ỨNG DỤNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN ĐỊNH DANH NẤM ĐƯỜNG SINH SẢN Ở PHỤ NỮ TRONG ĐỘ TUỔI SINH ĐẺ (18 - 49 TUỔI) ĐÃ CÓ CHỒNG TẠI THỊ XÃ QUẢNG YÊN TỈNH QUẢNG NINH (2013 - 2014)

11 426 0
ỨNG DỤNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN ĐỊNH DANH NẤM ĐƯỜNG SINH SẢN Ở PHỤ NỮ TRONG ĐỘ TUỔI SINH ĐẺ (18 - 49 TUỔI) ĐÃ CÓ CHỒNG TẠI THỊ XÃ QUẢNG YÊN TỈNH QUẢNG NINH (2013 - 2014)

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 ỨNG DỤNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN ĐỊNH DANH NẤM ĐƢỜNG SINH SẢN Ở PHỤ NỮ TRONG ĐỘ TUỔI SINH ĐẺ (18 - 49 TUỔI) ĐÃ CÓ CHỒNG TẠI THỊ XÃ QUẢNG YÊN TỈNH QUẢNG NINH (2013 - 2014) Cao Bá Lợi*; Vũ Quyết Thắng* CS TÓM TẮT 398 phụ nữ độ tuổi sinh đẻ (18 - 49 tuổi) có chồng thị xã Quảng Yên, tỉnh Quảng Ninh khám sản khoa lấy mẫu xét nghiệm dịch âm đạo tìm ký sinh trùng Kết quả: 116 phụ nữ nhiễm Candida sp phương pháp nuôi cấy môi trường Sabouraud, sau đó, phụ nữ xét nghiệm kỹ thuật PCR với gen mồi ITS1 ITS4 sử dụng enzym phân cắt hạn chế Msp I để định danh loài nấm, kết quả: 95/106 (89,6%) mẫu cho kết (+) Lựa chọn 95 mẫu tiến hành gel, 51 mẫu cho kết băng, tiến hành gel băng ADN riêng rẽ thu băng để giải trình tự Truy cập Ngân hàng Gen phân tích giám định loài 51 chuỗi gen cho thấy: 27 mẫu C glabrata, 15 mẫu C albicans, mẫu C tropical, mẫu C parapsilosis, mẫu C krusei * Từ khóa: Nấm đường sinh sản; PCR; Phụ nữ độ tuổi sinh đẻ; Quảng Ninh Application of PCR and Electrophoresis Gel Sequencing for Quantification of Vaginal Candidiasis in 398 Married Women at Reproductive Age (18 - 49) in Quangyen, Quangninh (2013 - 2014) Summary The research was conducted in Quangyen, Quangninh provice on 398 married women at reproductive age (18 - 49) Obstetric examination was carried out, vaginal samples were examined by Gram staining and cultured in Sabouraud medium for yeart gentital tract The result showed that 116 samples infected with Candida spp 106/116 samples were tested using PCR at Vietnam Institute of Biotechnology with ITS - ITS4 target gene resulting in 95/106 (89.6%) positive samples Selection of 51 samples in total of 95 positive samples were subjected to gel purifiel DNA from electrophoresis gel sequencing PCR product made saparated bands, it was purified seperately * Viện Sốt rột - Ký sinh trựng Côn trùng TW Người phản hồi (Corresponding): Cao Bá Lợi (saudaihocvsr2008@gmail.com) Ngày nhận bài: 09/10/2014; Ngày phản biện đánh giá báo: 20/11/2014 Ngày báo đăng: 26/11/2014 59 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 The order of the nucleotide sequence was handled by specialized software, with reference sequence in gene banks Results: 27 samples were as C glabrata, 15 samples purified as C albicans, samples as C tropical, samples known as C parapsilosis and and samples as C krusei * Key words: Vaginal candidiasis; PCR; Women at reproductive age; Quangninh province ĐẶT VẤN ĐỀ Tại Việt Nam, bệnh nhiễm trùng đường sinh sản (ĐSS) có xu hướng tăng cao nhiều nguyên nhân như: thói quen sinh hoạt vệ sinh, nguồn nước bị ô nhiễm, tệ mại dâm, tình trạng nạo phá thai không kiểm soát… dẫn đến tình trạng nhiễm trùng ĐSS, đặc biệt nhiễm nấm Candida sp ĐSS Vũ Đức Bình CS (2013) nghiên cứu phụ nữ 18 - 49 có chồng huyện Tam Nông, Phú Thọ kỹ thuật PCR giải trình tự gen nấm ký sinh ĐSS thấy: tỷ lệ nhiễm Candida sp ĐSS 30,5%, đó, Candida glabrata (C glabrata) chiếm 43,5%, Candida tropicalis (C tropicalis) 34,8%, Candida albicans (C albicans) 14,6%, Candida krusei (C krusei) 4,3% Candida parapsilosis (C parapsilosis) 2,8% [1, 2] Tại Quảng Ninh nói chung thị xã Quảng Yên nói riêng đến chưa có công trình nghiên cứu sâu đầy đủ tình trạng nhiễm nấm ĐSS phụ nữ độ tuổi sinh đẻ, yếu tố nguy nhiễm nấm ĐSS cao Với tính cấp thiết vấn đề để xác định tỷ lệ thành phần loài nấm ĐSS, thực nghiên cứu với mục tiêu: Ứng dụng kỹ thuật PCR giải trình tự gen xác định tỷ lệ, thành phần loài nấm ĐSS phụ nữ độ tuổi sinh đẻ (18 - 49 tuổi) 60 có chồng thị xã Quảng Yên, tỉnh Quảng Ninh ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Đối tƣợng, địa điểm thời gian nghiên cứu - Đối tượng nghiên cứu: phụ nữ độ tuổi sinh đẻ (18 - 49) có chồng, tình nguyện tham gia nghiên cứu - Địa điểm nghiên cứu: + Lấy mẫu bệnh phẩm thị xã Quảng Yên, tỉnh Quảng Ninh + Tiến hành kỹ thuật PCR giải trình tự gen nấm Phòng Miễn dịch học, Viện Công nghệ Sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học Việt Nam - Thời gian nghiên cứu từ - 2014 đến 10 - 2014 Phƣơng pháp nghiên cứu - Cỡ mẫu nghiên cứu: cỡ mẫu điều tra cắt ngang đánh giá tình trạng nhiễm nấm ĐSS 384, thực tế nghiên cứu 398 mẫu Thực kỹ thuật PCR giải trình tự gen 106/116 mẫu nấm - Thu thập bảo quản mẫu [3, 4]: gồm bệnh phẩm lấy từ dịch âm đạo đồ sau, sau đó, nuôi cấy môi trường Sabouraud có kháng sinh chloramphenicol, pH = 5,0 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 Các mẫu bệnh phẩm (+) với nấm Candida spp mẫu cho vào túi riêng biệt chuyển Phòng Miễn dịch học, Viện Công nghệ Sinh học Bảo quản ngăn mát (4 - 100C) (tủ lạnh thường) đến tiến hành tách ADN tổng số - Bổ sung 100 µl NaCl M, 100 µl CTAB/NaCl (4,1 g NaCl; 10 g CTAB; 100 ml nước), làm nóng đến 65oC, lắc xoáy đến toàn dịch chuyển sang màu trắng sữa ủ 65oC 10 phút Tiến hành tách ADN tổng số (ADN hỗn hợp tế bào nấm) theo quy trình sau: - Bổ sung 450 µl hỗn hợp chloroform/ isoamyl alcohol 24:1 lắc xoáy 10 giây Ly tâm 13.000 vòng/phút phút - Dùng que cấy (loop) lấy đầy tế bào nấm từ bề mặt ống nuôi cấy chuyển vào ống Eppendorf (dung tích 1,5 ml) - Chuyển dịch sang ống Eppendorf mới, bổ sung 450 µl isopropanol, ủ đá 10 phút - Bổ sung 400 µl đệm TE (500 µl Tris-HCl pH 6,8 M; 100 µl EDTA, pH8 0,5 M nước đến tổng số 50 ml) Ủ 800C 20 phút để giết tế bào nấm, sau hạ nhiệt độ xuống nhiệt độ phòng - Ly tâm 13.000 vòng/phút 15 phút; loại bỏ dịch Bổ sung 500 µl ethanol 70%, ly tâm 13.000 vòng/phút phút; loại bỏ dịch làm khô tủa Hòa tan tủa 50 µl dịch TE Bảo quản sản phẩm -20oC * Tách chiết ADN tổng số [3, 4]: - Bố sung 50 µl lysozyme nồng độ 10 mg/ml (35 mg lysozyme nước đến tổng số 3,5 ml) lắc xoáy (vortex), ủ 37oC - Bổ sung µl proteinase K nồng độ 10 mg/l 70 µl SDS 10% (1 g SDS ml nước), lắc xoáy nhẹ ủ 65oC 10 phút * Thiết kế mồi thực phản ứng PCR: Để thực xác định loài mẫu nấm, cặp mồi chung cho loài nấm ký hiệu ITS1/ITS4 [3, 4], thiết kế để thực phản ứng PCR vùng ITS (internal transcribed spacer) Bảng 1: Trình tự nucleotid chuỗi mồi thực PCR xác định loài nấm Candida spp ’ ’ ITS1 18S rRNA TCCGTAGGTGAACCTGCGG 19 ITS4 26S rRNA TCCTCCGCTTATTGATATGC 20 Khoảng 0.5 đến 0.9 kb (tùy loài nấm) vùng gen 18S rRNA-ITS15.8S rRNA-ITS2-28S rRNA Phản ứng PCR thực với cặp mồi, bao gồm mồi xuôi ITS1 mồi ngược ITS4 cho sản phẩm từ 500 - 900 bp, tùy loài Candida sp Thành phần phản ứng PCR sau: * Thành phần phản ứng PCR: PCR master mix (Fermentas): 12,5 µl; ITS1F (10 picomol/ul): µl; ITS4R (10 picomol/ul): µl; DMSO: 1,25 µl; ADN khuôn: µl; nước: 8,25 µl - Chu trình nhiệt thực PCR sau: 61 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 Bảng 2: Chu trình nhiệt thực PCR 95 C 5’ 95 C 30” 58 C 30” 1’ 72 C 35 72 C 5’ Nhiệt độ bảo quản sản phẩm 4C Sau thực phản ứng, kết PCR kiểm tra điện di sản phẩm thạch agarose 1%, hiệu điện U = 100 V 25 phút * Giải trình tự xử lý số liệu: Sản phẩm PCR sau kiểm tra tinh phương pháp gel (ADN elution) sử dụng kít AccuPrep™ Gel Purification Kit (Bioneer, Hàn Quốc) Nếu mẫu có băng ADN sản phẩm PCR, tiến hành gel băng ADN riêng rẽ thu băng để giải trình tự Sản phẩm PCR sau tinh giải trình tự trực tiếp, sử dụng mồi ITS1 Xử lý trình tự chuỗi nucleotid phần mềm chuyên biệt, bao gồm SeqEd1.03, AsemblyLIGNv1.9c hệ chương trình MacVector8.2 (Accelrys Inc) máy tính Macintosh So sánh đối chiếu xử lý số liệu chuỗi thu nhận Ngân hàng Gen (Genbank) chương trình GENEDOC2.7 So sánh trình tự nucleotid vùng ITS chủng nấm Candida spp thành phần nucleotid, xác định loài cách truy cập Ngân hàng Gen (BLAST: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/ Blast.cgi) xem xét mối quan hệ phả hệ nguồn gốc, sử dụng chương trình MEGA5.0 phương pháp “kết nối liền kề” 62 NJ (Neighbor-JoiningNJ) với hệ số tin tưởng 1.000 bootstrap [4] * Địa điểm thực hiện: Tiến hành giải trình tự gen xử lý số liệu Phòng Miễn dịch Phòng Thí nghiệm Trọng điểm, Viện Công nghệ Sinh học (Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam) KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN Kết tách chiết ADN tổng số từ mẫu nấm nuôi cấy Từ 106 mẫu nấm (phần lớn tập trung thuộc chi Candida spp.), sử dụng loại dung môi, hóa chất pha chế theo mô tả Kiểm tra ngẫu nhiên ADN tổng số số mẫu, kết cho thấy có hiển thị vệt sáng thạch agarose 1% nhuộm ethidium bromide, chứng tỏ mẫu tách chiết có ADN thu nhận từ hệ gen mẫu nấm nuôi cấy Từ kết tách chiết, sử dụng ADN tổng số mẫu sử dụng làm khuôn để thực PCR theo quy trình mô tả [3, 4] Kết sau: Bảng 3: Số lượng sản phẩm PCR ITS1 ITS4 trước sau cắt Msp I Candida sp 871 557,314 C glabrata 49 49,4 535 297,238 C albicans 27 27,3 524 340,184 C tropical 10 10,1 520 520,000 C parapsilosis 7,1 510 261,249 C krusei 6,1 99 100,0 Tổng TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 Bảng 4: Tổng hợp kết (+) với ITS1 ITS4 PCR Số mẫu (+) Tỷ lệ (%) Số mẫu (-) Tỷ lệ (%) Liên Vị (1) 35 29 82,9 17,1 Hoàng Tân (2) 47 44 93,6 6,4 Sông Khoai (3) 24 22 91,7 8,3 Chung 106 95 89,6 11 10,4 Giá trị p (1, 2, 3) < 0,05 89,6% phát nấm (+) kỹ thuật PCR với cặp mồi chung ITS1 ITS4 Có khác biệt tỷ lệ phát nấm xã Liên Vị, Hoàng Tân Sông Khoai tương ứng 82,9% so với 93,6% 91,7%, p < 0,05 Kết giải trình tự phân tích Có 106 mẫu tách chiết ADN tổng chuỗi gen giám định loài nấm gây số, thực PCR, kết 11 mẫu âm nhiễm tính không cho sản phẩm Tổng số thu * Một số nhận xét chung: Tất sản phẩm PCR thu nhóm, kể số sản phẩm thu hoạch 95 mẫu có sản phẩm PCR, đó, mẫu cho sản phẩm kép, gồm băng ADN (0.5 kb 0.9 kb) sau PCR lần 2, tinh thu đơn băng Hầu hết sản phẩm thæi gel mẫu ADN phương pháp gel (ADN giải trình tự trực tiếp Sau phân elution) Trường hợp đơn băng cắt tích, thu 51 chuỗi nucleotid đơn riêng băng ADN đó, trường hợp đa sử dụng để truy cập Ngân hàng Gen băng, cắt riêng băng thu phân tích giám định loài ADN tinh vào ống để đưa Một số sản phẩm PCR giải trình tự giải trình tự Sau giải trình tự, chuỗi cho chuỗi nucleotid lồng nhau, không nucleotid xử lý phân tích phần thể phân tích để thu chuỗi nucleotid riêng mềm chuyên biệt để có chuỗi cuối biệt Như vậy, kích thước, tiến hành truy cập Ngân hàng Gen sản phẩm ADN đa loài gây sử dụng chương trình BLAST (BLAST: nhiễm Với trường hợp này, cần tách dòng http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) Danh phân biệt để thu clon riêng giải sách mẫu, kết PCR, chuỗi gen giải trình tự trình tự, kết truy cập Ngân hàng Gen Kết truy cập Ngân hàng Gen chủ yếu liệt kê xác định loài số 51 mẫu truy cập, kết sau: xác định kết cuối thống kê bảng 63 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 - So sánh phân tích chuỗi gen ITS mẫu thuộc loài Candida albicans 20 40 60 Calb-IST(5 Calb-IST(5 M1-H1- 030 M2- H2-003 M-H2- 052 M-H2- 055 M-H3-064 M-S-061 M-S-072 M-S-130 M-S-150 M-S-161 M-L-Đông-107 M-L-Hàn-074 M-L-Bầu-044 M-L- Đình-121 M-L-Quán-198 : : : : : : : : : : : : : : : : : GTGTTTTTCTTTGAAACAAACTTGCTTTGGCGGTCCCAGCCTGCCGCCAGAGGTCTAAACTTACAACCAATTTTTTA Calb-IST(5 Calb-IST(5 M1-H1- 030 M2- H2-003 M-H2- 052 M-H2- 055 M-H3-064 M-S-061 M-S-072 M-S-130 M-S-150 M-S-161 M-L-Đông-107 M-L-Hàn-074 M-L-Bầu-044 M-L- Đình-121 M-L-Quán-198 : : : : : : : : : : : : : : : : : TCAACTTGTCACACCAGATTATTACT-AATAGTCAAAACTTTCAACAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAAC Calb-IST(5 Calb-IST(5 M1-H1- 030 M2- H2-003 M-H2- 052 M-H2- 055 M-H3-064 M-S-061 M-S-072 M-S-130 M-S-150 M-S-161 M-L-Đông-107 M-L-Hàn-074 M-L-Bầu-044: M-L- Đình-121 M-L-Quán-198 : : : : : : : : : : : : : : : : : GCAGCGAAATGCGATACGTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGT Calb-IST(5 Calb-IST(5 M1-H1- 030 M2- H2-003 M-H2- 052 M-H2- 055 M-H3-064 M-S-061 M-S-072 M-S-130 M-S-150 M-S-161 M-L-Đông-107 M-L-Hàn-074 M-L-Bầu-044 M-L- Đình-121 M-L-Quán-198 : : : : : : : : : : : : : : : : : ATTCCGGAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCGTTTCTCCCTCAAACCGCTGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGACTTGGGTTT 64 80 ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… 100 120 140 160 ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… 180 200 220 240 ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… 260 280 300 320 ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… ……………………………………………………………… …………………………… ……… : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 80 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 159 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 239 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 : 319 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 340 360 380 400 Calb-IST(5 Calb-IST(5 M1-H1- 030 M2- H2-003 M-H2- 052 M-H2- 055 M-H3-064 M-S-061 M-S-072 M-S-130 M-S-150 M-S-161 M-L-Đông-107 M-L-Hàn-074 M-L-Bầu-044 M-L- Đình-121 M-L-Quán-198 : : : : : : : : : : : : : : : : : GCTTGAAAGACGGTAGTGGTAAGGCGGGATCGCTTTGACAATGGCTTAGGTCTAACCAAAAACATTGCTTGCGGCGGTAA Calb-IST(5 Calb-IST(5 M1-H1- 030 M2- H2-003 M-H2- 052 M-H2- 055 M-H3-064 M-S-061 M-S-072 M-S-130 M-S-150 M-S-161 M-L-Đông-107 M-L-Hàn-074 M-L-Bầu-044 M-L- Đình-121 M-L-Quán-198 : : : : : : : : : : : : : : : : CGTCCACCACGTATATCTTCAAACTTT G ACCT CAAA TCAG GTAGGACTACC CGCTGAACTTAAG : 463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 ……………………………………………………………………………………………………………………………………:463 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 : 399 ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………………………… 420 : 440 460 Hình 1: So sánh trình tự nucleotid chuỗi gen ITS 15 chủng C albicans từ mẫu nghiên cứu với chủng C albicans giới Các chuỗi nucleotid 15 mẫu Candida sp nghiên cứu bao gồm H1-030, H2-003, H2-052, H2-055, H3-064, S-061, S-072, S-130, S-150, S-161, L-Đông-107, L-Hán-074, L-Bầu-044, L-Đình-121, L-Quán-198 xếp so sánh phân tích thành phần nucleotid với chuỗi C albicans thu thập từ Ngân hàng Gen C albicans (CalbITS(571bp)ATCC-JX094781 từ ATCC; Calb-ITS(540bp)ICB954-BR-JX463266 tõ Brazil) Các chủng cho tỷ lệ đồng đạt 99 - 100% Như vậy, truy cập Ngân hàng Gen, kết phân tích chuỗi gen khẳng định có 15 mẫu nấm gây nhiễm Việt Nam xác định C albicans - So sánh phân tích chuỗi gen ITS mẫu thuộc loài Candida glabrata: 20 Cglab-ITS( Cglab-ITS ( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7L-Hàn-086 M10LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17L-Quán18 65 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 40 60 80 100 TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAT AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAC TTTCTCTGCTGCGAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATACTTTCTCTGCTGC GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 : 104 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 120 140 160 180 200 Cglab-ITS( Cglab-ITS( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7-L-Hàn-086 M10-LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17-L-Quán18 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT Cglab-ITS( CglabITS( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7-L-Hàn-086 M10-LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17-L-Quán18 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC Cglab-ITS( CglabITS( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7-L-Hàn-086 M10-LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17-L-Quán18 : AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA ATAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT TTATTTAAA CTAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAAT AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT TTATTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC 220 420 66 260 280 300 CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA A GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG G AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA A GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA A GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC 320 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 240 340 440 360 460 380 480 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 208 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 312 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 : 311 400 500 520 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 415 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 414 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 : 411 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 Cglab-ITS( Cglab-ITS( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7-L-Hàn-086 M10-LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17-L-Quán18 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAAAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCATTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT Cglab-ITS( Cglab-ITS( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7-L-Hàn-086 M10-LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17-L-Quán18 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACA CGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACATTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA Cglab-ITS( CglabITS( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7-L-Hàn-086 M10-LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17-L-Quán18 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG Cglab-ITS( Cglab-ITS( M3-H1-052 M4-H1-053 M8-H2-008 M9-H2-019 M15-H2-062 M20-H3-070 M1-H3-016 M6-H3-042 M7-H3-046 M16-H3-069 M18-H3-073 M21-H3-082 M22-H3-083 M2-S-007 M8-S-082 M10-S-096 M15-S-122 M16-S-124 M3-L-Đông171 M4-L-Đông195 M5-L-Hàn-073 M7-L-Hàn-086 M10-LBầu-072 M12-LĐình-114 M19-LQuán-003 M16-L-Bầu-54 M17-L-Quán18 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG 540 640 560 660 480 680 600 620 700 760 780 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 623 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 622 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 : 619 720 TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG 740 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 519 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 518 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 : 515 800 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 727 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 726 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 : 723 820 : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : : 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 820 Hình 2: So sánh trình tự nucleotid chuỗi gen ITS 27 chủng C glabrata (Việt Nam) với chủng C glabrata giới 67 TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 Các chủng cho tỷ lệ đồng đạt cao (98 - 100%) Xác định chuỗi nucleotid 27 mẫu Candida sp Việt Nam C glabrata, xếp so sánh phân tích thành phần nucleotid với chuỗi C glabrata thu thập từ Ngân hàng Gen C glabrata (Cglab-ITS(886bp)-KW-FN652301 từ Cô-oét Cglab-ITS (905bp)-GR-KC253980 từ Hy Lạp) Ngoài sai khác mang tính chất đơn lẻ nucleotid, chủng mẫu nghiên cứu (các chủng H3-083 L-Hàn-073) có sai khác đặc biệt đến nucleotid (TTA) đột biến điểm thêm vào nucleotid G T vị trí giải trình tự gen Như vậy, truy cập Ngân hàng Gen, kết phân tích chuỗi gen khẳng định 27 mẫu nấm gây nhiễm nghiên cứu xác định C glabrata - So sánh phân tích chuỗi gen ITS mẫu thuộc loài Candida tropicalis: 20 Ctrop-CN(5 : Ctrop-TW(4 : Ctrop-PK(5 : M11-H2-030 : M12-H3-061 : M9 - S-084 : M12- S-103 : M17- S-129 : M21- S-157 : 100 Ctrop-CN(5 : Ctrop-TW(4 : Ctrop-PK(5 : M11-H2-030 : M12-H3-061 : M9 - S-084 : M12- S-103 : M17- S-129 : M21- S-157 : Ctrop-CN(5 : Ctrop-TW(4 : Ctrop-PK(5 : M11-H2-030 : M12-H3-061 : M9 - S-084 : M12- S-103 : M17- S-129 : M21- S-157 : 80 120 140 160 220 240 260 180 :194 :192 :193 :193 :193 :193 :193 :193 :193 :193 :193 280 :291 :289 :290 :290 :290 :290 :290 :290 :290 :290 :290 300 320 340 360 380 TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA :388 :385 :387 :387 :387 :387 :387 :387 :387 :387 :387 420 440 460 AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AA - CGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT : : : : : : : : : : : 474 470 473 473 473 473 473 473 473 473 473 Hình.3: So sánh trình tự nucleotid chuỗi gen ITS chủng C tropicalis mẫu nghiên cứu với chủng C tropicalis giới 68 :97 :95 :96 :96 :96 :96 :96 :96 :96 :96 :96 GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC 400 Ctrop-CN(5 : Ctrop-TW(4 : Ctrop-PK(5 : M11-H2-030 : M12-H3-061 :M9 - S-084 : M12- S-103 : M17- S-129 : M21- S-157 : 60 TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC 200 Ctrop-CN(5 : Ctrop-TW(4 : Ctrop-PK(5 : M11-H2-030 : M12-H3-061 : M9 - S-084 : M12- S-103 : M17- S-129 : M21- S-157 : 40 TGCTTAATTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT - GCTTA - TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014 Các chủng cho tỷ lệ đồng cao, gần tuyệt đối (99 - 100%) Đã xác định chuỗi nucleotid mẫu Candida sp C tropicalis xếp so sánh phân tích thành phần nucleotid với chuỗi C tropicalis thu thập từ Ngân hàng Gen C tropicalis (Ctrop - CN(533 bp) - FJ662410) từ Trung Quốc; Ctrop - TW(498bp) AB467290 từ Đài Loan (Ctrop - PK(548bp) JN159660 từ Pakistan) Truy cập Ngân hàng Gen phân tích 51 chuỗi gen cho thấy: 27 mẫu C glabrata, 15 mẫu C albicans, mẫu C tropical, mẫu C parapsilosis, mẫu C krusei Như vậy, kết phân tích chuỗi gen khẳng định mẫu nấm gây nhiễm mẫu nghiên cứu xác định C tropicalis Bộ Y tế Hướng dẫn chuẩn Quốc gia về dịch vụ chăm sóc sức khỏe sinh sản Nhà Xuất Y học Hà Nội 2003,tr.126-144 KẾT LUẬN Nghiên cứu định danh nấm ĐSS kỹ thuật PCR giải trình tự gen 106 mẫu bệnh phẩm nấm sau nuôi cấy, kết cho thấy: tổng số 106 mẫu tách chiết ADN, thực PCR Kết có 11 mẫu âm tính không cho sản phẩm, 95 mẫu có sản phẩm PCR, đó, mẫu cho sản phẩm kép, gồm băng ADN (0,5 kb 0,9 kb) Khi tiến hành thæi gel, 51 chuỗi nucleotid đơn sử dụng để truy cập Ngân hàng Gen phân tích giám định loài 69 Kết PCR phân tích chuỗi gen cho thấy tượng nhiễm loài nấm cá thể xuất sản phẩm đa băng ADN (khoảng 0,5 kb 0,9 kb) chuỗi nucleotid lồng giải trình tự TÀI LIỆU THAM KHẢO Vũ Đức Bình, Cao Bá Lợi CS Ứng dụng kỹ thuật PCR định danh nấm đường sinh sản phụ nữ tuổi 18 - 49 có chồng huyện Tam Nông, tỉnh Phú Thọ 2011 - 2012 Tạp chí Phòng chống bệnh sốt rét bệnh ký sinh trùng Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng TW 2013, số 2, tr.3-12 Wei Y P Feng J, Lou Z C et al Isolation and genotyping of vaginal non-albicans Candida spp in women from two different ethic groups in Lanzhou China, Int Juonal Gynaecol Obste 2010, Vol 110 (3), pp.227-230 Tamura K et al MEGA moleculer evolutionary genetics analysis using maximum Likeli - Hood, evolutionary distance and maximum parsimony methods Mol Biology 2011, Vol 28, pp.2731-2739

Ngày đăng: 11/10/2016, 23:49

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan