Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

77 1.1K 1
Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

MỞ ĐẦU 5 CHƯƠNG1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU 7 1.1. Giới thiệu về cây lạc. 7 1.1.1. Nguồn gốc, phân loại, và phân bố. 7 1.1.3. Tình hình sản xuất lạc. 9 1.1.4. Một số phương pháp chọn tạo giống cây lạc. 11 1

M U 4Ch ơng 1. Tổng quan tài liệu . 6 1.1. Giới thiệu về cây lạc . 6 Ch ơng 2. ( ngắn gọn gộp những cáci gì giữa vừng lạc) . 6 2.1.1. Nguồn gốc, phân loại, phân bố 6 2.1.1.1. Nguồn gốc 6 2.1.1.2. Phân loại 6 2.1.1.3. Sự phân bố của lạc . 7 a. Diện tích, sản lợng trồng lạc của các nớc trên thế giới 82.1.2. Di truyền học cây lạc 8 2.1.3. Tình hình sản xuất lạc 8 2.1.3.1. Tình hình sản xuất lạc trên thế giới . 8 2.1.3.2. Tình hình sản xuất lạc ở Việt Nam 9 2.1.4. Một số ph ơng pháp chọn tạo giống cây lạc vừng . 11 2.1.4.1. Xây dựng tập đoàn giống cảI tiến quần thể 11 2.1.4.2. Chọn tạo giống lạc bằng ph ơng pháp lai hữu tính . 11 2.1.4.3. Xử lý đột biến 12 2.2. Giới thiệu về cây vừng 13 2.2.1. Nguồn gốc, Phân loại phân bố . 13 2.2.2. Tình hình sản xuất vừng . 14 2.3. ứng dụng kỹ thuật sinh học phân tử trong việc phân tích đa hình kiểu gen 15 2.3.1. Ph ơng pháp phân tích RAPD (Random Aplified Polymorphic DNA) . 15 2.3.1.1. Nguyên lý . 15 2.3.1.3. u nh ợc điểm của ph ơng pháp RAPD . 17 2.3.1.4. ứng dụng 17 2.3.2. Ph ơng pháp phân tích SSR (Simple Sequence Repeats) . 19 2.3.2.1. Nguyên lý . 19 2.3.2.2. Ph ơng pháp 20 2.3.2.3. u nh ợc điểm . 20 2.3.2.4. ứng dụng 21 Ch ơng 3. Nguyên liệu ph ơng pháp 22 3.1. Nguyên liệu nghiên cứu 22 3.1.1. Nguyên liệu thực vật 22 1 3.1.2. Thiết bị hóa chất 22 3.2. Ph ơng pháp nghiên cứu . 22 3.2.1. Tách chiết ADN từ lá . 22 3.2.2. Xác định hàm l ợng độ tinh sạch của ADN 24 3.2.2.1. Ph ơng pháp đo quang phổ . 24 3.2.2.2. Ph ơng pháp điện di trên gen agarose . 25 3.2.3. Ph ơng pháp phân tích tính đa hình ADN . 26 3.2.3.1. Ph ơng pháp PCR-RAPD 26 3.2.4. Ph ơng pháp PCR-SSR . 27 3.2.5. Phân tích số liệu 29 Ch ơng 4. Kết quả thảo luận . 30 4.1. kết quả Tách ADN tổng số 30 4.1.1. Cải tiến quy trình tách ADN tổng số (Phải nêu rõ cải tiến ở chỗ nào?? theo cô thì phân fnày không cân fthiết cho vào LV) . 30 4.1.2. Kết quả tách chiết ADN tổng số 32 b. Phổ hấp thụ của ADN tách chiết .32c. Điện di kiểm tra ADN tổng số .334.2. đánh giá tính đa hình ADN tập đoàn giống lạc vừng 33 4.2.1. Phân tích tính đa hình ADN lạc bằng ph ơng pháp SSR 33 4.2.1.1. Cặp mồi L37 . 34 d. Sản phẩm SSR của mồi L37 điện di trên gen polyacrylamide 6% .354.2.1.2. Cặp mồi L36 . 36 e. Sản phẩm SSR của mồi L36 điện di trên gen acrylamide 6% .364.2.1.3. Kết quả phân tích ADN tập đoàn lạc bằng ph ơng pháp SSR 37 4.2.1.4. Mối quan hệ di truyền giữa các giống lạc dựa trên phân tích SSR. . 39 f. đồ hình cây tập đoàn giống lạc theo hệ số của kiểu phân nhóm gì?? 42g. Biểu đồ đa chiều (MDS) biểu diễn mối quan hệ giữa các giống lạc nghiên cứu (chú ý: thứ tự ký hiệu các giống theo phụ lục 1) .434.2.2. Phân tích tính đa hình ADN vừng bằng ph ơng pháp RAPD 43 4.2.2.1. Số phân đoạn tần số xuất hiện các phân đoạn . 44 4.2.2.2. Sản phẩm RAPD với mồi UBC336 46 h. Kết quả điện di sản phẩm RAPD của quần thể vừng với mồi UBC336 474.2.2.3. Sản phẩm RAPD với mồi UBC302 47 i. Kết quả điện di sản phẩm RAPD của tập đoàn vừng nghiên cứu với mồi UBC302.484.2.2.4. Mối quan hệ di truyền của các giống vừng nghiên cứu . 49 j. đồ hình cây các giống vừng nghiên cứu .512 k. Biểu đồ đa chiều (MDS) của các giống vừng dùng trong nghiên cứu 514.3. Xác định mức độ sai khác của các dòng lạc/vừng đột biến bằng ph ơng pháp phân tử . 52 4.3.1. Xác định mức sai khác của các dòng lạc đột biến bằng ph ơng pháp SSR 52 4.3.1.1. Sản phẩn SSR của mồi L25 đối với các dòng lạc đột biến 52 l. Kết quả điện di sản phẩm SSR của các dòng lạc đột biến với mồi L25 524.3.1.2. Sản phẩm SSR của mồi L41 đối với các dòng lạc đột biến . 53 m. Kết quả điện di sản phẩm SSR của các dòng lạc đột biến nghiên cứu với mồi L29 534.3.1.3. Số phân đoạn tần số xuất hiện các phân đoạn . 54 n. đồ hình cây các dòng lạc đột biến từ giống lạc VD2 nghiên cứu .57o. Biểu đồ đa chiều (MDS) của các dòng lạc đột biến từ giống lạc VD2 dùng trong nghiên cứu .57p. đồ hình cây các dòng lạc đột bién từ giống lạc L9801 nghiên cứu .60q. Biểu đồ đa chiều (MDS) của các dòng lạc đột biến từ giống lạc L9801 dùng trong nghiên cứu .604.3.2. Xác định mức sai khác của các dòng vừng đột biến bằng ph ơng pháp RAPD . 60 4.3.2.1. Sản phẩn RAPD của mồi RA159 đối với các dòng vừng đột biến . 61 r. Kết quả điện di sản phẩm RAPD của các dòng vừng đột biến nghiên cứu với mồi RA159 .614.3.2.2. Số phân đoạn tần số xuất hiện các phân đoạn . 62 s. đồ hình cây các dòng vừng đột bién từ giống vừng VD2 nghiên cứu 66t. Biểu đồ đa chiều (MDS) của các dòng vừng đột biến từ giống vừng V6 dùng trong nghiên cứu .66u. đồ hình cây các dòng vừng đột biến từ giống vừng V36 nghiên cứu .68v. Biểu đồ đa chiều (MDS) của các dòng vừng đột biến từ giống vừng V36 dùng trong nghiên cứu .69 Kết luận đề nghị 691.Kết luận 692. Đề nghị 70 Tài liệu tham khảo: .71Tài liệu tiếng Việt: 71Tài liệu tiếng Anh .723 MỞ ĐẦULạc, vừng là những cây lấy dầu quan trọng ở Việt Nam. Trong đó cây lạc được Bộ công nghiệp đề ra mục tiêu quy hoạch phát triển quy mô rộng từ năm 2001 đến 2010. Riêng cây vừng mặc dù có hàm lượng dầu rất cao chiếm hơn 50%, nhưng do năng suất thấp, hay bị rủi ro nên hiện chưa được đầu thích đáng [15]. Trong những năn gần đây, hạn hán ngày càng trở nên khắc nghiệt. Vì vậy, trồng nhóm cây đậu đỗ sẽ kinh tế hơn so với trồng lúa nước. Đặc biệt đối với những vùng đất bạc màu có khó khăn về tưới nước thì trồng vừng được xem như là có hiệu quả kinh tế hơn cả. Cho nên, một số tỉnh bị hạn hán không có điều kiện tưới đã đang tăng dần diện tích trồng các loại cây này.4 Việc cải thiện giống bằng các phương pháp truyền thống như lai tạo, đột biến đã làm năng suất tăng đáng kể đối với cây lạc, vừng. Chọn tạo giống cổ điển thường mất rất nhiều thời gian công sức Hơn nữa, vệc lựa chọn các giống làm bố mẹ thường chỉ dựa vào kiểu hình để đánh giá kiểu gen, vì thế nên hiệu quả tạo giống chưa cao Với sự hỗ trợ của sinh học phân tử đã giúp đẩy nhanh quá trình chọn tạo giống mà không bị chi phối bởi môi trường. Hàng loạt các chỉ thị phân tử dựa trên các kĩ thuật như: AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), RAPD (Radom Amplified Polymorphic DNA), SSR (Simple Sequence Repeat)… đã được nghiên cứu từng bước áp dụng vào chọn giống cây trồng trong đómục đích để bảo tồn giống đánh giá đa dạng kiểu gen. Chỉ thị phân tử đã khắc phục được những thiếu sót, hạn chế của phương pháp truyền thống trước đây, đặc biệt là xác định khoảng cách di truyền. Chỉ thị RAPD SSR hiện đang được áp dụng rất có hiệu quả ngay ở Việt Nam trong chọn tạo các giống lúa mới kháng rày nâu, đạo ôn (Nguyễn Thị Lang CS, 2002). Tuy nhiên ở nước ta, việc cải tạo các giống cây lạc/vừng bằng ứng dụng các chỉ thị phân tử mới bắt đầu được nghiên cứu. Nhằm bước đầu cung cấp các thông tin di truyền, góp phần lưu giữ, duy trì nguồn gen đa dạng của tập đoàn giống lạc vừng ở phía Nam, đồng thời làm cơ sở khoa học cho việc lựa chọn bố mẹ sử dụng trong các tổ hợp lai phù hợp theo mục đích của người tạo giống, công trình nghiên cứu này là sử dụng hai loại chỉ thị RAPD SSR để “ Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được”.5 Chơng 1. Tổng quan tài liệu1.1. Giới thiệu về cây lạcChơng 2. ( ngắn gọn gộp những cáci gì giữa vừng lạc)2.1.1. Nguồn gốc, phân loại, phân bố2.1.1.1. Nguồn gốcCây lạc có nguồn gốc Nam Mỹ. Năm 1977, E.G.Squier tìm thấy những quả lạc đợc chôn trong các ngôi mộ của những ngời Inca cổ xa dọc bờ biển phía tây của Nam Mỹ. Lạc đợc đựng trong các vại cùng một số thực phẩm khác. Niên đại của các ngôi mộ cổ này có từ năm 1500 1200 tr ớc công nguyên [12], [38].Theo Gregory (1979, 1980) một số tác giả, lạc có nguồn gốc ở Nam Mỹ: phân bố từ đông bắc Braxin đến tây nam Achentina vùng đất dốc dãy Andes của Braxin Peru [12], [45].2.1.1.2. Phân loạiLạc là cây họ đậu (Fabaceae), chi Arachis loài Arachis hypogaea.L. Đ-ợc chia làm 2 loài phụ chính khác nhau về dạng phân cành: loài phụ hypogaea có dạng phân cành xen kẽ loài phụ fastigiata với dạng phân cành liên tục 6 + Loài phụ hypogaea đợc chia thành 2 giống thực vật học: giống hypogaea (virginia) giống hirsute + Loài phụ fastigiata đợc chia thành các giống nh: giống fastigiata (valencia), giống vulgaris (spanish), giống peruviana giống acequafurian Trên thực tế, ngoài hai loài phụ đợc nhắc đến còn có loài phụ thứ 3 dạng bò cũng đợc công nhận [18], [23].2.1.1.3. Sự phân bố của lạcCó lẽ cây lạc đầu tiên đợc đa từ Nam Mỹ tới châu Âu vào năm 1574 theo báo cáo của Nicolas Monardes.Krapovickas (1986) cho rằng lạc đợc đa từ bờ biển phía tây Peru tới Mehico sau đó ngang qua Thái Bình Dơng theo các thơng thuyền Tây Ban Nha tới Philippine các vùng khác thuộc châu á - Thái Bình Dơng Tóm lại, từ vùng nguyên sản ở Nam Mỹ, bằng nhiều con đờng lạc đã đợc đa đi khắp thế giới nó nhanh chóng thích ứng với các vùng nhiệt đới, á nhiệt đới các vùng có khí hậu ẩm. Đặc biệt lạc đã tìm đợc mảnh đất phát triển thuận lợi ở châu Phi vùng nhiệt đới châu á. Lạc đợc trồng rộng rãi ở châu Phi rồi từ đây, theo các thuyền buôn nô lệ, lạc lại đợc đa trở lại châu Mỹ cả châu Âu. Chính sự giao lu chéo rộng rãi này đã hình thành nên nhiều vùng gen thứ cấp làm phong phú thêm hệ gen của lạc [12].Hiện nay, lạc đợc trồng ở hơn 100 nớc trên thế giới, với tổng diện tích trên 21 triệu ha. Châu á chiếm 63.4% diện tích, sản lợng chiếm 71.7%; châu Mỹ chiếm 31.3% diện tích, sản lợng chiếm 18.6% Bắc Trung Mỹ chiếm 3.7% về diện tích, sản lợng 7.5% (hình 1). Diện tích Sản lợng 7 Những nớc sản xuất lạc quan trọng ở châu á là Trung Quốc, ấn Độ , Thái Lan, Việt Nam Indonesia. Trong đó, ấn Độ có diện tích trồng lớn nhất trên 8 triệu ha. ở Việt Nam, tổng diện tích trồng lạc khoảng 270000 ha (số liệu năm 2000) phân bố trên tất cả các vùng sinh thái nông nghiệp của Việt Nam [10].2.1.2. Di truyền học cây lạcKawakami (1930) đã xác định số lợng nhiễm sắc thể của lạc A. hypogaea là 2n=4x=40. Husted (1931, 1933) đã xác định đợc 40 nhiễm sắc thể soma của 6 giống lạc thơng phẩm 16 dòng của những giống lạc trồng trọt. Xác nhận số đơn bội của lạc n=2x=20 ở một số dạng Valencia đứng hai dạng thân bò. Patel Narayana (1937) cũng thông báo n=2x=20 nhiễm sắc thể đơn bội 40 nhiễm sắc thể soma ở hai giống lạc đứng small japan Gudiyaham Bunch . Nh vậy, số nhiễm sắc thể đặc trng cho các giống khác nhau của loài A. hypogaea là 2n=4x=40 [37], [18].2.1.3. Tình hình sản xuất lạc2.1.3.1. Tình hình sản xuất lạc trên thế giớiLạc là cây lấy dầu cung cấp thực phẩm quan trọng. Nó là cây cung cấp dầu chính thứ 3 của thế giới bên cạnh cây đậu tơng cây bông (FAO Food Outlok, 1990) [24]. Hiện nay, diện tích đất trồng lạc trên thế giới là 21 triệu ha, đợc trồng trên 100 nớc sản lợng đạt 29,14 triệu tấn.Trong khi năng suất lạc trung bình trên thế giới mới đạt xấp xỉ 1,3 tấn/ha thì ở Trung Quốc thử nghiệm trên diện hẹp đã thu đợc năng suất khoảng 12 tấn/ha, cao hơn 9 lần so với năng suất bình quân của thế giới. Điều đó chứng tỏ tiềm năng năng suất lạc còn rất lớn để khai thác.a. Diện tích, sản lợng trồng lạc của các nớc trên thế giới8 ấn Độ là nớc đứng đầu thế giới về diện tích trồng lạc (6-7 triệu ha) nhng năng suất còn thấp (0,8-1,2 tấn/ha). Nói chung, năng suất lạc ở ấn Độ không đồng đều, có vùng chỉ đạt 0,5 tấn/ha, có vùng lại đạt tới 3 tấn/ha [42].Trung Quốc là nớc đứng thứ 2 về diện tích trồng lạc. Diện tích trồng lạc ở Trung Quốc có xu hớng tăng (năm 1993 tổng diện tích là 3379,0 nghìn ha, đến năm 2002 tổng diện tích là 4920,7 nghìn ha). Năng suất lạc ở Trung Quốc khá đồng đều ở các vùng [42]. Nhiều năm nay, sản phẩm lạc Trung Quốc là một trong các mặt hàng nông sản xuất khẩu nổi tiếng trên thị trờng quốc tế. Trung Quốc cũng là một nớc gặt hái nhiều thành tựu nhất trong phát triển sản xuất lạc, đặc biệt trong thập kỷ 90 vừa qua. Vào những năm 1960, năng suất lạc Trung Quốc mới chỉ đạt 1,14 tấn/ha; năm 1970 là 1,21 tấn/ha; năm1980 là 1,78 tấn/ha; đến năm 1990 là 2,5 tấn/ha. Năm 1994 năng suất lạc trung bình của Trung Quốc đã đạt 2,69 tấn/ha năm 2000 đa năng suất lạc toàn quốc lên 3,0 tấn/ha. Để đạt đợc những thành tựu nh vậy, Trung Quốc đã thực hiện chiến lợc đẩy mạnh nghiên cứu chuyển giao tiến bộ kỹ thuật, trong đó kỹ thuật che phủ nilon làm tăng năng suất từ 20-50% [42].Mỹ là nớc có diện tích trồng lạc không lớn (0,59 triệu ha), nhng năng suất đạt cao nhất thế giới (3,1 tấn/ha), sản lợng đạt 1,8 triệu tấn (số liệu năm 2003) [38]. Điều đó chứng tỏ Mỹ là nớc đứng đầu về áp dụng các tiến bộ khoa học kỹ thuật.2.1.3.2. Tình hình sản xuất lạc ở Việt Namở nớc ta, lạc đợc trồng rộng rãi trên nhiều loại đất địa hình khác nhau. Diện tích trồng lạc có xu hớng tăng mạnh những năm trớc đây nay có xu hớng ổn định diện tích 245- 247 triệu ha (bảng 1)Bảng 1: Diễn biến sản xuất lạc ở nớc taNămDiện tích(1000ha)Năng suất(tạ/ha)Sản lợng(tấn)1939 4,6 7,4 3,41955 17,7 8,3 14,51965 85,9 9,42 80,91973 81,5 9,66 78,71985 231,0 9,5 202,41993 217,1 11,9 259,31994 248,2 11,9 294,49 1995 259,9 12,9 334,61998 269,4 14,3 386,01999 247,6 12,8 318,12001 244,6 14,8 363,12002 246,7 16,2 400,4Từ năm 1990 đến nay, công tác nghiên cứu chuyển giao tiến bộ kỹ thuật trồng lạc ở nớc ta đã đợc quan tâm hơn trớc. Các đề tài nghiên cứu cấp Nhà nớc, cấp Ngành, các dự án trong nớc Quốc tế về nghiên cứu, chuyển giao tiến bộ kỹ thuật trên cây lạc đã đợc triển khai, thu hút sự tham gia của một đội ngũ đông đảo các cán bộ ngiên cứu khuyến nông trong cả nớc. Bộ Nông nghiệp & Phát triển Nông thôn xác định phát triển cây lấy dầu trong đó cây lạc là một trong những vấn đề trọng điểm trong chơng trình phát triển nông nghiệp nông thôn nớc ta. Hợp tác quốc tế trong lĩnh vực nghiên cứu phát triển cây lạc đã đợc tăng cờng. Thông qua chơng trình hợp tác với ICRISAT, mạng lới đậu đỗ Cây cốc châu á (CLAN), Việt Nam đã học hỏi tiếp cận đợc nhiều thành tựu mới [10].Triển vọng phát triển cây lạc ở Việt Nam:ở nớc ta, lạc đợc coi là cây trồng có hiệu quả kinh tế cao giá trị rất đa dạng. Trớc hết, với giá trị dinh dỡng cao nên lạc là cây thực phẩm quan trọng của nhân dân ta. Trong dầu lạc chứa hàm lợng axít béo cha no cao (80% trong thành phần axít béo của dầu lạc), đây chính là loại dầu thực phẩm tốt. Ngoài giá trị dinh dỡng, lạc còn là cây cải tạo đất rất tốt.Lạc là cây trồng nhiệt đới á nhiệt đới nên phù hợp với điều kiện nhiệt đới của nớc ta. Bên cạnh đó, yêu cầu về đất đai đối với cây lạc không khắt khe lắm. Đất đai nông nghiệp của ta bị rửa trôi phong hoá nhanh, hàm lợng mùn dinh dỡng thấp (nhất là đất bạc màu, đất phù sa cổ, đất dốc tụ ). Vì vậy, trồng lạc là một trong những biện pháp cải tạo đất, tạo nền nông nghiệp bền vững. Lạc là cây trồng cải tạo đất quan trọng trong hệ thống canh tác đa canh ở nớc ta [10], [12].10 [...]... 4.2 đánh giá tính đa tổ hình ADN tập đoàn n giống lạc vừng g s ố 4.2.1 Phân tích tính đa hình ADN lạc bằng phơng pháp SSR Tập đoàn 32 giống lạc đợc phân tích với 15 cặp mồi SSR, trình tự các cặp mồi đợc trình bày ở phụ lục 6 Đánh giá tính đa hình của mỗi cặp mồi 33 SSR thông qua giá trị PIC) Giá trị PIC càng lớn thì tính đa hình của cặp mồi đó càng cao Kết quả phân tích điện di sản phẩm SSR của. .. đợc sử dụng trong nhận biết, phân loại và phân tích đa hình di truyền của các loài khác nhau nh phân tích sự đa dạng ADN giữa các giống mía [35], xác định phân loại các kiểu di truyền của các giống đậu Hà Lan [60], phân tích mối quan hệ di truyền giữa các loài Orobanche [58], phân tích các biến đổi di truyền trong loài cỏ ba lá trắng ở Bắc Mỹ [34] Hai nhà khoa học Yang Quiros đã sử dụng 28 đoạn... sinh học phân tử trong việc phân tích đa hình kiểu gen Trong những năm qua, với sự ra đời của sinh học phân tử công nghệ gen, một ngành khoa học mới đã xuất hiện: Phân loại học phân tử (molecular taxonomy), chủ yếu dựa trên các kỹ thuật phân tích ADN Các kỹ thuật điểm chỉ ADN phân tích so sánh trình tự nucleotide của các đoạn ADN đã giúp cho việc phát hiện các loài mới, giải quyết các mối nghi... công tác chọn tạo sau này Tập đoàn giống gồm các giống có nguồn gốc khác nhau: các giống có thể thu thập từ các địa phơng hay nhập nội Từ tập đoàn giống, ta tiến hành các thí nghiệm so sánh, khảo nghiệm để xác định giống tốt cho sản xuất, một số giống khác lại đợc dùng làm nguyên liệu cho lai tạo hoặc xử lý đột biến Từ năm 1991 1995, bằng phơng pháp chọn lọc cá thể, dòng lạc VD1 đợc chọn tạo từ giống. ..Vài năm trở lại đây, tình trạng hạn hán kéo dài, Đảng Nhà nớc có chủ trơng chuyển đổi cây trồng sang cây trồng cạn, trong đó lạc là một trong những cây trồng chủ đạo 2.1.4 Một số phơng pháp chọn tạo giống cây lạc vừng 2.1.4.1 Xây dựng tập đoàn giống cảI tiến quần thể Bớc đầu tiên trong công tác chọn tạo giống là xây dựng tập đoàn giống nhằm thu nhập nguồn gen... đỗ đã chọn tạo đợc giống L12, L03 là những giống triển vọng, phù hợp với vùng nớc trời 2.1.4.3 Xử lý đột biến Đột biến là sự thay đổi đột ngột về vật chất di truyền của tế bào Đột biến có thể xảy ra ở gen (mất hay thay đổi cấu trúc) hoặc ở nhiểm sắc thể Đột biến là quá trình hoàn toàn ngẫu nhiên đa số chúng gây hại cho cơ thể sinh vật Tuy nhiên, trong chọn tạo giống, đột biến nhân tạo có tần số biến... L18 Đều là những giống có nguồn gốc nhập nội từ Trung Quốc đợc Trung tâm NC & TN Đậu đỗ Viện KHNN Việt Nam chọn tạo [10] [12] Ngày nay, ngoài việc đánh giá tập đoàn giống bằng các chỉ thị hình thái, ngời ta còn đánh giá tập đoàn giống bằng các phơng pháp chị thị phân tử (RAPD, SSR, RFLP, AFLP) Nhờ các chỉ thị này mà chúng ta biết đợc khoảng cách di truyền giữa các giống, tạo việc lựa chọn bố mẹ cặp... Tuỳ vào từng loại thực vật hay vi sinh vật mà các đoạn mồi ngẫu nhiên đợc thiết kế Theo lý thuyết, số lợng của các đoạn DNA đợc nhân bản phụ thuộc vào độ dài vị trí của các đoạn mồi, kích thớc mức độ phức tạp của cấu trúc DNA geneome Kết quả là sau khi điện di sản phẩm RAPD sẽ phát hiện đợc tính đa hình dựa trên các phân đoạn DNA đợc nhân bản Sự đa hình của sản phẩm RAPD là do kết quả thay đổi các. .. 3.2.5 Phân tích số liệu Dựa trên ảnh điện di sản phẩm PCR các mẫu nghiên cứu với các mồi riêng, ta có đợc dữ liệu về sự xuất hiện của các băng điện di Nhập số liệu vào máy tính xử lý số liệu bằng phần mềm NTSYSpc Version 2.0 để tạo các biểu đồ hình cây thể hiện mối tơng quan di truyền giữa các dòng, giống nghiên cứu Tiêu chuẩn hoá sản phẩm RAPD/SSR theo quy ớc: Số 1 - xuất hiện phân đoạn ADN Số 0... về vị trí phân loại, đánh giá đầy đủ về tính đa dạng di truyền, quan hệ chủng loại tiến hoá của nhiều loài động, thực vật vi sinh vật [59] Các kỹ thuật đợc sử dụng trong phân loại phân tử bao gồm: kỹ thuật isozym (đồng enzym), các kỹ thuật phân tích đoạn ADN nh phơng pháp đa hình chiều dài các đoạn cắt giới hạn (Restriction Fragment Length Polymorphism - RFLP), các kỹ thuật trên cơ sở của phản . tạo giống, công trình nghiên cứu này là sử dụng hai loại chỉ thị RAPD và SSR để “ Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và. và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được .5 Chơng 1. Tổng quan tài liệu1.1. Giới thiệu về cây lạcChơng 2. ( ngắn gọn và gộp

Ngày đăng: 30/10/2012, 14:53

Hình ảnh liên quan

2.1.3.2. Tình hình sản xuất lạc ở Việt Nam - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

2.1.3.2..

Tình hình sản xuất lạc ở Việt Nam Xem tại trang 9 của tài liệu.
2.2.2. Tình hình sản xuất vừng - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

2.2.2..

Tình hình sản xuất vừng Xem tại trang 14 của tài liệu.
Bảng 4: Độ sạch và hàm lợng ADN của  một số giống lạc/vừng - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 4.

Độ sạch và hàm lợng ADN của một số giống lạc/vừng Xem tại trang 32 của tài liệu.
Bảng 5: Số phân đoạn ADN nhân bản và giá trị PIC của tập đoàn 33 giống lạc nghiên cứu - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 5.

Số phân đoạn ADN nhân bản và giá trị PIC của tập đoàn 33 giống lạc nghiên cứu Xem tại trang 34 của tài liệu.
SSR thông qua giá trị PIC). Giá trị PIC càng lớn thì tính đa hình của cặp mồi đó càng cao. - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

th.

ông qua giá trị PIC). Giá trị PIC càng lớn thì tính đa hình của cặp mồi đó càng cao Xem tại trang 34 của tài liệu.
Bảng 6: Phân tích sản phẩm điện di trên gel polyacrylamide 6% của 32 giống lạc với  cặp mồi L37 - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 6.

Phân tích sản phẩm điện di trên gel polyacrylamide 6% của 32 giống lạc với cặp mồi L37 Xem tại trang 35 của tài liệu.
Kết quả phân tích tính đa hình với mồi L37 đã chứng minh rằng các giống lạc có sự khác nhau ở mức độ gen. - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

t.

quả phân tích tính đa hình với mồi L37 đã chứng minh rằng các giống lạc có sự khác nhau ở mức độ gen Xem tại trang 36 của tài liệu.
hình rất cao với PIC = 0,994. Cặp mồi này chỉ ra tính đa hình tơng đối rõ ràng khi so sánh các giống - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

hình r.

ất cao với PIC = 0,994. Cặp mồi này chỉ ra tính đa hình tơng đối rõ ràng khi so sánh các giống Xem tại trang 37 của tài liệu.
Bảng 10: Hệ số tơng đồng giữa các giống lạc nghiên cứu - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 10.

Hệ số tơng đồng giữa các giống lạc nghiên cứu Xem tại trang 41 của tài liệu.
Sơ đồ hình cây chỉ ra sự sai khác giữa các giống lạc về mặt di truyền. Mức độ khác nhau đợc biểu hiện bằng hệ số sai khác giữa các giống - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Sơ đồ h.

ình cây chỉ ra sự sai khác giữa các giống lạc về mặt di truyền. Mức độ khác nhau đợc biểu hiện bằng hệ số sai khác giữa các giống Xem tại trang 42 của tài liệu.
Bảng 11: Tổng số phân đoạn ADN xuất hiện khi điện di sản phẩm RAPD với 19 mồi - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 11.

Tổng số phân đoạn ADN xuất hiện khi điện di sản phẩm RAPD với 19 mồi Xem tại trang 44 của tài liệu.
Từ bảng 13 ta thấy, việc sử dụng các bộ mồi RAPD đối với tập đoàn vừng này cho tính đa hình cha cao nhng cũng đã thể hiện đợc tính đa hình  của các giống vừng nghiên cứu. - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

b.

ảng 13 ta thấy, việc sử dụng các bộ mồi RAPD đối với tập đoàn vừng này cho tính đa hình cha cao nhng cũng đã thể hiện đợc tính đa hình của các giống vừng nghiên cứu Xem tại trang 46 của tài liệu.
4.2.2.3. Sản phẩm RAPD với mồi UBC302 - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

4.2.2.3..

Sản phẩm RAPD với mồi UBC302 Xem tại trang 47 của tài liệu.
Bảng 17: Hệ số tơng đồng giữa các giống vừng nghiên cứu - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 17.

Hệ số tơng đồng giữa các giống vừng nghiên cứu Xem tại trang 50 của tài liệu.
Sơ đồ hình cây tính theo hệ số Jaccard và phân nhóm UPGMA đã chỉ ra mức độ sai khác di truyền giữa các giống vừng dùng trong nghiên cứu - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Sơ đồ h.

ình cây tính theo hệ số Jaccard và phân nhóm UPGMA đã chỉ ra mức độ sai khác di truyền giữa các giống vừng dùng trong nghiên cứu Xem tại trang 50 của tài liệu.
Dựa trên sơ đồ hình cây và biểu đồ đa chiều biểu hiện tính đa hình ADN giữa các giống vừng nghiên cứu, chúng tôi nhận thấy tập đoàn các giống  vừng này có độ sai khác ở mức độ phân tử. - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

a.

trên sơ đồ hình cây và biểu đồ đa chiều biểu hiện tính đa hình ADN giữa các giống vừng nghiên cứu, chúng tôi nhận thấy tập đoàn các giống vừng này có độ sai khác ở mức độ phân tử Xem tại trang 51 của tài liệu.
Bảng 19: Kết quả phân tích 19 dòng lạc đột biến với mồi L29 - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 19.

Kết quả phân tích 19 dòng lạc đột biến với mồi L29 Xem tại trang 53 của tài liệu.
4.3.1.2. Sản phẩm SSR của mồi L41 đối với các dòng lạc đột biến - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

4.3.1.2..

Sản phẩm SSR của mồi L41 đối với các dòng lạc đột biến Xem tại trang 53 của tài liệu.
Bảng 20: Phân tích sản phẩm 11 cặp mồi SSR đối với 19 dòng lạc - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 20.

Phân tích sản phẩm 11 cặp mồi SSR đối với 19 dòng lạc Xem tại trang 54 của tài liệu.
Bảng 22: Hệ số tơng đồng giữa các dòng lạc V2 đột biến - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 22.

Hệ số tơng đồng giữa các dòng lạc V2 đột biến Xem tại trang 56 của tài liệu.
Qua hình 14 và 15 chúng tôi nhận thấy, tất cả các dòng lạc đột biến đều có sự khác biệt so với giống gốc VD2 - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

ua.

hình 14 và 15 chúng tôi nhận thấy, tất cả các dòng lạc đột biến đều có sự khác biệt so với giống gốc VD2 Xem tại trang 57 của tài liệu.
Qua hình 16 và 17 chúng tôi nhận thấy, tất cả các dòng lạc đột biến - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

ua.

hình 16 và 17 chúng tôi nhận thấy, tất cả các dòng lạc đột biến Xem tại trang 60 của tài liệu.
Bảng 25: Các phân đoạn ADN đợc nhân bản khi tiến hành phản ứng RAPD với mồi RA159 - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 25.

Các phân đoạn ADN đợc nhân bản khi tiến hành phản ứng RAPD với mồi RA159 Xem tại trang 61 của tài liệu.
Bảng 26: Tổng hợp phân tích sản phẩm điện di trên gel agarose 2% của 9 dòng vừng với 10 cặp mồi RAPD - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 26.

Tổng hợp phân tích sản phẩm điện di trên gel agarose 2% của 9 dòng vừng với 10 cặp mồi RAPD Xem tại trang 63 của tài liệu.
Bảng 27: Giá trị PIC và các phân đoạn ADN đợc nhân bản - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

Bảng 27.

Giá trị PIC và các phân đoạn ADN đợc nhân bản Xem tại trang 64 của tài liệu.
Qua hình 19 và 20 chúng tôi nhận thấy, tất cả các dòng vừng đột biến đều có sự khác biệt so với giống gốc V6 - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

ua.

hình 19 và 20 chúng tôi nhận thấy, tất cả các dòng vừng đột biến đều có sự khác biệt so với giống gốc V6 Xem tại trang 66 của tài liệu.
PIC Số alen PD đa hình PD đơn hình %PD đa hình - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

alen.

PD đa hình PD đơn hình %PD đa hình Xem tại trang 67 của tài liệu.
u. Sơ đồ hình cây các dòng vừng đột biến từ giống vừng V36 nghiên cứuCoefficient - Phân tích đa dạng ADN tập đoàn một số giống cây lấy dầu (lạc, vừng) và đánh giá mức độ thay đổi phân tử của các dòng cây mới chọn tạo được

u..

Sơ đồ hình cây các dòng vừng đột biến từ giống vừng V36 nghiên cứuCoefficient Xem tại trang 68 của tài liệu.

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan