B GIÁO D C VÀ ÀO T O TR NG I H C M TP HCM KHOA CÔNG NGH SINH H C tài: TÌM HI U C N NGUYÊN VÀ TÌNH HÌNH KHÁNG KHÁNG SINH C A CÁC LỒI VI KHU N GÂY VIÊM NG HÔ H P TRÊN T I B NH VI N 175 T 05/2013 N 04/2014 BÁO CÁO KHÓA LU N T T NGHI P CHUYÊN NGÀNH: VI SINH-SINH H C PHÂN T GVHD: TS.BS V B O CHÂU SVTH: NGUY N PH M PH NG TRÀ MSSV: 1053010824 NIÊN KHÓA: 2010-2014 Tp HCM, tháng n m 2014 Báo cáo khóa lu n t t nghi p Nh n xét c a gi ng viên h SVTH: Nguy n Ph m Ph GVHD: TS.BS V B o Châu ng d n ng Trà MSSV: 1053010824 tài: “Tìm hi u c n nguyên tình hình loài vi khu n gây viêm kháng kháng sinh c a ng hô h p t i b nh vi n 175 t 05/2013 n 04/2014 ” SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu L IC M N u tiên, em xin g i l i c m n chân thành t i th y V B o Châu, th y ã h ng t n tình giúp nh em hồn thành t t báo cáo th c t p Em xin c m n ch khoa vi sinh v t c a b nh vi n 175 ã t n tình giúp chia s nh ng kinh nghi m quý báo, nhi t tình h ng d n su t trình em th c t p t i b nh vi n 175 Em xin g i l i c m n chân thành t i quý th y cô, anh ch Khoa Công Ngh Sinh H c anh ch phịng thí nghi m vi sinh c a tr M Thành Ph H Chí Minh ã ch d y truy n su t trình h c t p t i tr ih c t nh ng ki n th c quý báo ng Cu i xin c m n cha m , ng c tr ng i ã sinh thành nuôi l n d y d ng thành nh ngày hôm C m n t t c b n bè ã ng h chia s khó kh n báo cáo th c t p Chân thành c m n! SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà hồn thành t t Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu M CL C TV N M C TIÊU NGHIÊN C U PH N I: T NG QUAN TÀI LI U S L C V NHI M KHU N HÔ H P 1.1 Nhi m khu n hô h p .5 1.2 Tình hình nhi m khu n ng hơ h p 1.3 C ch mi n d ch b o v ng hô h p VIÊM 2.1 NG HÔ H P TRÊN nh ngh a .7 2.2 M t s b nh liên quan n ng hô h p .8 2.3 M t s y u t nguy c gây viêm 2.4 Tác nhân gây viêm ng hô h p ng hô h p 2.4.1 Streptococus spp 2.4.2 Staphylococcus spp 12 2.4.3 Pseudomonas aeruginosa .14 2.4.4 Moraxella cataharrlis .15 2.4.5 Klebsiella pneumoniae 16 2.4.6 Acinetobacter spp 16 KHÁNG SINH VÀ TÌNH HÌNH 3.1 KHÁNG KHÁNG SINH 17 Kháng sinh 17 3.1.1 nh ngh a 17 3.1.2 c i m 17 3.1.3 Phân lo i 17 3.1.4 X p lo i kháng sinh 18 3.1.5 C ch tác 3.2 S ng c a kháng sinh 18 kháng kháng sinh c a vi khu n 20 3.2.1 Hi n t 3.2.2 Ngu n g c c a trình SVTH: Nguy n Ph m Ph ng kháng kháng sinh 20 ng Trà kháng 20 Báo cáo khóa lu n t t nghi p 3.3 Tình hình IT GVHD: TS.BS V B o Châu kháng kháng sinh .21 NG 24 1.1 M u b nh ph m 24 1.2 Cách l y m u b nh ph m 24 1.2.1 M u àm 24 1.2.2 D ch nh y h ng 24 V T LI U 24 2.1 Hóa ch t 24 2.2 Môi tr 2.3 Thi t b d ng c .27 PH ng 25 NG PHÁP NGHIÊN C U 27 3.1 Ph ng pháp nghiên c u 27 3.2 K thu t nghiên c u, phân l p nh danh 27 3.2.1 Kh o sát tr c ti p 27 3.2.2 K thu t nuôi c y, nh danh 28 PH N III: K T Q A NGHIÊN C U 34 VÀ TH O LU N 34 K T QU 35 1.1 Tình hình nhi m khu n hơ h p chung 35 1.2 M i liên quan gi a viêm 1.3 M i liên h gi a V HHT gi i tính 37 1.4 M i liên h gi a V HHT mùa 38 1.5 C c u vi khu n gây nhi m khu n hô h p 39 1.6 Tình hình ng hơ h p tu i .36 kháng kháng sinh c a vi khu n phân l p c 41 1.6.1 T l kháng kháng sinh c a S.faecalis (n=48) 41 1.6.2 T l kháng kháng sinh c a M.cataharrlis (n=24) 42 1.6.3 T l kháng kháng sinh c a S.epidermidis (n=21) 43 1.6.4 T l kháng kháng sinh c a K.pneumoniae (n=19) 45 TH O LU N 46 PH N IV: K T LU N VÀ SVTH: Nguy n Ph m Ph NGH 48 ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu K T LU N 49 NGH 49 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu DANH M C HÌNH NH Hình 1.Hình thái Streptococcus spp Hình Các ki u tiêu huy t BA 10 Hình Hình thái S.aureus v t kính x100 12 Hình Hình thái P.aeruginosa v t kính x100 14 Hình Hình thái M.cataharrlis v t kính x100 15 Hình Hình thái K.pneumoniae v t kính x100 16 Hình a mơi tr ng BA 25 Hình 2 a mơi tr ng UriSelect 26 Hình a mơi tr ng MHA .27 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu DANH M C CÁC B NG B ng c i m khu n l c môi tr B ng N ng B ng 1 S t ng Uri 28 , kí hi u c a t ng lo i kháng sinh .32 ng quan gi a ch n oán lâm sàng k t qu xét nghi m 35 B ng T l loài vi khu n gây viêm ng hô h p 39 B ng T l kháng kháng sinh c a S.feacalis 41 B ng T l kháng kháng sinh c a M.cataharrlis 42 B ng T l kháng kháng sinh c a K.pneumoniae 45 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu DANH M C CÁC BI U Bi u 1 M i t ng quan gi a ch n oán lâm sàng k t qu 35 Bi u S t Bi u M i liên quan gi aV HHT gi i tính .37 Bi u T l NKHH theo mùa 38 Bi u T l V HHT theo mùa 38 Bi u T l vi khu n phân l p Bi u T l kháng kháng sinh c a S.faecalis 41 Bi u T l kháng kháng sinh c a M.cataharrlis .43 Bi u T l kháng kháng sinh c a K.pneumoniae 45 ng quan gi a V HHT SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà tu i 36 c 39 Báo cáo khóa lu n t t nghi p DANH M C CÁC CH IgA: Immunoglobulin A NKHH: Nhi m khu n hô h p V HHT: Viêm ng hô h p VK: vi khu n NST: nhi m s c th S.epidermidis: Staphylococcus epidermidis S.agalactiae: Streptococcus agalactiae K.pneumoniae: Klebsiella pneumonia P.aeruginosa: Pseudomonas aeruginosa M.cataharrlis: Moraxella cataharrlis S.faecalis: Streptococcus feacalis SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà GVHD: TS.BS V B o Châu VI T T T Báo cáo khó lu n t t nghi p óa 1.4 GVHD: TS.BS V B o Châu u M i liên h gi a V HHT mùa Bi u T l NKHH the mùa eo Mùa m a a Mùa kh hô T ng s K t qu 46/ /56 99/108 145/164 T l (%) 82,1% 91,7% % P70% i v i Cotrim, Erythromycin gentamycin cịn nh y c m hồn toàn v i Vancomycin Theo m t nghiên c u khác c a Ph m V n D ng(2012) có 90,6% t c u kháng Oxacillin, nghiên c u c a tơi t c u ã kháng hồn toàn Oxacillin K t qu nghiên c u k t q a nghiên c u c a cho th y t c u ã kháng hoàn toàn kháng sinh Oxacillin nh ng v n nh y v i Vancomycin Nh 46 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p v y Vancomycin v n thu c nghi ng GVHD: TS.BS V B o Châu c l a ch n hàng u i v i nh ng tr ng h p nhi m t c u kháng thu c Theo nghiên c u c a Nguy n Th Thu Hi n (2012), K.pneumoniae v n nh y c m t t v i nhóm kháng sinh Carbapenem, nh ng so v i nghiên c u c a tơi K.pneumoniae ã kháng v i h u h t lo i kháng sinh ó có nhóm kháng sinh Carbapenem C th t l Meropenem (69,2%) i u ch ng t kh n ng kháng kháng Imipenem (15,4%) kháng c a K.pneumoniae ngày t ng cao gây nguy hi m cho lâm sàng 47 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu PH N IV: K T LU N VÀ NGH 48 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu K T LU N Qua kh o sát 164 m u b nh ph m bao g m m u b nh ph m àm d ch nh y h ng, nh n th y: - T l d ng tính cao chi m 88%, có s phù h p gi a ch n oán lâm sàng k t qu phân l p - T l b nh nhân V HHT theo mùa mùa khơ chi m t l cao h n 91,7% - Các ch ng phân l p c bao g m: S.feacalis (33,1%), M.cataharrlis (16,6%), S.epidermidis (14,5%), S.agalactiae (11,7%), K.pneumoniae (13,1%), Acinetobacter spp (7,6%), P aeruginosa (2,8%), S.aureus (0,7%) - S.feacalis ã kháng m nh v i Oxacilin (89,6%), Cefazidin (70,8%) nh y v i Amykacine (6,3%) - M.cataharrlis ã kháng cao v i lo i kháng sinh Cefazidine (70,8%), Nalidixi acid (66,7%) - S.epidermidis ã kháng hoàn toàn v i Oxacilin, nh y c m v i Vancomycin - K.pneumoniae ã kháng v i h u h t lo i kháng sinh cao nh t Cefazidin (84,6%) th p nh t Imipenem, Nalidixi acid v i t l kháng 15,4% - NGH C n ti n hành kh o sát m c khu n hô h p m t cách th - kháng kháng sinh c a vi khu n gây nhi m ng xuyên thông báo k p th i cho lâm sàng C n nghiên c u kh n ng sinh men ESBL K.pneumoniae ph c v cho lâm sàng 49 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu TÀI LI U THAM KH O Tài li u ti ng vi t Nguy n Thanh B o(2003), Vi khu n h c, HYD Tp.HCM - B môn vi sinh Ph m V n Ca, Lê S.pneumoniae ng Hà (2003), “T l tr kh a m nh mang H.influenzae v xuyên Vân n”, t p chí nghiên c u y h c, s 23 (3) Ph m V n Ca c ng s (2005), T n su t b t g p Moraxella cataharrlis vi khu n gây b nh m c kháng thu c t i Vi t Nam”, T p chí y h c d phịng, t p XV, s (73) Ph m Ti n D ng, Nguy n S Tu n H a M Ng c, “Kh o sát kháng kháng sinh c a dòng vi khu n gây b nh t i b nh vi n a khoa th ng nh t ng Nai t 06/2011 n 04/2012”, s y t ng Nai Nguy n Th M Linh, Phan H u Nguy t Di m Nguy n Th Ph “Tình hình ng, kháng kháng sinh c a vi khu n gây viêm ph i b nh vi n tr em t tháng n tu i t i BVN I t 1/5/2009 n 1/5/2010”, Y H c TP.H Chí Minh, t p 15, ph b n c a s 1, 2011 D ng Nh t Linh(2013), Giáo trình vi sinh gây b nh, Tr ng ih cM TpHCM D ng Nh t Linh(2013), Giáo trình th c hành vi sinh gây b nh, Tr ng i h c M TpHCm PGS.TS.Cao Minh Nga (2013), “S nhi m khu n b nh vi n kháng kháng sinh c a vi khu n gây ng hơ h p t i TP.HCM” Hồng Th Thu Nguy t(2008), Tìm hi u c n nguyên kh n ng kháng sinh c a vi khu n gây viêm kháng ng hô h p t i b nh vi n 175, Lu n v n c nhân 10 Tr n Qu (2003), “ c i m gi i ph u, sinh lý b máy hô h p tr em”, Nhi khoa t p I, Nhà xu t b n Y h c, Hà N i SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p 11 V V n Thành, GVHD: TS.BS V B o Châu ng trùng hô h p c p tính c Anh (2010),“Nghiên c u c n nguyên gây nhi m tr em d i tu i t i Nha Trang”, T p chí y h c d phòng, t p XX, s (113) 12 Phan ình Th m(2013), ánh giá tình hình tác nhân gây nhi m khu n kháng kháng sinh c a ng hô h p t i b nh vi n Nguy n Tri Ph kho ng th i gian t tháng 4/2012 ng n tháng 4/2013 13 Nguy n V Trung (2007), “Moraxella catarrhalis”, Vi sinh v t Y h c, sách t o bác s a khoa, Nhà xu t b n Y h c Hà N i-2007, tr.161-164 14 Ph m Hùng Vân, Ph m Thái Bình (2005), “Nghiên c u kháng kháng sinh c a tác nhân vi khu n gây nhi m khu n hô h p c p”, T p chí Y h c th c hành, s 513, tr.117-125 15 Ph m Hùng Vân(2006),K thu t xét nghi m vi sinh lâm sàng, Nhà Xu t B n Y H c 16 Ph m Hùng Vân, tác nhân gây nhi m khu n hô h p c p vi khu n h c th c t kháng kháng sinh 17 Nguy n Th Vinh, Nguy n s c Hi n (2006), “Báo cáo ho t kháng kháng sinh c a vi khu n gây b nh th 2005”, Thông tin d Tài li u n ng g p ng theo dõi Vi t Nam n m c lâm sàng, t p XVI, s 6, tr.16-22 c 18 Batuwanthudawe, R.,K Karunarathne, M Dassanayake, S.de Silva, M.K Lalitha, K Thomas, M Steinhoff and N Abeysinghe (2009), “Surveillance of invasive pneumococcal disease in Colombo, Sri Lanka”, Infect, Dis, 48(Supp1.2), pp.136-140 19 Butler J.C., Hofmann J., Cetron M.S., Elliott J.A, Facklam R.R and Breiman R.F., (2004), “The continued emergence of drug resistant Streptococcus pneumoniae in the United Stated: an update from the Centers for Disease Control and Prevention’s Pneumonococcal Sentinel Surveillance System”, Journal of Infectious Disease, 174, pp.986-93 SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: TS.BS V B o Châu 20 HARRISON 2000 Priciples of Internal Medicine Pp Ngu n Internet 21 http://hcm.24h.com.vn/suc-khoe-doi-song/viem-duong-ho-hap-trenc62a347222.html SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà ... u[10], ng hô h p d Vi? ?m - Vi? ?m tai gi a - ng hô h p trên: Vi? ?m Amidan - i, l y s n n p qu n làm m c: Vi? ?m h ng - ng hô h p Vi? ?m m i - ng hô h p chia làm hai ph n Vi? ?m xoang Vi? ?m ng hô h p d - Vi? ?m... 3.2.1 kháng kháng sinh c a vi khu n Hi n t ng kháng kháng sinh kháng kháng sinh tình tr ng kháng sinh không tiêu di t vi khu n, m t s vi khu n cịn s ng sót s có kh n ng c hồn tồn kháng l i kháng sinh. .. c t lâm sàng, ti n hành nghiên c u ? ?Tìm hi u c n nguyên tình hình khu n gây vi? ?m tài: kháng kháng sinh c a lồi vi ng hơ h p t i b nh vi n 175 t 05/ 2013 n 04/ 2014? ?? SVTH: Nguy n Ph m Ph ng Trà Báo