Đang tải... (xem toàn văn)
Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.Một số đặc điểm dịch tễ, yếu tố liên quan và căn nguyên vi rút của vụ dịch COVID19 tại nhà máy POYUN, tỉnh Hải Dương, năm 2021.
GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * PHAN TÂN DÂN MỘT SỐ ĐẶCĐIỂMDỊCH TỄ,YẾUTỐLIÊNQUANVÀ CĂN NGUYÊN VI RÚT CỦA VỤ DỊCH COVID-19 TẠINHÀ MÁYPOYUN,TỈNH HẢIDƯƠNG,NĂM2021 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI - 2024 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * PHAN TÂN DÂN MỘT SỐ ĐẶCĐIỂMDỊCH TỄ,YẾUTỐLIÊNQUANVÀ CĂN NGUYÊN VI RÚT CỦA VỤ DỊCH COVID-19 TẠINHÀ MÁYPOYUN,TỈNH HẢIDƯƠNG,NĂM2021 Ngành : Dịch tễhọc Mãsố : 72 0117 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS Phạm NgọcHùng GS.TS Lê Thị QuỳnhMai HÀ NỘI - 2024 LỜI CAM ĐOAN Tơi,PhanTân Dân,Nghiêncứu sinh khóa40,ViệnVệsinh dịchtễTrung ương, chunngành Dịchtễhọc, xincamđoan: Đây cơng trình nghiên cứu thân trực tiếp thực hướng dẫn Thày, Cơ hướngdẫn; Cơng trình không trùng lặp với nghiên cứu khác cơng bố ViệtNam; Cácsốliệuvàthơngtintrongnghiêncứulàhồntồnchínhxác,trung thựcvàkháchquan,đãđượcxácnhậnvàchấpthuậncủa cáccơsởnghiêncứu Tơixinhồntồnchịutráchnhiệmtrướcphápluậtvềnhữngcamkếtnày./ Hà Nội, ngày 22 tháng 02 năm 2024 Người viết cam đoan Phan Tân Dân LỜI CẢM ƠN Để hồn thành Luận án Tiến sỹ, trước hết tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc GS.TS Lê Thị Quỳnh Mai PGS.TS Phạm Ngọc Hùng, người Thày ln tận tình bảo, giúp đỡ, cho lời khuyên quýbáutrongthờigianthựchiệnđềtàiNghiêncứusinh,đãtiếpthêmđộnglực để tiến bước đường nghiên cứu khoahọc TơixincảmơncácThày,CơvàcánbộnhânviênKhoaKiểmsốtBệnh truyền nhiễm, Khoa Vi rút, Phòng Đào tạo Sau đại học/Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương, nhóm nghiên cứu Đại học Nagasaky Việt Nam nhiệt tình giúp đỡ thời gian học tập thực nghiên cứu tạiViện Xin trân trọng biết ơn Thủ trưởng Cục Quân y, huy cán Phòng Y học dự phòng/Cục Quân y, huy, cán nhân viên Viện y học dự phòng Quân đội phía Nam/Cục Quân y tạo điều kiện thời gian để yên tâm học tập thực đề tài Tôi xin gửi lời cảm ơn tới cán bộ, công nhân Nhà máy POYUN (khu công nghiệp Cộng Hịa, thành phố Chí Linh, tỉnh Hải Dương) tham gia nghiêncứu;xincảmơncáccánbộ,nhânviênytếthuộcCDCtỉnhHảiDương, Trung tâm Y tế thành phố Chí Linh, Đại học Y Hà Nội, Đại học kỹ thuật y tế HảiDươngđãhỗtrợtơikịpthời,hiệuquảtrongqtrìnhtriểnkhainghiêncứu thực địa phịng thínghiệm Cuối cùng, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn tới bố, mẹ hai bên gia đình, biết ơn vợ, con, em trai anh chị - người ln bên cạnh, độngviên,hỗtrợvàgiúpđỡtơiđểtơintâmcơngtác,họctập,nghiêncứuvà hồn thành Luậnán! NCS Phan Tân Dân MỤC LỤC ĐẶT VẤNĐỀ Chương -TỔNGQUAN .3 1.1 Tổng quan vềbệnhCOVID-19 .3 1.1.1 Tác nhângây bệnh 1.1.2 Phương thứclây truyền .4 1.1.3 Khối cảmthụ 1.1.4 Lâmsàng 1.1.5 Điều trị vàdựphòng 1.1.6 Yếu tố liên quan đến lây nhiễm COVID-19 nơisản xuất 1.1.7 Tình hình dịch bệnh giới vàViệtNam .12 1.2 Một số đặc điểm vi rúthọcSARS-CoV-2 .21 1.2.1 Đặc điểm sinh học phân tử virút SARS-CoV-2 21 1.2.2 Tổng quan đặc điểm huyết họccủaSARS-CoV-2 29 1.3 Thông tin chung nhàmáyPOYUN 35 Chương -PHƯƠNG PHÁPNGHIÊNCỨU 38 2.1 Mô tả đặc điểm dịch tễ yếu tố liên quan tình trạng lây nhiễmCOVID-19 nhàmáyPOYUN 38 2.1.1 Thiết kếnghiêncứu 38 2.1.2 Thời gian, địa điểmnghiêncứu .38 2.1.3 Đối tượngnghiên cứu .38 2.1.4 Cỡ mẫu phương phápchọn mẫu 39 MỤC LỤC 2.1.5 Các số, biến sốnghiêncứu 41 2.1.6 Thu thậpthôngtin 46 2.1.7 Nhập phân tíchsố liệu .46 2.2 Phân tích số đặc điểm vi rút SARS-CoV-2 gâyvụdịch 48 2.2.1 Thiết kếnghiên cứu 48 2.2.2 Cỡ mẫu, phương phápchọnmẫu 48 2.2.3 Đối tượngnghiêncứu 48 2.2.4 Thời gian, địa điểmnghiêncứu 49 2.2.5 Các số, biến sốnghiêncứu 49 2.2.6 Quy trìnhnghiêncứu .50 2.2.7 Nhập phân tíchsố liệu .51 2.3 Các xét nghiệm sử dụng trongnghiên cứu 52 2.3.1 Xét nghiệm SARS-CoV-2 bằngRealtimeRT-PCR .52 2.3.2 Xét nghiệm giải trình tự gen hệmới (NGS) .53 2.3.3 Kỹ thuật ELISA phát khángthểIgG .53 2.4 Đạo đức trongnghiên cứu 55 2.4.1 Thời điểm đáp ứngchốngdịch 55 2.4.2 Thời điểm tiến hành nghiên cứu huyếtthanhhọc 55 Chương 3-KẾTQUẢNGHIÊNCỨU 57 3.1 Đặc điểm chung đối tượngnghiên cứu 57 3.2 Đặc điểm dịch tễ học vụdịchCOVID-19 .59 3.2.1 Phân bố ca bệnh theo yếu tố người, không gian,thời gian .59 MỤC LỤC 3.2.2 Một số đặc điểm lâm sàng cabệnh COVID-19 .64 3.2.3 Các yếu tố liên quan đến tăng nguy lây lanvụdịch 67 3.3 Đặc điểm vi rút SARS-CoV-2 gây vụdịch COVID-19 72 3.3.1 Một số đặc điểm sinh họcphân tử 72 3.3.2 Đáp ứng kháng thể kháng SARS-CoV-2 nhàmáyPOYUN 76 Chương 4-BÀN LUẬN 85 4.1 Một số đặc điểm dịch tễ học số yếu tố liên quan đến lâynhiễm SARS-CoV-2 vụ dịch nhàmáyPOYUN 85 4.1.1 Tỉ suất công, hệ sốlây nhiễm 85 4.1.2 Một số đặc điểmlâmsàng .89 4.1.3 Các yếu tố liên quan đến tăng nguy lây lanvụdịch 92 4.2 Đặc điểm vi rút SARS-CoV-2 gây dịch nhàmáyPOYUN 97 4.2.1 Đặc điểm sinh học phân tử vi rút gâyvụ dịch 97 4.2.2 Đặc điểm đáp ứng kháng thể IgG cơngnhânPOYUN .102 4.3 Tính số hạn chế củanghiêncứu .110 4.3.1 Tính củanghiên cứu 110 4.3.2 Một số hạn chế củanghiên cứu 113 KẾTLUẬN 116 KHUYẾNNGHỊ 118 PHỤ LỤC DANH MỤC VIẾT TẮT Chữ viết tắt Tiếng Anh ATSH Tiếng Việt An toàn sinh học ELISA Enzym-linked Immunosorbent Assay Phản ứng hấp phụ liên kết gắn enzym IHR International Health Regulation Điều lệ y tế Quốc tế ICU Intensive Care Unit Khoa điều trị tích cực MERS-CoV Middle East Respiratory Syndrom-Coronavirus Vi rút corona gây hội chứng viêmđườnghơhấpcấpTrung Đơng PHEIC Public Health Emergency International Concerns Tình trạng Y tế khẩn cấp sức khỏe cộng đồng toàn cầu RBD Receptor Binding Domand Vùng liên kết thụ cảm thể SARS-CoV Severe Acute Respiratory Syndrom-Coronavirus Vi rút corona gây hội chứng viêm đường hô hấp cấp SARS-CoV-2 Severe Acute Respiratory Syndrom-Coronavirus Virútcorona2gâybệnhviêm đường hơ hấp cấptính WHO World Health Organization Tổ chức Y tế giới USCDC The United States Center for The US Center for Disease Control and Prevention Trung tâm phịng ngừa kiểm sốt bệnh tật Hoa Kỳ VĐHHC Viêm đường hơ hấp cấp tính VOC Variants of Concern Biến thể lo ngại VOHC Variants of High Consequence Biến thể gây hậu nghiêm trọng VOI Variants of Interest Biến thể quan tâm Variants of Monitor Vệ sinh dịch tễ Trung ương Biến thể cần theo dõi VSDTTƯ VUM DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 1.1 Các protein không cấu trúc vi rút SARS-CoV-2 23 Bảng 2.1 Các số, biến số sử dụng nghiên cứu 41 Bảng 3.1 Đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 57 Bảng 3.2.Phân bố ca bệnh theo số đặc trưng mẫu nghiên cứu 59 Bảng 3.3 Một số đặc điểm lâm sàng ca bệnh COVID-19 64 Bảng 3.4 Liên quan tình trạng mắc COVID-19 với triệu 65 chứng lâm sàng (phân tích đơn biến) Bảng 3.5 Yếu tố nhân chủng học liên quan tới nguy lây nhiễm 67 SARS-CoV-2 (phân tích đơn biến) Bảng 3.6 Các yếu tố môi trường làm việc liên quan tới nguy lây 68 nhiễm SARS-CoV-2 (phân tích đơn biến) Bảng 3.7 Các yếu tố liên quan đến nguy lây nhiễm nơi sinh sống 69 đối tượng nghiên cứu (phân tích đơn biến) Bảng 3.8.Các yếu tố liên quan đến lịch sử tiếp xúc, biểu lâm sàng 70 đối tượng nghiên cứu (phân tích đơn biến) Bảng 3.9 Các yếu tố liên quan đến tăng nguy lây nhiễm SARS- 71 CoV-2 phân tích hồi quy đa biến logistic Bảng 3.10 Danh sách mẫu giải trình tự gen vi rút SARS-CoV-2 72 Bảng 3.11 Tỉ lệ đối tượng có đáp ứng kháng thể IgG lần xét nghiệm 76 thứ Bảng 3.12 Chi tiết trường hợp có đáp ứng kháng thể IgG 77 Bảng 3.13.Tỉ lệ có đáp ứng kháng thể IgG lần xét nghiệm thứ 78 Bảng 3.14 Tỉ lệ phát kháng thể IgG theo nhóm nguy nhà 79 máy POYUN Bảng 3.15.Tỉ lệ phát kháng thể IgG nhóm nguy gia 81 đình, cộng đồng Bảng 3.16.Tình trạng đáp ứng kháng thể IgG theo nhóm nguy 82 khác Bảng 3.17.Đáp ứng kháng thể IgG người mắc COVID-19 83 Bảng 3.18.Đáp ứng kháng thể IgG theo thời gian nhóm đối tượng 84 có kết Realtime RT-PCR (+) với SARS-CoV-2 Bảng 4.1.Hệ số lây nhiễm chủng Alpha (B.1.1.7) số quốc 88 gia giới Bảng 4.2 Một số chủng vi rút SARS-CoV-2 lưu hành Việt Nam tính đến tháng 3/2021 98