Đánh giá đa dạng di truyền một số giống bơ (Persea americana Mill.) bằng chỉ thị phân tử SSR

5 96 0
Đánh giá đa dạng di truyền một số giống bơ (Persea americana Mill.) bằng chỉ thị phân tử SSR

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

Cây bơ (Persea americana Mill.) được du nhập và trồng khá phổ biến ở vùng Tây Nguyên và Đông Nam Bộ. Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm đánh giá mức độ đa dạng di truyền của 24 giống bơ dựa trên chỉ thị phân tử SSR. Tổng số 18 primer SSR đã ghi nhận kết quả có 59 băng đa hình trong tổng số 62 băng khuếch đại với kích thước dao động từ 70 đến 350 bp, trung bình 3,44 băng/primer. 3 primer cho kết quả 5 băng đa hình là AVAG13, AVAG21 và LMAV.33. Chỉ số PIC của các primer dao động từ 0,12 đến 0,9, trong đó primer LMAV.06 và primer LMAV.33 có tính đa hình cao nhất. Kết quả phân tích cũng cho thấy hệ số tương đồng di truyền của 24 giống bơ biến thiên từ 0,12 đến 0,99. Kết quả phân nhóm di truyền đã chia các giống bơ thành 6 nhóm chính với khoảng cách di truyền trung bình là 0,39.

Khoa học Nông nghiệp Đánh giá đa dạng di truyền số giống bơ (Persea americana Mill.) thị phân tử SSR Phạm Thị Phương1*, Phạm Đức Toàn2, Nguyễn Vũ Phong2* Trường Đại học Tây Nguyên Trường Đại học Nơng lâm TP Hồ Chí Minh Ngày nhận 14/1/2019; ngày chuyển phản biện 18/1/2019; ngày nhận phản biện 22/2/2019; ngày chấp nhận đăng 18/3/2019 Tóm tắt: Cây bơ (Persea americana Mill.) du nhập trồng phổ biến vùng Tây Nguyên Đông Nam Bộ Mục tiêu nghiên cứu nhằm đánh giá mức độ đa dạng di truyền 24 giống bơ dựa thị phân tử SSR Tổng số 18 primer SSR ghi nhận kết có 59 băng đa hình tổng số 62 băng khuếch đại với kích thước dao động từ 70 đến 350 bp, trung bình 3,44 băng/primer primer cho kết băng đa hình AVAG13, AVAG21 LMAV.33 Chỉ số PIC primer dao động từ 0,12 đến 0,9, primer LMAV.06 primer LMAV.33 có tính đa hình cao Kết phân tích cho thấy hệ số tương đồng di truyền 24 giống bơ biến thiên từ 0,12 đến 0,99 Kết phân nhóm di truyền chia giống bơ thành nhóm với khoảng cách di truyền trung bình 0,39 Từ khóa: bơ, đa dạng di truyền, Persea americana Mill., SSR Chỉ số phân loại: 4.6 Mở đầu Cây bơ du nhập trồng phổ biến vùng Tây Nguyên Đơng Nam Trong trái bơ, ngồi nước chứa chất béo, protein, loại vitamin chất quan trọng khác folate, choline Có thể nói bơ loại trái có nhiều chất dinh dưỡng, phù hợp với lứa tuổi Ngoài ra, số giống bơ sử dụng cho mục đích khác làm gốc ghép, gỗ thương phẩm, làm chất đốt [1, 2] Ở Việt Nam, bơ coi loại trái đặc sản vùng Tây Nguyên trồng thử nghiệm nhiều vùng, miền khắp nước Việc nghiên cứu đa dạng di truyền giống bơ cung cấp liệu mức độ phân tử, giúp cho việc lai chọn tạo giống tiết kiệm thời gian, công sức Nghiên cứu đa dạng di truyền tạo sở khoa học cho bảo tồn nguồn gen Trong năm gần đây, thị phân tử RAPD, ISSR, SSR, ADN Barcode sử dụng phổ biến đánh giá di truyền đa dạng di truyền Những thị giúp nghiên cứu di truyền xác hơn, việc phân loại tốt sâu vào quan hệ di truyền giống bơ, củng cố thêm kết phân loại công bố Một số nghiên cứu gần góp phần làm sáng tỏ nguồn gốc giống lai khác xác định thị chuyên biệt cho giống Sự đánh giá cấu trúc di truyền nguồn giúp cho việc quản lý nguồn di truyền bơ tốt cho chương trình nhân giống bảo tồn vật liệu Nhìn chung, nghiên cứu chủ yếu tập trung đánh giá đa dạng di truyền giống bơ xác định mối quan hệ di truyền giống [3-9] Ở Việt Nam, năm 2016, Lê Ngọc Triệu cs [10] khảo sát đa dạng di truyền xác lập thị phân tử nhận dạng số dòng bơ Lâm Đồng 10 thị ISSR Kết thu cho thấy, mức độ đa dạng di truyền thấp 11 dòng bơ khảo sát dòng bơ tạo giống tuyển chọn Lâm Đồng có nguồn gốc gần Ngoài ra, nghiên cứu xác lập số thị phân tử để nhận dạng dòng bơ tiềm Nhìn chung, việc sử dụng thị phân tử để đánh giá đa dạng di truyền, xác định quan hệ di truyền giống nhằm mục đích bảo tồn chọn tạo giống Việt Nam mẻ Trong nghiên cứu này, thị SSR sử dụng đánh giá đa dạng nguồn gen 24 giống, từ đưa nhận định ban đầu quan hệ di truyền giống bơ tham gia nghiên cứu, góp phần cung cấp liệu sử dụng cơng tác lai tạo giống bơ phục vụ sản xuất Vật liệu phương pháp nghiên cứu Vật liệu nghiên cứu Tổng số 24 mẫu bơ lưu giữ vườn tập đồn giống thuộc Viện Khoa học Kỹ thuật Nơng lâm nghiệp Tây Nguyên sử dụng nghiên cứu (bảng 1) Tác giả liên hệ: ptphuong@gmail.com; nvphong@hcmuaf.edu.vn * 61(7) 7.2019 60 Khoa học Nông nghiệp Bảng Danh sách giống bơ sử dụng nghiên cứu [11] Assessment on the genetic diversity of some avocado (Persea americana Mill.) varieties using microsatellite markers Thi Phuong Pham1*, Duc Toan Pham2, Vu Phong nguyen2* Tay Nguyen University Nong Lam University Ho Chi Minh City Received 14 January 2019; accepted 18 March 2019 Abstract: TT Giống Nguồn gốc TT Giống Nguồn gốc TT Giống Nguồn gốc TA1 Đắk Lắk TA36 Đắk Lắk 17 Arthdith Nhập nội TA3 Đắk Lắk 10 TA40 Đắk Lắk 18 Reed Nhập nội TA5 Đắk Lắk 11 TA44 Đắk Lắk 19 Ettinger Nhập nội TA6 Đắk Nông 12 TA47 Đắk Lắk 20 Fuerte Nhập nội TA17 Đắk Lắk 13 TA54 Gia Lai 21 Sharwill Nhập nội TA21 Đắk Lắk 14 Số Nhập nội 22 GA Nhập nội TT Giống TA26 Nguồn Đắk Lắkgốc 15 TT Booth Giống Nhập nội Nguồn 23 gốc GB TTNhậpGiống nội Nguồn gốc TA1 TA31 Đắk Đắk Lắk Lắk 17NhậpArthdith nội Nhập nội TA3 Đắk Lắk 18 Nhập nội 16 9Hass TA36Nhập nội Đắk24Lắk GC 10 TA40 Đắk Lắk Reed Các primer sử dụng nghiên cứu tham khảo TA5 Đắk Lắk 11 TA44 Đắk Lắk 19 Ettinger TT Giống bố Nguồn TT Giống gốc [5], TTGrossGiống từ công gốc Abraham TakramaNguồn (2014) TA6 Đắk Nông 12 TA47 Đắk Lắk 20 Fuerte German TA1 Viruel Đắk Lắk (2012) [7],TA36 Đắk 17 Arthdith Sharon csLắk (1997) [8] TA17 Đắk Lắk 13 TA54 Gia Lai 21 Sharwill TA3 Đắk Lắk 10 TA40 Đắk Lắk 18 Reed PhươngĐắk pháp TA21 Lắk nghiên 14 cứu Số Nhập nội 22 GA TA5 Đắk Lắk 11 TA44 Đắk Lắk 19 Ettinger TA26 Đắknon Lắk 15 Booth Nhập nội thu riêng 23 rẽ GBvà Mẫu giống TA6 chồi Đắk Nôngcủa 12 TA47 bơ Đắk Lắk 20 Fuerte tách TA31 Đắk Lắktổng số 16 theo Hass Nhập nội CTAB 24 củaGC chiết ADN phương pháp J.J TA17 Đắk Lắk 13 TA54 Gia Lai 21 Sharwill Nhập nội Nguồn gốc Nhập nội Nhập nội Nhập nội Nhập nội Nhập nội Nhập nội Nhập nội Nhập nội Nhập nội Nhập nội Persea americana Mill is cultivated popularly in the Central Highlands and South Eastern regions of Vietnam The purpose of this study was to assess the genetic J.L Doyle (1990) [12] Phản ứngnộiPCR thực Các cứu Nhập tham khảo nghiên cứunộicủa diversity of twenty-four avocado (Persea americana Doyle TA21 primer Đắksử Lắkdụng 14 nghiên Số 22 từGA Nhập Abraham Takrama (2014) [5], Gross-German Viruel (2012) [7], Sharon c với tổng thể tích phản ứng 12 µl, gồm 6,25 µl Master Mill.) varieties based on molecular markers SSR The TA26 Đắk Lắk 15 Booth Nhập nội 23 GB Nhập nội (1997) [8] 2X (Bioline), 0,5 µl primer 10 µM loại, 0,5GCµl PCR analysis with 18 SSR markers showed 62 amplified MixTA31 Đắk Lắk 16 Hass Nhập nội 24 Nhập nội bands including 59 polymorphic bands, and other ADN (50 ng/ul), 4,75 µl nước khử ion Chu kỳ nhiệt phản Phương pháp nghiên cứu Các primer sử dụng nghiên cứuo tham khảo từ nghiên cứu củ properties such as 3.44 bands/primer and molecular ứngMẫu gồmchồi 94oC phút), chubơ kỳđược [94 C giây), non(5của từng35 giống thu(50 riêng rẽ và52 tách chiết tổng Abraham Takrama (2012) [7],ADN Sharon số c o o(2014) [5], Gross-German Viruel o sizes ranging from 70 to 350 bp Three primers namely theo 58phương C (30 giây), 72 C (60 giây)] kết thúc 72 C (7 phút) pháp CTAB J.J Doyle J.L Doyle (1990) [12] Phản ứng PCR (1997) [8] AVAG13, AVAG21 and LMAV.33 gave five polymorphic Sảnthực phẩm đượcthể kiểm trênứng gellàagarose 1,5%, điện hiệnPCR với tổng tíchtra phản 12 µl, gồm 6,25 µl Master Mix 2X pháp cứuphút Kích thước đoạn ADN bands The polymorphic information content (PIC) (Bioline), di Phương 800,5 V, µl 400 mAnghiên primer 10 µM40 loại, 0,5 µl ADN (50 ng/ul), 4,75 µl nước khử ion ranged from 0.12 to 0.90, in which LMAV.06 and Chukhuếch chồi non bơ thu riêng rẽoC tách chiết52 ADN s C (5 lượng phút), 35 chucách kỳ [94 (50 giây), hoặctổng 58oC kỳ Mẫu nhiệt phản ứnggel gồm 94ogiống đại ước so sánh với o o theo phương CTAB Doyle J.L.phút) Doyle (1990) LMAV.33 markers had the highest polymorphism The (30 (60 giây)] kếtJ.J thúc 72và C (7 Sản phẩm[12] PCR Phản ứng kiểmPC tra giây), 72 Cpháp thang chuẩn ADN 100và bp đượcgelthực 1,5%, với tổng ứngmA 12 µl,40 gồm 6,25 µl thước Mastercác Mix 2X agarose điệnthể di tích 80phản V, 400 phút Kích đoạn analysis result also exhibited the similarity coefficient of Xây0,5 dựng phân di truyền: kết đượcvới ghi (Bioline), µl primer 10 µMnhóm 0,5bằng µl ADN 4,75 µl nước khử ion khuếch đại gel ướcloại, lượng cách(50 so ng/ul), sánh thang chuẩn ADN twenty-four avocado varieties varied from 0.12 to 0.99 ADN o nhận dựa vào không35xuất băng (5 phút), chu kỳ [94của C (50 giây), 52 58o Chu kỳ nhiệt phảnsự ứngxuất gồmhiện 94oChay bp The phylogenetic analysis divided the genotypes into six 100 o o (60 giây)] xử kết 72 C (7 phút) PCR kiểm tr giây), Số 72 Cliệu lý thúc phân tích Sản phầnphẩm mềm main groups which have the mean similarity coefficient (30ADN Xây dựng phân nhóm di truyền: kết ghi nhận dựa vào xuấ gel agarose 1,5%, điện di 80 V, 400 mA 40 phút Kích thước đoạ NTSYSpc đểhiện tìm mốibăng tương quanSốgiữa of 0.39 hay không2.1 xuất ADN liệu đượcgiống xử lýnghiên phân tích phần ADN khuếch đại gel ước lượng cách so sánh với thang chuẩn ADN cứuNTSYSpc thông qua hệ số tương trận mềm 2.1ma để trận tìm mối tương quanđồng giữadi cáctruyền giống (ma nghiên cứu thông qua ma Keywords: avocado, genetic diversity, Persea americana 100 bp cách)đồng xây dựng công thức: trậnkhoảng hệ số tương di truyền (ma trận khoảng cách) xây dựng công thức: Mill., SSR Xây dựng phân nhóm di truyền: kết ghi nhận dựa vào xuấ Classification number: 4.6 hay không xuất băng ADN Số liệu xử lý phân tích phầ mềm NTSYSpc 2.1 để tìm mối tương quan giống nghiên cứu thông qua m Trong đó: đồng băng chung hai mẫu; xđược sốxây băng củatrên mẫucông x; ythức: số trận hệTrong số tương trận khoảng dựng đó: xy xy làlàdisố sốtruyền băng(ma chung haicách) mẫu; x số băng băng mẫu y; Sxy hệ số tương đồng mẫu Từ Sxy tính khoảng cách mẫu x; y số băng mẫu y; Sxy hệ số tương đồng di truyền x y theo công thức: Dxy = – Sxy mẫu Từ Sxy tính khoảng cách di truyền x đa dạng di truyền đánh giá mức độ đa dạng dựa ySự theo cơng –giống Sxy Trong đó: xythức: sốDxy băng=chung hai mẫu; x số băng mẫu x; y s vào tần suất xuất band đa hình primer phân tử thể số băng mẫu y; Sxy hệ số tương đồng mẫu Từ Sxy đatính dạng dilà truyền giống đánhtính giáđược khoảng PIC vàSự công thức: di truyền x y theo công thức: Dxy = – Sxy mức độ đa dạng ∑ dựa vào tần suất xuất band đa hình đa dạngphân di truyền thể giống cònbằng đánhsốgiá mức cácSựprimer tử vàcủa PIC độ đa dạng dự Trong đó: P tần suất xuất alen thứ j locus SSR thứ vào tần suất xuất band đa hình primer phân tử thểi s ij tính cơng thức: PIC tính cơng thức: Kết thảo luận Kết phân∑tích SSR Trong đó: Pij tần suất xuất alen thứ j locus SSR thứ i Trong đó: Pij tần suất xuất alen thứ j locus Kết quảthứ thảo SSR i luận Kết phân tích SSR 61(7) 7.2019 61 Khoa học Nông nghiệp Kết thảo luận Kết phân tích SSR Bảng Kết phân tích 18 primer SSR TT Primer Tổng số băng Số băng đa hình Tỷ lệ băng đa hình (%) PIC Kích thước băng (bp) AVAC01 66,7 0,35 70-150 AVAG03 2 100 0,35 90-115 AVMIX04 3 100 0,67 150-200 70-100 AVAG05 3 100 0,47 AVAG06 2 100 0,44 70-105 70-230 AVAG10 3 100 0,12 AVAG13 5 100 0,62 80-175 AVAG21 80 0,63 150-230 AVAG22 4 100 0,59 80-130 10 AVAG25 3 100 0,58 100-150 100 0,40 190-250 180-200 11 LMAV.02 4 12 LMAV.06 2 100 0,89 13 LMAV.07 4 100 0,53 180-230 14 LMAV.14 3 100 0,47 200-260 100 0,55 280-350 170-215 15 LMAV.15 4 16 LMAV.18 4 100 0,49 17 LMAV.24 3 100 0,41 190-220 18 LMAV.33 80 0,90 70-305 Trung bình 3,44 3,27 96 0,53 Tổng số 62 59   70-350   Kết nghiên cứu cho thấy, số 20 primer SSR sử dụng có primer không cho sản phẩm khuếch đại (LMAV.04 LMAV.31) Còn lại 18 primer cho sản phẩm đa hình 2-5 băng primer (bảng 2) Kích thước băng dao động từ 70 đến 350 bp Số băng tạo đa số băng hầu hết primer Các primer có nhiều băng (5 băng) AVAG13, AVAG21 LMAV.33 Tổng số sản phẩm khuếch đại 62 băng ADN, có 59 băng đa hình, đạt 96% với trung bình 3,44 băng/primer Trong đó, với 20 primer SSR trên, tác giả khác thu sản phẩm từ băng (AVAG06) đến 22 băng (AVAG21) Tổng số sản phẩm khuếch đại 247 băng, trung bình có 12 băng/ primer Sự khác biệt số lượng băng thu nhận nghiên cứu so với nghiên cứu khác nguồn mẫu khác nhau, số lượng giống tham gia vào nghiên cứu hạn chế Kết ghi nhận biến thiên kích thước băng dao động từ 70 đến 350 bp Ở nghiên cứu trước, dao động từ 71 đến 270 bp [5, 7] Sự biến động kích thước băng phản ánh phần đa dạng di truyền giống bơ 61(7) 7.2019 Chỉ số PIC primer dao động từ 0,12 đến 0,9 Trong quần thể, giá trị PIC primer lớn primer đa hình Theo đó, primer LMAV.06 LMAV.33 có tính đa hình cao Ngồi ra, giá trị PIC trung bình 18 primer 0,53 cho thấy có đa dạng di truyền nguồn gen giống bơ nghiên cứu Quan hệ di truyền giống bơ Khoảng cách di truyền 24 giống bơ nghiên cứu dao động từ 0,12 đến 0,99 (hình 1) Giá trị cho thấy có khác biệt mặt di truyền giống bơ 24 giống bơ nghiên cứu phân thành nhóm mức giá trị trung bình khoảng cách di truyền 0,39 Nhóm I, gồm giống (TA1 TA5) với hệ số tương đồng 0,3 Nhóm II, có giống (TA3, TA17, TA21) với hệ số tương đồng từ 0,13 (giữa TA17 TA21) đến 0,18 (giữa TA3 TA17) Nhóm III, gồm giống (TA6, TA26, TA31, TA36) với hệ số tương đồng từ 0,13 (giữa TA26 TA31) đến 0,87 (giữa TA6 TA36) giống gồm TA40, TA44 TA47 xếp vào nhóm IV với hệ số tương đồng từ 0,21 (giữa TA44 TA47; TA40 TA47) đến 0,23 (giữa A40 TA44) Nhóm V gồm giống (TA54, Số 5, Booth 7) với hệ số tương đồng từ 0,17 (giữa TA54 Booth 7) đến 0,25 (giữa Số Booth 7) Cuối cùng, nhóm VI có giống (GA, GB, GC, Fuerte, Ardith, Reed, Ettinger, Hass, Sharwill) với hệ số tương đồng từ 0,12 (giữa Hass Sharwill) đến 0,47 (giữa Ettinger Fuerte) Trong đó, giống xếp chung vào nhóm nhỏ Reed Ettinger, Hass Sharwill, Fuerte Ardith Kết phù hợp với nghiên cứu trước [13, 14] Hình Sơ đồ hình mối quan hệ di truyền 24 giống bơ dựa vào 18 primer SSR 62 Khoa học Nơng nghiệp Nhìn chung, giống bơ nước phân bố vào nhóm I, II, III, IV; giống nhập nội thuộc nhóm VI; nhóm V gồm giống nước (TA54) giống nhập nội (Booth Số 5) Giá trị trung bình khoảng cách di truyền 24 giống bơ thấp, cho thấy giống bơ có tương đồng lớn đặc điểm di truyền Tuy nhiên, biến thiên hệ số tương đồng giống bơ phần nói lên đa dạng di truyền mối quan hệ di truyền giống bơ nghiên cứu Sự phân chia có tách biệt hầu hết giống bơ nước với giống bơ nhập nội Tuy nhiên, nhóm V, TA54 giống nước lại ghép chung với Booth Số Điều cho phép giả định rằng, TA54 giống bơ đưa vào Việt Nam trước liên quan đến giống bơ di thực thơng qua chương trình nghiên cứu bơ từ sớm Điều đặc biệt hai giống TA54 Booth xếp vào nhánh nhỏ cho thấy có gần gũi đặc điểm di truyền chúng Về kiểu hình, Booth TA54 có đặc tính thịt vàng đậm, dẻo, béo, khơng xơ, thơm, chí độ dẻo béo TA54 cao so với Booth Ngồi đặc tính thịt quả, hai giống có số đặc điểm tương đồng khác màu sắc non nâu đỏ, bánh tẻ xanh đậm, mép TA54 phẳng, Booth gợn sóng, khối lượng trái gần tương đương [11] Trong nhóm V, giống Số có màu sắc non nâu đỏ, bánh tẻ xanh đậm tương tự TA54 Booth Tuy nhiên, thịt màu vàng kem, béo, sáp, xơ - khác biệt với thịt giống Booth coi kết lai nhóm Guatemalan West Indian, mang số đặc điểm nhóm West Indian (quả chín có màu xanh vàng) nhóm Guatemalan (quả tròn, thời gian từ lúc nở hoa trưởng thành muộn, dao động từ đến 12 tháng) Trong đó, TA54 có màu sắc trái màu vàng nâu thời gian trưởng thành từ đến tháng, Số có màu sắc trái màu xanh nâu thời gian trưởng thành từ đến tháng [11] Đây đặc điểm nhóm West Indian Các giống bơ địa lại chia thành nhóm, số lượng giống nhóm dao động từ đến Trong nhóm I gồm TA1 TA5 lai nhóm West Indian Mexican Nhóm II gồm giống (TA3, TA17, TA21), TA17 TA21 có số đặc điểm nhóm Mexican thời gian trưởng thành từ đến tháng, mép gợn sóng ít, non có màu xanh vàng trưởng thành có màu biến thiên từ xanh đến xanh đậm, thịt màu vàng nhạt, dẻo, béo, không xơ [11] Tuy vậy, màu sắc chín lại mang hướng nhóm West Indian (xanh vàng TA17 vàng nâu TA21), hình dạng trái thay đổi 61(7) 7.2019 Trong nhóm III, TA6 giống mang nhiều đặc điểm khác biệt Kiểu hình mang đặc tính nhóm West Indian (màu sắc non, màu sắc bánh tẻ, màu chín) chiếm tỷ lệ nhiều so nhóm Mexican (thời gian trưởng thành quả) Trong nhóm TA26 TA31 có nhiều điểm tương đồng với với đặc tính màu sắc lá, màu sắc chín đặc trưng nhóm West Indian, thời gian trưởng thành quả, dạng lại thiên nhóm Mexican Cũng nằm nhóm III, TA36 có quan hệ gần gũi với giống TA26, TA31 so với TA6 mang đặc điểm nhóm West Indian (màu sắc lá) nhóm Mexican (dạng quả, màu chín, thời gian trưởng thành quả), nhóm Mexican chiếm ưu Trong nhóm IV cho thấy TA40 TA47 có nhiều điểm tương đồng màu non, bánh tẻ, tán có dạng chóp, thời gian phát triển màu chín Có thể thấy, giống mang đặc tính nhóm Mexican Guatemalan Giống TA44 có đặc tính màu sắc giống với nhóm West Indian thời gian trưởng thành, dạng tương tự nhóm Mexican Do vậy, giống dạng lai nhóm West Indian Mexican Nhóm VI bao gồm dòng/giống nhập nội chia thành hai nhóm nhỏ VIa VIb Trong nhóm VIa, giống Reed, Ettinger, Hass Sharwill phân bố nhóm nhỏ Hass, Sharwill Ettinger lai nhóm Guatemalan Mexican, Reed giống Guatemalan [14] Sự phân chia phù hợp với kết nghiên cứu trước GA, GB, GC tạo nhờ nhân giống vô tính từ lai P americana với P schiedeana có nguồn gốc Guatemala Đây gốc ghép có giá trị thương mại Mỹ chúng có tính kháng bệnh thối rễ [2] Trên phân nhóm, GA GB xếp vào nhóm VIa với giống Guatemalan lai Guatemalan Mexican Trong đó, GC lại xếp vào nhóm VIb với giống lai Guatemalan Mexican Trong nghiên cứu sản lượng giống Hass ghép giống GA, GB, GC, người ta nhận thấy sản lượng bơ Hass gốc ghép GA GB cao so với GC, ghép GC nhỏ so với GA GB Trong nghiên cứu tính kháng mặn gốc ghép, GB có tính kháng mặn trung bình Ngồi ra, giống có tính kháng lạnh mức trung bình, GC kháng mạnh so với GA GB Các đặc tính kháng mặn kháng lạnh biểu dòng đặc tính nhóm Guatemalan Nhìn chung, dòng/giống bơ nhập nội nghiên cứu có nhiều đặc điểm tương đồng với Kết chúng nhóm chủ yếu vào nhóm VI phần nhóm V 63 Khoa học Nông nghiệp Kết luận Sử dụng 18 primer SSR để nghiên cứu tính đa hình 24 giống bơ ghi nhận có 59 băng đa hình, trung bình có 3,44 băng/primer Chỉ số PIC trung bình primer 0,53 cho thấy có đa dạng di truyền giống bơ nghiên cứu Trên phân nhóm di truyền, 24 giống bơ chia thành nhóm với giá trị trung bình khoảng cách di truyền 0,394 Nhóm I, II, III IV bao gồm giống nước, nhóm VI chứa hầu hết giống nhập nội, riêng nhóm V có pha trộn giống nước giống nhập nội Kết nghiên cứu thông tin hữu ích, cung cấp thêm thơng tin đa dạng di truyền bơ Việt Nam, giúp phát triển chọn tạo giống bơ triển vọng tương lai TÀI LIỆU THAM KHẢO [1] J Bost (2014), “Persea schiedeana: A high oil ‘Cinderella Species’ fruit with potential for tropical agroforestry systems”, Sustainability, 6, pp.99-111 [2] S.B Gary, M.L Arpaia (2012), Avocado production in California: A cultural handbook for growers, The University of California Cooperative Extension, and The California Avocado Society Supported by the California Avocado Commission [3] A.K Acheampong, et al (2008), “Genetic characterization of ghanaian avocados using microsatellite markers”, Journal of the American Society for Horticultural Science, 133(6), pp.801-809 [6] H Cuiris-Pérez, et al (2009), “Genetic Variability within Mexico race Avocado (Persea americana Mill.) Germplasm Collections Determined by ISSRs”, Revista Chapingo Serie Horticultura, 15(2), pp.169-175 [7] E Gross-German, M.A Viruel (2012), “Molecular characterization of avocado germplasm with a new set of SSR and EST-SSR markers: genetic diversity, population structure, and identification of race-specific markers in a group of cultivated genotypes”, Tree Genetics and Genomes, 9(2), pp.539-555 [8] D Sharon, et al (1997), “An integrated genetic linkage map of avocado”, Theoretical and Applied Genetics, 95, pp.911-921 [9] J.C Reyes-Alemán, et al (2016), “Assessment of genetic relationship in Persea spp by traditional molecular markers”, Genetics and Molecular Research, 15(2), doi: 10.4238/gmr.15027359 [10] Lê Ngọc Triệu, Nguyễn Hoàng Phong, Mai Tiến Đạt, Thái Thạch Bích, Nguyễn Thanh Tiền, Lê Đình Vĩnh Bảo, Nguyễn Khắc Quang, Phan Ngọc Quỳnh Như (2016), “Khảo sát đa dạng di truyền xác lập thị phân tử cho việc nhận dạng số dòng bơ (Persea americana Mill.) qua sơ tuyển chọn Lâm Đồng”, Tạp chí Khoa học, Trường Đại học Đà Lạt, 6(4), tr.1-14 [11] Hoàng Mạnh Cường (2015), Nghiên cứu tuyển chọn giống bơ (Persea americana Mill.) thích hợp cho số tỉnh Tây Nguyên, Luận án tiến sỹ nông nghiệp, Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam [12] J.J Doyle, J.L Doyle (1990), “Isolation of plant DNA from fresh tissue”, Focus, 12, pp.11-15 [4] M.L Alcaraz, J.I Hormaza (2007), “Molecular characterization and genetic diversity in an avocado collection of cultivars and local Spanish genotypes using SSRs”, Hereditas, 144(6), pp.244-253 [13] V.E Ashworth, M.T Clegg (2003), “Microsatellite markers in avocado (Persea americana Mill.): genealogical relationships among cultivated avocado genotypes”, Journal of Heredity, 94(5), pp.407-415 [5] J.D Abraham, J.F Takrama (2014), “Genetic characterization of avocado (Persea americana Mill.) in two regions of Ghana”, African Journal of Biotechnology, 13(51), pp.4620-4627 [14] R.J Schnell, et al (2003), “Evaluation of avocado germplasm using microsatellite markers”, Journal American Society Horticulture Science, 128(6), pp.881-889 61(7) 7.2019 64 ... thức: di truyền x y theo công thức: Dxy = – Sxy mức độ đa dạng ∑ dựa vào tần suất xuất band đa hình đa dạngphân di truyền thể giống cònbằng đánhs giá mức cácSựprimer tử vàcủa PIC độ đa dạng dự... thấp, cho thấy giống bơ có tương đồng lớn đặc điểm di truyền Tuy nhiên, biến thiên hệ số tương đồng giống bơ phần nói lên đa dạng di truyền mối quan hệ di truyền giống bơ nghiên cứu Sự phân chia có... 24 giống bơ ghi nhận có 59 băng đa hình, trung bình có 3,44 băng/primer Chỉ số PIC trung bình primer 0,53 cho thấy có đa dạng di truyền giống bơ nghiên cứu Trên phân nhóm di truyền, 24 giống bơ

Ngày đăng: 14/01/2020, 13:19

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan