Đang tải... (xem toàn văn)
Phân lập và tuyển chọn các chủng vi sinh vật hữu ích phục vụ cho việc sản xuất các chế phẩm probiotic dùng trong chăn nuôi
[...]... 1989) DGGE cho phép xác định cả những vi sinh vật không thể phân lập và nuôi cấy đợc (Davies và cs, 2004) 1.7.2 FISH (Fluorescence In Situ Hybridization) FISH là một trong số những phơng pháp cho phép xác định nhóm phân loại của vi khuẩn trong mẫu mà không qua nuôi cấy bằng cách lai với các đầu dò gắn huỳnh quang đặc hiệu cho rRNA và pháp hiện trên kính hiển vi huỳnh quang FISH ứng dụng cho vi khuẩn... Muyzer và cs công bố trong nghiên cứu về sinh thái vi sinh vật năm 1993 Cho đến nay kỹ thuật này đợc biết đến phổ biến trong nghiên cứu đa dạng di truyền vi sinh vật trong nhiều phòng thí nghiệm Ngày càng có nhiều công bố về ứng dụng PCR-DGGE trong nghiên cứu đa dạng di truyền 15 Chuyên ngành Vi sinh vật học Luận văn thạc sĩ khoa học Nguyễn Thị Tuyền - Cao học K16 vi sinh vật trong nhiều môi trờng sinh. .. dụng trong thí nghiệm sinh học phân tử: Hóa chất cần thiết để tách DNA, PCR, tinh sạch sản phẩm PCR, điện di biến tính, giải trình tự 2.1.3 Thiết bị, dụng cụ sử dụng trong nghiên cứu 18 Chuyên ngành Vi sinh vật học Luận văn thạc sĩ khoa học Nguyễn Thị Tuyền - Cao học K16 Nghiên cứu đợc thực hiện tại Vi n Vi sinh vật và Công nghệ sinh học ĐHQGHN, sử dụng các thiết bị chuyên môn dùng trong vi sinh vật. .. chất và một số kit dùng cho phân tích sinh học phân tử do các hãng Bioneer-Hàn Quốc, Fermentas-Đức, Qiagen-Mỹ, ABI-Mỹ, BioRad-Mỹ cung cấp - Hóa chất sử dụng nuôi cấy vi khuẩn: Các chất khoáng (bảng 1), vi lợng (bảng 2), vitamine (bảng 2), chất cho điện tử (FeSO 4 và MnSO4), chất nhận điện tử (NaNO3), khí N2 và CO2 - Hóa chất sử dụng trong phơng pháp quang phổ xác định hàm lợng sắt II, mangan II và nitrate:... nguồn vi sinh vật (10%) từ ống 22 Chuyên ngành vi sinh vật học Luận văn thạc sĩ khoa học Nguyễn Thị Tuyền - Cao học K16 MPN (nguồn phân lập) đợc sục khí N2 và ủ ở t thế đảo ngợc đầu tại 28oC trong bóng tối Khuẩn lạc đơn phát triển trong các ống pha loãng đợc tách bằng pipet Pasteur và chuyển sang môi trờng dịch thể thích hợp (nớc ngọt hay nớc lợ) 2.2.3 Tách DNA tổng số từ mẫu bùn và trầm tích và chủng. .. về trớc (Giovannoni và cs, 1988; Delong và cs, 1989; Amann và cs, 1990), và đợc đợc đánh dấu nh một bớc tiến vợt bậc trong lĩnh vực sinh thái vi sinh vật Phơng pháp này chủ yếu dựa trên trình tự của hệ tiểu đơn vị 16S rRNA, là trình tự đã đợc rất quan tâm trong nghiên cứu hệ thống phân loại của vi sinh vật (Woese và cs, 1990; Ludwig và Schleifer, 1994) Đây là phơng pháp duy nhất cho phép quan sát tính... và cs, 1994; Martínez-Murcia và cs, 1995; Lagacé và cs, 2004) Phơng pháp này còn đợc sử dụng để đánh giá nhanh sự biến đổi về mặt di truyền trong quần xã qua thời gian hoặc là so sánh các quần xã trong các điều kiện môi trờng khác nhau (Frederic và cs, 2000; Lagacé và cs, 2004) hay nghiên cứu đa dạng di truyền các chủng đơn trong quần xã vi sinh vật (Moyer và cs, 1994) 1.7.4 Giải trình tự tự động Các. .. tự dỡng (Straub và cs, 1998) Vi khuẩn oxy hóa Fe(II), khử nitrate tự dỡng mới chỉ đợc biết đến với hai chủng Ferroglobus placidus, là một vi khuẩn cổ a nhiệt (Hafenbradl và cs, 1996) và chủng 2002, là vi khuẩn a ấm thuộc phân lớp -Proteobacteria (Weber và cs, 2006 b) 1.4 Cơ chế phân tử của quá trình oxy hóa Fe(II) và các gen liên quan Cho đến nay cha có bất cứ công bố nào về cơ chế phân tử của quá... hòa tan Tuy nhiên, ở pH trung tính cơ chất và sản phẩm của quá trình chuyển hóa sắt lại ít hòa tan, điều này gây khó khăn cho vi c nghiên cứu (Straub và cs, 2001) Hình 1 Chu trình sắt trong tự nhiên (Ehrlich và Newman, 2008) 1 - Vi sinh vật trong môi trờng acid; 2 - Vi sinh vật kỵ khí ở môi trờng trung tính (khử nitrate, quang hợp kỵ khí); 3 - Quá trình hóa học trong môi trờng trung tính với nồng độ O2... và ở dạng NH4+ tại pH acid và trung tính Cố định nitơ không khí chuyển thành ammonium là quá trình tiêu tốn nhiều năng lợng Trong tự nhiên chỉ có một số loài vi khuẩn và tảo lam có khả năng thực hiện phản ứng này nhờ sản sinh ra enzyme nitrogenase Các loài vi khuẩn cố định nitơ đợc chia vào hai nhóm (1) các loài sống cộng sinh trong nốt sần ở rễ của thực vật (Rhizobium) và (2) các loài sống tự do trong 123doc.vn
