phân loại và quan hệ di truyền nhóm ếch cây xanh rhacophorus (amphibia rhacophoridae) ở việt nam

86 436 1
phân loại và quan hệ di truyền nhóm ếch cây xanh rhacophorus (amphibia rhacophoridae) ở việt nam

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT NGUYỄN THIÊN TẠO PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH RHACOPHORUS (AMPHIBIA: RHACOPHORIDAE) Ở VIỆT NAM LUẬN VĂN THẠC SỸ SINH HỌC HÀ NỘI - 2010 Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT NGUYỄN THIÊN TẠO PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH RHACOPHORUS (AMPHIBIA: RHACOPHORIDAE) Ở VIỆT NAM Chuyên nghành: Động vật học Mã số: 60 42 10 LUẬN VĂN THẠC SỸ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS. ĐẶNG TẤT THẾ HÀ NỘI - 2010 Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cảm ơn TS. Đặng Tất Thế (Viện Sinh thái và Tài nguyên sinh vật) đã trực tiếp hướng dẫn và giúp đỡ tôi trong suốt quá trình thực hiện đề tài nghiên cứu và hoàn thiện luận văn. Tôi xin trân trọng cảm ơn Lãnh đạo Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam, Phòng Sinh học, bạn bè và đồng nghiệp đã động viên và giúp đỡ trong quá trình hoàn thiện luận văn này. Xin cảm ơn sự giúp đỡ và hợp tác hiệu quả của các đồng nghiệp ở Viện Sinh thái và Tài nguyên sinh vật; Khoa Sinh học, Đại học Khoa học tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội; Viện Động vật St. Petersburg, Liên bang Nga; Bảo tàng Leiden, Hà Lan; Vườn thú Cologne, Cộng hòa Liên bang Đức. Xin cảm ơn gia đình đã ủng hộ và động viên tôi trong suốt quá trình học tập và nghiên cứu. Đề tài nghiên cứu này nhận được sự hỗ trợ kinh phí của Quỹ Học bổng Nagao – Trung tâm Nghiên cứu Tài nguyên Môi trường (CRES); Quỹ Bảo tồn Việt Nam (VCF); Chương trình Hỗ trợ dự án nhỏ (NEF) của Quỹ Nagao, Nhật Bản; Quỹ Hỗ trợ trang thiết bị nghiên cứu IdeaWild và Hội Địa lý Quốc gia Hoa Kỳ (National Geographic Society). Hà Nội, ngày 20 tháng 12 năm 2010 Học viên Nguyễn Thiên Tạo Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan các số liệu, kết quả sử dụng trong luận văn này là do tôi thu thập và phân tích. Đồng thời, luận văn này chưa từng được bảo vệ trước bất cứ một hội đồng nào khác trước đây. Hà Nội, ngày tháng năm 2010. Nguyễn Thiên Tạo NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 1 THUẬT NGỮ VIẾT TẮT TRONG LUẬN VĂN BMNH Bảo tàng Lịch sử tự nhiên Anh, Luân Đôn. IEBR Viện Sinh thái và Tài nguyên sinh vật, Hà Nội. KBTTN Khu Bảo tồn thiên nhiên. MNHN Bảo tàng Lịch sử tự nhiên Quốc gia Pháp, Paris. MSNG Bảo tàng Lịch sử tự nhiên Genoa, I-ta-li-a. VNMN Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam, Hà Nội. VNUH Bảo tàng Động vật, Trƣờng Đại học Khoa học tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội. VQG Vƣờn Quốc gia. ZISP Viện Động vật Xanh Pê-tec-bua, Viện Hàn lâm Khoa học Liên bang Nga. ZMH Viện nghiên cứu và Bảo tàng Động vật, Đại học Ham-buốc, Cộng hòa Liên bang Đức. ZRC Bảo tàng Nghiên cứu Đa dạng sinh học Raffles, Đại học Quốc gia Sing-ga-po. NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 2 DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng II.1. Danh sách và thông tin về mẫu vật nghiên cứu. Bảng II.2. Thành phần hỗn hợp PCR. Bảng II.3. Chu trình nhiệt PCR. Bảng III.1. Số đo mẫu vật loài Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus chuyangsinensis. Bảng III.2. Số đo mẫu vật loài Ếch cây xanh đốm Rhacophorus dennysi. Bảng III.3. Số đo mẫu vật loài Ếch cây phê Rhacophorus feae. Bảng III.4. Số đo các mẫu vật loài Ếch cây ki-ô Rhacophorus kio. Bảng III.5. Số đo mẫu vật loài Ếch cây lớn Rhacophorus maximus. Bảng III.6. So sánh các đặc điểm hình thái chính 5 loài ếch cây xanh giống Rhacophorus ở Việt Nam. Bảng III.7. Khoảng cách di truyền giữa các mẫu nghiên cứu trên đoạn gen 16S rRNA. Bảng III.8. Khoảng cách di truyền giữa các mẫu vật nghiên cứu trên đoạn gen Cytochromeb. NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 3 DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1. Bản đồ điểm nóng đa dạng sinh học Đông dƣơng – Mi-an-ma. Hình II.1. Bản đồ các địa điểm khảo sát thực địa. Hình III.1. Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus chuyangsinensis thu tại Chƣ Yang Sin, Đắk Lắk. Hình III.2. Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus chuyangsinensis thu tại Hòn Bà, Khánh Hoà. Hình III.3. Bản đồ phân bố loài Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus chuyangsinensis. Hình III.4. Ếch cây xanh đốm Rhacophorus dennysi thu tại Tam Đảo, Vĩnh Phúc. Hình III.5. Bản đồ phân bố loài Ếch cây xanh đốm Rhacophorus dennysi ở Việt Nam. Hình III.6. Ếch cây phê Rhacophorus feae. Hình III.7. Bản đồ phân bố loài Ếch cây phê Rhacophorus feae ở Việt Nam. Hình III.8. Ếch cây ki-ô Rhacophorus kio thu tại Nguyên Bình, Cao Bằng và tại Kon Plông, Kon Tum. Hình III.9. Bản đồ phân bố loài Ếch cây ki-ô Rhacophorus kio ở Việt Nam. Hình III.10. Ếch cây lớn Rhacophorus maximus thu tại Sơn Động, Bắc Giang. Hình III.11. Bản đồ phân bố loài Ếch cây lớn Rhacophorus maximus ở Việt Nam. Hình III.12. Đối chiếu trình tự nucleotide và axit amin từ các mẫu nghiên cứu trên gen 16S rRNA. Hình III.13. Cây phát sinh chủng loại NJ (Neighbor Joining). Hình III.14. Cây phát sinh chủng loại MP (Maximum Parsimony). Hình III.15. Đối chiếu trình tự nucleotide và axit amin từ các mẫu nghiên cứu trên gen Cytochromeb. Hình III.16. Cây phát sinh chủng loại NJ (Neighbor Joining). NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 4 Hình III.17. Cây phát sinh chủng loại MP (Maximum Parsimony), Hình III.18. Sinh cảnh loài Ếch cây chƣ yang sin ở Hòn Bà, Khánh Hoà. Hình III.19. Sinh cảnh loài Ếch cây xanh đốm ở Nguyên Bình, Cao Bằng. Hình III.20. Sinh cảnh loài Ếch cây phê ở Chƣ Yang Sin, Đắk Lắk. Hình III.21. Sinh cảnh loài Ếch cây ki-ô ở Kon Plông, Kon Tum. Hình III.22. Sinh cảnh loài Ếch cây lớn ở Sơn Động, Bắc Giang. NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 5 MỤC LỤC THUẬT NGỮ VIẾT TẮT TRONG LUẬN VĂN 1 DANH MỤC CÁC BẢNG 2 DANH MỤC CÁC HÌNH 3 MỤC LỤC 5 MỞ ĐẦU 7 CHƢƠNG I. TỔNG QUAN VỀ VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 10 I.1. Các nghiên cứu về phân loại nhóm ếch cây xanh 10 I.2. Các nghiên cứu về quan hệ di truyền của nhóm ếch cây xanh 13 I.3. Các nghiên cứu về sinh thái học của nhóm ếch cây xanh 14 CHƢƠNG II. THỜI GIAN, ĐỊA ĐIỂM, VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 15 II.1. Thời gian, địa điểm nghiên cứu 15 II.2. Thu thập và xử lý mẫu vật 15 II.3. Phƣơng pháp nghiên cứu 17 II.3.1. Phân tích mối quan hệ di truyền 17 II.3.1.1. Gen nghiên cứu 17 II.3.1.2. Thiết kế mồi PCR 18 II.3.1.3. Tách chiết DNA tổng số 18 II.3.1.4. Nhân bản đoạn DNA đích bằng kỹ thuật PCR 18 II.3.1.5. Giải mã và phân tích trình tự DNA 20 II.3.1.6. Phân tích số liệu 20 II.3.2. Đặc điểm hình thái 21 CHƢƠNG III. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 23 III.1. Phân loại nhóm ếch cây xanh giống Rhacophorus 23 III.1.1. Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus chuyangsinensis Orlov, Nguyen & Ho, 2008 23 III.1.2. Ếch cây xanh đốm Rhacophorus dennysi Blanford, 1881 29 III.1.3. Ếch cây phê Rhacophorus feae Boulenger, 1893 34 III.1.4. Ếch cây ki-ô Rhacophorus kio Ohler & Delorme, 2006 39 III.1.5. Ếch cây lớn Rhacophorus maximus Günther, 1858 44 NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 6 III.1.6. Khóa định loại 5 loài ếch cây xanh giống Rhacophorus ở Việt Nam 49 III.2. Quan hệ di truyền giữa các loài ếch cây xanh ở Việt Nam 50 III.2.1. Kết quả giải trình tự nucleotide trên gen 16S rRNA 50 III.2.1.1. Sai khác về mặt di truyền giữa các mẫu cùng loài 58 III.2.1.2. Khoảng cách di truyền giữa các loài 59 III.2.1.3. Xây dựng cây phát sinh chủng loại 59 III.2.2. Kết quả giải trình tự nucleotide trên gen Cytochromeb 61 III.2.2.1. Sai khác về mặt di truyền giữa các mẫu cùng loài 67 II.2.2.2. Khoảng cách di truyền giữa các loài 68 II.2.2.3. Xây dựng cây phát sinh chủng loại 68 III.3. Một số đặc điểm sinh học, sinh thái của các loài ếch cây xanh giống Rhacophorus ở Việt Nam 70 III.3.1. Loài Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus chuyangsinensis 71 III.3.2. Loài ếch cây xanh đốm Rhacophorus dennysi 71 III.3.3. Loài ếch cây phê Rhacophorus feae 73 III.3.4. Loài ếch cây ki ô Rhacophorus kio 73 III.3.5. Loài ếch cây lớn Rhacophorus maximus 75 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 76 1. Kết luận 76 1.1. Về phân loại nhóm ếch cây xanh giống Rhacophorus ở Việt Nam 76 1.3. Về đặc điểm sinh học, sinh thái của các loài ếch cây xanh giống Rhacophorus ở Việt Nam 77 2. Kiến nghị 77 TÀI LIỆU THAM KHẢO 78 [...]... http://www.lrc-tnu.edu.vn NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Cũng trong năm 2008, Nguyen et al lần đầu tiên ghi nhận loài Rhacophorus maximus ở Việt Nam dựa trên bộ mẫu thu ở Yên Tử, Bắc Giang[20] I.2 Các nghiên cứu về quan hệ di truyền của nhóm ếch cây xanh Wilkinson et al (2002) đã tiến hành đánh giá mối quan hệ di truyền của họ ếch cây ở Châu Á và Châu Phi Các tác giả giải... TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Hình III.3 Bản đồ phân bố của loài Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus chuyangsinensis: hình tròn là địa điểm thu mẫu chuẩn theo Orlov et al 2008, hình ngôi sao là ghi nhận phân bố mới Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên 28 http://www.lrc-tnu.edu.vn NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM. .. sinh thái của các loài ếch cây xanh thông qua quan sát trực tiếp trong tự nhiên và trong điều kiện nuôi nhốt Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên 9 http://www.lrc-tnu.edu.vn NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM CHƢƠNG I TỔNG QUAN VỀ VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU I.1 Các nghiên cứu về phân loại nhóm ếch cây xanh Trên thế giới, họ Ếch cây Rhacophoridae hiện... phân loại của Dubois (1986) thì các loài ếch cây xanh ghi nhận ở Việt Nam nằm trong hai nhóm dƣới đây: Nhóm 1) Nhóm Rhacophorus Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên 10 http://www.lrc-tnu.edu.vn NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM reinwardtii (Schlegel, 1840) gồm: Rhacophorus bipunctatus Ahl, 1927; Rhacophorus dulitensis Boulenger, 1892; Rhacophorus. .. loài ếch cây xanh thuộc hai giống là Polypedates và Rhacophorus là Polypedates dennysi, P feae và Rhacophorus reinwardtii[26] Số hóa bởi Trung tâm Học Liệu – Đại học Thái Nguyên 11 http://www.lrc-tnu.edu.vn NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Tài liệu của Nguyễn Văn Sáng và cs (2005) ghi nhận tổng số 45 loài ếch cây, trong đó cũng ghi nhận 3 loài ếch cây xanh. .. địa điểm phân bố và xây dựng khoá định loại cho 5 loài ếch cây xanh thuộc giống Rhacophorus ở Việt Nam 2 Đánh giá mối quan hệ di truyền, xây dựng cây phát sinh chủng loại và xác định sự sai khác về mặt di truyền của 5 loài ếch cây xanh, đồng thời xem xét sự sai khác giữa các mẫu vật cùng loài nhƣng thu thập ở các địa điểm khác nhau ở Việt Nam dựa trên kết quả giải trình tự DNA của gen 16S rRNA và gen... III KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN III.1 Phân loại nhóm ếch cây xanh giống Rhacophorus Dựa vào bộ mẫu vật mới thu thập đƣợc ở các địa điểm khác nhau, mô tả đặc điểm hình thái và dẫn liệu về phân bố của 5 loài ếch cây xanh ở Việt Nam đƣợc trình bày dƣới đây Đặc điểm chung: Năm loài ếch cây xanh ở Việt Nam có chung các đặc điểm nhận dạng sau: Kích cỡ tƣơng đối lớn (SVL 41–131 mm) so với các nhóm ếch cây khác, con... sinh học và sinh thái của nhóm ếch cây xanh ở Việt Nam Mục tiêu của đề tài là: 1 Nghiên cứu phân loại 5 loài nhóm ếch cây xanh giống Rhacophorus dựa trên các đặc điểm hình thái 2 Phân tích mối quan hệ di truyền và tiến hoá ở mức độ phân tử dựa trên kết quả giải mã trình tự DNA 3 Bƣớc đầu tìm hiểu một số đặc điểm sinh học và sinh thái của các loài ếch cây xanh trên Căn cứ vào mục tiêu trên, đề tài thực... với vùng phân bố kéo dài từ Nam Trung Quốc qua Việt Nam và Lào đến Thái Lan và kết luận loài R reinwardtii không phân bố ở Việt Nam[ 24] Yu et al (2008) nghiên cứu quan hệ di truyền các loài thuộc họ ếch cây Rhacophoridae, tập trung vào các loài phân bố ở Trung Quốc Nhóm nghiên cứu này đã giải trình tự một đoạn gen ty thể 12S và 16S rRNA của 23 loài ếch cây đại di n 4 trong 8 giống trong họ ếch cây của... ếch nhái ở Việt Nam, họ Ếch cây (Rhacophoridae) có sự đa dạng về thành phần loài cao nhất (51 loài thuộc 9 giống) với 12 loài mới đƣợc mô tả kể từ năm 2000 trở lại đây Trong họ này thì giống Ếch cây Rhacophorus có số loài đa dạng nhất với 17 loài đã đƣợc ghi nhận và chiếm ƣu thế là nhóm ếch cây xanh với 5 loài[23] Hiện nay, nhóm ếch cây xanh ở Việt Nam gồm có các loài sau: Ếch cây chƣ yang sin Rhacophorus . trong họ Ếch cây ở Việt Nam và chuyển hai loài R.dennysi và R.feae thuộc giống Rhacophorus[ 27]. NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số hóa bởi Trung. Theo phân loại của Dubois (1986) thì các loài ếch cây xanh ghi nhận ở Việt Nam nằm trong hai nhóm dƣới đây: Nhóm 1) Nhóm Rhacophorus NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY. cảnh loài Ếch cây ki-ô ở Kon Plông, Kon Tum. Hình III.22. Sinh cảnh loài Ếch cây lớn ở Sơn Động, Bắc Giang. NGUYỄN THIÊN TẠO: PHÂN LOẠI VÀ QUAN HỆ DI TRUYỀN NHÓM ẾCH CÂY XANH Ở VIỆT NAM Số

Ngày đăng: 20/12/2014, 23:56

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan