Đang tải... (xem toàn văn)
Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna tại một số địa phương ở Việt Nam
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI – 2014 ii BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG Ở VIỆT NAM Chuyên ngành : DỊCH TỄ HỌC Mã số : 62.72.01.17 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: 1. PGS. TS. PHAN THỊ NGÀ 2. GS. TS. VŨ SINH NAM HÀ NỘI – 2014 iii LỜI CẢM ƠN Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành nhất tới Lãnh đạo Cục Y tế dự phòng, Lãnh đạo Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Khoa Đào tạo và Quản lý khoa học, và các thầy cô giáo đã tạo mọi điều kiện thuận lợi, giúp đỡ tôi trong suốt quá trình học tập và hoàn thiện Luận án. Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS. Phan Thị Ngà và GS.TS. Vũ Sinh Nam những thầy cô đã trực tiếp hướng dẫn, động viên khích lệ, tận tình giúp đỡ và định hướng cho tôi trong suốt thời gian học tập, nghiên cứu và thực hiện Luận án này. Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới GS.TS. Phạm Ngọc Đính, Phó Tổng biên tập Tạp chí Y học dự phòng đã đóng góp những ý kiến quý báu để tôi hoàn thành Luận án. Tôi xin bày tỏ lời cảm ơn chân thành tới ThS. Bùi Minh Trang, ThS. Đặng Thị Thu Thảo, cử nhân Nguyễn Thành Luân Phòng thí nghiệm Vi sinh, Khoa Đào tạo và Quản lý Khoa học; ThS. Đỗ Phương Loan, PGS. TS. Nguyễn Thị Hiền Thanh, Khoa vi rút; Cử nhân Nguyễn Thị Yên phòng thí nghiệm Côn trùng, Khoa Côn trùng và Động vật Y học; ThS. Đỗ Thiện Hải, Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Nhi Trung ương; ThS. Nguyễn Thị Tuyết, Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Đa Khoa tỉnh Bắc Giang đã giúp đỡ tôi trong quá trình thực hiện các kỹ thuật xét nghiệm cũng như hoàn thành việc điều tra, thu thập số liệu của nghiên cứu. Tôi cũng xin gửi lời cảm ơn chân thành sự hợp tác và giúp đỡ của Giáo sư Kouichi Morita, Khoa Vi rút, Viện Y học Nhiệt đới Trường đại học Nagasaki Nhật Bản trong nghiên cứu của đề tài. Tôi vô cùng biết ơn sự quan tâm, động viên và giúp đỡ của gia đình, bạn bè và các bạn đồng nghiệp trong quá trình học tập, nghiên cứu và hoàn thành bản Luận án này. Hà Nội, ngày 07 tháng 3 năm 2014 Tác giả luận án Hoàng Minh Đức iv LỜI CAM ĐOAN Được sự đồng ý của tác giả cho phép sử dụng số liệu của bài báo, của đề tài nghiên vào nội dung luận án này. Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của tôi, do chính tôi thực hiện dưới sự hướng dẫn của các thầy cô và Chủ nghiệm đề tài. Kết quả nêu trong Luận án là trung thực và chưa từng công bố trong bất kỳ một công trình nào khác. Tôi xin chịu hoàn toàn trách nhiệm về những lời cam đoan của tôi. Hà Nội, ngày 07 tháng 3 năm 2014 Tác giả luận án Hoàng Minh Đức v MỤC LỤC Nội dung Trang Trang phụ bìa ii Lời cảm ơn iii Lời cam đoan iv Mục lục v Danh mục chữ viết tắt viii Danh mục hình, bảng biểu ix ĐẶT VẤN ĐỀ 1 CHƯƠNG I – TỔNG QUAN 3 1.1 Lịch sử hội chứng não cấp 3 1.1.1 Trên thế giới 3 1.1.2 Tại Việt Nam 6 1.2 Dịch tễ học hội chứng não cấp do vi rút Banna 7 1.2.1 Ổ chứa vi rút 7 1.2.2 Véc tơ truyền vi rút Banna 7 1.2.3 Khối cảm thụ 12 1.3 Đặc điểm hình thái, cấu trúc vi rút Banna 13 1.3.1 Đặc điểm hình thái 13 1.3.2 Đặc điểm cấu trúc của vi rút Banna 15 1.3.3 Cấu trúc genome của vi rút Banna 17 1.3.4 Cấu trúc và chức năng các protein của vi rút Banna 17 1.3.5 Phân loại và nguồn gốc vi rút Banna 19 1.3.6 Sự sao chép của vi rút 21 1.4 Đặc điểm hội chứng não cấp ở người do vi rút Banna 22 1.4.1 Sinh bệnh học 22 1.4.2 Đặc điểm lâm sàng 23 vi Nội dung Trang 1.4.3 Đáp ứng miễn dịch 24 1.4.4 Điều trị và dự phòng bệnh 24 1.5 Các phương pháp chẩn đoán phòng thí nghiệm 25 1.5.1 Phương pháp phát hiện nhanh vi rút 25 1.5.2 Phương pháp phân lập vi rút 26 1.5.3 Phương pháp chẩn đoán huyết thanh học 27 CHƯƠNG II - ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 31 2.1. Thời gian và địa điểm nghiên cứu 31 2.2. Đối tượng nghiên cứu 31 2.3. Phương pháp nghiên cứu 33 2.3.1. Thiết kế nghiên cứu 33 2.3.2. Điều tra xác định các đặc điểm dịch tễ học bệnh nhân HCNC 33 2.4 Vật liệu và kỹ thuật xét nghiệm trong phòng thí nghiệm 35 2.4.1 Phương pháp xét nghiệm kháng thể bằng kỹ thuật miễn dịch enzyme gián tiếp phát hiện IgM kháng vi rút Banna – IgM INDIRECT ELISA 35 2.4.2 Phương pháp phân lập vi rút 37 2.5 Thống kê toán học và một số phần mềm tin sinh học sử dụng trong phân tích về đặc điểm phân tử của các chủng vi rút Banna 50 2.5.1 Thống kê toán học 50 2.5.2 Sử dụng các phần mềm tin sinh học 50 2.6 Chấp thuận về đạo đức trong nghiên cứu y sinh 51 2.7 Hạn chế khi thiết kế nghiên cứu 52 CHƯƠNG III – KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 53 3.1 Mô tả một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng của bệnh nhân hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna ở một số địa phương củaViệt Nam, 2002-2012 53 vii Nội dung Trang 3.1.1 Mô tả tỷ lệ số mắc của bệnh nhân hội chứng não cấp do vi rút Banna 53 3.1.2 Đặc điểm lâm sàng của bệnh nhân hội chứng não cấp do vi rút Banna 58 3.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna trong quần thể muỗi thu thập ở một số địa phương ở Việt Nam 64 3.2.1 Kết quả thu thập muỗi trong các năm 2001-2011 64 3.2.2 Kết quả phân lập vi rút Banna từ các mẫu muỗi thu thập 68 3.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử của vi rút Banna phân lập được ở Việt Nam 75 3.3.1 Phân bố vi rút Banna ở Việt Nam 75 3.3.2 Đặc điểm dịch tễ học vi rút Banna ở Việt Nam 77 3.3.3 Kết quả giải trình tự nucleotide của vùng gen mã hóa số 12 82 3.3.4 Đặc điểm các acid amin thay thế của vùng gen mã hóa số 12 84 CHƯƠNG IV – BÀN LUẬN 86 4.1 Mô tả một số đặc điểm dịch tễ, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna ở một số địa phương của Việt Nam, 2002 - 2012 86 4.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna trong quần thể muỗi thu thập ở một số địa phương ở Việt Nam 97 4.3 Xác định một số đặc điểm sinh học phân tử của vi rút Banna phân lập được ở Việt Nam 102 KẾT LUẬN 108 KIẾN NGHỊ 111 DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ 112 TÀI LIỆU THAM KHẢO 114 PHỤ LỤC 129 viii DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT BAV Banna vi rút BAV-Ch Banna vi rút Trung Quốc BAV-In Banna vi rút Indonesia CTFV Colorado tick fever virus DENV Dengue virus (Vi rút sốt xuất huyết) dsRNA Double-stranded RNA EEE Eastern equine encephalitis virus (Viêm não ngựa miền Đông) EYAV Eyach virus GenBank Ngân hàng gen GenBank Database Dữ liệu ngân hàng gen HCNC Hội chứng não cấp HIV Human Immuno deficiencyVirus (Vi rút gây suy giảm miễn dịch ở người) KDV Kadipiro virus LAC La Crosse encephalitis (Viêm não La Crosse) MAC-ELISA IgM antibody capture – enzyme linked immunosorbent assay (Kỹ thuật miễn dịch gắn enzyme phát hiện kháng thể IgM) Motif Một đoạn trình tự giống nhau, lặp lại NCR Non-coding regions (Vùng không mã hóa) NLRV Nilaparvata lugens reovirus POW Powassan (Viêm não Powassan) RT-PCR Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (Phản ứng chuỗi khuếch đại gen phiên mã ngược) RRSV Rice ragged stunt vi rút RNA Ribonucleic acid SLE Saint Louis encephalitis (Viêm não St. Louis) SDS-PAGE Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis VNNB Viêm não Nhật Bản VIB Virus Inclusion Body (Thể vùi của vi rút) VP Viral Protein (Protein của vi rút) WEE Western equine encephalomyelitis virus (Viêm não ngựa miền Tây) ix DANH MỤC ẢNH, HÌNH VÀ BẢNG DANH MỤC ẢNH Ảnh Tên ảnh Trang 1.1 Tế bào bình thường và tế bào gây nhiễm vi rút Banna 27 DANH MỤC HÌNH Hình Tên hình Trang 1.1 Phân bổ địa lý của vi rút Banna ở Trung Quốc 5 1.2 Hình thái nhân và vi rút Banna của Chủng BAV-Ch 13 1.3 Vi rút Banna có ký hiệu 02VN9b được phân lập từ Cx vishnui ở Hà Tây 14 1.4 Vi rút Banna có ký hiệu 02VN18b được phân lập từ Cx vishnui ở Quảng Bình 15 1.5 Sơ đồ tiến hóa của họ Reoviridae 21 1.6 Sơ đồ quá trình sao chép của vi rút Banna 22 2.1 Quy trình xây dựng cây di truyền phả hệ các chủng vi rút Banna 51 3.1 Sự phân bố theo tháng các trường hợp hội chứng não cấp xác định do vi rút Banna, 2002-2012 55 3.2 Tỷ lệ số mắc hội chứng não cấp do vi rút Banna phân bổ theo giới 57 3.3 Phân bố các chủng vi rút Banna phân lập ở Việt Nam 2002-2007 76 3.4 Kết quả khuếch đại một phần vùng gen số 12 của các chủng vi rút Banna phân lập từ bệnh nhân, muỗi, lợn 78 3.5 Cây di truyền phả hệ mô tả mối quan hệ giữa các chủng vi rút Banna của Việt Nam với một số chủng vi rút Banna từ một số nước châu Á dựa trên trình tự nucleotide toàn bộ vùng gen mã hóa phân đoạn số 12 81 4.1 Tình hình hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút và sự thay đổi về tỷ lệ xác định VNNB tại Bệnh viện Nhi Trung ương, 1995-2011 90 x DANH MỤC BẢNG Bảng Tên bảng Trang 1.1 Độ dài của các phân đoạn dsRNA 1-12, protein được mã hóa và 5’NCR và 3’NCR của BAV 17 2.1 Danh sách trình tự nucleotide toàn bộ vùng gen mã hóa của phân đoạn số 12 của các chủng vi rút Banna sử dụng trong nghiên cứu 44 3.1 Kết quả loại trừ căn nguyên vi rút VNNB và vi rút ECHO 30 trong số các trường hợp HCNC nghi ngờ do vi rút, 2002 – 2012 53 3.2 Kết quả xác định IgM kháng vi rút Banna trong dịch não tủy bênh nhân hội chứng não cấp, 2002-2012 54 3.3 Tỷ lệ xác định theo tuổi hội chứng não cấp do vi rút Banna, 2002- 2012 56 3.4 Tỷ lệ số mắc hội chứng não cấp do vi rút Banna theo nhóm tuổi, 2002-2012 57 3.5 Thông tin chung về bệnh nhân hội chứng não cấp do vi rút Banna 58 3.6 Một số thông tin chung của hội chứng não cấp do vi rút Banna, khi so sánh với hội chứng não cấp do ECHO30 và VNNB ở trẻ em tại một số bệnh viện 59 3.7 Một số dấu hiệu, triệu chứng lâm sàng ở bệnh nhân khi nhập viện 60 3.8 Các dấu hiệu, triệu chứng lâm sàng sau 7 ngày điều trị bệnh nhân nhiễm vi rút Banna so sánh với nhiễm ECHO30 và VNNB 62 3.9 Số ngày điều trị hội chứng não cấp do vi rút trung bình tại bệnh viện 63 3.10 Kết quả sau điều trị nhiễm vi rút Banna 64 3.11 Kết quả thu thâp muỗi ở 5 tỉnh thành miền Bắc, 2001-2011 64 3.12 Kết quả thu thập muỗi ở Quảng Bình, miền Trung, 2001-2011 66 [...]... của vi rút Banna là rất cần thiết Đ góp phần vào vi c giám sát, chẩn đoán, điều trị và dự phòng HCNC nghi ngờ do vi rút Banna gây ra, nghi n cứu đề tài Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna tại một số địa phương ở Vi t Nam được thực hiện với ba mục tiêu cụ th như sau: 1 Mô tả một số đặc đi m dịch tễ học, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna ở một số địa. .. (ORF) số 12 của vi rút Banna ở Vi t Nam có ký hiệu 03VN99 so với chủng vi rút Banna ở Trung Quốc có mã số ngân hàng gen AF052030 84 1 ĐẶT VẤN ĐỀ Hội chứng não cấp (HCNC) do rất nhiều nguyên nhân khác nhau trong đó vi rút là một trong những nguyên nhân chủ yếu gây HCNC bao gồm các nhóm vi rút lây truyền trực tiếp như vi rút Nipah, vi rút đường ruột , nhóm vi rút do côn trùng truyền như vi rút vi m não. .. tễ học, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna ở một số địa phương của Vi t Nam, 2002 – 2012 2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna trong quần th muỗi thu thập ở một số địa phương Vi t Nam 3 Xác định một số đặc đi m sinh học phân tử của vi rút Banna phân lập được ở Vi t Nam 3 Chương I TỔNG QUAN LỊCH SỬ HỘI CHỨNG NÃO CẤP 1.1 1.1.1 Trên thế giới Trên thế giới, HCNC có tỷ lệ mắc cao, th n ch... vùng gen mã hóa số 12 của một số chủng vi rút Banna phân lập từ muỗi, lợn ở Vi t Nam, 2002-2005 79 3.26 Thông tin về số đăng ký trình tự nucletide vùng gen số 12 của 5 chủng vi rút Banna trong ngân hàng gen quốc tế 80 3.27 Trình tự nucleotide vùng gen mã hóa phân đoạn số 12 vi rút Banna phân lập từ bệnh nhân ở Vi t Nam với chủng vi rút Banna phân lập từ Trung Quốc 83 3.28 Phân tích đặc điểm các axit... 1.2 DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP DO VI RÚT BANNA 1.2.1 Ổ chứa vi rút t s n hiên cứ t i trên thế iới ch th ỗi, có ằn chứn rõ r n n ôi ( ợn) ằn ts s Vi t N i chi ết h n ic s ềs i rút N ic c hát tán i rút s n các h h nh c i rút Banna tồn i rút B nn tr n t i r , i rút B nn có thể tồn t i nhữn i chi n t iề iện ch c hác [21],[71],[72] 1.2.2 Véc tơ truyền vi rút Banna i ới i rút B nn , éc tơ tr ền i rút. .. ở 4 tỉnh Tây Nguyên, 2004-2011 66 3.14 Kết quả thu thập muỗi ở hai tỉnh miền Nam, 2005-2007 67 3.15 Các chủng vi rút Banna phân lập được ở miền Bắc 68 3.16 Các chủng vi rút Banna phân lập được ở miền Trung 69 3.17 Các chủng vi rút Banna phân lập được ở Tây Nguyên 70 3.18 Các chủng vi rút Banna phân lập được ở miền Nam 70 3.19 Tỷ lệ phân lập được vi rút Banna từ muỗi 71 3.20 Thông tin các chủng vi rút. .. tin các chủng vi rút Banna phân lập được ở miền Bắc 72 3.21 Thông tin các chủng vi rút Banna phân lập được ở miền Trung 73 3.22 Thông tin các chủng vi rút Banna phân lập được ở Tây Nguyên 73 3.23 Thông tin các chủng vi rút Banna phân lập được ở miền Nam 74 3.24 Thông tin về 5 chủng vi rút Banna phân lập từ người và muỗi ở Vi t Nam sử dụng trong nghi n cứu phân tích vùng gen mã hóa số 12 77 3.25 So sánh... tố tiếp xúc trực tiếp với vi rút [3],[31],[43],[49],[57],[65],[89],[97] Hiện nay đã xác định được khoảng 100 loại vi rút khác nhau gây HCNC, trong số này vi rút Banna là tác nhân vi rút mới phát hiện được cho là nguyên nhân gây HCNC ở một số nước châu Á như Vi t Nam, Trung Quốc [26],[27],[29],[32],[33],[72],[74],[ 99] Vi rút Banna thuộc chi Seadornavirus, họ Reoviridae, là vi rút có vật liệu di truyền... năm 2005 2 Nghi n cứu hồi cứu xác định vi rút Banna đã được phân lập từ muỗi Culex tại hai t nh Hà Tây (nay thuộc Hà Nội) và t nh Quảng B nh năm 2002 [19],[21],[83] Vi c ghi nhận vi rút Banna được phát hiện trên muỗi Culex đồng thời c ng là loại véc tơ truyền bệnh vi m não Nhật Bản ở Vi t Nam cho thấy vi c nghi n cứu sâu về một số đặc đi m lâm sàng, dịch tễ sinh học phân tử, huyết thanh học và véc... Bản (VNNB), vi rút vi m não Nga xuân hạ, vi rút vi m não ngựa miền Đông và nhóm vi rút tiềm ẩn là một số type vi rút Herpes simplex [6],[12],[17] [29],[66],[94] HCNC do vi rút không có thuốc điều trị đặc hiệu (trừ vi rút Herpes simplex), nên bệnh thường có tỷ lệ tử vong cao và di chứng thần kinh nặng nề Biện pháp phòng chống có hiệu quả hiện nay là sử dụng vắc xin hoặc cắt đường truyền dịch tễ như diệt . TẠO BỘ Y TẾ VI N VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG * HOÀNG MINH ĐỨC MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG Ở VI T NAM LUẬN. MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG Ở VI T NAM Chuyên ngành : DỊCH TỄ HỌC Mã số : 62.72.01.17 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người. – KẾT QUẢ NGHI N CỨU 53 3.1 Mô tả một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng của bệnh nhân hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna ở một số địa phương củaViệt Nam, 2002-2012 53 vii Nội