BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG VIỆN NGHIÊN CỨU KHOA HỌC Y DƯỢC LÂM SÀNG 108  NGUYỄN THỊ THANH HÀ NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG VÀ VI SINH Ở BỆNH NHÂN NHIỄM KHUẨN HUYẾT DO ACINETOBACTER BAUMANNII (2011 – 2012) LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC HÀ NỘI – NĂM 2015 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG VIỆN NGHIÊN CỨU KHOA HỌC Y DƯỢC LÂM SÀNG 108  NGUYỄN THỊ THANH HÀ NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG VÀ VI SINH Ở BỆNH NHÂN NHIỄM KHUẨN HUYẾT DO ACINETOBACTER BAUMANNII (2011 – 2012) Chuyên ngành: Truyền nhiễm bệnh nhiệt đới Mã số: 62720153 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: PGS.TS NGUYỄN TRỌNG CHÍNH TS PHAN QUỐC HOÀN HÀ NỘI – NĂM 2015 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng Các kiện, kết nêu luận án trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Hà Nội, tháng 01 năm 2015 NCS Nguyễn Thị Thanh Hà LỜI CẢM ƠN Lời muốn bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến PGS.TS.BS.Nguyễn Trọng Chính, Chính ủy Học viện Quân y, người hướng dẫn khoa học, ln giúp đỡ tận tình truyền đạt kiến thức kinh nghiệm quý báu để tơi hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến TS.BS.Phan Quốc Hoàn, Trưởng khoa Sinh học phân tử Viện nghiên cứu Khoa học Y dược lâm sàng 108, giáo viên đồng hướng dẫn, người đồng hành, giúp đỡ tôi, bảo động viên tơi suốt q trình học tập, thực hồn thành luận án này, Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến PGS.TS Trần Duy Anh, Viện trưởng Viện nghiên cứu Khoa học Y dược lâm sàng 108, người giúp đỡ, tư vấn tạo điều kiện tốt để thực hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến TS.BS.Mari Matsui.Trung tâm nghiên cứu gen vi khuẩn, Viện quốc gia bệnh truyền nhiễm Nhật Bản tận tình giúp đỡ chúng tơi tạo điều kiện cho tơi hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến TS.Hoàng Thu Hà, TS.Trần Huy Hoàng và đồng nghiệp Khoa Vi khuẩn, Viện vệ sinh dịch tễ Trung ương, giúp tơi hồn thành nghiên cứu sinh học phân tử A baumannii phân lập tạo điều kiện giúp tơi hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến Thầy cô giáo Bộ môn Truyền Nhiễm, Viện nghiên cứu Khoa học Y dược lâm sàng 108, nơi đào tạo dìu dắt tơi suốt q trình làm nghiên cứu sinh Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến Ban Giám đốc, tập thể Khoa Vi sinh, Kiểm soát nhiễm khuẩn bệnh viện Trung ương Quân đội 108, Bạch Mai, Trung ương Huế, Chợ Rẫy, Nhân Dân 115, Trưng Vương Nhi Đồng bạn bè, đồng nghiệp hết lòng tạo điều kiện, giúp đỡ, hỗ trợ suốt trình thực hồn thành luận án Cuối tơi ln ghi nhớ cơng ơn tình u thương cha mẹ giành cho ủng hộ, động viên, thương u, chăm sóc, khích lệ hết lịng chồng, anh chị em gia đình, người ln bên tơi, chỗ dựa vững để yên tâm học tập hoàn thành luận án Hà Nội, tháng 01 năm 2015 NCS Nguyễn Thị Thanh Hà DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt tiếng Việt BN Bệnh nhân BV Bệnh viện Bilirubin TP Nồng độ bilirubin máu toàn phần Bilirubin TT Nồng độ bilirubin máu trực tiếp Bilirubin GT Nồng độ bilirubin máu gián tiếp MĐ Máu đơng HA Huyết áp HSTC Hồi sức tích cực KS Kháng sinh NC Nghiên cứu NKH Nhiễm khuẩn huyết NVYT Nhân Viên Y Tế RLCN Rối loạn chức SNK Sốc nhiễm khuẩn SĐT Suy đa tạng TB Trung bình TC Tiểu cầu TE Trẻ em TG Thời gian TTXL Thủ thuật xâm lấn Chữ tiếng Anh viêt tắt Viết tắt Tiếng anh đầy đủ Gỉai thích tiếng việt AB Acinetobacter Vi khuẩn A baumannii A baumannii baumannii ACCP/ American College of Hiệp hội thầy thuốc lồng ngực SCCM Chest Physicians and Mỹ/Hội Hồi sức cấp cứu Society of Critical Care Medicine APACHE Acute Physiology Thang điểm lượng giá bệnh lý cấp and Chronic Health tính mạn tính Evaluation aPTT Activated partial Thời gian hoạt hóa phần thromboplastin time CDC Center for thromboplastin Disease Trung tâm kiểm soát bệnh tật Hoa Control and Kỳ Prevention CLSI ESBL Clinical Laboratory Viện tiêu chuẩn lâm sàng phòng Standards Institute xét nghiệm Extended-spectrum Enzyme beta-lactamase kháng với beta-lactamases kháng sinh phổ rộng nhóm betalactam Hb Hemoglobin Huyết sắc tố HCT Hematocrit Dung tích hồng cầu INR International Tỷ số chuẩn hóa quốc tế Normalized Ratio NMBL New Delhi Metalo-β- Men New Delhi Metalo-β-lactamase lactamase NNIS kháng carbapenem National Nosocomial Hệ Thống Tầm Soát Nhiễm khuẩn Infection Surveillance Bệnh viện Quốc Gia Viết tắt Tiếng anh đầy đủ Gỉai thích tiếng việt Mean MODS Trung bình Multiple organ Hội chứng rối loạn chức dysfunction syndrome đa tạng OXA Oxacillinase Enzyme OXA kháng carbapenem PaCO2 Partial pressure of Phân áp CO2 máu động mạch carbon dioxide PaO2 Partial pressure of Phân áp O2 máu động mạch oxygen PBDs PCR Penicillin-binding Điểm tiếp nhận kháng sinh nhóm proteins penicillin Polymerase chain Phản ứng chuỗi men reaction PFGE Pulsed field gel Điện di xung trường electrophoresis RFLP Restriction fragment Phân tích đa hình chiều dài giới hạn length polymorphism PT Prothrombine time Thời gian prothrombin SaO2 Oxygen saturation Độ bão hịa ơxy máu động mạch SCCM Society of Critical Hiệp Hội hồi sức tích cực Hoa Kỳ Care Medicine SD Standard Deviation Độ lệch chuẩn SHV Sulphydryl variable Enzyme sulphydryl ly giải kháng sinh SIRS Systemic inflammatory response syndrome Hội chứng đáp ứng viêm hệ thống MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN LỜI CẢM ƠN MỤC LỤC DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ DANH MỤC CÁC HÌNH DANH MỤC CÁC SƠ ĐỒ DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT ĐẶT VẤN ĐỀ Chương TỔNG QUAN 1.1 Đặc điểm dịch tễ nhiễm khuẩn huyết Thế giới, Châu Á Việt Nam 1.2 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng nhiễm khuẩn huyết 1.3 Đặc điểm vi sinh học A.baumannii 17 1.4 Nghiên cứu đặc điểm kháng kháng kháng sinh A baumannii 22 1.5 Một số yếu tố nguy gây nhiễm khuẩn huyết A.baumannii 31 1.6 Ứng dụng kỹ thuật sinh học phân tử xác định dịch tễ học A baumannii 32 Chương ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 35 2.1 Đối tượng nghiên cứu 35 2.2 Phương pháp nghiên cứu 36 2.3 Nội dung nghiên cứu liệu nghiên cứu 37 2.4 Phương pháp xử lý số liệu 46 2.5.Vấn đề y đức 46 Chương KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 48 3.1 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng nhiễm khuẩn huyết A baumannii 48 3.2 Đánh giá mức độ nhạy cảm với kháng sinh chủng A baumannii 70 3.3 Phát gen Oxacillinase, tìm mối tương đồng kiểu gen A baumannii 73 Chương BÀN LUẬN 84 4.1 Đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng nhiễm khuẩn huyết A.baumanni 84 4.2 Đánh giá mức độ nhạy cảm kháng sinh A baumannii phân lập 98 4.3 Phát gen OXA, tìm mối tương đồng kiểu gen A.baumannii 101 KẾT LUẬN 110 KIẾN NGHỊ 112 NHỮNG ĐÓNG GÓP CỦA NGHIÊN CỨU 113 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC Phụ lục 1: Danh mục cơng trình liên quan đến đề tài tác giả Phụ lục 2: Phiếu thu thập liệu Phụ lục 3: Phiếu đánh giá tình trạng bệnh nhân Phụ lục 4: Danh sách bệnh nhân nghiên cứu từ bệnh viện DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 1.1: Tóm tắt triệu chứng lâm sàng biến chứng nhiễm khuẩn huyết Bảng 1.2: Tiêu chuẩn tương đồng kiểu gen kỹ thuật PFGE 33 Bảng 2.1: Nhịp tim, nhịp thở, huyết áp, bạch cầu trẻ em theo tuổi 39 Bảng 2.2: Điểm gãy kháng sinh nhóm carbapenem với A baumannii 43 Bảng 2.3: Trình tự xắp xếp đoạn mồi sử dụng phát gen OXA 44 Bảng 3.1: Phân bố nhiễm khuẩn huyết A baumannii theo diễn tiến điều trị 49 Bảng 3.2: Ổ nhiễm khuẩn ban đầu nhiễm khuẩn huyết A baumannii 50 Bảng 3.3: Lâm sàng NKH A baumannii bệnh nhân trẻ em người lớn 52 Bảng 3.4: Lâm sàng nhiễm khuẩn huyết A baumannii sốc nhiễm khuẩn 54 Bảng 3.5: Lâm sàng nhiễm khuẩn huyết A baumannii theo diễn tiến bệnh 55 Bảng 3.6: Lâm sàng NKH A baumannii SNK theo diễn tiến bệnh 57 Bảng 3.7: Xét nghiệm huyết học NKH A baumannii trẻ em người lớn 58 Bảng 3.8: Xét nghiệm huyết học NKH A baumannii theo diễn tiến bệnh 59 Bảng 3.9: Xét nghiệm đông máu NKH A baumannii trẻ em người lớn 60 Bảng 3.10: Xét nghiệm đông máu NKH A baumannii theo diễn tiến bệnh 62 Bảng 3.11: Xét nghiệm sinh hóa NKH A baumannii trẻ em người lớn 64 Bảng 3.12: Xét nghiệm sinh hóa NKH A baumannii theo diễn tiến bệnh 65 Bảng 3.13: Yếu tố lâm sàng liên quan đến tử vong NKH A.baumannii 66 Bảng 3.14: Yếu tố thủ thuật xâm lấn liên quan đến tử vong NKH A.baumannii 67 Bảng 3.15: Yếu tố huyết học liên quan đến tử vong NKH A.baumannii 68 Bảng 3.16: Yếu tố đông máu liên quan đến tử vong NKH A.baumannii 68 Bảng 3.17: Yếu tố sinh hóa liên quan đến tử vong NKH A.baumannii 69 Bảng 3.18: MIC kháng sinh với chủng A baumannii phân lập 70 Bảng 3.19: Phân bố gen OXA ba miền Bắc, Trung, Nam 73 Bảng 3.20: Mức độ kháng kháng sinh A baumannii với gen OXA 75 Bảng 3.21: Phân bố mức độ nhạy cảm KS A baumannii mang gen OXA……76 Bảng 3.22: Mức độ kháng nhóm β-lactam A baumannii với gen OXA 77 Bảng 3.23: Mức độ tương đồng kiểu gen chủng A.baumannii…………80 61 Grupper M., Sprecher H., Mashiach T et al (2007), "Attributable Mortality of Nosocomial Acinetobacter Bacteremia", Infection control and hospital epidemiology, 28 (3), pp.293-299 62 Giannouli M., Tomasone F., Agodi A et al (2002), "Molecular epidemiology of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains in intensive care units of multiple Mediterranean hospitals", Chemotherapy, 46, pp.2155-2161 Journal of Antimicrobial 63 Hall MZ., Williams SN., DeFrances CJ (2011), "Inpatient Care for Septicemia or Sepsis: A Challenge for Patients and Hospitals", NCHS Data Brief, 62, pp.1-8 64 Harrison (2012), Severe Sepsis and Septic Shock Harrison's Principles Of Internal Medicine 18, Mac Graw-Hill, pp.3602-3615 65 Harrison DA., Welch CA., Eddleston JM (2006), "The epidemiology of severe sepsis in England, Wales and Northern Ireland, 1996 to 2004: secondary analysis of a high quality clinical database, the ICNARC Case Mix Programme Database" Critical Care, 10, pp.42 66 Houang ETS., Chu YW., Leung CM et al (2001), "Epidemiology and Infection Control Implications of Acinetobacter spp in Hong Kong", Acinetobacter Epidemiology And Infection Control, 39, pp.228-234 67 Huang XZ., Chahine MA., Frye JG et al (2012), "Molecular analysis of imipenem-resistant Acinetobacter baumannii isolated from US service members wounded in Iraq, 2003-2008", Epidemiol Infect 140 (12), pp.2302-7 68 Huttune R., Aittoniemi J (2011), "New concepts in the pathogenesis, diagnosis and treatment of bacteremia and sepsis", Journal of Infection, 63 (6), PP.407-419 69 Huys G., Cnockaert M., Nemec A et al (2005), "Sequence-Based Typing of adeB as a Potential Tool To Identify Intraspecific Groups among Clinical Strains of Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii", Journal Of Clinical Microbiology, 43 (10), pp.5327-5331 70 Jang TN., Lee SH., Huang CH et al (2009), "Risk factors and impact of nosocomial Acinetobacter baumannii bloodstream infections in the adult intensive care unit: a case-control study", J Hosp Infect, 73 (2), pp.143-150 71 Jason P., Younsuck K., Bin D et al (2011), "Management of severe sepsis in patients admitted to Asian intensive care units: prospective cohort study", BMJ 342, 3245 72 Jeong BC., Jeong SH., Bae LK et al (2005), "Investigation of a nosocomial outbreak of imipenem-resistant Acinetobacter baumannii producing the OXA-23 betalactamase in Korea", J Clin Microbiol 43 (pp.2241-2245) 73 Jeong SH., Bae LK., Park KO et al (2006), "Outbreaks of imipenem-resistant Acinetobacter baumannii producing carbapenemases in Korea", J Microbiol 44, pp.423-31 74 Jose Luis G., Carlos OL., Jose GM (2001), "Risk Factors for Acinetobacter baumannii Nosocomial Bacteremia in Critically Ill Patients: A Cohort Study", Clinical Infectious Diseases, 33, pp.939-946 75 Jung JY., Park MS., Kim SE et al (2010), "Risk factors for multi-drug resistant Acinetobacter baumannii bacteremia in patients with colonization in the intensive care unit", BMC Infectious Diseases, 10, pp.228 76 Kang CI., Kim SH., Park WB et al (2005), "Bloodstream Infections Caused by Antibiotic-Resistant Gram-Negative Bacilli: Risk Factors for Mortality and Impact of Inappropriate Initial Antimicrobial Therapy on Outcome ", Antimicrobial Agents And Chemotherapy, 49 (2), pp 760-766 77 Kari AB., Anthony AC (2012), "The Acinetobacter baumannii BiofilmAssociated Protein Plays a Role in Adherence to Human Epithelial Cells", Infect Immun, 80 (1), pp.228 78 Katsaragakis S., Markogiannakis H., Samara E (2010), "Predictors of mortality of Acinetobacter baumannii infections: A 2-year prospective study in a Greek surgical intensive care unit", Am J Infect Control, 38, pp.631-635 79 Kempf M., Rolain JM., Diatta G et al (2012), "Carbapenem Resistance and Acinetobacter baumannii in Senegal: The Paradigm of a Common Phenomenon in Natural Reservoirs", PLOS ONE, (6), pp.39495 80 Kim SY., Jung JY., Kang YA et al (2012), "Risk Factors for Occurrence and 30-Day Mortality for Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Bacteremia in an Intensive Care Unit", J Korean Med Sci, 27, pp.939-947 81 Kim YJ., Kim SI., Hong KW et al (2012), "Risk Factors for Mortality in Patients with Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Bacteremia: Impact of Appropriate Antimicrobial Therapy", Korean Med Sci, 27, pp.471475 82 Knaus WA., Draper EA., Wagner DP et al (1985), "Prognosis in acute organsystem failure", Ann Surg, 202 (6), pp 685-693 83 Kuo SC., Chang SC., Wang HY et al (2012), "Emergence of extensively drugresistant Acinetobacter baumannii complex over 10 years: Nationwide data from the Taiwan Surveillance of Antimicrobial Resistance (TSAR) program", BMC Infectious Diseases, 12, pp.200 84 Lai CC., Hsu HL., Tan CK et al (2012), "Recurrent Bacteremia Caused by the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii Complex", Journal of Clinical Microbiology 50 (9), pp.2982-2986 85 Lambiase A., Piazza O., Rossano F et al (2012), Pesistence of carbapenemresistant Acinetobacter baumannii strains in an Italian intensive care unit during a forty-six month study periode, New Microbiologica, 35, 199-206 86 Laurent Poirel, Patrice Nordmann (2008), Acinetobacter baumannii: Mechanisms of Resistance, Multiple ß-Lactamases Acinetobacter Biology and Pathogenesis, Springer, Temple University School of Medicine Philadelphia, pp.129-144 87 Laute NBE., Synnestvedt M., Weiner MG et al (2009), "Epidemiology and impact of imipenem resistance in Acinetobacter baumannii" Infect Control Hosp Epidemiol, 30 (12), pp.1186-1192 88 Lee NY., Chang TC., Wu CJ et al (2010), "Clinical manifestations, antimicrobial therapy, and prognostic factors of monomicrobial Acinetobacter baumannii complex bacteremia", Journal of Infection, 61, pp 219-227 89 Lee SH et al (2004), "Risk Factors for Acquisition of Imipenem-Resistant Acinetobacter baumannii: a Case-Control Study", Antimicrobial Agents And Chemotherapy, 48 (1), pp.224-228 90 Lee Y., Yum JH., Kim CK et al (2010), "Role of OXA-23 and AdeABC Efflux Pump for Acquiring Carbapenem Resistance in an Acinetobacter baumannii Strain Carrying the blaOXA-66 Gene", Annals of Clinical & Laboratory Science, 40 (1), pp.43-48 91 Levy MM., Fink MP., Marshall JC et al (2003), "20 SCCM/ESICM/ACCP/ATS/SIS International Sepsis Definitions Conference", Intensive Care Med, 29, pp.530-538 92 Liakopoulos A., Miriagou V., Katsifas EA et al (2012), "Identification of OXA-23-producing Acinetobacter baumannii in Greece, 2010 to 2011", Euro Surveill, 17(11), pp.1-3 93 Lin MF., Kuo HY., Yeh HW et al (2011), "Emergence and dissemination of blaOXA-23-carrying imipenem-resistant Acinetobacter sp in a regional hospital in Taiwan", Journal of Microbiology, Immunology and Infection, 44, pp.39-44 94 Lowell SY (2000), Sepsis Syndrome Principles and practice of infectious diseases, Churchill livingston, 5, pp.806-819 95 Mammina C., Palma DM., Bonura C (2012), "Epidemiology and clonality of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii from an intensive care unit in Palermo, Italy", BMC Research Notes 2012, 5, pp.365 96 Manikal VM., Landman D., Saurina G et al (2000), "Endemic carbapenemresistant Acinetobacter species in Brooklyn, New York: citywide prevalence, interinstitutional spread, and relation to antibiotic usage", Clin Infect Dis, 31, pp.101-106 97 Maria Giannouli, Federica T., Antonella A et al (2002), "Molecular epidemiology of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains in intensive care units of multiple Mediterranean hospitals", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 46, pp.2155-2161 98 Mark AJ., Lowell SY (1986), "New Developments in the Treatment of GramNegative Bacteremia", Medical Progress, 144, pp.185-194 99 Marti S et al (2008), "Characterization of the carbapenem-hydrolyzing oxacillinase OXA-58 in an Acinetobacter Genospecies clinical isolate, Molecular bases of antimicrobial resistance in Acinetobacter spp clinical isolates", Antimicrobial Agents and Chemotherapy University Barcelona, 52(8), pp.2955-2958 100 Martin GS., Mannino DM., Eaton S et al (2003), "The epidemiology of sepsis in the United States from 1979 through 2000", N Engl Med, 348, pp.1546 101 McDonald CL., Banerjee SN., Jarvis WR (1999), "Seasonal variation in Acinetobacter infection from 1987-1996", Clin Infect Dis, 29, pp.1133-1137 102 Metan G., Sariguzel F., Sumerkan B et al (2012), "Factors influencing survival in patients with multidrugresistant Acinetobacter baumannii infection", Braz J Infect Dis., 16 (3), pp.237-241 103 Ming FL., Han YK., Hui-WY et al (2011), "Emergence and dissemination of blaOXA-23-carrying imipenem-resistant Acinetobacter sp in a regional hospital in Taiwan", Journal of Microbiology, Immunology and Infection, 44, pp.39-44 105 Mugnier PD., Poirel L., Naas T et al (2010), "Worldwide Dissemination of the blaOXA-23 Carbapenemase Gene of Acinetobacter baumannii", Emerging Infectious Diseases", 16, 1, pp.35-40 104 Mishra A., Mishra S., Jaganath G et al (1998), "Acinetobacter Sepsis In 105 Mugnier PD, Poirel L, Naas T, et al (2010) "Worldwide Dissemination of the blaOXA-23 Carbapenemase Gene of Acinetobacter baumannii" Emerging Infectious Diseases" 16, 1, pp.35-40 106 Nabil Karah (2011), Identification, molecular epidemiology, and antibiotic resistance characterization of Acinetobacter Philosophiae Doctor, University of Tromso, spp clinical isolates, 107 Naomi Runnegar, Hanna Sidjabat et al (2010), "Molecular Epidemiology of Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii in a Single Institution over a 10-Year Period ", Journal of Clinical Microbiology, 48(11), pp 4051–4056 108 Nathan IS., Gary DZ., Adam ZB (2002), "Sepsis Syndromes" Rosen's Emergency Medicine - Concepts and Clinical Practice, Marx, 8th ed, pp.1957-1969 109 Nemec A., Křížová L., Maixnerová M et al (2009), "Emergence of carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii in the Czech Republic is associated with the spread of multidrugresistant strains of European clone II", J Antimicrob Chemother, 62, pp.484-489 110 Neviere R., Parsons P., Wilson K (2013), Sepsis and the systemic inflammatory response syndrome: Definitions, epidemiology, and prognosis, UptoDate, http://www.uptodate.com, Acceess on Nov 2013 111 Niumsup PR., Boonkerd N., Tansawai U et al (2009), "Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Producing OXA-23 in Thailand", Jpn.Infect.Dis, 62, pp.152-154 112 Park SY., Choo JW., Kwon SH et al (2013), "Risk Factors for Mortality in Patients with Acinetobacter baumannii Bacteremia", Infect Chemother, 45 (3), pp.325-330 113 Peleg AY., Hooper DC (2010), "Hospital-Acquired Infections Due to GramNegative Bacteria", N Engl J Med, 362, pp.1804-1813 114 Peleg AY., Seifert H., Paterson DL (2008), "Acinetobacter baumannii: Emergence of a Successful Pathogen", Clinical Microbiology Reviews, 21 (3), pp.538-582 115 Perez F., Hujer AM., Hujer KM (2007), "Global Challenge of MultidrugResistant Acinetobacter baumannii", Antimicrobiol Agents and Chemotherapy American Society for Microbiology, 51 (10), pp 3471-3484 116 Pierre EF and Herve´ Richet (2006), "The Epidemiology and Control of Acinetobacter baumannii in Health Care Facilities", Clinical Infectious Diseases, 42, pp.692-9 117 Pilar V., Sylvia V., Maria JMP et al (2011), "Clonal diversity of nosocomial epidemic Acinetobacter baumannii strains isolated in spain ", Journal of clinical microbiology, 49 (3), pp.875 -882 118 Pongpech P., Amornnopparattanakul S., Panapakdee S et al (2010), "Antibacterial Activity of Carbapenem-Based Combinations Againts Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii", J Med Assoc Thai, 93, pp.166-169 119 Prashanth K., Vasanth T, Saranathan R (2012), Antibiotic Resistance, Biofilms and Quorum Sensing in Acinetobacter Species, Antibiotic Resistant Bacteria – A Continuous Challenge in the New Millennium, www.intechopen.com, Acceess on 15 Feb 2012 120 Phillip D., Mitchell ML., Andrew R et al (2013), "Surviving Sepsis Campaign: International Guidelines for Management of Severe Sepsis and Septic Shock: 2012", Critical Care Medicine and Intensive Care Medicine, 41(2), pp.580-637 121 Raka L., Kalenc S., Budimir A et al (2009), "Molecular Epidemiology of Acinetobacter baumannii in Central Intensive Care Unit in Kosova Teaching Hospital", The Brazilian Journal of Infectious Diseases, 13 (6), pp.408-413 122 Robenshtok E., Paul M., Leibovici L et al (2006), "The significance of Acinetobacter baumannii bacteraemia compared with Klebsiella pneumoniae bacteraemia: risk factors and outcomes", J Hosp Infect, 64 (3), pp.282-287 123 Rohini JM., Gee YS et al (2003), "Endemic carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in a London hospital", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 52, pp.141-142 124 Seifert H., Strate A., Pulverer G (1995), "Nosocomial Bacteremia due to Acinetobacter baumannii: Clinical Features, Epidemiology, and Predictors of Mortality" Medicine, Instutude of Medical Microbiology and Hygiene, University of Cologne,Germany, 74 (6), pp.340-349 125 Seifert H., Dolzani L., Bressan R et al (2005), "Standardization and interlaboratory reproducibility assessment of pulsed-field gel electrophoresis-generated fingerprints of acinetobacter baumannii, consensus protocol for pfge typing of A Baumannii ", J Clin.microbiol, 9(43), pp.4328-4335 126 Senkyrikova M., Husickova V., Chroma M (2013), "Acinetobacter baumannii producing OXA-23 detected in the Czech Republic" SpringerPlus, 2, pp.296 127 Shahin J., Harrison DA., Rowan KM (2012), "Relation between volume and outcome for patients with severe sepsis in United Kingdom: retrospective cohort study", BMJ 342, pp.3-13 128 Singh A., Goering RV., Simjee S et al (2006), "Application of Molecular Techniques to the Study of Hospital Infection", Clinical Microbiology Reviews, 19 (3), pp.512-530 129 Siširak Hukić (2012), "Acinetobacter baumannii as a cause of sepsis", Med Glas 9(2), pp.311-316 130 Souha S., Kanj ZA (2012), Epidemiology, microbiology and pathogenesis of Acinetobacter, http://www.uptodate.com, Acceess on Nov 2014 131 Stilianos Katsaragakis, Haridimos Markogiannakis, Eleni Samara (2010), "Predictors of mortality of Acinetobacter baumannii infections: A 2-year prospective study in a Greek surgical intensive care unit", Am J Infect Control, 38, pp.631-635 132 Tatsuya Tada, Tohru Miyoshi-Akiyama, Yasuyuki Kato (2013), "Emergence of 16S rRNA methylase-producing Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa isolates in hospitals in Vietnam", BMC Infectious Diseases, 13, pp.251 133 Tenover (2006), "Mechanisms of Antimicrobial Resistance in Bacteria", The American Journal of Medicine, 119 (6), pp.s3-s10 134 Tseng YC., Wang JT., Wu FLL et al (2007), "Prognosis of adult patients with bacteremia caused by extensively resistant Acinetobacter baumannii", Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 59, pp.181-190 135 Thamarai Schneiders, Jacqueline Findlay et al (2008), "Efflux Pumps in Acinetobacter baumannii, Acinetobacter Biology and Pathogenesis", Springer.com, pp.105 - 128 136 Ulrike Gerischer (2008), Acinetobacter Mocular Biological, International Microbiology Caister Academic Press Norfolk UK, pp.147-150 137 Valentine SC., Contreras D., Tan S., Real LJ (2008), "Phenotypic and Molecular Characterization of Acinetobacter baumannii Clinical Isolates from Nosocomial Outbreaks in Los Angeles County, California", Ournal Of Clinical Microbiology, 46 (8), pp 2499-2507 138 Villalon P., Valdezate S., Medina-Pascual MJ et al (2011), "Clonal diversity of nosocomial epidemic Acinetobacter baumannii strains isolated in spain ", Journal of clinical microbiology, 49 (3), pp.875 -882 139 Vincent JL., Sakr Y., Charles LS et al (2006), "Sepsis in European intensive care units: Results of the SOAP study", Crit Care Med 34, pp 344-353 140 Wang H., Guo P., Sun H., Wang H (2007), "Molecular Epidemiology of Clinical Isolates of Carbapenem-Resistant Acinetobacter spp from Chinese Hospitals", Antimicrobial Agents And Chemotherapy, 51 (11), pp 4022-4028 141 Wisplinghoff H., Edmond MB., Pfaller MA et al (2000), "Nosocomial Bloodstream Infections Caused by Acinetobacter Species in United States Hospitals: Clinical Features, Molecular Epidemiology, and Antimicrobial Susceptibility", Clinical Infectious Diseases, 31, pp.690-697 142 Wisplinghoff H., Bischoff T., Tallent SM et al (2004), "Nosocomial Bloodstream Infections in US Hospitals: Analysis of 24,179 Cases from a Prospective Nationwide Surveillance Study", Clinical Infectious Diseases 39, pp.309-17 143 Wisplinghoff PW., Seifert H (1999), "Risk Factors for Nosocomial Bloodstream Infections Due to Acinetobacter baumannii: A Case-Control Study of Adult Burn Patients" Clincal Infectious Diseases, 28, pp.59-66 144 Woodford N., Ellington MJ., Coelho JM et al (2006), "Multiplex PCR for genes encoding prevalent OXA carbapenemases in Acinetobacter spp", Int J Antimicrob Agents Apr;:, 27(4), pp.351-3 145 Yang HY., Lee HJ., Suh JT et al (2009), "Outbreaks of Imipenem Resistant Acinetobacter Baumannii Producing OXA-23 β-Lactamase in a Tertiary Care Hospital in Korea", Yonsei Med J, 50 (6), pp.764-770 146 Yang YS., Lee YT., Tsai WC et al (2013), "Comparison between bacteremia caused by carbapenem resistant Acinetobacter baumannii and Acinetobacter nosocomialis", BMC Infectious Diseases 13, pp.311-317 Phụ lục CÁC CƠNG TRÌNH NGHIÊN CỨU KHOA HỌC CÓ LIÊN QUAN ĐẾN ĐỀ TÀI CỦA TÁC GIẢ Nguyễn Thị Thanh Hà, Phan Quốc Hoàn, Nguyễn Trọng Chính (2012), “ Tình hình kháng kháng sinh Acinetobacter baumannii bệnh viện Việt Nam”, Tạp chí Y Dược Lâm Sàng 108, tập 7, số 4, tr 108 – 113 Nguyễn Thị Thanh Hà, Trần Huy Hồng, Nguyễn Trọng Chính, Phan Quốc Hồn (2013), “Phát gen Oxacillinase kháng Carbapenem Acinetobacter baumannii phân lập bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết Việt Nam”, Tạp chí Y Dược Lâm Sàng 108, tập 8, số 4, tr 87 - 93 Nguyễn Thị Thanh Hà, Đỗ Quốc Huy, Phan Quốc Hồn, Nguyễn Trọng Chính (2014), “Đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng, cận lâm sàng nhiễm khuẩn huyết Acinetobacter baumannii bệnh viện Việt Nam”, Y Học Thực Hành Bộ Y Tế, số 904, tr 17-26 Phụ lục PHIẾU THU THẬP DỮ LIỆU BỆNH VIỆN……………………… HÀNH CHÍNH Họ tên: Mã hồ sơ: Tuổi: Giới : Nam, Nữ Nghề nghiệp: Địa nơi cư trú: Nơi chuyển bệnh Tự đến Chuyển viện Ngày nhập viện Khoa điều trị Ngày xuất THƠNG TIN LIÊN QUAN Chẩn đốn lúc nhập viện: Chẩn đoán lúc cấy máu (+): Chẩn đoán lúc xuất viện: Tình trạng lúc nhập viện: Có nhiễm trùng lúc nhập ☐,Loại NT: Bệnh mạn tính lúc nhập viện ☐,Loại bệnh: Thuốc UCMD dùng ☐,Loại thuốc: TS ngày: KS dùng trước nhập viện ☐,Loại KS: TS ngày: KS dùng nhập viện ☐,loại KS: TS ngày: KS dùng cấy máu dương tính ☐,Loại KS: TS ngày: PT thủ thuật sử dụng BN Catherter mạch ngoại biên ☐,TS ngày: Mở khí quản ☐,TS ngày: Catherter mạch trung tâm ☐,TS ngày: Thận nhân tạo ☐,TS ngày: Ống thông tiểu ☐,TS ngày: Lọc máu ☐,TS ngày: Thở máy ☐,TS ngày: Phẫu thuật ☐,TS ngày: Cấy Aci (+) Có sốc Tình trạng thời gian nằm viện Dấu hiệu Ngày Lúc nhập viện Glassgow Mạch (lần/phút) Tính chất mạch Huyết áp tối đa/tối thiểu (mmHg) Nhiệt độ ( oC) Tính chất sốt Tần số thở (lần/phút) Tính chất kiểu thở Biểu bệnh quan khác Trên da Cơ, xương, khớp Hơ hấp Tiêu hố Khác Dấu hiệu cận lâm sàng Dấu hiệu Lúc nhập viện Ngày Huyết học Bạch cầu (WBC) Tỷ lệ BC đa nhân trung tính (NEUT) Hồng cầu (RBC) HGB (Hemoglobin) HCT (Hematocrit) PLT (Tiểu cầu) Đông máu Đông máu TP TP% APTT INR FIB D-limer Sinh hoá máu Na+ K+ Cl- Cấy Aci (+) Có sốc Calci-ion hố Glucose Lactate CRP BUN Urê Creatinine Proteine Albumine SGOT SGPT Bilirubin TP Bilirubin TT Bilirubin GT Khí máu động mạch pH FiO2 PCO2 PO2 HCO3 BE TCO2 Sinh hoá nước tiểu Lượng nước tiểu/g pH SG Glucose Protein Blood Leukocyte X-Quang Tim Phổi Khác Siêu âm Tim Phổi Khác KẾT QUẢ VI SINH (Nhạy: S; Kháng: R; Trung gian: I) KẾT QUẢ MÁU KQ ………… …………… Ngày cấy Ngày trả KQ Đề kháng KS Đề kháng KS Đề kháng KS Cefotaxim Cefotaxim Cefotaxim Ceftazidin Ceftazidin Ceftazidin Cefoperazon Cefoperazon Cefoperazon Cefepim Cefepim Cefepim Ciprofloxacin Ciprofloxacin Ciprofloxacin Amikacin Amikacin Amikacin Amox/clav Amox/clav Amox/clav Amp/Sulbactam Amp/Sulbactam Amp/Sulbactam Gentamycin Gentamycin Gentamycin Ceftriaxon Ceftriaxon Ceftriaxon Clindamycin Clindamycin Clindamycin Colistin Colistin Colistin Imipenem Imipenem Imipenem Meropenem Meropenem Meropenem Ticarcillin Ticarcillin Ticarcillin Vancomycin Vancomycin Vancomycin HIỆU QUẢ ĐIỀU TRỊ Kết điều trị Kết Còn sống Tử vong Người kiểm tra Người thực Phụ lục PHIẾU ĐÁNH GIÁ TÌNH TRẠNG BỆNH NHÂN APACHE II :…………………… điểm RLCNCQ Hơn mê: ☐ có ☐ khơng Nếu có, ngày bắt đầu: RLCN Tuần hoàn: ☐ có ☐ khơng Nếu có, ngày bắt đầu: ☐ Nhịp tim ≤ 54 l/ph > 100 l/ph ☐ Huyết áp tâm thu ≤ 70 mmHg ☐ Nhịp tim nhanh, rung thất ☐ pH máu ≤ 7,24 với PO2 ≤ 40 mmHg RLCN Hơ hấp ☐ có ☐ khơng Nếu có, ngày bắt đầu: ☐ Nhịp thở ≥ 49 l/ph < 10 l/ph ☐ PCO2 ≥ 50 mmHg ☐ Phụ thuộc máy thở CPAP ☐ PO2 ≤ 60 mmHg RLCN Thận ☐ có ☐ khơng Nếu có, ngày bắt đầu: ☐ Nước tiểu ≥ 400 ml/24 ☐ BUN ≥ 30 mg% ☐ Creatine ≥ 1mg% ☐ Chạy thận, lọc máu RLCN Huyết học ☐ có ☐ khơng Nếu có, ngày bắt đầu: ☐ BC ≤ 4000 (N ≤ 500) ☐ TC ≥ 50 000 ☐ HC ≤ 000 000 (Hb ≤ 10g%) ☐ XH da, niêm mạc tự nhiên RLCN Gan ☐ có ☐ khơng Nếu có, ngày bắt đầu: ☐ ASAT, ALAT ≥ bình thường ☐ PTT dài ☐ Bilirubin máu ≥ 2mg% ☐ Albumine máu ≤ g% SIRS ☐ có ☐ khơng Nếu có, ngày bắt đầu: ☐ Sốt > 38oC < 36oC ☐ Nhịp thở > 20l/ph ☐ BC > 1200 < 4000/mm3 ☐ Nhịp tim > 90 l/ph Đường vào: Bệnh chính: