... nhận genmãhóa cho protein màng (M) Giải trìnhtựgen tiến hành phân tích số liệu, so sánh tương đồng nucleotide amino acid để đánh giá đa dạng di truyền chủng PRRS Việt Nam giới dựa trìnhtựgen ... acid tương ứng đoạn gen quy địnhmãhóa Kết so sánh trìnhtự amino acid trình bày hình 3.8 cho thấy: - Chuỗi gen M chủng nghiên cứu có độ dài 174 amino acid giống độ dài trìnhtự polypeptide chủng ... [25] Bộ gen PRRSV dài khoảng 15 kb bao gồm tám (ORF) bao gồm ORF1a, 1b, 2,3,4,5,6, -7 , ORF 1a ORF 1b genmãhóa RNA polymerase, GP 2-3-4 genmãhóaprotein chức năng, GP5 (hay E) glycoprotein...
... sánh trìnhtựgen thu đợc Các bớc tiến hành nh sau: + So sánh trìnhtựgen đợc đọc từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xácđịnhtrìnhtự đầy đủ gen + Xácđịnh đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trìnhtự ... đình đầy đủ trìnhtự đoạn gen Muốn tiến hành subclone trớc hết phải xácđịnhtrìnhtự chiều trìnhtự gen, sau xácđịnh vị trí cắt enzym giới hạn Chọn vị trí cắt enzym giới hạn gen PCS phải khác ... phẩm tich plasmit gel agarose 1% 2.2.8 Phơng pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotit Gen NIb đợc xácđịnhtrìnhtự máy đọc tự động ABI PRIMđ 3100 Avant Genetic Analyzer b»ng c¸ch sư dơng bé ho¸ chÊt sinh...
... khác theo trìnhtự amino acid proteinmà chúng mãhóa Năm 1996, Estruch cs phát genmãhóaprotein Vip3A Vip3B, sinh tổng hợp tế bào sinh dưỡng Crick More cs xây dựng khóa phân loại genmãhóa độc ... Nhóm gen cryI: mãhóaprotein gây độc cho trùng Cánh vảy Nhóm gen cryII: mãhóaprotein gây độc cho trùng Hai cánh, Cánh vảy Nhóm gen cryIII: mãhóaprotein gây độc cho trùng Cánh cứng Các gen ... 1981, genmãhóaprotein tinh thể diệt sâu tách dòng đọc trìnhtựTừ đó, số lượng genmãhóaprotein tinh thể Bt tách dòng nghiên cứu đặc tính khơng ngừng tăng lên Những gen chủ yếu thuộc họ gen...
... chế tác động protein độc tố tinh thể 14 1.4 Genmãhóaprotein độc tố tinh thể 16 1.4.1 Vị trí genmãhóa độc tố vi khuẩn Bacillus thuringiensis 17 1.4.2 Phân nhóm genmãhóa độc tố ... đại gen cry1C chủng Bacillus thuringiensis subsp aizawai phương pháp PCR 43 3.2 Tách dòng đọc trìnhtựgen cry1C .44 3.2.1 Tách dòng gen cry1C 44 3.2.2 Xácđịnhtrìnhtự ... để khuếch đại gen cry1C 31 2.3.7 Phương pháp tách dòng gen cry1C 31 2.3.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng 34 2.4 Địa điểm nghiên cứu 35 Chƣơng...
... thu đoạn gen OsHKT2,1 Các bước thiết kế mồi tiến hành sau: Tìm trìnhtựgentrìnhtự CDS gen OsHKT2,1 từ ngân hàng gen lúa 33 So sánh trìnhtự tương đồng gen với trìnhtự CDS Xácđịnh vị ... 40 Hình 16 So sánh trìnhtự vùng mãhóagen giống lúa 41 Hình 17 So sánh trìnhtự vùng khơng mãhóagen giống lúa Trìnhtự nucleotide intron giống so sánh với trìnhtự liệu gen lúa thấy có độ ... nghiên cứu Nhân gen OsHKT2,1 mãhóa cho protein vận chuyển ion số giống lúa Xácđịnhtrìnhtựgen OsHKT 2,1ở số giống lúa So sánh trìnhtự nucleotide gen OsHKT2,1 trìnhtự acid amin suy diễn...
... tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trìnhtrìnhtự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... giải trìnhtự sản phẩm HPV-16 HPV-18 từ mẫu kiểm tra 53 3.1.4 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen E6 HPV-16 chuỗi gen L1 HPV-18 54 3.1.5 Kết truy cập Ngân hàng genxácđịnh chuỗi ... giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phản ứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen...
... PCR tinh giải trìnhtự MACROGEN Phân tích trìnhtựgen chương trình Seqman DNASTAR Kiểm tra trìnhtự chương trình ClustalX (Thompson et al, 1997) Nhận dạng trìnhtự tính tốn chương trình BioEdit ... rút vàng xoăn Trìnhtự đoạn gen CP giải mãtừ sản phẩm PCR TYLCV mẫu cà chua thu huyện Đơn Dương tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trìnhtự phiên mã xi /ngược gen CP vi vi rút ... chương trình BLAST (bảng 4) trìnhtự hai đoạn trìnhtự xi ngược vi rút gây bệnh vàng xoăn thu vùng Eakar, tỉnh Đắk Lắk cho thấy có độ đồng cao (99%) Tuy nhiên kết phân tích proteinmãhóa (bảng...
... cứu 3.2 NHÂN GEN PPO Ở CÁC MẪU CHÈ NGHIÊN CỨU Genmãhóa PPO cho có trìnhtựmãhóa có kích thước 1,8 kb Trìnhtựgenmãhóa PPO phân lập từ mRNA genome chè công bố Genbank với mã số DQ513313, ... Tổng thể tích 10 2.2.6 Phƣơng pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotide Trìnhtự nucleotide gen PPO xácđịnh máy đọc trìnhtự nucleotide tự động ABI PRISM@ 3100 Advant Genetic Analyzer hãng Ampplied Biosystem ... oxidase Số hóa Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/ 3 - Nhân, tách dòng xácđịnhtrìnhtựgenmãhóa polyphenol oxidase giống chè Trung Du, Keo Am Tích, LDP1 - So sánh trìnhtựgenmãhóa polyphenol...
... Hình 18 So sánh trìnhtự DNA với trìnhtựprotein nhóm Nhóm gồm trìnhtự chủng LPH209 với trìnhtựprotein dài gồm 413 axit amin Trìnhtựprotein chủng sai khác với trìnhtựprotein Thite_72629 ... QUẢ TRÌNHTỰ 3.6.1 Xácđịnhtrìnhtựprotein 19 chủng nấm mốc chịu nhiệt Thielavia spp Để đánh giá đa dạng gen Thite_72629 mãhóa cho endo-1,4-β-glucanase cách xác hơn, chúng tơi tiến hành xácđịnh ... Bùi Ngọc Anh Khóa luận tốt nghiệp vực gen, nhiều genmãhóa cho cellulase nhân dòng giải trìnhtự DNA Một số genmãhóa cho cellulase có trìnhtự khác biệt chứng tỏ đa dạng cellulase tự nhiên Các...
... chọn dòng xácđịnhtrìnhtựgen IFS1 giống đậu tương nghiên cứu - So sánh trìnhtựgen IFS1 phân lập giống đậu tương nghiên cứu với trìnhtự cơng bố ngân hàng GenBank - So sánh trìnhtự amino ... Phƣơng pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotide Các mẫu plasmid mang gen quan tâm có kích thước phù hợp với lý thuyết sử dụng để giải trìnhtự máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM® 3100-Avant Genetic ... mang gen IFS1 đạt kết tốt, đảm bảo chất lượng số lượng để tiến hành đọc trìnhtự nucleotide gen IFS1 3.4 KẾT QUẢ GIẢI TRÌNHTỰGENTrìnhtự nucleotide gen IFS1 tách dòng đọc thiết bị giải trình tự...
... Plasmid (1 µg) Enzyme (1 Ul) 0.2 H2O Ðến 20 2.2.7 XácđịnhtrìnhtựgenTrìnhtựgenxácđịnh máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer kết hợp với sử dụng kit BigDye Terminator ... Chúng tơi xácđịnhtrìnhtựgen FLS gắn với vector pJET 1.2 Sau phân tích trình tự, khẳng định chắn đoạn cDNA 35 phân lập trìnhtự ORF hồn chỉnh mãhóa FLS Gen có kích thước 996 bp, mãhóa 331 ... khẳng định dòng plasmid có gắn gen FLS Để khẳng định chắn đoạn chèn có phải gen FLS hay khơng, chúng tơi tiếp tục tinh dòng plasmid để giải trìnhtự 3.4 Xácđịnh phân tích trìnhtựgenmãhóa Flavonol...
... tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trìnhtrìnhtự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... giải trìnhtự sản phẩm HPV-16 HPV-18 từ mẫu kiểm tra 53 3.1.4 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen E6 HPV-16 chuỗi gen L1 HPV-18 54 3.1.5 Kết truy cập Ngân hàng genxácđịnh chuỗi ... giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phản ứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen...
... pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotit đoạn gen tách dòng Tiến hành xácđịnhtrìnhtự theo phương pháp Sanger cộng sự, dựa vào tổng hợp mạch bổ sung cho mạch đơn DNA cần xácđịnh Dưới xúc tác enzyme ... Trong protein nhiều thành phần này, protein thành phần mãhoágen Tiểu phần B mãhoágen hblA gen hblC hblD mã hố cho tiểu phần L1, L2 Các gen nằm operon Hoạt tính độc tố mạnh có đầy đủ protein ... cereus Gen gyrB mãhóa tiểu phần protein B ADN gyrase (topoisomerase type II), gen điều khiển siêu xoắn sợi ADN Gen có vai trò quan trọng q trình nhân ADN Do vậy, người ta tách dòng giải trìnhtự gen...
... Giải trìnhtựgen 16S rDNA chủng xoắn khuẩn Giải trìnhtự với máy giải trìnhtự AB 3500 (Applied Biosystems, USA) Viện Nghiên cứu hệ gen Quy trình tóm tắt sau: Các sản phẩm PCR giải trìnhtự theo ... rDNA vùng mãhóa RNA ribosome xácđịnh đoạn gen bảo tồn tất tế bào Trìnhtự đoạn gen sinh vật có khoảng cách di truyền xa tìm thấy có giống Tuy nhiên, vùng linh hoạt, thay đổi trìnhtự nucleotide ... Đề nghị Cần tiếp tục nghiên cứu: - Giải trìnhtựgenđịnh kháng nguyên tiềm (gen LigA, LigB, gen OmpL1, gen LipL32, gen LipL41 gen LipL21) - Phân tích protein tái tổ hợp tiềm để tạo sở cho việc...
... Giải trìnhtựgen 16S rDNA chủng xoắn khuẩn Giải trìnhtự với máy giải trìnhtự AB 3500 (Applied Biosystems, USA) Viện Nghiên cứu hệ gen Quy trình tóm tắt sau: Các sản phẩm PCR giải trìnhtự theo ... rDNA vùng mãhóa RNA ribosome xácđịnh đoạn gen bảo tồn tất tế bào Trìnhtự đoạn gen sinh vật có khoảng cách di truyền xa tìm thấy có giống Tuy nhiên, vùng linh hoạt, thay đổi trìnhtự nucleotide ... Đề nghị Cần tiếp tục nghiên cứu: - Giải trìnhtựgenđịnh kháng nguyên tiềm (gen LigA, LigB, gen OmpL1, gen LipL32, gen LipL41 gen LipL21) - Phân tích protein tái tổ hợp tiềm để tạo sở cho việc...
... giải trìnhtựtrình bày phần phương pháp nghiên cứu Quá trình giải trìnhtự thực máy giải trìnhtựtự động ABI 3100 Sau giải trìnhtựgenmãhóa kháng ngun HA virus H5N1, trìnhtự phân tích genmã ... đoạn genmãhóa kháng nguyên HA Để khẳng địnhxác chúng tơi tiến hành giải trìnhtựgen 3.4 Kết tinh plasmit tái tổ hợp Dòng plasmit tái tổ hợp cần tinh trước làm phản ứng xácđịnhtrìnhtự Để ... [16] 14 Các genmãhóa cho protein chức chúng sau: - Phân đoạn 1: Là genmãhóa cho protein PB2 với kích thước 2341bp có vai trò q trình mã: gắn mũ - Phân đoạn 2: Liên quan đến q trình mã: kéo dài,...
... hợp enzyme cắt giới hạn Nội dung 3: Xácđịnhtrìnhtự gene gltA tách dòng - Giải trìnhtự gene gltA tách dòng máy giải trìnhtựtự động Applied Biosystems - So sánh thành phần thiết yếu trìnhtự ... trìnhtự gene gltA giải trìnhtự với thiết kế in silico - Phân tích kết dịch mã đoạn gene giải trìnhtự - So sánh trìnhtự gene gltA tách dòng với trìnhtự công bố ngân hàng gene NCBI (Gene bank) ... Hình 21: Trìnhtự nucleotide gene gltA tách dòng 57 Hình 22: Kết dịch mã gene gltA 58 Hình 23: Kết so sánh trìnhtự gene gltA tách dòng với trìnhtự gene cơng bố ngân hàng gene ...