... phân tích dữ liệu bộ
gene, protein,…
2 .3. 1.2. Một số cơ sở dữ liệu trong NCBI
Nucleotide (GenBank ): là CSDL về trình tự nucleotide.
Protein: là CSDL về trình tự amino acid.
Genome: trình tự ... ra các trang web và giao thức
truyền siêu văn bản HTTP (Hypertext Transfer Protocol).
14
Cơ sở dữ liệu về
protein của Thụy
Sỹ đặt tại Genva...
... RT-RNaseH
3. 2 .3. 1. phân tích dữ liệu
Các yêu cầu của dữ liệu
Dữ liệu về trình tự nucleotide của gene hsp-70 và RT-RNaseH gồm có hai
thực thể chính cần quan tâm: là Trình tự (Sequence) và Sinh vật ...
Hình 3. 4 Kết quả sắp gióng cột cặp trình tự gene RT-RNaseH (đã biết vị trí) với RT-
RNaseH trong ORF hay genome của virus
32
3. 2 .3. Thiết kế CSDL tr...
... HỌC
***000***
XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU HAI GENE 16S VÀ 23S
RIBOSOM RNA Ở VI KHUẨN – ỨNG DỤNG CƠ SỞ DỮ LIỆU
HAI GENE 16S VÀ 23S RIBOSOM RNA Ở VI KHUẨN ĐỂ
PHÁT HIỆN CÁC TÁC ... tích dữ liệu bộ
gene, protein…
9
Cơ sở dữ liệu về
protein của Thụy
Sỹ đặt tại Geneva
Cơ sở dữ liệu về protein
của trƣờng đại học Y
George...
... các vùng nghi có bệnh.
Cuối cùng, một cơ sở dữ liệu ảnh X quang vú ñã ñược chẩn ñoán và kiểm
nghiệm kết quả bằng thực tế ñược xây dựng. ðó là cơ sở dữ liệu chuẩn bao gồm các
ảnh ñược dùng ... quang vú.
3. 1 Ảnh số
Một bức ảnh số là một bức ảnh x
ij
= f (i, j) ñược rời rạc hoá cả về toạ ñộ
không gian và về ñộ sáng. Ta có thể xem một bức ảnh số như...
... đã tải đƣợc 32 5 trình tự gene hsp-70 và RT-RNaseH từ cơ sở dữ
liệu NCBI.
Thông qua việc tìm hiểu về hai họ virus, trình tự gene tƣơng đồng, trình tự
protein bảo tồn và kết hợp với ClustalW. ... nghiệp. trang
104-106.
2. Lƣu Phúc Lợi. 2004. Xây dựng cơ sở dữ liệu gene pbp (PENICILLIN-
BINDING PROTEIN) ở Vi khuẩn Streptococcus pneumoniae. Luận vă...
... xảy ra ở trên hai gene này. Nhƣng CSDL
nhỏ, chỉ có 32 5 trình tự gene hsp-70 và RT-RNaseH ở hai họ virus, chứa lƣợng thông
tin ít và chƣa có chế độ bảo mật. Ở cấp độ phòng thí nghiệm, cơ quan ... NUMBER,
hai là khi biết tên của loài trong họ.
Hình 4.5 Trang HOME PAGE
43
Bảng 4.1 Tổng số trình tự trong CSDL gene hsp-70 và RT-RNaseH
Họ
Số trình...
... 56 loài. Số lƣợng trình tự thu nhận ở bảng 4.1.
Về trình tự
CSDL gene hsp-70 và RT-RNaseH gồm 32 5 trình tự (hsp-70 và RT-RNaseH),
kết quả chi tiết ở bảng III .3. 2. và III .3. 3. CSDL gene này ... gene RT-RnasH của hai giống này đăng tải.
Trong 4 giống (Caulimovirus, Soymovirus, Badnavirus và Petuvirus) ở
Caulimoviridae và 3 giống (Ampelovirus, Criniviru...
...
Hình 2.4 Ba cơ sở dữ liệu nucleotide (GenBank – EMB -DDB) và
công cụ tìm kiếm tƣơng ứng.
Hình 2.5 Sự hợp nhất của ba cơ sở dữ liệu MSD, PDBj, PDB
19
Trong đ :
ORF I Movement protein ... virus thực vật có genome chứa dsDNA. Đƣợc chia ra
làm năm nhóm gồm:
Caulimovirus (loài đặc trƣng: cauliflower mosaic virus) .
Soymovirus (loài đặc trƣng: So...