Hướng Dẫn Sử Dụng Hệ Thống Thơng Tin Phòng Xét Nghiệm (ELIS) I TỔNG QUAN VỀ HỆ THỐNG THÔNG TIN PHÒNG XÉT NGHIỆM II BẢO MẬT .3 Cài đặt chế độ bảo mật ban đầu Đăng nhập vào OpenELIS 3 Thoát khỏi OpenELIS .5 III DANH SÁCH CHÍNH Khái quát Danh Sách Chính .5 Những bảng liệu Danh Sách Chính Hiển thị liệu .10 Cách làm cho liệu Làm Không Hoạt Động .12 Chỉnh sửa liệu 12 Thêm liệu 14 IV KIẾN TRÚC HỆ THỐNG 15 I TỔNG QUAN VỀ HỆ THỐNG THƠNG TIN PHỊNG XÉT NGHIỆM - OpenELIS Hệ Thống Thông Tin Phòng Xét Nghiệm đựợc phát triển dựa nỗ lực hợp tác chung nhân viên công nghệ thông tin thuộc phòng thí nghiệm sức khỏe cơng cộng bang: Inova, Minnesota Kansas Hệ thống xây dựng dựa "Những yêu cầu Các Hệ Thống Thơng Tin Phòng Xét Nghiệm Sức Khỏe Cơng Cộng", phát triển sau họp liên bang “Hiệp hội Các Phòng Xét Nghiệm Sức Khỏe Cơng Cộng” (Association of Public Health Laboratories (APHL)), triển khai “Viện Khoa học Thông Tin Sức Khỏe cộng đồng”(Public Health Informatics Institute (PHII)) với tài trợ tổ chức Robert Wood Johnson Sự nỗ lực hợp tác Bang xác định 16 qui trình tác nghiệp cho phòng thí nghiệm sức khỏe cơng cộng, bao gồm tất lĩnh vưc xét nghiệm sức khỏe công cộng: xét nghiệm lâm sàng, xét nghiệm môi trường, sàng lọc sơ sinh thử nghiệm động vật - Mục đích nhóm OpenELIS phát triển Hệ Thống Thơng Tin Phòng Xét Nghiệm (LIS) nhằm đáp ứng u cầu phòng thí nghiệm sức khỏe công cộng, hệ thống bền vững, tiết kiệm mặt kinh tế, có khả tạo cộng đồng mã nguồn mở cho phát triển tương lai mở rộng chức hệ thống Bằng cách sử dụng công cụ mã nguồn mở tập trung vào hệ thống vận hành điều hành, tính độc lập sở liệu với thiết kế triển khai hệ thống theo giảm đáng kể chi phí đầu tư ban đầu bảo trì hệ thống sau - Trang Web OpenELIS đưa vào sử dụng, bao gồm kho lưu trữ mã nguồn, diễn đàn Wiki lưu trữ tài liệu, “những câu hỏi thường gặp”, ứng dụng tìm kiếm lỗi cải tiến.Truy cập website địa www.openelis.org II BẢO MẬT Cài đặt chế độ bảo mật ban đầu Đăng nhập vào OpenELIS Thoát khỏi OpenELIS Thay Đổi Mật Khẩu Cài đặt tài khoản người dùng Cài đặt chế độ bảo mật ban đầu - Trước người dùng truy cập vào OpenELIS, người quản lý phải cài đặt tài khoản người dùng, mơđun (màn hình) cấp quyền cho người dùng Người quản lý OpenELIS sử dụng hình danh sách (Người Dùng Hệ Thống , Người đăng nhập, Mođun Hệ Thống Mođun Người Dùng Hệ Thống) để thiết lập trình cài đặt bảo mật ban đầu Các hình danh sách mơ tả mục 9.5 Ngồi ra, bạn xem thêm chương Danh sách phụ lục liệu danh sách để hiểu rõ - Sau hoàn tất việc cài đặt bảo mật, trình thêm người dùng vào hệ thống cấp quyền giống với trình cài đặt ban đầu, ngoại trừ mođun hệ thống không cần phải định nghĩa lại Cách thêm người dùng vào hệ thống sau cài đặt bảo mật ban đầu mơ tả hồn chỉnh phần cuối cuả chương Đăng nhập vào OpenELIS Để đăng nhập vào ứng dụng OpenELIS: a Mở trang đăng nhập OpenELIS Người quản lý hệ thống OpenELIS cuả bạn cho bạn biết cách để vào trang đăng nhập này; thường bạn nhấn chuột vào đường kết nối cuả OpenELIS b Người quản lý hệ thống OpenELIS cấp cho bạn tên truy cập mật Nhập tên truy cập mật vào trang đăng nhập nhấn nút “Submit” c Nếu bạn nhập tên truy cập mật khẩu, trang chủ mở d Nếu tên truy cập mật sai, thông báo "Đăng nhập khơng hợp lệ" Có thể bạn nhập thơng tin chưa xác, thử điền tên truy cập mật bạn lại lần Nếu nhận thông báo cũ, liên lạc với người quản lý hệ thống OpenELIS cuả bạn để giúp đỡ e Nếu mật bạn hết hạn, thông báo hiển thị Hãy liên lạc với người quản lý hệ thống OpenELIS cuả bạn để giúp đỡ Người quản lý hệ thống OpenELIS xác định ngày hết hạn mật bạn trình cài đặt bảo mật ban đầu xác lập lại ngày hết hạn Thoát khỏi OpenELIS Để thoát khỏi ứng dụng OpenELIS, nhấn vào Thốt trang chủ, viền đỏ Nếu bạn khơng tìm thấy Thốt, khỏi trang để trở lại trang chủ Thốt III DANH SÁCH CHÍNH a) b) c) d) e) f) Khái quát Danh Sách Chính Những bảng liệu Danh Sách Chính Xem liệu Cách làm liệu Làm Không Hoạt Động Chỉnh sửa liệu Thêm liệu Khái quát Danh Sách Chính - - Từng chức Danh Sách Chính tương ứng với bảng liệu mà chứa đựng danh sách tất giá trị hợp lệ cho trường liệu ứng dụng Ví dụ: Bảng liệu Tổ chức - Organization liệt kê tất Tổ chức hợp lệ nhập hình ứng dụng Để ứng dụng hoạt động đắn, trước tiên người quản trị sơ liệu phải dùng tập tin phát sinh liệu để khởi tạo phần hoạc tồn liệu cho bảng danh sách - Chỉ có người giám sát hay quản trị hệ thống mói truy cập đến danh sách chức Danh Sách Chính Nếu có quyền truy cập, nhấn chọn thẻ Danh Sách Chính, bạn thấy danh sách đường dẫn xuất bên Mơ tả phía bảng liệu dùng Danh Sách Chính bước thực cho việc thêm chỉnh sửa liệu có Mơ tả chi tiết cho bảng Danh Sách Chính xem phần Phụ Lục: Dữ liệu Danh Sách Chính Những bảng liệu Danh Sách Chính Danh sách chức Danh Sách Chính bảng liệu tương ứng cho chức Những ví dụ minh họa làm rõ loại liệu mục đích bảng liệu Tên bảng Bảng Mơ tả Ví dụ Nhóm mẫu xét nghiệm Bảng xét nghiệm Vi khuẩn dùng cho mục đích có u cầu Bảng xét nghiệm Virus hô hấp định lúc nhiều xét nghiệm cho mẫu xét nghiệm cách chọn gán nhóm cho mẫu xét nghiệm Chỉ Số Chương Trình Dấu Vết Xét Nghiệm Dự Án Giới Tính Hành Động Thêm số để thiết lập kết cho xét nghiệm Chương trình điều tra nghiên cứu sức khỏe Các mẫu thông báo gắn vào cho xét nghiệm in phần cuối báo cáo cho xét nghiệm Mẫu thơng báo thường in cho xét nghiệm không chỉnh sửa báo cáo mẫu xét nghiệm nhân Một dự án liên kết loạt mẫu xét nghiệm liên quan đến việc bùng phát bệnh khoảng thời gian ngắn đó, khóa học dài hạn hay câu hỏi chất vấn dựa loạt tiêu chuẩn Giới tính bệnh nhân Bùng phát bệnh nhà hàng ABC Chương trình HIV Nam Nữ Hành động diễn kiện Khách hàng gọi Kiểm Soát Chất lượng Ngày Lấy Mẫu chỉnh sửa Khoa Những khoa tổ chức gửi mẫu tới khoa xét nghiệm Loại Bệnh Nhân Quản lý loại bệnh nhân tổ chức Loại Kết Quả Xét Loại kết xét nghiệm Nghiệm nhập thành phần xét nghiệm (câu hỏi) Loại “Từ điển” liệt kê bảng Dictionary Loại Độ chuẩn Số định nghĩa “Thiết lập Thành phần/Chỉ số Xét nghiệm” lưu bảng TEST_RESULT Loại Mẫu Xét Loại mẫu xét nghiệm nhận từ Nghiệm bệnh nhân cho việc kiểm tra (khác với “nguồn mẫu xét nghiệm” mơ tả vị trí lấy mẫu xét nghiệm) Loại Thanh Tốn Quản lý hình thức toán bệnh nhân Loại Từ Điển Kết Quả Kết Quả (Âm tính/ Dương tính) Bệnh đường ruột Bệnh lây qua đường tình dục Chú ý: Kết PCR sử dụng cho nghiên cứu, không nên sử dụng cho việc chẩn đoán bênh Nội, Ngoại, Dịch Vụ, … Nội Trú, Ngoại Trú Từ Điển Độ chuẩn Kiểu Số Máu Mơ Nước BHYT, Dịch Vụ, Viện Phí, Miễn Phí, … Nhóm hay loại mục từ điển Virút hay câu trả lời Đa khoa Dịch tễ học Nghề Nghiệp Quản lý loại nghề nghiệp Nông Dân, Công Nhân, Bác Sĩ, bệnh nhân Kỹ Sư, … Nguồn Mẫu Xét Vị trí thực mẫu xét nghiệm Tai trái Nghiệm Tay phải Sơng Mississippi Phòng Xét Nghiệm Chương trình hoạt động hay điều tra Vi Trùng học nghiên cứu phòng xét nghiệm Virút Miễn dịch học Phương Pháp Những kỹ thuật sử dụng cho Chuỗi dây chuyền phản ứng việc kiểm tra mẫu xét nghiệm (PCR) Sự ni cấy Sinh hóa Quận Quản lý tất quận/ huyện Quận 1, Quận 2, Huyện Châu đất nuớc Thành, … Sự Kiện QA Sự kiện đảm bảo chất lượng Mẫu vật tiêu chưa được gán cho phân tích Những nhận kiện gán cho xét Chất lượng chưa hồn hảo nghiệm khơng phải gán cho mẫu Ngày lấy mẫu trống xét nghiêm Thành Phần Bảng Từng xét nghiệm gán vào bảng Nuôi cấy vi khuẩn hiếu khí Gram dương hình que Phiến đồ Acid Fast Bacilli smear Parainfluenza PCR Parainfluenza PCR Thiết Lập Chỉ Số/ Màn hình khác với Xét nghiệm HIV-1 Western Kết Quả Cho Xét hình khác chỗ dùng đường dẫn Blot Nghiệm để định nghĩa trước Thành phần/Câu hỏi (bảng ANALYTE) định nghĩa Thành phần vạch p65, trước Kết quả/Câu Trả lời (bảng vạch p55, v.v DICTIONARY) để định nghĩa cho xét nghiệm cụ thể Những giá Kết +, -, +/trị liên kết lưu bảng TEST_RESULT Tỉnh/ Thành Phố Quản lý tất tỉnh/ thành phố Tp HCM, Hà Nội, Đà Nẵng, đất nuớc Bình Dương, Đồng Nai, … Tổ Chức Tất thực thể mà hệ thống Viện Sức khỏe Lâm sàng Miền ELIS tương tác qua lại như: Nơi gửi đông xét nghiệm, liên bang văn Bệnh viện dùng phương pháp phòng đại diện tiểu bang học Cơ quan Kiểm sốt nhiễm Trạng Thái Mẫu Xét Trạng thái theo dõi mẫu xét Mẫu Xét Nghiệm Bệnh Nhân Nghiệm nghiệm tiến trình phân tích hồn tất q trình thực phòng xét Hồn tất nghiệm Từ Điển Những kết câu trả lời Dương tính Âm tính Khơng có kháng thể có tiền tố HIV-1 diện Vùng Mẫu Xét Lĩnh vực mẫu xét nghiệm Xét nghiệm cho người Nghiệm thực Xét nghiệm cho động vật Xét nghiệm môi trường Xét Nghiệm Thủ tục thực phòng xét HIV-1 EIA nghiệm có phương pháp Nuôi cấy vi khuẩn hiếu khí gắn kết cho mẫu xét nghiệm Chỉ Gram dương hình que xét nghiệm in Virus bệnh cúm A PCR bảng, kết nhập xác minh xét nghiệm câu hỏi gán cho xét nghiệm Xét Nghiệm Có Điều Khi gặp điều kiện này, Nếu xét nghiệm HIV ½ Plus Kiện xét khác thêm vào cho mẫu O xét nghiệm Những điều kiện Và Thành phần Kết cuối định nghĩa xét nghiệm thành phần (câu hỏi) Và Kết Phản ứng lặp lại kết (câu trả lời) cho xét Xét nghiệm có điều kiện nghiệm HIV-1 Western Blot Nhật Ký Kết Quả Lưu lại tất thao tác người Xét Nghiệm sử dụng thao tác kết xét nghiệm Thông tin lưu lại bao gồm: tên tài khoản thao tác, ngày giờ, chuyển từ kết sang kết Nhật Ký Nhận Xét Lưu lại thông tin người dùng Nghiệm nhận xét nghiệm bệnh nhân Thông tin lưu lại bao gồm: tên tài khoản thêm, ngày thêm, tên xét nghiệm Nhật Ký Thông Tin Lưu lại tất thao tác người Bệnh Nhân sử dụng thông tin bệnh nhân Thông tin lưu lại bao gồm: tên tài khoản thao tác, ngày giờ, thông tin bị thay đổi Người Đăng Nhập Người Thống Thành Thống Dùng Thiết lập tên người dùng mật cho người đăng nhập vào hệ thống Hệ Thiết lập họ, tên tên đăng nhập Hệ Thiết lập cho tất hình Quản Lý Kết Quả Xét Nghiệm, ứng dụng khả thực Xem Kết Quả, … thực chọn, thêm, chỉnh sửa xóa Quyền Cho Người Phân quyền chức hệ Dùng Hệ Thống thống cho tài khoản sử dụng Thành phần cho Thiết lập việc chọn, thêm, cập nhật người quản trị hệ xóa quyền hạn gán thống cho người dùng hệ thống phận hệ thống .3 Phần Hiển thị liệu Để hiển thị liệu Danh Sách Chính, thực bước sau: Nhấn chọn Danh Sách Chính Nhấn chọn đường dẫn Màn hình giống bên xuất Nhấn nút TRƯỚC SAU để hiển thị khối liệu phía trước hay phía sau khối liệu Các mẫu liệu xếp theo ký tự abc dựa theo trường liệu quan trọng 10 11 .4 Cách làm cho liệu Làm Không Hoạt Động Thỉnh thoảng, liệu danh sách khơng hiệu lực nhiều ngun nhân: tổ chức khơng hoạt động nữa, xét nghiệm khơng thực hay dự án hồn thành Để làm cho mẫu liệu khơng hiệu lực ta làm theo cách sau: f Nhấn chọn vào hộp chọn mẫu liệu hình hiển thị g Nhấn nút Làm Khơng Hoạt Động (deactivate) h Trường Có Hiệu Lực đổi từ Y sang N i Một mẫu liệu được kích hoạt trở lại cách sử dụng chức Chỉnh Sửa mơ tả phía Chỉnh sửa liệu Để chỉnh sửa liệu có Danh Sách Chính, thực sau: Sử dụng nút TRƯỚC TIẾP hình để hiển thị khối liệu tìm mẫu liệu mà bạn muốn chỉnh sửa Nhấn chọn vào hộp chọn mẫu liệu Nhấn nút Thay Đổi 12 Màn hình Thay Đổi hiển thị với giá trị mẫu tin tương ứng với trường liệu Thay đổi trường liệu cần thiết Những trường liệu đánh dấu dấu hoa thị màu đỏ (*) trường bắt buộc Để phục hồi hiệu lực lại mẫu liệu, bạn việc thay đổi giá trị N thành Y trường liệu “Có Hiệu Lực” (activate) Nhấn nút LƯU để lưu lại thay đổi Nhấn nút THỐT để khỏi hình mà khơng cần phải lưu lại Nếu trường liệu bắt buộc mà khơng có liệu bạn nhấn nút LƯU hộp thoại xuất thông báo trường liệu bắt buộc bị trống 13 .6 Thêm liệu Để thêm mẫu liệu cho Danh Sách Chính, thực sau: Nhấn nút THÊM hình hiển thị Màn hình Thêm xuất bên Một vài trường liệu tự động điền với giá trị mặc định Nhập liệu vào trường Những trường liệu đánh dấu dấu hoa thị màu đỏ (*) trường bắt buộc Chi tiết trường liệu mô tả phần Phụ Lục: Dữ liệu Danh Sách Chính Nhấn nút LƯU để lưu lại thay đổi bạn cho mẫu liệu Nhấn nút THỐT để khỏi hình mà khơng cần phải lưu lại thay đổi Nếu 14 trường liệu bắt buộc mà khơng có liệu bạn nhấn nút LƯU hộp thoại xuất thông báo trường liệu bắt buộc bị trống 15 ... chương Đăng nhập vào OpenELIS Để đăng nhập vào ứng dụng OpenELIS: a Mở trang đăng nhập OpenELIS Người quản lý hệ thống OpenELIS cuả bạn cho bạn biết cách để vào trang đăng nhập n y; thường bạn nhấn... mật ban đầu Đăng nhập vào OpenELIS Thoát khỏi OpenELIS Thay Đổi Mật Khẩu Cài đặt tài khoản người dùng Cài đặt chế độ bảo mật ban đầu - Trước người dùng truy cập vào OpenELIS, người quản lý phải... Trang Web OpenELIS đưa vào sử dụng, bao gồm kho lưu trữ mã nguồn, diễn đàn Wiki lưu trữ tài liệu, “những câu hỏi thường gặp”, ứng dụng tìm kiếm lỗi cải tiến.Truy cập website địa www.openelis.org