia cầm sống được xác định là đối tượng lưu trữ nguồn bệnh. Vật mang bệnh thầm lặng đóng vai trò quan trọng trong những ổ dịch. MỤC TIÊU CỦA ĐỀ TÀI 1 Xác định được sự lưu hành virus cúm type A/H5N1 và H7N9 lưu hành tại các chợ của 2 tỉnh/ thành phố Xác định được subtype virus cúm gia cầm đang lưu hành tại 2 tỉnh/thành phố 2 2 Phần II Nội dung và phương pháp nghiên cứu NỘI DUNG NGHIÊN CỨU Điều tra tình hình chăn nuôi gia cầm tại 2 tỉnh/ thành phố nghiên cứu Điều tra tình hình chăn nuôi gia cầm tại 2 tỉnh/ thành phố nghiên cứu 1 Tình hình dịch cúm gia cầm trên địa bàn nghiên cứu Tình hình dịch cúm gia cầm trên địa bàn nghiên cứu 2 Giám sát sự lưu hành virus cúm type A/H5N1 và H7N9 trên đàn gia cầm tại địa bàn nghiên cứu Giám sát sự lưu hành virus cúm type A/H5N1 và H7N9 trên đàn gia cầm tại địa bàn nghiên cứu 3 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Phương pháp điều tra hồi cứu Phương pháp điều tra hồi cứu Phương pháp Real Time RT - PCR Phương pháp Real Time RT - PCR Phương pháp xử lý số liệu Phương pháp xử lý số liệu 1 2 3 ĐỊA ĐIỂM VÀ THỜI GIAN NGHIÊN CỨU Thu thập mẫu Swab của 3 tỉnh/ thành phố Thu thập mẫu Swab của 3 tỉnh/ thành phố Trạm CĐXN-Cơ quan thú y vùng I Trạm CĐXN-Cơ quan thú y vùng I Kết quả số mẫu +/- với A/H5N1 và H7N9 Kết quả số mẫu +/- với A/H5N1 và H7N9 Tổng hợp và xử lý số liệu Tổng hợp và xử lý số liệu Thời gian nghiên cứu từ 9/2012 đến 6/2014 QUY TRÌNH THỰC HIỆN XÉT NGHIỆM CÚM GIA CẦM Chuẩn bị swabs Chuẩn bị swabs Lấy mẫu Lấy mẫu Sử lý mẫu Sử lý mẫu Tách RNA Tách RNA Ngoáy ổ nhớp Ngoáy ổ nhớp Ngoáy vùng hầu, khí quản Ngoáy vùng hầu, khí quản 1 1 2 2 3 3 4 4 5 5 Swabs gộp Swabs gộp Tiến hành phản ứng RT- PCR Tiến hành phản ứng RT- PCR Đọc và xử lý kết quả Đọc và xử lý kết quả [...]... 90 19 21,11 5 5,56 3 3,33 450 54 12,00 10 2,22 4 0,89 Tổng Hình 3.4 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A/ H5N1 trên gia cầm sống bán tại các chợ c a thành phố Hà Nội Bảng 3.7 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A/ H5N1 trên gia cầm sống bán tại các chợ c a thành phố Hà Nội qua các tháng Kết quả xét nghiệm A Thời gian lấy mẫu A/ H5 A/ H5N1 Số mẫu xét nghiệm Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Tháng... 3.233 2012 Hà Nội 4 2012 Ninh Bình 2 2 3 0 0 1.204 100 1.204 2013 2 2 1.100 73,33 400 26,67 1.500 2014 0 0 0 0 0 0 0 Tổng 7 9 2.170 36,55 3.767 63,45 5.937 Hình 3.2 Tình hình dịch cúm gia cầm trên đ a bàn c a 2 tỉnh /thành phố từ năm 2011 đến 6/2014 Kết quả xác định nhiễm virus cúm A/ H5N1 c a chợ Ninh Bình Bảng 3.4 Tỷ lệ nhiễm virus cúm A/ H5N1 trên gia cầm sống bán tại các chợ c a tỉnh Ninh Bình Kết quả... virus cúm A/ H5N1 c a chợ Hà Nội Bảng 3.6 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A/ H5N1 trên gia cầm sống bán tại các chợ c a thành phố Hà Nội Kết quả xét nghiệm A Chợ đầu mối A/ H5 A/ H5N1 Số mẫu xét nghiệm Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Chợ Thạch Thất 90 8 8,89 0 0,00 0 0,00 Chợ Mỹ Đức 90 3 3,33 0 0,00 0 0,00 Chợ Phú Xuyên 90 11 12,22 3 3.33 1 1,11 Chợ Ứng H a 90 13 14,44 2 2,22 1 1,11 Chợ. .. nghiệm A Chợ đầu mối A/ H5 A/ H5N1 Số mẫu xét nghiệm Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Chợ Hoa Lư 50 7 14,00 1 2,00 1 2,00 Chợ Yên Khánh 50 8 16,00 3 6,00 1 2,00 Chợ TP Ninh Bình 50 10 20,00 4 8,00 2 4,00 150 25 16,67 8 5,33 4 2,67 Tổng Hình 3.3 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A/ H5N1 trên gia cầm sống tại các chợ c a tỉnh Ninh Bình Bảng 3.5 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A/ H5N1 trên gia cầm sống. .. 1,11 1 1,11 Tháng 9 90 8 8,89 1 1,11 0 0,00 Tổng Ninh Bình 30 450 54 10,28 10 2,22 4 0,89 600 79 13,17 18 3,00 8 1,33 Hà Nội Tổng chung Bảng 3.9 Tổng hợp kết quả giám sát cúm type A/ H7N9 trên gia cầm sống bán tại các chợ c a 2 tỉnh /thành phố nghiên cứu Số mẫu dương tính Số mẫu dương tính Số mẫu xét nghiệm với A với H5 H7N9 Tháng 5 12 4 Tháng 6 9 Tháng 7 Tỉnh Dương tính với H7 Dương tính với N9 8 0 0... Tháng 8 4 2 2 0 0 Tháng 9 5 0 5 0 0 Tổng 25 8 17 0 0 79 18 61 0 0 Hà Nội Ninh Bình Tổng chung Phần IV: Kết luận và đề nghị Kết luận Tình hình chăn nuôi gia cầm c a thành phố Hà Nội là 1 cao nhất luôn dao động trong khoảng 18 triệu con, tiếp theo là tỉnh Ninh Bình dao động 3 triệu con 2 3 Thành phố Hà Nội tỷ lệ tiêm phòng vaccine đạt tỷ lệ cao nhất (luôn vượt kế hoạch tiêm phòng), ... tại 2 tỉnh/ thành phố từ năm 2011 đến 6/2014 Năm 17.971.092 Số được tiêm 79.872 21.454.440 0.78 119.4 10.200.000 10.855.584 Số được tiêm 2.572.473 11.384.919 Tỷ lệ (%) 25.22 104.88 Số gia cầm phải tiêm 9.000.000 23.373.152 Số được tiêm 2.457.593 25.634.387 Tỷ lệ (%) 27.3 109.7 Số gia cầm phải tiêm 6 tháng đầu năm 2014 10.290.000 Số gia cầm phải tiêm 2013 Hà Nội Tỷ lệ (%) 2012 Ninh Bình Số gia cầm phải... quả và thảo luận Bảng 3.1 Tổng gà, vịt trên đ a bàn c a 2 tỉnh /thành phố từ năm 2011 đến 2013 Tỉnh Vịt Tổng đàn 10.240.826 4.585.650 14.826.476 2012 12.022.767 6.226.411 18.249.178 2013 12.300.500 7.234.432 19.534.932 2011 Ninh Bình Gà 2011 Hà Nội Năm 2.486.436 1.065.615 3.552.051 2012 2.393.230 1.025.670 3.418.900 2013 2.405.300 1.130.500 3.535.800 Bảng 3.2 Kết quả tiêm phòng vaccine cúm gia cầm tại. .. 1 1,11 Tháng 09 Tổng 12 Tháng 06 Năm 2014 90 90 8 8,89 1 1,11 0 0,00 450 54 12,00 10 2,22 4 0,89 Bảng 3.8 Tổng hợp kết quả xác định nhiễm virus cúm A/ H5N1 trên gia cầm sống tại các chợ c a 2 tỉnh /thành phố Kết quả xét nghiệm A Số mẫu xét Tỉnh nghiệm A/ H5 A/ H5N1 Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Số mẫu (+) Tỷ lệ % Tháng 5 3 10,00 0 0,00 0 0,00 Tháng 6 30 6 20,00 2 6,67 2 6,67 Tháng 7 30 7 23,33...Trình tự các phản ứng Realtime RT-PCR để xác định các gen Bước 1 Bước 2 Tách ARN Tiến hành phản ứng RT- PCR để xác định sự có mặt c a gen A Bước 3 Các mẫu dương tính với gen A được tiếp tục xác định sự có mặt c a gen H5 Các mẫu dương tính với gen H5 được xác định Bước 4 Bước 5 sự có mặt c a gen N1 Các mẫu dương tính với gen A nhưng âm tính với gen H5 được tiếp tục xác định sự có mặt c a gen H7 và N9 Phần . TÀI Giám sát cúm gia cầm type A/ H5N1 và A/ H7N9 trên gia cầm, thủy cầm sống được bán tại các chợ tại đ a bàn thành phố Hà Nội và tỉnh Ninh Bình . Giám sát cúm gia cầm type A/ H5N1 và A/ H7N9 trên. dịch cúm gia cầm trên đ a bàn nghiên cứu Tình hình dịch cúm gia cầm trên đ a bàn nghiên cứu 2 Giám sát sự lưu hành virus cúm type A/ H5N1 và H7N9 trên đàn gia cầm tại đ a bàn nghiên cứu Giám. TIÊU C A ĐỀ TÀI 1 Xác định được sự lưu hành virus cúm type A/ H5N1 và H7N9 lưu hành tại các chợ c a 2 tỉnh/ thành phố Xác định được subtype virus cúm gia cầm đang lưu hành tại 2 tỉnh /thành phố 2 2 Phần