Tóm tắt: Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng

Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng.

BỘ GIÁO DỤC ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ

VIỆN SỐT RÉT - KÝ SINH TRÙNG - CÔN TRÙNG TRUNG ƯƠNG

-* -

PHẠM THỊ HÀ TRANG

NGHIÊN CỨU THỰC TRẠNG NHIỄM SÁN LÁ GAN NHỎ TRÊN NGƯỜI Ở HAI XÃ TRỌNG ĐIỂM THUỘC NINH BÌNH, PHÚ YÊN VÀ CHẾ TẠO KIT LAMP ỨNG DỤNG TRONG

Công trình hoàn thành tại

Viện sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Trung ương

Người hướng dẫn khoa học:

1 PGS TS Trần Thanh Dương 2 TS Trương Văn Hạnh

Phản biện 1: ……… Phản biện 2: ……… Phản biện 3: ………

Luận án sẽ được bảo vệ trước Hội đồng chấm luận án cấp Viện họp tại Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Trung ương

Vào hồi giờ ngày tháng năm 20

Có thể tìm đọc luận án tại:

1 Thư viện Quốc gia Việt Nam

2 Viện Sốt rét - Thư viện Ký sinh trùng và Côn trùng học

DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH NGHIÊN CỨU LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN ĐÃ CÔNG BỐ

1 Phạm Thị Hà Trang, Trương Văn Hạnh, Hoàng Đình Cảnh, Trần Thanh Dương, (2024), Thực trạng và một số yếu tố liên

quan đến nhiễm sán lá gan nhỏ Clonorchis sinensis trên người

tại xã Yên Lộc, huyện Kim Sơn, tỉnh Ninh Bình (2018-2020)

Tạp chí Y học Việt Nam, Tập 538, tháng 5/2024 (số 2), tr:

xxx-xxx (Bài báo đã được Tạp chí chấp nhận đăng)

2 Phạm Thị Hà Trang, Trương Văn Hạnh, Hoàng Đình Cảnh, Trần Thanh Dương, (2024), Thực trạng và một số yếu tố liên

quan đến nhiễm sán lá gan nhỏ Opisthorchis viverrini trên

người tại xã An Mỹ, huyện Tuy An, tỉnh Phú Yên

(2018-2019) Tạp chí Y học Việt Nam, Tập 538, tháng 5/2024 (số 2), tr: yyy-yyy (Bài báo đã được Tạp chí chấp nhận đăng)

3 Phạm Thị Hà Trang, Trương Văn Hạnh, Hoàng Đình Cảnh, Trần Thanh Dương, (2024), Nghiên cứu chế tạo kít LAMP

chẩn đoán sán lá gan nhỏ Clonorchis sinensis nhiễm trên người Tạp chí Khoa học và Công nghệ Việt Nam, Tập X, (số Y), tr: yyy-yyy (Bài báo đã được Tạp chí chấp nhận đăng)

C sinensis và O viverrini phân bố ở ít nhất 32 tỉnh thành Hai địa phương

Ninh Bình và Phú Yên được coi là điểm nóng với tỷ lệ nhiễm sán lá gan nhỏ khá cao với nhiều yếu tố liên quan, trong đó, nguyên nhân chính do tập quán ăn gỏi cá của nhân dân đã tồn tại lâu đời

Có rất nhiều phương pháp xét nghiệm nhiễm sán lá gan nhỏ Gần đây, nhiều nghiên cứu có xu hướng chuyển sang các phương pháp khuếch đại ADN đẳng nhiệt (đặc biệt là kỹ thuật khuếch đại đẳng nhiệt mạch vòng trung gian– Loop - mediated Isothermal Amplification - LAMP) với nhiều ưu điểm Đến nay, tại Việt Nam chưa có kit LAMP được thương mại hóa để chẩn đoán nhiễm sán lá gan nhỏ trên người Xuất phát từ những yêu cầu khoa học và thực tiễn trên đây, chúng tôi tiến hành nghiên cứu đề tài:

“Nghiên cứu thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người ở hai xã trọng điểm thuộc Ninh Bình, Phú Yên và chế tạo kit LAMP ứng dụng trong chẩn đoán tại cộng đồng” với các mục tiêu sau:

1 Mô tả thực trạng và một số yếu tố liên quan nhiễm sán lá gan nhỏ trên người tại hai xã trọng điểm thuộc tỉnh Ninh Bình và Phú Yên (2018-2020)

2 Chế tạo kit LAMP xét nghiệm nhiễm Clonorchis sinensis, Opisthorchis viverrini trên người ở quy mô phòng thí nghiệm

NHỮNG ĐÓNG GÓP MỚI VÀ Ý NGHĨA KHOA HỌC, Ý NGHĨA THỰC TIỄN CỦA LUẬN ÁN

1 Mô tả, đánh giá thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ và yếu tố liên quan nhiễm sán lá gan nhỏ trên người tại 2 xã Yên Lộc và An Mỹ của tỉnh Ninh Bình và Phú Yên, góp phần tiên lượng và xây dựng chiến lược phòng chống bệnh sán lá gan nhỏ tại khu vực có thói quen ăn gỏi cá của 02 tỉnh

trên có hiệu quả

2 Đây là nghiên cứu đầu tiên xây dựng hoàn thiện được quy trình và

chế tạo thành công kit LAMP chẩn đoán nhiễm sán lá gan nhỏ C sinensis và

O viverrini trên người tại Việt Nam tạo ra được bước đột phá về giải pháp kỹ

thuật trong chẩn đoán nhiễm sán lá gan nhỏ C sinensis và O viverrini trên

người, đóng góp vào công tác chẩn đoán sớm và điều trị kịp thời, đáp ứng yêu cầu thực tiễn phòng chống nhiễm sán lá gan nhỏ trên người nói riêng và các bệnh ký sinh trùng đường ruột nói chung tại nước ta

CẤU TRÚC CỦA LUẬN ÁN

Luận án dày 140 trang gồm: Đặt vấn đề 2 trang; Tổng quan: 33 trang; Đối tượng và phương pháp nghiên cứu 23 trang; Kết quả nghiên cứu 41 trang; Bàn luận: 39 trang; Kết luận 2 trang Luận án có 39 hình, 45 bảng số liệu, 10 phụ lục Có 127 tài liệu tham khảo, có > 40% số tài liệu tham khảo trong thời gian 5 năm trở lại đây

Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU

1.1 Một số đặc điểm dịch tễ học nhiễm sán lá gan nhỏ 1.1.1 Tác nhân gây bệnh

Trên thế giới, có 3 loài sán lá gan nhỏ thuộc họ Opisthorchiidae gây

bệnh cho người là Clonorchis sinensis, Opisthorchis viverrini và

Opisthorchis felineus với đặc điểm sinh học, vòng đời và lâm sàng tương

đối giống nhau Ở Việt Nam hiện chỉ ghi nhận sự có mặt của 2 loài sán lá

gan lá gan nhỏ là Clonorchis sinensis và Opisthorchis viverrini

1.1.3.2 Cơ chế lây truyền bệnh:

Vòng đời sán lá gan nhỏ phức tạp, qua nhiều vật chủ

1.1.4 Sức cảm thụ và miễn dịch

Mọi người đều có thể mắc bệnh khi bị nhiễm sán lá gan nhỏ Người không có miễn dịch tự nhiên với sán lá gan nhỏ, sau khi nhiễm mầm bệnh có thể dễ dàng bị tái nhiễm

1.1.5 Một số yếu tố liên quan đến nhiễm sán lá gan nhỏ trên người

1.1.5.1 Tập quán ăn gỏi cá

Thói quen ăn gỏi cá là một trong các yếu tố nguy cơ quan trọng ở những người nhiễm sán lá gan nhỏ, điều nay đã được chứng minh ở nhiều nghiên cứu tại Việt Nam và một số nước châu Á khác

1.1.5.2 Độ tuổi, giới tính, nghề nghiệp

Tuổi: Nói chung nhiễm sán lá gan nhỏ quan sát thấy ở tất cả các nhóm tuổi, tuy nhiên thường gặp ở người lớn Tỷ lệ và cường độ nhiễm tăng theo tuổi

Giới: Nhiều nghiên cứu trên thế giới cho thấy tỷ lệ và cường độ nhiễm ở nam cao hơn nữ

Nghề nghiệp: cũng là một trong các yếu tố liên quan đến tình trạng lây nhiễm sán lá gan nhỏ

1.1.5.3 Một số yếu tố khác:

- Yếu tố kinh tế - xã hội

- Tập quán sinh hoạt và canh tác - Yếu tố môi trường tự nhiên

1.1.6 Các biện pháp phòng chống

- Không ăn gỏi cá và các loại thực phẩm chế biến từ cá chưa nấu chín - Không dùng phân người nuôi cá, không phóng uế xuống nguồn nước - Truyền thông giáo dục sức khỏe cho cộng đồng về phòng chống bệnh sán lá gan nhỏ

- Định kỳ tẩy sán cho chó, mèo, lợn

- Điều trị dự phòng tại cộng đồng: Áp dụng Hướng dẫn tẩy sán lá gan nhỏ tại cộng đồng theo quyết định số 1931/QĐ-BYT ngày 19/5/2016 của Bộ trưởng Bộ Y tế

1.1.7 Đặc điểm phân bố và tình hình nhiễm sán lá gan nhỏ ở người trên thế giới và Việt Nam

1.1.7.1 Đặc điểm phân bố và tình hình nhiễm sán lá gan nhỏ trên thế giới

Bệnh sán lá gan nhỏ phân bố trên thế giới rất đa dạng ở nhiều quốc

gia khác nhau Có khoảng 680 triệu người trên thế giới có nguy cơ nhiễm

Ước tính 45 triệu người sống ở châu Á và châu Âu nhiễm bệnh (khoảng

35 triệu người nhiễm C sinensis, 10 triệu người nhiễm O viverrini và 1,2 triệu người nhiễm O felineus)

C sinensis gây bệnh phổ biến nhất trong số 3 loài sán lá gan nhỏ gây

bệnh ở người chủ yếu ở châu Á bao gồm Trung Quốc, Hàn Quốc, miền bắc Việt Nam và miền Đông nước Nga Hơn nữa, những người di cư hoặc du lịch từ các vùng lưu hành bệnh sẽ làm tăng nguy cơ truyền bệnh sang các nước khác

Tương tự như C sinensis, dân cư nhiễm sán O viverrini thường sống

ở những vùng có nhiều ao, hồ và dọc những con sông Ước tính có khoảng

12,39 triệu người nhiễm O viverrini tại 4 quốc gia lưu hành chủ yếu bao

gồm Thái Lan (6,71 triệu), CHDCND Lào (2,45 triệu), Việt Nam (2,07 triệu) và Campuchia (1,00 triệu)

Loài O felineus ít phổ biến nhất trong số 3 loài sán lá gan nhỏ Nó đã

được báo cáo từ các quốc gia châu Âu trừ Phần Lan, Na Uy và Thụy Điển

Khoảng 12,5 triệu người có nguy cơ nhiễm O felineus, chủ yếu gặp ở khu

vực Nga, Đông Âu

1.1.7.2 Đặc điểm phân bố và tình hình nhiễm sán lá gan nhỏ tại Việt Nam

Việt Nam là nước đang phát triển, hai đới khí hậu khác biệt tại hai miền Nam-Bắc là điều kiện thuận lợi cho cho sự xuất hiện và phân bố của

2 loài sán lá gan nhỏ: C sinensis lưu hành ở ít nhất 21 tỉnh miền bắc và O

viverrini lưu hành ở ít nhất 11 tỉnh miền trung và khu vực Tây Nguyên, tỷ

lệ nhiễm khác nhau tùy địa điểm

Các tỉnh: Nam Định (nơi cao nhất là 26,0–37,5%), Ninh Bình (tỷ lệ nhiễm dao động từ 23,5–31,0%), Phú Yên, Bình Định được coi là điểm nóng nhiễm sán lá gan nhỏ, tập quán ăn gỏi cá của nhân dân đã tồn tại lâu đời

Số liệu điều tra 5 năm gần đây của Viện Sốt rét – Ký sinh trùng – Côn trùng Trung ương cho thấy tỷ lệ nhiễm sán lá gan nhỏ tại Bình Định là 6,8%; Quảng Trị 8,9%; Đăk Lăk 4,8%; Phú Yên 15,3%; Quảng Nam 4,3%; Hòa Bình 24,4%; Nam Định 11,8%; Ninh Bình 21%, Thanh Hóa 21,6%, Yên Bái 23 – 64,7%, Sơn La < 1% Tuy nhiên, còn rất nhiều địa phương mà người dân có thói quen ăn gỏi cá nhưng chưa được đánh giá và chưa có số liệu về thực trạng nhiễm sán lá gan nhỏ để có thể tiến hành các biện pháp can thiệp và phòng chống bệnh

1.1.7.3 Một số đặc điểm về tình hình nhiễm sán lá gan nhỏ tại hai xã của Ninh Bình và Phú Yên

- Tại Ninh Bình:

Điều tra của Đoàn Thúy Hòa (2020) tại Kim Sơn và Yên Khánh, Ninh Bình cho thấy tỷ lệ nhiễm sán lá gan nhỏ là 20,1% Tỷ lệ nhiễm và cường độ nhiễm sán trung bình ở nam cao hơn ở nữ (p< 0,001; OR = 3,994) Người ăn gỏi cá có nguy cơ nhiễm sán cao gấp 5,8 lần không ăn gỏi cá (p<0,001) Đa số (87,2%) nhiễm nhẹ, không có đối tượng nào nhiễm mức độ nặng

- Tại Phú Yên:

Các điều tra từ năm 2015-2018 của Viện Sốt rét – Ký sinh trùng -

Côn trùng Trung ương cho thấy O viverrini phân bố ở các tỉnh miền

Trung và khu vực Tây Nguyên, trong đó Phú Yên là 15,3%

1.2 Đặc điểm lâm sàng, chẩn đoán và điều trị bệnh sán lá gan nhỏ trên người

1.2.1 Đặc điểm lâm sàng bệnh sán lá gan nhỏ trên người

Đa số trường hợp nhiễm bệnh không có triệu chứng lâm sàng Có ba thể bệnh: thể nhẹ, thể trung bình, thể nặng

1.2.2 Chẩn đoán

Theo hướng dẫn tại Quyết định số 1172/QĐ-BYT ngày 13/5/2022 của Bộ Y tế

1.2.3 Điều trị bệnh sán lá gan nhỏ trên người

Điều trị đặc hiệu bằng Praziquantel liều 75mg/kg

1.3 Các phương pháp xét nghiệm xác định tình trạng nhiễm sán lá gan nhỏ trên người

Phương pháp Kato-Katz, Xét nghiệm miễn dịch chẩn đoán sán lá gan nhỏ (phản ứng ELISA - enzyme-Linked immunosorbent assay), phương pháp sinh học phân tử

1.4 Kỹ thuật LAMP và nghiên cứu chế tạo bộ kít LAMP xét nghiệm phát hiện nhiễm sán lá gan nhỏ trên người

1.4.1 Nguyên lý của kỹ thuật LAMP

Kỹ thuật LAMP sử dụng 4-6 mồi khác nhau được thiết kế đặc biệt để nhận ra 6-8 vùng riêng biệt trên gen đích và phản ứng diễn ra ở một nhiệt độ duy nhất (550C-650C) Sản phẩm phản ứng có thể quan sát bằng mắt thường LAMP thường được sử dụng tạo các kit chẩn đoán nhanh

1.4.2 Thành phần phản ứng LAMP

Thành phần cơ bản của phản ứng LAMP: Các cặp mồi, dung dịch

đệm, enzym Bst ADN polymerase, ADN khuôn, chất nhuộm màu (nếu có)

1.4.3 Cơ chế của phản ứng LAMP

Ba giai đoạn chính: tạo vật liệu khởi đầu, tái bản và kéo dài chuỗi, lặp lại chu kỳ

1.4.4 Đánh giá kết quả của LAMP

Đánh giá kết quả bằng điện di và không bằng điện di

1.4.6 Tính ưu việt của kỹ thuật LAMP

Ưu điểm là nhanh, đơn giản, dễ thực hiện, không cần các thiết bị chuyên dụng có độ nhạy và độ đặc hiệu tương đương và cao hơn các phương pháp dựa trên kỹ thuật PCR Kết quả của phản ứng LAMP có thể được quan sát ngay dưới ánh sáng thường hoặc soi dưới tia UV

1.4.8 Một số ứng dụng của kỹ thuật LAMP trong chẩn đoán nhiễm sán lá gan nhỏ ở người

Nghiên cứu của Lê Thanh Hòa, Nguyễn Văn Đề và cộng sự (2012)

chẩn đoán sán lá gan nhỏ O viverrini: xét nghiệm LAMP nhạy hơn

10-100 lần so với PCR

Từ năm 2017 - 2020, Viện Sốt rét – Ký sinh trùng – Côn trùng Trung

ương đã thực hiện Nhiệm vụ nghiên cứu khoa học cấp Quốc Gia “Nghiên

cứu chế tạo bộ kít LAMP chẩn đoán ký sinh trùng sốt rét, sán lá gan lớn, sán lá gan nhỏ, giun lươn đường ruột tại thực địa” Kết quả đã nghiên cứu

chế tạo thành công các bộ kít LAMP trong đó có Bộ kít LAMP chẩn đoán

sán lá gan nhỏ C sinensis và O viverrini Độ nhạy, độ đặc hiệu đánh giá

thử nghiệm tại phòng thí nghiệm đạt > 95%

1.4.9 Chế tạo và chuẩn hóa bộ kit LAMP chẩn đoán sán lá gan nhỏ

- Thiết kế mồi để xác định tác nhân gây bệnh mong muốn; - Xây dựng quy trình tiến hành phản ứng LAMP;

- Đánh giá độ nhạy, độ đặc hiệu, ngưỡng phát hiện của phản ứng LAMP;

- Tạo chuẩn dương cho kit;

- So sánh độ nhạy, độ đặc hiệu, ngưỡng phát hiện; - Đóng gói bộ sinh phẩm;

- Đánh giá độ ổn định của bộ sinh phẩm trên mẫu chuẩn

Chương 2

ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

2.1 Mục tiêu 1: Mô tả thực trạng và một số yếu tố liên quan nhiễm sán lá gan nhỏ trên người tại hai xã trọng điểm thuộc tỉnh Ninh Bình và Phú Yên (2018-2020)

2.1.1 Đối tượng, thời gian và địa điểm nghiên cứu

- Đối tượng nghiên cứu: Người dân ≥ 18 tuổi sống liên tục trên 1 năm tại 2 xã của tỉnh Ninh Bình và tỉnh Phú Yên

- Thời gian: Năm 2018, 2020: 459 người tại Ninh Bình Năm 2019,

2020: 460 người tại Phú Yên - Địa điểm nghiên cứu

+ Thực địa: xã Yên Lộc, huyện Kim Sơn, tỉnh Ninh Bình và xã An Mỹ, huyện Tuy An, tỉnh Phú Yên

+ Khoa sinh học phân tử, Khoa Ký sinh trùng Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Trung ương

2.1.2 Phương pháp nghiên cứu

- Thiết kế nghiên cứu: Nghiên cứu mô tả có phân tích với các đợt điều

tra cắt ngang

- Cỡ mẫu nghiên cứu

Sử dụng công thức tính cỡ mẫu cho nghiên cứu mô tả để xác định một tỷ lệ:

Trong đó: n: cỡ mẫu tối thiểu cần nghiên cứu tại 1 xã của mỗi tỉnh

thì Z1—α/2 = 1,96 p : Tỷ lệ nhiễm ước đoán, theo báo cáo của Viện Sốt rét – Ký sinh trùng- Côn trùng Trung ương tỷ lệ này là 0,21 d: Sai số tuyệt

đối cho phép, chọn d = 0,038 Với các giá trị lựa chọn cỡ mẫu tính được là 441 người/địa điểm Thực tế, nghiên cứu 460 người ở xã An Mỹ (Phú Yên), 459 người ở xã Yên Lộc (Ninh Bình)

- Tiêu chuẩn và phương pháp chọn mẫu

Chọn mẫu theo phương pháp chọn mẫu chùm (Cluster Sampling) kết hợp với phương pháp chọn mẫu hệ thống (Systematical Sampling) tại mỗi chùm Thu mẫu phân theo từng cá thể cho đến khi đủ cỡ mẫu nghiên cứu Chọn đối tượng có khả năng trả lời phỏng vấn, đồng ý tham gia nghiên cứu và cung cấp mẫu phân Loại trừ: Người bị bệnh tâm thần và đã uống thuốc tẩy sán trong 6 tháng gần thời gian điều tra

- Nội dung nghiên cứu

Xác định tỷ lệ nhiễm sán lá nhỏ trên đối tượng nghiên cứu và một số yếu tố liên quan nhiễm sán lá gan nhỏ

- Các kỹ thuật sử dụng trong nghiên cứu

Kỹ thuật phỏng vấn, điều tra KAP Kỹ thuật Kato-Katz Kỹ thuật real time PCR xác định sán lá gan nhỏ

- Các chỉ số đánh giá

Tỷ lệ nhiễm sán lá nhỏ Cường độ nhiễm sán lá gan nhỏ Một số yếu tố liên quan đến nhiễm sán lá gan nhỏ

- Các biến số nghiên cứu

Gồm: tuổi, giới, nghề nghiệp, trình độ học vấn, sử dụng nhà tiêu hợp vệ sinh, có ao nuôi cá, sử dụng phân tươi để nuôi cá và trồng trọt, có nuôi chó/mèo, tiền sử ăn gỏi cá (cá sống)

- Phương pháp thống kê và xử lý số liệu:

Xử lý thống kê bằng phương pháp y sinh học Sử dụng phần mềm SPSS 22.0

2.2 Mục tiêu 2: Chế tạo kit LAMP xét nghiệm nhiễm Clonorchis sinensis, Opisthorchis viverrini trên người ở quy mô phòng thí nghiệm

2.2.1 Đối tượng, thời gian và địa điểm nghiên cứu

2.2.1.1. Đối tượng:

- Sán lá gan nhỏ O viverrini, sán lá gan nhỏ C sinensis

- Con trưởng thành hoặc ấu trùng của một số loài sán, giun khác thu

thập từ người hoặc động vật gồm: H taichui; H pumilo; F gigatica; P

heterotremus; T solium; An duodenale; As lumbricoides O viverrini 2.2.1.2 Thời gian và địa điểm nghiên cứu

- Thời gian: Năm 2018 – 2020 - Địa điểm nghiên cứu

Thực địa: xã An Mỹ(Phú Yên), xã Yên Lộc (Ninh Bình) Phòng Thí nghiệm Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Trung ương Kiểm định kit LAMP tại Viện kiểm định Quốc gia Vacxin và sinh phẩm Y tế, Bộ Y tế

2.2.2 Phương pháp nghiên cứu

2.2.2.1 Thiết kế nghiên cứu: Thực nghiệm trong Phòng Thí nghiệm và

trên thực địa

2.2.2.2 Cỡ mẫu nghiên cứu

- Đánh giá độ nhạy, độ đặc hiệu của kit tại Phòng Thí nghiệm: nse =z

1−α/2 Pse (1− Pse)

W2 P = 72,9 nsp = z2

1−α/2 Pse (1− Pse)W2 (1−P) = 24,3

Trong đó: z1-α/2: Hệ số tin cậy, với độ tin cậy 95% thì z1-α/2 =1,96 Ước tính tỷ lệ dương tính là (P): 25% Độ nhạy mong đợi của kít LAMP (Pse): 95% Độ đặc hiệu mong đợi của kít LAMP (Psp): 95% Sai số tuyệt đối cho phép của độ nhạy và độ đặc hiệu (W): 10% Tính được cỡ mẫu tối thiểu xác định độ nhạy là 72,9 và độ đặc hiệu là 24,3 Thực tế, tiến hành đánh giá trên 100 mẫu: 73 mẫu dương tính và 27 mẫu phân âm tính

- Đánh giá bộ kít tại thực địa hẹp tại thực địa: 150 mẫu/địa điểm

2.2.2.3 Các kỹ thuật được sử dụng trong nghiên cứu

- Thiết kế mồi sử dụng các phần mềm tin sinh chuyên dụng Kỹ thuật real-time PCR Xử lý thống kê bằng phần mềm MedCalc 19.4.1

2.2.2.5 Nội dung nghiên cứu

Sơ đồ thiết kế nghiên cứu chế tạo các bộ kít LAMP

2.2.2.6 Phương pháp phân tích và xử lý số liệu

Phân tích số liệu bằng các phần mềm tin sinh, phần mềm Quickcalc, phần mềm Medcalc

Tối ưu hóa các điều kiện phản ứng LAMP: Nhiệt độ, nồng độ MgSO4, thời gian phản ứng, chỉ thị màu

Tạo chứng chuẩn dương plasmid tái tổ hợp mang gen của các tác nhân

đích sán lá gan nhỏ(sản phẩm đề tài

nghiên cứu khoa học cấp quốc gia)

- Xác định ngưỡng phát hiện của bộ kít - Xác định độ nhạy, độ đặc hiệu của bộ kít

- Xác định điều kiện bảo quản, tính ổn định của kit

- Đánh giá bộ kít tại thực địa

- So sánh bộ kít với bộ mồi có mục đích tương tự - Đánh giá ngoại kiểm kít LAMP

2.2.2.7 Phương pháp kiểm soát nhiễu và sai số trong nghiên cứu

Kiểm soát quá trình phỏng vấn đối tượng nghiên cứu và quy trình xét nghiệm phân Mã hóa số liệu

2.3 Đạo đức trong nghiên cứu

Có đầy đủ hồ sơ đạo đức trong nghiên cứu; Đảm bảo cam kết nghĩa vụ và trách nhiệm của người nghiên cứu và quyền lợi của người tham gia nghiên cứu Thực hiện đúng quy trình kỹ thuật Chỉ nghiên cứu ở người tự nguyện Tất cả những người có kết quả dương tính với ký sinh trùng được hướng dẫn điều trị tại cơ sở y tế địa phương theo phác đồ quy định của Bộ Y tế

CHƯƠNG 3 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

3.1 Thực trạng và một số yếu tố liên quan nhiễm sán lá gan nhỏ trên người tại hai xã trọng điểm thuộc tỉnh Ninh Bình và Phú Yên (2018-2020)

3.1.1 Đặc điểm của đối tượng nghiên cứu

Bảng 3.1 Đặc điểm nhân khẩu học của đối tượng nghiên cứu (n=919) Chỉ số Phân loại

Xã Yên Lộc (459) (Ninh Bình)

Xã An Mỹ (460)

Phú Yên Tổng (919) SL TL (%) SL TL (%) SL TL (%)