HỘI NGHỊ KHOA HỌC SÀNG LỌC CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH VÀ SƠ SINH KHU VỰC BẮC TRUNG BỘ - LẦN THỨ I ỨNG DỤNG XÉT NGHIỆM DI TRUYỀN CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH BS Tăng Hùng Sang Ths Sức khoẻ Bà Mẹ & Trẻ Em, Hoa Kỳ Viện di truyền y học- Genesolutions HỘI NGHỊ KHOA HỌC SÀNG LỌC CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH VÀ SƠ SINH KHU VỰC BẮC TRUNG BỘ - LẦN THỨ I Nội dung Tổng quan về chẩn đoán trước sinh Xét nghiệm gen ứng dụng kỹ thuật giải trình tự gen hệ (Next Generation Sequencing)  CNV  Diagsure/G4500/WES/WGS  Khuyến cáo chuyên môn Ca lâm sàng & nghiên cứu Viện di truyền y học Genesolution HỘI NGHỊ KHOA HỌC SÀNG LỌC CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH VÀ SƠ SINH KHU VỰC BẮC TRUNG BỘ - LẦN THỨ I NGUYÊN NHÂN BẤT THƯỜNG BẨM SINH 55% nguyên nhân bất thường di truyền 7-8% 6-7% THOMPSON & THOMPSON GENETICS IN MEDICINE 8th condition, 2016 Mục tiêu sàng lọc chẩn đốn trước sinh cung cấp thơng tin cho phụ nữ mang thai cặp vợ chồng nguy sinh bị dị tật bất thường di truyền với đầy đủ lựa chọn cách quản lý rủi ro HỘI NGHỊ KHOA HỌC SÀNG LỌC CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH VÀ SƠ SINH KHU VỰC BẮC TRUNG BỘ - LẦN THỨ I TÍNH HỮU DỤNG LÂM SÀNG CỦA CHẨN ĐỐN TRƯỚC SINH • Chấm dứt thai kỳ vs tiếp tục thai kỳ • Quản lý trước sinh chu sinh • Tư vấn nguy tái phát • Các phương án quản lý/chăm sóc sức khoẻ sinh sản ACMG CONFERENCE 2023 HỘI NGHỊ KHOA HỌC SÀNG LỌC CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH VÀ SƠ SINH KHU VỰC BẮC TRUNG BỘ - LẦN THỨ I CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH CHỈ ĐỊNH CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH BẰNG THỦ THUẬT XÂM LẤN Đứa trước bị lệch bội bất thường cấu trúc nhiễm sắc thể không di truyền từ cha mẹ (de novo) Bố mẹ có bất thường di truyền xác định Tiền gia đình có bệnh lý di trùn xác định xét nghiệm sinh hoá xét nghiệm gen Thai tăng nguy mắc dị tật xác định xét nghiệm sàng lọc huyết mẹ, siêu âm, xét nghiệm sàng lọc trước sinh không xâm lấn NIPT Phụ nữ mang thai cặp vợ chồng muốn thực hiện chẩn đốn xâm lấn (ví dụ: mẹ cao t̉i) Thompson, Margaret "Thompson and Thompson genetics in medicine 8th." CHẨN ĐỐN TRƯỚC SINH • Chọc ối: > 15 tuần • Tỷ lệ sẩy thai: 1/500 • Sinh thiết gai nhau: 11-13 tuần • Tỷ lệ sẩy thai: 1/100 HỘI NGHỊ KHOA HỌC SÀNG LỌC CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH VÀ SƠ SINH KHU VỰC BẮC TRUNG BỘ - LẦN THỨ I HƯỚNG DẪN CHUN MƠN HIỆN NAY Phân tích CMA/CNV có độ phân giải chẩn đốn gấp khoảng 100 lần so với karyotyping, giúp tăng tỷ lệ phát biến thể số lượng có ý nghĩa lâm sàng : • 6% thai nhi có dị tật cấu trúc • 1,2%–1,7% trường hợp mang thai có cấu trúc bình thường lấy mẫu để chẩn đốn thai phụ cao tuổi, sàng lọc dương tính thai phụ lo lắng Các xét nghiệm giải trình tự gen hệ (NGS) giải trình tự tồn exome (WES) giúp tăng tỷ lệ chẩn đoán khoảng 14% thai nhi có bất thường cấu trúc chẩn đốn karyotype CMA/CNV bình thường Society for Maternal-Fetal Medicine "Committee Opinion No 682: Microarrays and nextgeneration sequencing technology: the use of advanced genetic diagnostic tools in obstetrics and gynecology." Obstetrics and gynecology 128.6 (2016): e262-e268 Levy, Brynn, et al "Chromosomal microarrays and next-generation sequencing for diagnosis of fetal abnormalities." Human Reproductive and Prenatal Genetics Academic Press, 2023 767-787 QUY TRÌNH ỨNG DỤNG: GIẢI TRÌNH TỰ MƠ GAI NHAU/ ỐI/ MÔ THAI SẨY DNA gen Chuẩn bị thư viện NGS QC thư viện Giải trình tự NGS QC liệu Bất thường lệch bội NST Xác định biến thể gây bệnh Bất thường vi mất/lặp đoạn NST Đột biến điểm/indel Rehm et al ACMG clinical laboratory standards for NGS Genet Med., 2013 Roy et al Standards and guidelines for Validating NGS Bioinformatics pipelines AMG-CAP, 2018 CẤP ĐỘ BẤT THƯỜNG DI TRUYỀN NST - GEN v Bất thường số lượng NST: dư NST Bất thường cấu trúc NST Vi đoạn/ Đột biến Vi lặp đoạn điểm gen 20,000 gen >4,000 bệnh đơn gen Xét nghiệm: DNA NỘI BÀO CNV-seq Diagsure: panel gen < 100 gen G4500 WES WGS HỘI NGHỊ KHOA HỌC SÀNG LỌC CHẨN ĐOÁN TRƯỚC SINH VÀ SƠ SINH KHU VỰC BẮC TRUNG BỘ - LẦN THỨ I CNV-SEQ  Là cơng nghệ giải trình tự gen để xác định CNV (copy number variations)  CNV bao gồm bất thường số lượng NST vi đoạn, vi lập đoạn NST Các nghiên cứu cho thấy 90-95% CNV lành tính (khơng gây bệnh) có kích thước