           Dendrobium T      H           2007                Dendrobium T      H         2007   TS.    CN.        iii           : -  -                      -            : -  - TS.  -             ,                      .         TP. HCM             ,  Nai      .     , ,          .          iv    ,      .   , 9/2007.     Dendrobium                        : TS.   , TS. , CN.     .       :            ,          .         ,     ,          Dendrobium. Dendrobium     ,  ,   . ,                  Dendrobium,    ,     ,       .                            h cao.     ,              .     ,          10   Dendrobium     c Version 2.1 Winboot.                              . 6    : OPAC10, OPAH13, 0PB01, OPB08, S1384, U693                    .     , x        10    Dendrobium.                  ,   h 5 0.39  0.79. v SUMMARY Genetic diversity analysis of wild Dendrobium stem at Ho Chi Minh city and Nam Cat Tien forest by RAPD Supervisor: Tran Thi Dung 1 , PhD; Vo Thai Dan 2 , PhD; Luu Phuc Loi 1 , BSc Student: Truong Minh Dung 1 1 Department of Biotechnology, Nong Lam university, Ho Chi Minh city 2 Faculty of Agriculture, Nong Lam university, Ho Chi Minh city To analysis the genetic diversity of wild Dendrobium orchid, six decamers were used for 10 wild Dendrobium species, collected from Ho Chi Minh city and Nam Cat Tien forest (Dong Nai province). Collecting 10 species from Ho Chi Minh city and Nam Cat Tien forest (Dong Nai province), optimizing of protocols for DNA extraction and purification, constructing of protocol for RAPD, analyzing the genetic of 10 wild Dendrobium species by RAPD and constructing the dendrogram by NTSYSpc 2.1 software, Winboot program are the objective of the study. Methods - To identify 10 wild Dendrobium species with genotype. - Extraction of total DNA from fresh tissue of 10 wild Dendrobium species. - Six random primer: OPAC10, OPAH13, OPB01, OPB08, S1384, U693 were used to analysis of genetic diversity. - Following RAPD reactions, dendrogram were constructed by NTSYSpc 2.1 and Winboot program. Conclusion Six decamers are enough to compare the identity of all samples. We could use those primers to establish the methodology to perform genetic comparisons in Vietnam. Besides, the genetic diversity among 10 wild Dendrobium species were established to support the breeder overcome difficulties in plant salection. vi   Trang       iii   iv SUMMARY v  vi          ix        x         x        xi 1.      1 1.1.  2 1.2.    ung     2 2.        3 Dendrobium 3  3 Dendrobium 5  6   8  11  11  14  14 2.3.2.2. Primer 14 2.3.2.3. dNTP 16 2.3.2.4. MgCl2 17 2.3.2.5. Taq 17 vii 2.3.5.6. Buffer 17    18  18  18  18  19   19 2.5.            Winboot 26 2.5.1. NTSYSpc version 2.1 26 2.5.2. Winboot 28 2.6 29 2.6.1.  29 2.6.2. nh h 31 3.              32  32  32 3.1.2  32  32 Dendrobium  32 3.2.2. T-  34  34  36  36  36 -  45 4.1.         Dendrobium                          45 viii 4.2.                          48 4.3.                 53 4.4.         10   Dendrobium d  54 4.5.         10   Dendrobium b 2.1 Winboot 60   -  69 5.1.    69 5.2.   70  71  ix               AFLP: Amplified Fragment Length Polymorphism bp: base pair CTAB: Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide DNA: Deoxyribonucleic acid dNTP: Deoxyribonucleotide triphosphate EB: extraction buffer EDTA: Ethylene Diamine Tetra acetic Acid mM: milimolar (milimol/lite) NCT:    OD: Optical density PCR: Polymerase Chain Reaction pmol: Picomol RAPD: Random Amplified Polymorphic DNA RFLP: Restriction Fragment Length Polymorphism RNA: Ribonucleic acid Rnase: Ribonuclease SSR: Simple Sequence Repeat Ta : Annealing t TAE: Tris  Acetate  EDTA TE: Tris  EDTA  TP. HCM:   UPGMA: Unweighted Pair Group Method with Arithmetic VNTR: variable number tandem repeat x         Trang  11  34   37  40  42  42 4.1.               Dendrobium 46 4.2.              Dendrobium 47 B       50 4.4.   (ng/)  51  53  53  55 Dendrobium thu      62            Trang  3 qu 50  51 [...]... phố Hồ Chí Minh 54 Hình 4.6 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer OPAC10 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Thành phố Hồ Chí Minh 55 Hình 4.7 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer OPAC10 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Nam Cát Tiên 56 Hình 4.8 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer OPAH13 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Thành phố Hồ Chí Minh. .. phẩm RAPD với primer OPB08 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Thành phố Hồ Chí Minh 58 Hình 4.13 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer OPB08 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Nam Cát Tiên 59 Hình 4.14 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer S1384 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Thành phố Hồ Chí Minh 59 Hình 4.15 Ảnh điện di sản phẩm RAPD. .. Taq polymerase 2.4 Đa dạng di truyền – một số phƣơng pháp nghiên cứu đa dạng di truyền 2.4.1 Đa dạng di truyền Đa dạng di truyền là tập hợp tất cả các gen khác nhau của tất cả các cá thể thực vật, động vật, nấm, và vi sinh vật Đa dạng di truyền tồn tại trong một loài và giữa các loài khác nhau Đa dạng di truyền là sự đa dạng về thành phần gen giữa các cá thể trong cùng một loài và giữa các loài... các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Nam Cát Tiên 60 Hình 4.16 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer U693 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Thành phố Hồ Chí Minh 60 Hình 4.17 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer U693 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Nam Cát Tiên 61 Hình 4.18 Sơ đồ phân nhóm di truyề n dựa trên kết quả RAPD đối với nhóm lan. .. Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer OPAH13 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Nam Cát Tiên 57 Hình 4.10 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer OPB01 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Thành phố Hồ Chí Minh 57 Hình 4.11 Ảnh điện di sản phẩm RAPD với primer OPB01 đối với các giống lan rừng Dendrobium thu thập tại Nam Cát Tiên 58 xi Hình 4.12 Ảnh điện di sản... chúng tôi đa tiế n hành nghiên cƣ́u và thƣ̣c hiê ̣n đề tài : Đa nh giá đa dạng di truyền của giống lan rừng Dendrobium thu thập ta ̣i Thành ph ố Hồ Chí Minh và rƣ̀ng Nam Cát Tiên bằ ng kỹ thu ̣t RAPD Kế t quả của đề tài này tạo cơ sở cho việc xây dựng thƣơng hiệu cho cây lan Việt Nam nói chung và cây lan Thành phố Hồ Chí Minh nói riêng 1.2 Mục tiêu – nô ̣i dung – yêu cầu đề tài Mục... yêu cầu đề tài Mục tiêu Xây dựng phƣơng pháp nghiên cứu tối ƣu nhằm phân tích sự đa dạng di truyền của giống lan rừng Dendrobium, thu thập tƣ̀ Thành phố Hồ Chí Minh và rƣ̀ng Nam Cát Tiên Nô ̣i dung - Điề u tra và thu thâ ̣p các giố ng lan rƣ̀ng Dendrobium tƣ̀ Thành phố Hồ Chí Minh và rƣ̀ng Nam Cát Tiên dƣ̣a trên đă ̣c điể m hinh thái ̀ - Tố i ƣu phƣơng pháp ly trích DNA tổ... Xây dựng đƣợc qui trình PCR – RAPD ổn định, cho tính đa hình cao - Đánh giá sự khác biệt di truyền giữa các giống lan rừng Dendrobium qua việc phân tích RAPD với primer ngẫu nhiên - Mô tả quan hệ di truyền của các giống lan rừng Dendrobium bằng phần mềm NTSYS và Winboot 3 Chƣơng 2 TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Giới thiệu tổng quan về giống lan rừng Dendrobium Dendrobium thu c tông Epidendreae, họ phụ... ng lan rƣ̀ng Dendrobium vẫn chƣa đƣơ ̣c khai thác triê ̣t để Vì vậy , trƣớc hết chúng ta cần phải tiến hành khảo sát tính đa dạng di truyền các giống lan rƣ̀ng Dendrobium giƣ̃a các địa phƣơng, trên cơ sở đó thực hiện có hiệu quả việc nhân và tạo giống mới, đồng thời xây dựng các định hƣớng về kiểm tra, quản lý và bảo vệ nguồn gen giống lan Dendrobium trong nƣớc Để nghiên cứu đa dạng di truyền, ... nhau; là sự đa dạng về gen có thể di truyền đƣợc trong một quần thể hoặc giữa các quần thể Qua đó, sự đa dạng của các biến dị có thể di truyền trong một loài, một quần xã hoặc giữa các loài, các quần xã đƣợc biểu hiện Xét cho cùng, đa dạng di truyền chính là sự biến dị của sự tổ hợp trình tự của bốn cặp bazơ cơ bản, thành phần của axit nucleic, tạo thành mã di truyền Đa dạng di truyền giúp . v SUMMARY Genetic diversity analysis of wild Dendrobium stem at Ho Chi Minh city and Nam Cat Tien forest by RAPD Supervisor: Tran Thi Dung 1 ,. the genetic diversity of wild Dendrobium orchid, six decamers were used for 10 wild Dendrobium species, collected from Ho Chi Minh city and Nam Cat Tien