B GIÁO DC VẨ ẨO TO TRNG I HC M TP.HCM KHịA LUN TT NGHIP Tên đ tài: GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PH M MÁU TI BNH VIN NHI NG 1 T 10/2013 N 03/2014 KHOA CÔNG NGH SINH HC CHUYÊN NGHÀNH VI SINH-SINH HC PHÂN T GVHD: THS.BS. LÊ QUC THNH SVTH: NGUYN QUANG TÍN MSSV: 1053010802 NIÊN KHÓA: 2010-2014 Tp. H Chí Minh, tháng 05 nm 2014 Nhn xét ca giáo viên hng dn: SVTH: Nguyn Quang Tín MSSV: 1053010802  tài: “GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PHM MÁU TI BNH VIN NHI NG 1 T 10/2013 N 03/2014” ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ LI CM N u tiên, em xin gi li cm n sơu sc nht đn ThS. Bs. Lê Quc Thnh. Thy đƣ nhit tình hng dn và cho em nhng kin thc chuyên môn đ em hoàn thành tt báo cáo khóa lun tt nghip này. Em xin chơn thƠnh cám n Ban giám hiu và Quý thy cô Khoa Công ngh sinh hc trng i hc M Thành ph H Chí Minh trong sut 4 nm hc qua đƣ nhit tình ging dy, ht lòng truyn đt cho em nhng kin thc c bn và kin thc chuyên môn, to điu kin tt nht cho em trong sut quá trình hc tp ti trng. Em xin gi li cm n đn các cô, chú, anh, ch trong khoa Vi sinh - Bnh vin Nhi ng 1 đƣ nhit tình hng dn các kin thc, k thut chuyên môn, góp ý và giúp đ em hoàn thành khóa thc tp tt nghip. Cui cùng, con xin cm n b m đƣ sinh thƠnh, dy d con khôn ln và dành cho con nhng điu tt đp nht đ con có th chuyên tâm hc hành và có đc thành qu nh ngƠy hôm nay. Thành ph H Chí Minh, ngày 22 tháng 05 nm β014 Sinh viên Thc Hin Nguyn Quang Tín KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 1 MSSV: 1053010802 DANH MC VIT TT CFU: Colony Forming Unit (đn v to khúm đi vi các vi khun sng) ESBLs: Extended spectrum beta-lactamase F1: Fraction 1(kháng nguyên nang) I: Intermediate (trung gian) Ks: kháng sinh KS: kháng sinh đ LPS: lipopolysaccharide (ni đc t) n: c mu NKT: nhim khun huyt NTH: nhim trùng huyt R: Resistant (đ kháng) S: Susceptible (nhy cm) Môi trng: BA: Blood agar BHI: Brain Heart Infusin CA: Chocolate Agar KIA: Kligler’s Iron Agar MC: MacConkey agar MHA: Mueller Hinton Agar SIM: Sulfide Indole Motility KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 2 MSSV: 1053010802 Vi khun: aan: Acinetobacter sp E. coli: Escherichia coli EAEC: Enteroadherent E.coli ecl: Enterobacter cloacae eco: Escherichia coli EHEC: Enterohemorrhagic E.coli EIEC: Entero invasive Escherichia coli ent: Enterococcus sp EPEC: Enteropathogenic Escherichia coli ETEC: Enteroxigenic Escherichia coli kpn: Klebsiella pneumonia pae: Pseudomonas aeruginosa pce: Pseudomonas cepacia ps-: Pseudomonas spp sau: Staphylococcus aureus scn: Staphylococcus coagulase nagative sta: Staphylococci str: Streptococcus sp KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 3 MSSV: 1053010802 Kháng sinh AP: ampicillin ATM: aztreonam Ba: Bacitracin C: chloramphenicol CAZ: ceftazidime CCAZ: ceftazidime /clav. CCTX: cefotaxime/clav. CIP: ciprofloxacin CPD: cefpodoxime CPM: cefepime CPZ: cefoperazone CTX: cefotaxime CXM: cefuroxime GM: gentamycin IMP: imipenem Op: Optochin OX: oxacillin PB: polimyxin B PEF: pefloxacin PG: penicillin RP: rifampicin TIM: ticarcillin/Clavulanic acid TS: cotrimoxazole VA: vacomycin Khoa: 1AB: Khoa ngoi tng hp 1CD: Khoa ni tng quát 1 1I: Khoa dch v 2AB: Khoa phng, chnh hình 2CD: Khoa ni tng quát 2 2I: Khoa Thn 3B: Khoa tim mch 3CD: Khoa hô hp 3I: Khoa st xut huyt + huyt hc CC: Khoa cp cu HSN: Khoa hi sc ngoi ICU: Khoa hi sc tng cng NC: Khoa ngoi chn Nhim NICU: Khoa hi sc s sinh RHM: Khoa rng hƠm mt. SS: Khoa s sinh TH: Khoa tiêu hóa KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 4 MSSV: 1053010802 DANH MC CÁC BNG Bng 3. Bng trc nghim sinh hóa đnh danh trc khun Gram âm thuc nhóm Enterobacteriaceae. [3] 71 Bng 3.1: T l cy máu dng tính  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 76 Bng 3.2: T l phân b ca cy máu dng tính theo tng khoa  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 543) 78 Bng 3.3: T l phân b s ca cy máu dng tính theo đ tui  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014 (n = 543). 79 Bng 3.4: T l phân b s ca cy máu dng tính theo gii tính  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014 (n = 543). 81 Bng 3.5: T l các loi vi khun phân lp đc t chai cy máu dng ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/2013- 03/2014 (n = 543). 82 Bng 3.6: T l đ kháng kháng sinh ca Escherichia coli đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 22). 84 Bng 3.7: T lên đ kháng kháng sinh ca Acinetobacter spp đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n=59). 86 Bng 3.8: T l đ kháng kháng sinh ca Klebsiella pneumoniae đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 26). 88 Bng 3.9: T l đ kháng kháng sinh ca P. aerigunosa đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 23). 90 Bng 3.10: T l đ kháng kháng sinh ca Staphylococcus aureus đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014 (n = 25). 92 Bng 3.11: Kh nng sinh men ESBLs ca : Escherichia coli (n = 22) và Klebsiella pneumonia (n = 26), Acinetobacter sp (n = 59) đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 94 Bng PL.1: Hng dn đt đa kháng sinh (CLSI β01β) [11] 103 KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 5 MSSV: 1053010802 Bng PL.2: Tiêu chun đng kính vòng vô khun vi khun đng rut (Enterobacteriaceae) [11] 104 Acinetobacter sp. [11] 105 Staphylococci. [11] 106 Pseudomonas aerigunosa. [11] 107 KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 6 MSSV: 1053010802 DANH MC BIU  Biu đ 3.1: T l cy máu dng tính  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 77 Biu đ 3.2: T l phân b ca cy máu dng tính theo tng khoa  Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 79 Biu đ 3.3: T l phân b ca cy máu dng theo đ tui  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014 80 Biu đ 3.4: T l phân b ca cy máu dng theo gii tính  Bnh vin Nhi ng 1 t tháng 10/β01γ đn 03/2014. 81 Biu đ 3.5: T l các loi vi khun phân lp đc t chai cy máu dng ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/2013- 03/2014. 83 Biu đ 3.6: T l đ kháng kháng sinh ca Escherichia coli đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 85 Biu đ 3.7: T lên đ kháng kháng sinh ca Acinetobacter sp đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 87 Biu đ 3.8: T đ kháng kháng sinh ca Klebsiella pneumoniae đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1 t 10/β01γ đn 03/2014. 89 Biu đ 3.9: T l đ kháng kháng sinh ca Pseudomonas aerigunosa đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 91 Biu đ 3.10: T l đ kháng kháng sinh ca Staphylococcus aureus đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 93 Biu đ 3.11: T l sinh men ESBLs ca : Escherichia coli và Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter sp đc phân lp t bnh phm máu ti Bnh vin Nhi ng 1t 10/β01γ đn 03/2014. 94 KHOA CÔNG NGH SINH HC GVHD: ThS.BS. Lê Quc Thnh Báo cáo khóa lun tt nghip SVTH: Nguyn Quang Tín Trang 7 MSSV: 1053010802 DANH MC HÌNH NH Hình 1.1: Staphylococci di kính hin vi và khun lc trên thch MHA 33 Hình 1.2: Streptococci di kính hin vi và khun lc trên môi trng BA 38 Hình 1.3: Klebsiella di kính hin vi và khun lc trên thch MC 42 Hình 1.4: Pseudomonas aeruginosa di kính hin vi và khun lc trên MHA 44 Hình 1.5: Acinetobacter di kính hin vi và khun lc trên MC 47 Hình 1.6: Escherichia coli di kính hin vi và khun lc trên MC 48 [...]... Kh o sát t n su t các vi khu n gây b nh phân l m c t b nh ph m máu và kháng kháng sinh c a các ch ng vi khu n này t i b nh vi n Nhi ng 1 t tháng 10 n tháng 03/ 2014 2 M C TIÊU C TH : Kh o sát t l phân b ca c tu i, gi i tính, khoa u tr Kh o sát t l vi khu n phân l nhân có ch nh c y máu Kh b nh vi c t b nh ph m máu c a các b nh ng 1 kháng kháng sinh c a các vi khu n phân l ct b nh ph m máu Kh o sát t... này, chúng tôi xin th c hi GIÁM SÁT TÌNH HÌNH KHU N PHÂN L P T tài: KHÁNG KHÁNG SINH C A CÁC VI B NH PH M MÁU T I B NH VI N NHI NG 1 T 10 N 03/ 2014 K t qu nghiên c u nh m cung c p thêm thông tin tham kh o cho các nhà lâm sàng trong vi ng s d u tr i v i các ng h p có nhi m trùng huy t do vi khu n gây nên SVTH: Nguy n Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02 Trang 12 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu n t t nghi... 22 1.7 Phòng b nh nhi m khu n huy t[18] 23 2 THU C KHÁNG SINH VÀ S KHÁNG KHÁNG SINH 25 thu c kháng sinh 25 2.2 X p lo i kháng sinh 25 ng c a kháng sinh 26 2.4 S kháng kháng sinh [1] 27 2.5 Ngu n g c c a vi c kháng thu c 28 kháng[ 16] 30 2.7 S kháng chéo 30 2.8 Bi n pháp h n ch n kháng kháng sinh 30 2.9 ESBLs (Extended... l c qua vi c dùng kháng sinh Vì v y vi c phòng ch ng, gi m thi u nh ng v do nh ng vi khu gây nên chính là vi c ch ng nhi m khu n t t t và s d ng kháng sinh h p lý cho nh ng b nh nhân ph - c bi c bi t quan tr B-lactam có s u tr dài ngày n s m nh t trong l ch s kháng sinh u tr các nhi m khu n Hi n nay nhóm ng kháng sinh l n nh t, chi m g n ba ph kháng sinh hi các vi khu n Gram âm Vi khu n sinh kháng toàn... CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu n t t nghi p 2 THU C KHÁNG SINH VÀ S 2.1 GVHD: ThS.BS Lê Qu c Th nh KHÁNG KHÁNG SINH thu c kháng sinh Thu c kháng sinh là nh ng ch n nhân lên b hay nhi ng ch ng l i s s ng c a vi khu n, ng m c phân t , ho n chuy n hóa c n thi t c ng vào m t i s ng vi khu n ho ng vào s cân b ng lí hóa [16] Kháng sinh có tác d c hi t lo i kháng sinh s m t lo i vi khu n hay m t nhóm vi khu... ThS.BS Lê Qu c Th nh Vi c phát hi n các vi khu n sinh ESBL nhanh, chính xác c a phòng xét nghi m Vi sinh t i các b nh vi n là vi c làm h t s c c n thi lâm sàng s m l a ch c kháng sinh thích h p, gi b nh nhân T i Vi u tr , c u s ng u ki n c a t ng b nh vi n, m t s khoa Vi n hành th nghi m phát hi n vi khu n sinh ESBL b ng các SVTH: Nguy n Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02 Trang 32 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo... i d ng kháng sinh, các nhà kháng v ng g p t kì gen liên các ch ng vi khu i [16] Trang 27 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu n t t nghi p GVHD: ThS.BS Lê Qu c Th nh Hi u loài vi khu n gây b i và là m i quan tâm lo l ng c a toàn xã h i Vi khu n kháng kháng sinh làm gi i h n kh h pd u tr nhi m trùng, m t s n t vong do vi khu n gây b u tr G ng kháng v i h u h t các kháng sinh u còn cho bi t vi khu... s d ng r ng rãi nên t l vi khu kháng các kháng sinh này r t cao, nh t là ESBL s c bi t a kháng chéo v i nhi aminoglycoside, fluoroquinolone, tetracyclin, co-trimoxazol gây u tr do vi c l a ch n kháng sinh b thu h p Nh ng b nh nhân nhi m khu n do vi khu n sinh ESBL có b nh c n ng, t l t vong cao do vi khu SVTH: Nguy n Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02 ng kháng Trang 31 KHOA CÔNG NGH SINH H C Báo cáo khóa lu... kháng sinh ch ng lai các tác nhân n , virus, vi n m r t hi u l hi n các vi sinh v t kháng thu c t m ng Nhi m trùng huy t là nguyên nhân gây t trong b nh vi n, mà t l cao nh t là b u các b nh nhân c bi t ngay c các b nh vi n c dù có h th ng trang thi t b ph c v c p c u t l t vong v n r t cao Nguyên nhân không nh d n tình tr ng này chính là chi ng gia c c a các ch ng vi khu n gây NTH Hi n nay, t i Vi. .. còn cho bi t vi khu n có kh kháng v i không ch nh ng kháng sinh m i s d ng mà còn kháng l i các ng n a, các ch ng vi khu n không gây b n tr tính kháng truy n cho nh ng vi khu n gây b nh khác [16] thu Nhi u nghiên c u cho th m khu n huy t, s c nhi m khu n, th m chí b nh nhân b t nh kho ng 70% là nhi m trùng do vi khu n Gram âm Các vi khu n Gram âm gây b ng g p t i các b nh vi n là Escherichia coli, Klebsiella . tài: GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PH M MÁU TI BNH VI N NHI NG 1 T 10/ 2013 N 03/ 2014 KHOA CÔNG NGH SINH HC CHUYÊN NGHÀNH VI SINH- SINH. Nguyn Quang Tín MSSV: 105 3 0108 02  tài: “GIÁM SÁT TỊNH HỊNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP T BNH PHM MÁU TI BNH VI N NHI NG 1 T 10/ 2013 N 03/ 2014 ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ ầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầầ. đánh giá tình trng NTH do vi khun gây ra và mc đ đ kháng kháng sinh ca các vi khun này, chúng tôi xin thc hin đ tài: “GIÁM SÁT TÌNH HÌNH  KHÁNG KHÁNG SINH CA CÁC VI KHUN PHÂN LP