Nghiên cứu đánh giá sự đa dạng và vai trò của một số module trong cấu trúc enzyme thủy phân cellulose từ khu hệ vi sinh vật trong dạ cỏ của dê

180 31 0
Nghiên cứu đánh giá sự đa dạng và vai trò của một số module trong cấu trúc enzyme thủy phân cellulose từ khu hệ vi sinh vật trong dạ cỏ của dê

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - Nguyễn Khánh Hoàng Việt NGHIÊN CỨU ĐÁNH GIÁ SỰ ĐA DẠNG VÀ VAI TRÒ CỦA MỘT SỐ MODULE TRONG CẤU TRÚC ENZYME THỦY PHÂN CELLULOSE TỪ KHU HỆ VI SINH VẬT TRONG DẠ CỎ CỦA DÊ LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Hà Nội – 2020 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - Nguyễn Khánh Hoàng Việt NGHIÊN CỨU ĐÁNH GIÁ SỰ ĐA DẠNG VÀ VAI TRÒ CỦA MỘT SỐ MODULE TRONG CẤU TRÚC ENZYME THỦY PHÂN CELLULOSE TỪ KHU HỆ VI SINH VẬT TRONG DẠ CỎ CỦA DÊ Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số: 9.42.02.01 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: GS TS Trương Nam Hải PGS TS Đỗ Thị Huyền Hà Nội – 2020 i LỜI CAM ĐOAN Luận án cơng trình nghiên cứu thực chủ yếu cá nhân hướng dẫn khoa học GS TS Trƣơng Nam Hải PGS TS Đỗ Thị Huyền Phần lớn kết nghiên cứu đăng tải báo khoa học, phần khác chưa công bố Các số liệu kết nghiên cứu trình bày luận văn hồn tồn trung thực Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm lời cam đoan Nghiên cứu sinh Nguyễn Khánh Hồng Việt ii LỜI CẢM ƠN Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới GS TS Trƣơng Nam Hải, nguyên Viện trưởng Viện Công nghệ sinh học PGS TS Đỗ Thị Huyền, trưởng phòng Kỹ thuật di truyền, Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam định hướng nghiên cứu, hướng dẫn, bảo tận tình tạo điều kiện cho tơi hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng cảm ơn sâu sắc tới cán bộ, thầy cô Học viện Khoa học Công nghệ, Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam giảng dạy bảo cho kiến thức chuyên môn kỹ cần thiết, tạo điều kiện thuận lợi cho trình học tập làm thủ tục bảo vệ luận án Tơi xin chân thành cảm ơn tập thể Phịng Kỹ thuật di truyền, Viện Công nghệ sinh học - nơi thực luận án - giúp đỡ, bảo tận tình chia sẻ kinh nghiệm chun mơn q báu Để hồn thành luận án này, xin gửi lời cảm ơn tới thủ trưởng đồng chí nơi tơi cơng tác Viện Công nghệ mới, Viện Khoa học Công nghệ qn ln động viên, khuyến khích, hỗ trợ mặt cho suốt thời gian học tập nghiên cứu luận án Tôi xin cảm ơn hỗ trợ kinh phí từ Đề tài độc lập cấp Nhà nước (Mã số: ĐTĐLCN.15/14) Đề tài thuộc hướng KH&CN ưu tiên cấp Viện Hàn lâm KHCNVN (Mã số: VAST02.05/18-19) PGS TS Đỗ Thị Huyền làm chủ nhiệm Cuối cùng, xin gửi lời cảm ơn tới gia đình, bạn bè người thân bên cạnh động viên, giúp đỡ, chia sẻ khó khăn tạo điều kiện tốt cho tơi học tập, nghiên cứu hoàn thiện luận án Hà Nội, ngày tháng năm 2020 Nghiên cứu sinh Nguyễn Khánh Hoàng Việt iii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT…………….…………….….vii DANH MỤC CÁC BẢNG………………………………………………………… ……….ix DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ, ĐỒ THỊ…… ………………………………………… xx MỞ ĐẦU CHƢƠNG TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan cellulose 1.1.1 Thành phần cấu trúc cellulose .5 1.1.2 Vai trò sinh khối cellulose kinh tế sinh học 1.2 Cellulase 10 1.2.1 Khái quát chung celllulase 10 1.2.2 Nguồn gốc cellulase 12 1.2.3 Cấu trúc cellulase 14 1.2.4 Cellulosome 20 1.2.5 Cơ chế thủy phân cellulose 21 1.2.6 Ứng dụng cellulase 23 1.3 Ứng dụng Metagenomics khai thác gen 25 1.3.1 Khái quát Metagenomics 25 1.3.2 Các phương pháp tiếp cận gen kỹ thuật Metagenomics 28 1.3.2.1 Metagenomics dựa vào chức 28 1.3.2.2 Metagenomics dựa vào giải trình tự DNA đa hệ gen 29 1.3.3 Ứng dụng Metagenomics khai thác gen 30 1.3.3.1 Khai thác gen ứng dụng công nghiệp .30 1.3.3.2 Khai thác gen mã hóa cho cellulase 31 1.3.3.3 Sàng lọc gen mã hóa cellulase từ cỏ dê 32 CHƢƠNG ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 35 2.1 Đối tƣợng, vật liệu hóa chất thiết bị máy móc 35 2.1.1 Đối tượng vật liệu nghiên cứu 35 2.1.2 Hóa chất thiết bị máy móc 35 iv 2.1.2.1 Hố chất mơi trường 35 2.1.2.2 Máy móc thiết bị 37 2.2 Phƣơng pháp nghiên cứu 38 2.2.1 Các phương pháp sinh học phân tử, vi sinh vật 38 2.2.1.1 Biến nạp DNA plasmid vào vi khuẩn E coli 38 2.2.1.2 Tách chiết DNA plasmid từ tế bào vi khuẩn E coli 38 2.2.1.3 Cắt ghép nối gen 38 2.2.1.4 Điện di gel agarose 39 2.2.1.5 Tinh chế DNA từ gel agarose 40 2.2.1.6 Tối ưu mã tổng hợp gen mã hóa enzyme thủy phân cellulose 40 2.2.1.7 Thiết kế vector biểu 40 2.2.2 Các phương pháp hóa sinh protein 43 2.2.2.1 Biểu protein tái tổ hợp E coli .43 2.2.2.2 Điện di protein gel polyacrylamide 43 2.2.2.3 Tinh chế protein sắc kí lực his-tag 44 2.2.2.4 Xác định độ enzyme Quantity One 45 2.2.2.5 Định lượng protein phương pháp Bradford 45 2.2.2.6 Xác định hoạt tính endoglucanase 46 2.2.2.7 Đánh giá ảnh hưởng SFn3 SXFn3 đến CMC giấy lọc 48 2.2.2.8 Ảnh hưởng nhiệt độ, pH, ion kim loại, hóa chất lên enzyme 50 2.2.2.9 Xác định độ bền nhiệt enzyme 51 2.2.2.10 Xác định thông số động học enzyme 51 2.2.3 Các phương pháp tin sinh học 43 2.2.3.1 Phương pháp nghiên cứu Pfam trình tự 52 2.2.3.2 Nghiên cứu vùng bảo thủ cấu trúc bậc ba trình tự .52 2.2.3.3 Dự đốn khả chịu kiềm/acid 53 2.2.3.4 Dự đoán khả chịu nhiệt enzyme 54 2.2.4 Xử lý số liệu 54 CHƢƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 55 3.1 Đánh giá đa dạng GH cấu trúc module cellulase 55 3.1.1 Đánh giá đa dạng cấu trúc họ GH cellulase 55 3.1.2 Đánh giá đa dạng cấu trúc cellulase hoàn thiện có cấu trúc module 57 3.1.3 Đánh giá đa dạng nguồn gốc ORF mã hóa cellulase .61 3.1.4 Đánh giá mức độ tương đồng trình tự axit amin suy diễn 64 v 3.1.5 Ước đốn số tính chất vật lý enzyme suy diễn từ trình tự 65 3.2 Nghiên cứu lựa chọn trình tự có cấu trúc module điển hình 68 3.2.1 Khảo sát cấu trúc bậc trình tự chứa module FN3 .68 3.2.2 Khảo sát giá trị pI, pH trình tự chứa module FN3 70 3.3 Tách dòng gen XFn3Egc 72 3.3.1 Phân tích tối ưu mã ba trình tự XFn3Egc 72 3.3.2 Tạo vector biểu pETSUMO mang gen 74 3.3.3 Chọn dòng plasmid pETSUMO mang gen 74 3.3.3.1 Chọn dòng vector pETSUMO-Fn3 75 3.3.3.2 Chọn dòng vector pETSUMO-Egc 76 3.3.3.3 Chọn dòng vector pETSUMO-Fn3Egc 76 3.3.3.4 Chọn dòng vector pETSUMO-XFn3Egc 77 3.3.3.5 Chọn dòng vector pETSUMO-XFn3 78 3.4 Biểu gen tế bào E coli 79 3.4.1 Khảo sát điều kiện biểu gen 79 3.4.2 Kiểm tra protein tái tổ hợp biểu pha tan 81 3.4.3 Kiểm tra hoạt tính endoglucanase 82 3.5 Tinh chế protein tái tổ hợp xác định hoạt tính 85 3.5.1 Tinh chế protein tái tổ hợp 85 3.5.1.1 Tinh chế protein SFn3 85 3.5.1.2 Tinh chế protein SFn3Egc 86 3.5.1.3 Tinh chế protein SXFn3Egc 87 3.5.1.4 Tinh chế protein SXFn3 89 3.5.2 Đánh giá hoạt tính protein sau tinh chế 90 3.5.2.1 Đánh giá hoạt tính riêng rẽ protein chất CMC .90 3.5.2.2 Đánh giá SFn3, SXFn3 làm tăng hoạt tính enzyme CMC 91 3.5.2.3 Đánh giá SFn3, SXFn3 làm tăng hoạt tính enzyme giấy lọc 92 3.5.3 Đánh giá khả Fn3 làm tăng lực enzyme với chất 94 3.5.3.1 Trên chất CMC 95 3.5.3.2 Trên chất giấy lọc 97 3.5.3.3 Đánh giá khả nới lỏng cấu trúc tinh thể bề mặt giấy lọc 98 3.5.4 Ảnh hưởng nhiệt độ, pH lên hấp phụ SFn3, SXFn3 với chất 99 3.5.4.1 Ảnh hưởng pH lên hấp phụ SFn3, SXFn3 với chất 99 3.5.4.2 Ảnh hưởng nhiệt độ đến hấp phụ SFn3, SXFn3 với chất 100 vi 3.6 Đánh giá số tính chất enzyme có cấu trúc hoàn thiện .101 3.6.1 Ảnh hưởng pH đến hoạt tính SXFn3Egc 101 3.6.2 Ảnh hưởng nhiệt độ đến hoạt tính SXFn3Egc 103 3.6.3 Đánh giá độ bền nhiệt SXFn3Egc 104 3.6.4 Ảnh hưởng ion kim loại, hóa chất đến hoạt tính SXFn3Egc 105 3.6.5 Đặc điểm động học XFn3Egc .108 KẾT LUẬN 110 DANH MỤC CƠNG TRÌNH LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN ……….………… 112 TÀI LIỆU THAM KHẢO 113 PHỤ LỤC 136 vii DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT Tên viết tắt Tên tiếng Anh Bacterial artificial BAC chromosome BG Beta-glucosidase Basic Local Alignment BLAST Search Tool bp CBH CBD CBM CD CE Nghĩa tiếng Việt Nhiễm sắc thể nhân tạo vi khuẩn Beta-glucosidase Công cụ so sánh mức độ tương đồng trình tự nucleotit/axit amin trực tuyến NCBI Cặp base Cellobiohydrolase binding Vùng liên kết với carbohydrate Base pair Cellobiohydrolase Carbohydrate domain Cellulose binding module Catalytic domain Carbohydrate esterase Vùng liên kết với cellulose Vùng xúc tác Carbohydrate esterase DNA tổng hợp từ khuôn cDNA Complementary DNA mRNA nhờ enzyme phiên mã ngược reverse transcriptase CMC Carboxymethyl cellulose Carboxymethyl cellulose Cơ sở liệu protein sinh vật nhân sơ nhân chuẩn đơn bào/cơ Clusters of Orthologous sở liệu từ hệ gen sinh vật COG/KOG Groups/euKaryotic nhân chuẩn (3 loài động vật, loài Orthologous Groups thực vật, Arabidopsis thaliana, loài nấm ký sinh trùng nội bào) CSDL Cơ sở liệu DNA Deoxyribonucleic acid Axit deoxyribonucleic DNS/DNSA 3,5-Dinitrosalicylic acid Axit 3,5-dinitrosalicylic dNTP 2’-deoxyribonucleoside 5’- 2’-deoxyribonucleoside 5’triphosphate triphosphate EDTA Ethylene diamine tetraacetic Axit ethylene diamine tetraacetic acid EG Endoglucanase Endoglucanase Evolutionary genealogy of Cơ sở liệu chứa nhóm genes: Non-supervised orthologous (các gen eggNOG Orthologous Groups loài khác tiến hóa từ tổ tiên chung) Fn3 Fibronectin type III module Module FN3 GB Gigabyte Gigabyte (10 byte) His (H) Histidine Axit amin histidin HPLC High performance liquid Sắc ký lỏng hiệu cao chromatography HTS High throughput sequencing Giải trình tự thơng lượng cao Ig Immunoglobulin module Module Ig viii Tên viết tắt IPTG Kb kDa KEGG Km LB LBA MB MEGAN NCBI NGS NR OD ORF PCR PE PFAM pH pNPG pNPX RDP RNA SDS SDS-PAGE TEMED Vmax VSSA w/v Tên tiếng Anh Isopropy-β-D thiogalactosidase Kilobase Kilodalton Kyoto Encyclopedia Genes and Genomes Nghĩa tiếng Việt Isopropy-β-D-thiogalactosidase Kilobase (1000 cặp bazơ) Đơn vị đo trọng lượng protein of Cơ sở liệu gen, đường sinh học, bệnh tật chất hóa học Michaelis constant Nồng độ chất để tốc độ phản ứng đạt ½ tốc độ tối đa Luria-Betani Môi trường nuôi cấy LB Môi trường nuôi cấy LB bổ sung Luria-Betani ampicillin ampicillin Megabyte Megabyte (10 byte) Phần mềm phân tích tối ưu MEtaGeneomic ANalyser trình tự đa hệ gen National Center for Trung tâm quốc gia thông tin Biotechnology Information công nghệ sinh học Next-generation sequencing Đọc trình tự hệ Cơ sở liệu chứa trình tự Non-redundant hồn tồn giống hợp từ ngân hàng gen Optimal density Mật độ quang học Open reading frame Khung đọc mở Polymarase chain reaction Phản ứng chuỗi trùng hợp Read (đoạn trình tự ADN ngắn riêng rẽ) có hai đầu tương đồng Pair-end với contig (đoạn trình tự ADN thường gộp từ read) Protein families Các họ protein + Hydrogen power Chỉ số đo nồng độ ion H , ion OH dung dịch p-nitrophenol-β-glucoside p-nitrophenol-β-glucoside 4-nitrophenyl β-D- 4-nitrophenyl β-D-xylopyranoside xylopyranoside Cơ sở liệu trình tự rARN tiểu Ribosomal Database Project đơn vị nhỏ vi khuẩn vi khuẩn cổ Ribonucleic acid Axit ribonucleic Sodium dodecyl sulphate Sodium dodecyl sulphate SDS-polyacrylamide gel Điện di gel polyacrylamide electrophoresis biến tính Tetramethylethylenediamine Tetramethylethylenediamine Maximum velocity Vận tốc tối đa Vietnam Sugar and Hiệp hội Mía đường Việt Nam Sugarcane Association Weight/volume Khối lượng/thể tích XVI [denovogenes]_7073 [denovogenes]_6435 [denovogenes]_4807 [denovogenes]_4580 [denovogenes]_5436 [denovogenes]_2866 [denovogenes]_4293 [denovogenes]_4885 [denovogenes]_2534 [denovogenes]_60023 [denovogenes]_32327 [denovogenes]_5048 [denovogenes]_4818 [denovogenes]_30752 [denovogenes]_15061 [denovogenes]_3932 [denovogenes]_8137 [denovogenes]_10476 [denovogenes]_3335 [denovogenes]_32360 [denovogenes]_14698 [denovogenes]_36154 [denovogenes]_5349 [denovogenes]_11087 [denovogenes]_26350 [denovogenes]_27279 [denovogenes]_5016 [denovogenes]_16694 [denovogenes]_14579 [denovogenes]_23320 [denovogenes]_47983 [denovogenes]_19383 [denovogenes]_29919 [denovogenes]_5940 [denovogenes]_42324 [denovogenes]_21710 [denovogenes]_4566 [denovogenes]_41184 [denovogenes]_4887 [denovogenes]_23432 [denovogenes]_31115 [denovogenes]_33156 [denovogenes]_18633 [denovogenes]_93986 [denovogenes]_18919 [denovogenes]_116021 [denovogenes]_42148 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 5.08 5.96 6.65 5.82 5.99 6.11 5.48 5.47 5.15 74260.67 77468.90 83185.48 83175.09 79404.83 95687.08 85825.64 82751.15 99208.60 4.65 30910.80 GH3 5.38 41923.36 GH3 4.95 81775.52 GH3 5.09 82906.14 GH3 4.93 43024.62 GH3 5.76 55923.04 GH3 5.83 87884.68 GH3 6.88 71817.60 GH3 6.29 65198.99 GH3 6.02 92626.36 GH3 5.68 42614.10 GH3 5.19 57168.54 GH3 4.70 40555.67 GH3 6.81 81393.53 GH3 7.51 64333.35 GH3 6.22 46768.00 GH3 4.96 45187.88 GH3 6.68 83093.07 GH3 6.52 55506.80 GH3 6.84 58873.02 GH3 6.14 48798.14 GH3 4.87 35391.76 GH3 6.79 52881.83 GH3 5.62 45324.15 GH3 6.09 77677.68 GH3 5.11 38733.67 GH3 5.05 49594.11 GH3 5.91 83200.29 GH3 5.21 38196.04 GH3 5.10 83041.37 GH3 5.99 48294.92 GH3 6.62 43163.08 GH3 4.74 41200.38 GH3 8.31 53358.43 8.59 22516.29 GH3 5.50 52462.14 4.95 18303.59 GH3 5.55 37908.77 XVII [denovogenes]_117482 [denovogenes]_12182 [denovogenes]_132699 [denovogenes]_133402 [denovogenes]_74772 [denovogenes]_130059 [denovogenes]_87400 [denovogenes]_109796 [denovogenes]_57467 [denovogenes]_20670 [denovogenes]_106223 [denovogenes]_31495 [denovogenes]_6951 [denovogenes]_69570 [denovogenes]_21970 [denovogenes]_50207 [denovogenes]_51295 [denovogenes]_20854 [denovogenes]_11769 [denovogenes]_6569 [denovogenes]_4239 [denovogenes]_4238 [denovogenes]_42606 [denovogenes]_14657 [denovogenes]_26381 [denovogenes]_24982 [denovogenes]_6729 [denovogenes]_72186 [denovogenes]_100959 [denovogenes]_6075 [denovogenes]_26233 [denovogenes]_11439 [denovogenes]_63809 [denovogenes]_13202 [denovogenes]_2657 [denovogenes]_2493 [denovogenes]_3350 [denovogenes]_10980 [denovogenes]_3161 [denovogenes]_2713 [denovogenes]_2980 [denovogenes]_3057 [denovogenes]_3633 [denovogenes]_6574 [denovogenes]_22280 [denovogenes]_2488 [denovogenes]_3220 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 5.10 5.90 9.34 5.10 5.79 9.67 5.02 8.98 5.84 4.81 9.42 5.19 5.10 4.91 5.26 6.40 5.28 5.16 5.39 5.71 5.80 5.73 5.02 4.95 5.79 5.14 5.73 6.13 5.65 5.04 4.99 6.36 9.17 5.97 5.58 5.54 5.97 5.43 5.73 5.68 6.17 5.63 5.58 5.70 7.70 5.69 5.55 18217.50 61106.18 16260.30 16166.20 26000.47 16932.32 23986.75 19219.74 31087.10 51647.25 20713.55 43404.22 74802.97 27822.63 50542.55 34067.60 33284.54 51372.10 62955.36 76793.10 87632.57 87534.45 37669.66 58171.74 46660.75 46565.61 74444.20 27788.41 20854.34 78058.42 46837.81 63146.50 29552.86 59577.76 99306.65 100498.79 93680.17 65931.32 93383.40 97226.04 96391.47 94380.16 92255.69 77067.01 50438.41 100477.95 94821.62 XVIII [denovogenes]_3579 [denovogenes]_6218 [denovogenes]_55603 [denovogenes]_12315 [denovogenes]_12968 [denovogenes]_26217 [denovogenes]_35572 [denovogenes]_5944 [denovogenes]_37636 [denovogenes]_13518 [denovogenes]_20773 [denovogenes]_23999 [denovogenes]_57307 [denovogenes]_6687 endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase complete lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 5.96 5.68 4.70 5.88 5.22 5.70 5.60 5.73 6.24 5.43 5.63 5.57 4.52 5.11 92519.98 79595.83 32772.99 62302.27 61268.43 47681.95 42070.20 80667.80 41515.00 60996.41 52358.19 48976.06 32417.66 76807.38 XIX Phụ lục Ƣớc đoán khả chịu kiềm, axit 243 trình tự mã hóa cellulase có chứa module chƣa biết chức (FN3, Ig) Gene code KEGG Status GH [denovogenes]_3282 [denovogenes]_4109 [denovogenes]_2809 [denovogenes]_3406 [denovogenes]_3382 [denovogenes]_3206 [denovogenes]_3200 [denovogenes]_3366 [denovogenes]_3327 [denovogenes]_3396 [denovogenes]_4170 [denovogenes]_3311 [denovogenes]_11451 [denovogenes]_2709 [denovogenes]_4974 [denovogenes]_5153 [denovogenes]_4133 [denovogenes]_11003 [denovogenes]_4103 [denovogenes]_2859 [denovogenes]_4763 [denovogenes]_4148 [denovogenes]_2574 [denovogenes]_4081 [denovogenes]_4125 [denovogenes]_3894 [denovogenes]_4378 [denovogenes]_2596 [denovogenes]_4110 [denovogenes]_3486 [denovogenes]_2771 [denovogenes]_2942 [denovogenes]_3914 [denovogenes]_2827 [denovogenes]_4879 [denovogenes]_2731 [denovogenes]_4560 [denovogenes]_4712 [denovogenes]_4718 [denovogenes]_2805 [denovogenes]_5080 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 Acid 0.01 0.32 0.16 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.02 0.38 0.01 0.01 0.68 0.23 0.53 0.39 0.65 0.22 0.01 0.02 0.18 0.43 0.29 0.28 0.17 0.39 0.47 0.31 0.33 0.22 0.70 0.71 0.33 0.53 0.14 0.45 0.81 0.47 0.73 0.22 Alkaline 0.99 0.68 0.84 0.99 0.99 1.00 1.00 0.99 1.00 0.98 0.62 0.99 0.99 0.32 0.77 0.47 0.61 0.35 0.78 0.99 0.98 0.82 0.57 0.71 0.72 0.83 0.61 0.53 0.69 0.67 0.78 0.30 0.29 0.67 0.47 0.86 0.55 0.19 0.53 0.27 0.78 XX [denovogenes]_2801 [denovogenes]_5214 [denovogenes]_5084 [denovogenes]_2679 [denovogenes]_4441 [denovogenes]_2632 [denovogenes]_2703 [denovogenes]_2748 [denovogenes]_4837 [denovogenes]_2683 [denovogenes]_2747 [denovogenes]_2796 [denovogenes]_2623 [denovogenes]_4394 [denovogenes]_4008 [denovogenes]_2658 [denovogenes]_2821 [denovogenes]_2746 [denovogenes]_4396 [denovogenes]_4719 [denovogenes]_4616 [denovogenes]_2878 [denovogenes]_2672 [denovogenes]_9726 [denovogenes]_2761 [denovogenes]_4840 [denovogenes]_39321 [denovogenes]_4524 [denovogenes]_4363 [denovogenes]_5791 [denovogenes]_5628 [denovogenes]_2914 [denovogenes]_4764 [denovogenes]_4506 [denovogenes]_4221 [denovogenes]_4266 [denovogenes]_4252 [denovogenes]_4563 [denovogenes]_5096 [denovogenes]_4222 [denovogenes]_4509 [denovogenes]_4456 [denovogenes]_3916 [denovogenes]_4532 [denovogenes]_4273 [denovogenes]_4309 [denovogenes]_4178 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 0.73 0.20 0.06 0.44 0.24 0.77 0.40 0.07 0.31 0.95 0.10 0.57 0.67 0.06 0.31 0.93 0.31 0.27 0.02 0.06 0.04 0.19 0.65 0.86 0.31 0.02 0.01 0.00 0.06 0.90 0.33 0.19 0.52 0.16 0.21 0.60 0.10 0.46 0.72 0.09 0.16 0.16 0.08 0.07 0.13 0.08 0.27 0.27 0.80 0.94 0.56 0.76 0.23 0.60 0.93 0.69 0.05 0.90 0.43 0.33 0.94 0.69 0.07 0.69 0.73 0.98 0.94 0.96 0.81 0.35 0.14 0.69 0.98 0.99 1.00 0.94 0.10 0.67 0.81 0.48 0.84 0.79 0.40 0.90 0.54 0.28 0.91 0.84 0.84 0.92 0.93 0.87 0.92 0.73 XXI [denovogenes]_3960 [denovogenes]_3979 [denovogenes]_4240 [denovogenes]_21483 [denovogenes]_4317 [denovogenes]_5120 [denovogenes]_5067 [denovogenes]_4279 [denovogenes]_4750 [denovogenes]_3999 [denovogenes]_4040 [denovogenes]_3920 [denovogenes]_4005 [denovogenes]_2662 [denovogenes]_2535 [denovogenes]_2648 [denovogenes]_2656 [denovogenes]_2610 [denovogenes]_2671 [denovogenes]_13359 [denovogenes]_2639 [denovogenes]_17198 [denovogenes]_7571 [denovogenes]_2426 [denovogenes]_3628 [denovogenes]_5059 [denovogenes]_3678 [denovogenes]_4134 [denovogenes]_4402 [denovogenes]_3708 [denovogenes]_3591 [denovogenes]_3834 [denovogenes]_17221 [denovogenes]_4104 [denovogenes]_3450 [denovogenes]_3618 [denovogenes]_4257 [denovogenes]_68027 [denovogenes]_4224 [denovogenes]_4251 [denovogenes]_4269 [denovogenes]_4277 [denovogenes]_4353 [denovogenes]_4074 [denovogenes]_4151 [denovogenes]_3784 [denovogenes]_38487 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH5 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 0.05 0.05 0.10 0.06 0.29 0.02 0.07 0.32 0.03 0.57 0.11 0.06 0.17 0.85 0.94 0.94 0.83 0.95 0.80 0.92 0.77 0.78 0.44 0.93 0.22 0.21 0.23 0.19 0.03 0.02 0.04 0.15 0.63 0.02 0.01 0.23 0.76 0.67 0.13 0.07 0.06 0.03 0.08 0.01 0.40 0.33 1.00 0.95 0.95 0.90 0.94 0.71 0.98 0.93 0.68 0.97 0.43 0.89 0.94 0.83 0.15 0.06 0.06 0.17 0.05 0.20 0.08 0.23 0.22 0.56 0.07 0.78 0.79 0.77 0.81 0.97 0.98 0.96 0.85 0.37 0.98 0.99 0.77 0.24 0.33 0.87 0.93 0.94 0.97 0.92 0.99 0.60 0.67 0.00 XXII [denovogenes]_7073 [denovogenes]_6435 [denovogenes]_4807 [denovogenes]_4580 [denovogenes]_5436 [denovogenes]_2866 [denovogenes]_4293 [denovogenes]_4885 [denovogenes]_2534 [denovogenes]_60023 [denovogenes]_32327 [denovogenes]_5048 [denovogenes]_4818 [denovogenes]_30752 [denovogenes]_15061 [denovogenes]_3932 [denovogenes]_8137 [denovogenes]_10476 [denovogenes]_3335 [denovogenes]_32360 [denovogenes]_14698 [denovogenes]_36154 [denovogenes]_5349 [denovogenes]_11087 [denovogenes]_26350 [denovogenes]_27279 [denovogenes]_5016 [denovogenes]_16694 [denovogenes]_14579 [denovogenes]_23320 [denovogenes]_47983 [denovogenes]_19383 [denovogenes]_29919 [denovogenes]_5940 [denovogenes]_42324 [denovogenes]_21710 [denovogenes]_4566 [denovogenes]_41184 [denovogenes]_4887 [denovogenes]_23432 [denovogenes]_31115 [denovogenes]_33156 [denovogenes]_18633 [denovogenes]_93986 [denovogenes]_18919 [denovogenes]_116021 [denovogenes]_42148 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 0.00 0.32 0.21 0.19 0.21 0.84 0.00 0.43 0.30 0.70 0.00 0.08 0.01 0.05 0.74 0.14 0.92 0.13 0.22 0.32 0.70 0.59 0.69 0.80 0.93 0.93 0.62 0.19 0.05 0.41 0.06 0.38 0.43 0.33 0.01 0.00 0.13 0.85 0.09 0.20 0.62 0.96 0.01 0.88 0.72 0.92 0.62 1.00 0.68 0.79 0.81 0.79 0.16 1.00 0.57 0.70 0.30 1.00 0.92 0.99 0.95 0.26 0.87 0.08 0.87 0.78 0.68 0.30 0.41 0.31 0.20 0.07 0.07 0.38 0.81 0.95 0.59 0.94 0.62 0.57 0.67 0.99 1.00 0.87 0.15 0.91 0.80 0.38 0.04 1.00 0.12 0.28 0.08 0.38 XXIII [denovogenes]_117482 [denovogenes]_12182 [denovogenes]_132699 [denovogenes]_133402 [denovogenes]_74772 [denovogenes]_130059 [denovogenes]_87400 [denovogenes]_109796 [denovogenes]_57467 [denovogenes]_20670 [denovogenes]_106223 [denovogenes]_31495 [denovogenes]_6951 [denovogenes]_69570 [denovogenes]_21970 [denovogenes]_50207 [denovogenes]_51295 [denovogenes]_20854 [denovogenes]_11769 [denovogenes]_6569 [denovogenes]_4239 [denovogenes]_4238 [denovogenes]_42606 [denovogenes]_14657 [denovogenes]_26381 [denovogenes]_24982 [denovogenes]_6729 [denovogenes]_72186 [denovogenes]_100959 [denovogenes]_6075 [denovogenes]_26233 [denovogenes]_11439 [denovogenes]_63809 [denovogenes]_13202 [denovogenes]_2657 [denovogenes]_2493 [denovogenes]_3350 [denovogenes]_10980 [denovogenes]_3161 [denovogenes]_2713 [denovogenes]_2980 [denovogenes]_3057 [denovogenes]_3633 [denovogenes]_6574 [denovogenes]_22280 [denovogenes]_2488 [denovogenes]_3220 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 0.91 0.70 0.04 0.97 0.63 0.38 0.85 0.84 0.01 0.71 0.03 0.71 0.22 0.01 0.39 0.28 0.45 0.89 0.03 0.02 0.46 0.30 0.01 0.01 0.91 0.13 0.10 0.01 0.39 0.15 0.76 0.98 0.95 0.94 0.98 0.97 0.98 0.92 0.74 0.18 0.78 0.49 0.96 0.06 0.96 0.95 0.97 0.09 0.30 0.96 0.03 0.37 0.62 0.15 0.16 0.99 0.29 0.97 0.29 0.78 0.99 0.61 0.72 0.55 0.11 0.97 0.98 0.54 0.70 0.99 0.99 0.09 0.87 0.90 0.99 0.61 0.85 0.24 0.02 0.05 0.06 0.02 0.03 0.02 0.08 0.26 0.82 0.22 0.51 0.04 0.94 0.04 0.05 0.03 XXIV [denovogenes]_3579 [denovogenes]_6218 [denovogenes]_55603 [denovogenes]_12315 [denovogenes]_12968 [denovogenes]_26217 [denovogenes]_35572 [denovogenes]_5944 [denovogenes]_37636 [denovogenes]_13518 [denovogenes]_20773 [denovogenes]_23999 [denovogenes]_57307 [denovogenes]_6687 endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase complete lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 0.98 0.84 0.94 0.59 0.65 0.93 0.98 0.71 0.91 0.95 0.94 0.69 1.00 0.84 0.02 0.16 0.06 0.41 0.35 0.07 0.02 0.29 0.09 0.05 0.06 0.31 0.00 0.16 XXV Phụ lục Ƣớc đốn khả bền nhiệt 243 trình tự mã hóa cellulase có chứa module chƣa biết chức (FN3, Ig) Gene code KEGG Status GH Tem [denovogenes]_16694 [denovogenes]_93986 [denovogenes]_130059 [denovogenes]_4109 [denovogenes]_2809 [denovogenes]_2709 [denovogenes]_4103 [denovogenes]_4763 [denovogenes]_4148 [denovogenes]_2574 [denovogenes]_4081 [denovogenes]_3894 [denovogenes]_4110 [denovogenes]_2771 [denovogenes]_3914 [denovogenes]_2827 [denovogenes]_2731 [denovogenes]_2805 [denovogenes]_2801 [denovogenes]_2679 [denovogenes]_2632 [denovogenes]_2703 [denovogenes]_2748 [denovogenes]_2747 [denovogenes]_2796 [denovogenes]_2658 [denovogenes]_2821 [denovogenes]_2746 [denovogenes]_4719 [denovogenes]_4616 [denovogenes]_2672 [denovogenes]_9726 [denovogenes]_5791 [denovogenes]_5628 [denovogenes]_2914 [denovogenes]_4221 [denovogenes]_4266 [denovogenes]_5096 [denovogenes]_4222 [denovogenes]_4509 [denovogenes]_4532 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_5' lack_5' lack_5' complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 XXVI [denovogenes]_4273 [denovogenes]_5120 [denovogenes]_4279 [denovogenes]_4040 [denovogenes]_3920 [denovogenes]_2662 [denovogenes]_2535 [denovogenes]_2648 [denovogenes]_2656 [denovogenes]_2610 [denovogenes]_2671 [denovogenes]_17198 [denovogenes]_3628 [denovogenes]_3678 [denovogenes]_4134 [denovogenes]_4402 [denovogenes]_3708 [denovogenes]_3591 [denovogenes]_3834 [denovogenes]_17221 [denovogenes]_4104 [denovogenes]_3450 [denovogenes]_3618 [denovogenes]_4257 [denovogenes]_4224 [denovogenes]_4251 [denovogenes]_4269 [denovogenes]_4277 [denovogenes]_4353 [denovogenes]_4151 [denovogenes]_3784 [denovogenes]_4807 [denovogenes]_5436 [denovogenes]_60023 [denovogenes]_32327 [denovogenes]_5048 [denovogenes]_4818 [denovogenes]_30752 [denovogenes]_3335 [denovogenes]_32360 [denovogenes]_14698 [denovogenes]_5349 [denovogenes]_27279 [denovogenes]_5940 [denovogenes]_41184 [denovogenes]_23432 [denovogenes]_33156 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 XXVII [denovogenes]_18633 [denovogenes]_18919 [denovogenes]_116021 [denovogenes]_42148 [denovogenes]_117482 [denovogenes]_12182 [denovogenes]_109796 [denovogenes]_20670 [denovogenes]_6951 [denovogenes]_20854 [denovogenes]_4239 [denovogenes]_4238 [denovogenes]_42606 [denovogenes]_24982 [denovogenes]_72186 [denovogenes]_100959 [denovogenes]_6075 [denovogenes]_26233 [denovogenes]_3282 [denovogenes]_3406 [denovogenes]_3382 [denovogenes]_3206 [denovogenes]_3200 [denovogenes]_3366 [denovogenes]_3327 [denovogenes]_3396 [denovogenes]_4170 [denovogenes]_3311 [denovogenes]_11451 [denovogenes]_4974 [denovogenes]_5153 [denovogenes]_4133 [denovogenes]_11003 [denovogenes]_2859 [denovogenes]_4125 [denovogenes]_4378 [denovogenes]_2596 [denovogenes]_3486 [denovogenes]_2942 [denovogenes]_4879 [denovogenes]_4560 [denovogenes]_4712 [denovogenes]_4718 [denovogenes]_5080 [denovogenes]_5214 [denovogenes]_5084 [denovogenes]_4441 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 XXVIII [denovogenes]_4837 [denovogenes]_2683 [denovogenes]_2623 [denovogenes]_4394 [denovogenes]_4008 [denovogenes]_4396 [denovogenes]_2878 [denovogenes]_2761 [denovogenes]_4840 [denovogenes]_39321 [denovogenes]_4524 [denovogenes]_4363 [denovogenes]_4764 [denovogenes]_4506 [denovogenes]_4252 [denovogenes]_4563 [denovogenes]_4456 [denovogenes]_3916 [denovogenes]_4309 [denovogenes]_4178 [denovogenes]_3960 [denovogenes]_3979 [denovogenes]_4240 [denovogenes]_21483 [denovogenes]_4317 [denovogenes]_5067 [denovogenes]_4750 [denovogenes]_3999 [denovogenes]_4005 [denovogenes]_2639 [denovogenes]_7571 [denovogenes]_2426 [denovogenes]_5059 [denovogenes]_68027 [denovogenes]_4074 [denovogenes]_38487 [denovogenes]_7073 [denovogenes]_6435 [denovogenes]_4580 [denovogenes]_2866 [denovogenes]_4293 [denovogenes]_4885 [denovogenes]_2534 [denovogenes]_15061 [denovogenes]_3932 [denovogenes]_8137 [denovogenes]_10476 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 XXIX [denovogenes]_36154 [denovogenes]_11087 [denovogenes]_26350 [denovogenes]_5016 [denovogenes]_14579 [denovogenes]_23320 [denovogenes]_47983 [denovogenes]_19383 [denovogenes]_29919 [denovogenes]_42324 [denovogenes]_21710 [denovogenes]_4566 [denovogenes]_4887 [denovogenes]_31115 [denovogenes]_132699 [denovogenes]_133402 [denovogenes]_74772 [denovogenes]_87400 [denovogenes]_57467 [denovogenes]_106223 [denovogenes]_31495 [denovogenes]_69570 [denovogenes]_21970 [denovogenes]_50207 [denovogenes]_51295 [denovogenes]_11769 [denovogenes]_6569 [denovogenes]_14657 [denovogenes]_26381 [denovogenes]_6729 [denovogenes]_13359 [denovogenes]_22280 [denovogenes]_20773 [denovogenes]_11439 [denovogenes]_63809 [denovogenes]_13202 [denovogenes]_37636 [denovogenes]_2657 [denovogenes]_2493 [denovogenes]_3350 [denovogenes]_10980 [denovogenes]_3161 [denovogenes]_2713 [denovogenes]_2980 [denovogenes]_3057 [denovogenes]_3633 [denovogenes]_6574 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete lack_both complete complete complete lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH5 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 65 >65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 XXX [denovogenes]_2488 [denovogenes]_3220 [denovogenes]_3579 [denovogenes]_6218 [denovogenes]_55603 [denovogenes]_12315 [denovogenes]_12968 [denovogenes]_26217 [denovogenes]_35572 [denovogenes]_5944 [denovogenes]_13518 [denovogenes]_23999 [denovogenes]_57307 [denovogenes]_6687 endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase complete complete complete lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 ... trò số module cấu trúc enzyme thủy phân cellulose từ khu hệ vi sinh vật trong cỏ dê? ?? ● Mục tiêu nghiên cứu: - Nghiên cứu đánh giá đa dạng cellulase cellulase có cấu trúc module từ khu hệ vi khu? ??n... chứa module FN3 Ig 60 Hình 3.2 Phân tích cấu trúc vi khu? ??n cỏ dê chứa gen phân giải 62 52 cellulose Hình 3.3 Các loài vi khu? ??n phổ biến mang gen cellulase khai thác 63 từ liệu đa hệ gen cỏ dê Vi? ??t... (Bảng 1.2) Gần đây, nghiên cứu đa dạng vi sinh vật phân giải cellulose từ cỏ động vật tiếp tục nhận quan tâm nhiều nhà sinh học Nyonyo cộng phân lập 129 chủng vi khu? ??n phân giải cellulose từ cỏ bò

Ngày đăng: 11/07/2020, 19:54

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan